BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-067L22
ChromosomeX (Build37)
Map Location 22,605,069 - 22,706,964
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100043182, LOC100043956, EG436197, Ppia-psx_207.1, 1700023I07Rik
Downstream geneKlhl13, EG635719, Wdr44, EG236749, EG214450, EG245376
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-067L22.bB6Ng01-067L22.g
ACCDH886534DH886535
length1,0141,031
definitionDH886534|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-067L22, 5' end.DH886535|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-067L22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(22,605,069 - 22,606,082)(22,705,931 - 22,706,964)
sequence
gaattcctactgagctagatcgtattctttgctaaagctcatcagagaag
atacttttcaatttcagtgatcaaattaatacagtgagcaaacagccgta
gtgcataatggataacgtttactaaacagtttggtttggtaactaaccag
gttgctacagataaactgttcataactactaattaggaagcccaagtgag
aaatgtgcctctttgtagctgttacttaatgtagctgcatctatagcaag
aaagtttttttagatagatttacacttctgagtttgtttttccttaatca
agaccagcattacaaggaggtgaagtgcatcaaaaccagaatagtatgat
caaaggaatgccaaagtgatatgccttcaaaaacatctcttccagtattg
gtgccacctgaacactcacattgttcctgaaatttaaagctatattcatc
cttgtgcagtaaccaatgaaatgtgtcaggggatgttgtacagtggccca
gtatgttcttagcatacacaagactctgagcaaaatcgccaatgctacat
aaaatataaaactaagattattttaagaatttacttgtgtgaattaatgt
ttgtcattatgtatgtatgttcaacatgtgtatgctcaaagcctatagaa
ataagaagaaggtttcaggacccatgggacacaggtatgaatagttgtag
atcaccatctgggtgctagaaattcaacccagctcctctgcaagagcaag
aaatgctcttaattgctgagccaattttctaggccctaaagtaagtttga
tttggtttattattattactattatcattatcaacatcatcatcattatt
attatattatatctggaaaggaacactatagtttctaactgtaatatggt
gatacgaccctataggtggaacaacaatatgaactaaccagtaaagccag
aactcgtgtatctagctgcatatgtagcagaagatgggctagtcagccaa
cattgggaagagag
gaattctaagctatcctgagctacagaaagatcctgtctgaaaaaatgcc
attattaattatgtatcagggtacctgtgctcttataatattcataccac
caccaagaagaaatattctttttgttaatatagctaaatatatatttatt
cattatttctctaaaccaaaatttgtattatttaacaggacacaaatatt
acaaaaaaaaaaataggtgaaagcagcatcatttcgatgccaatggtatt
actattgttctataccaaatagcaccagcttgaaacaatagtagcattaa
aactggcattccaggatggagagatggcttagcattaagagcacttgttg
atcttgcagaggtctcagaattgattcccagaacccacatggaggctcat
gcctatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatcttg
ttctagtgaatctccaatgctcacatctgacatgcatgagcaccaggcaa
aaatgggatttctgaggaaattcccagttttttaaggtccattgtttcaa
tagtctgatagattaaaagacagaattgtctccttagaatatcttcattt
cttccaggcctattacagttctttgaattatctgctgtgaatagaactgc
aataaacattgaagtgcaagtattctgttatctgttgacttggaggcaat
actattaacttgggtaaatacccaggagtggtatagttggctcatatggt
agatctattgttaattttttttgaaaacctccaaattgttttccacagag
gtccaacaactcttttccttgtgcctacatccttgccaacatttgtaata
tctattcttaatgactgtcattctgggctgtattaaaataaaatctcaat
actatttggatctgcaggtctcagatgtctagtagattgacctcttttca
tatttatggccgtgtatatttttcctttcagagttattgttaatttcttt
agcccttttactgttaaatggggtgacttct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chrX_22605069_22606082
seq2: B6Ng01-067L22.b_48_1061

seq1  GAATTCCTACTGAGCTAGATCGTATTCTTTGCTAAAGCTCATCAGAGAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTACTGAGCTAGATCGTATTCTTTGCTAAAGCTCATCAGAGAAG  50

seq1  ATACTTTTCAATTTCAGTGATCAAATTAATACAGTGAGCAAACAGCCGTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTTTTCAATTTCAGTGATCAAATTAATACAGTGAGCAAACAGCCGTA  100

seq1  GTGCATAATGGATAACGTTTACTAAACAGTTTGGTTTGGTAACTAACCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCATAATGGATAACGTTTACTAAACAGTTTGGTTTGGTAACTAACCAG  150

seq1  GTTGCTACAGATAAACTGTTCATAACTACTAATTAGGAAGCCCAAGTGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGCTACAGATAAACTGTTCATAACTACTAATTAGGAAGCCCAAGTGAG  200

seq1  AAATGTGCCTCTTTGTAGCTGTTACTTAATGTAGCTGCATCTATAGCAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGTGCCTCTTTGTAGCTGTTACTTAATGTAGCTGCATCTATAGCAAG  250

seq1  AAAGTTTTTTTAGATAGATTTACACTTCTGAGTTTGTTTTTCCTTAATCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTTTTTTTAGATAGATTTACACTTCTGAGTTTGTTTTTCCTTAATCA  300

seq1  AGACCAGCATTACAAGGAGGTGAAGTGCATCAAAACCAGAATAGTATGAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCAGCATTACAAGGAGGTGAAGTGCATCAAAACCAGAATAGTATGAT  350

seq1  CAAAGGAATGCCAAAGTGATATGCCTTCAAAAACATCTCTTCCAGTATTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGGAATGCCAAAGTGATATGCCTTCAAAAACATCTCTTCCAGTATTG  400

seq1  GTGCCACCTGAACACTCACATTGTTCCTGAAATTTAAAGCTATATTCATC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCACCTGAACACTCACATTGTTCCTGAAATTTAAAGCTATATTCATC  450

seq1  CTTGTGCAGTAACCAATGAAATGTGTCAGGGGATGTTGTACAGTGGCCCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTGCAGTAACCAATGAAATGTGTCAGGGGATGTTGTACAGTGGCCCA  500

seq1  GTATGTTCTTAGCATACACAAGACTCTGAGCAAAATCGCCAATGCTACAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGTTCTTAGCATACACAAGACTCTGAGCAAAATCGCCAATGCTACAT  550

seq1  AAAATATAAAACTAAGATTATTTTAAGAATTTACTTGTGTGAATTAATGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATATAAAACTAAGATTATTTTAAGAATTTACTTGTGTGAATTAATGT  600

seq1  TTGTCATTATGTATGTATGTTCAACATGTGTATGCTCAAAGCCTATAGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCATTATGTATGTATGTTCAACATGTGTATGCTCAAAGCCTATAGAA  650

seq1  ATAAGAAGAAGGTTTCAGGACCCATGGGACACAGGTATGAATAGTTGTAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGAAGAAGGTTTCAGGACCCATGGGACACAGGTATGAATAGTTGTAG  700

seq1  ATCACCATCTGGGTGCTAGAAATTCAACCCAGCTCCTCTGCAAGAGCAAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACCATCTGGGTGCTAGAAATTCAACCCAGCTCCTCTGCAAGAGCAAG  750

seq1  AAATGCTCTTAATTGCTGAGCCAATTTTCTAGGCCCTAAAGTAAGTTTGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGCTCTTAATTGCTGAGCCAATTTTCTAGGCCCTAAAGTAAGTTTGA  800

seq1  TTTGGTTTATTATTATTACTATTATCATTATCAACATCATCATCATTATT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGTTTATTATTATTACTATTATCATTATCAACATCATCATCATTATT  850

seq1  ATTATATTATATCTGGAAAGGAACACTATAGTTTCTAACTGTAATATGGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATATTATATCTGGAAAGGAACACTATAGTTTCTAACTGTAATATGGT  900

seq1  GATACGACCCTATAGGTGGAACAACAATATGAACTAACCAGTAAAGCCAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATACGACCCTATAGGTGGAACAACAATATGAACTAACCAGTAAAGCCAG  950

seq1  AACTCGTGTATCTAGCTGCATATGTAGCAGAAGATGGCCTAGTCAGCCAA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  AACTCGTGTATCTAGCTGCATATGTAGCAGAAGATGGGCTAGTCAGCCAA  1000

seq1  CATTGGGAAGAGAG  1014
      ||||||||||||||
seq2  CATTGGGAAGAGAG  1014

seq1: chrX_22705931_22706964
seq2: B6Ng01-067L22.g_68_1098 (reverse)

seq1  AGAAGTCACACAATTTAAACAGTAAAAGGGCTAAAGAAATTAACAAATAA  50
      ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  AGAAGTCACCCCATTT-AACAGTAAAAGGGCTAAAGAAATTAAC-AATAA  48

seq1  CTCTGAAAAGGAAAAATATACACGGCCATAAATATGAAAAGAGGTCAATC  100
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTG-AAAGGAAAAATATACACGGCCATAAATATGAAAAGAGGTCAATC  97

seq1  TTACTAGACATCTGAGAACTGCAGATTCAAATAGTATTGAGATTTTATTT  150
       |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  -TACTAGACATCTGAGACCTGCAGATCCAAATAGTATTGAGATTTTATTT  146

seq1  TAATACAG-CCAGAATGACAGTCATTAAGAATAGATATTACAAATGTTGG  199
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATACAGCCCAGAATGACAGTCATTAAGAATAGATATTACAAATGTTGG  196

seq1  CAAGGATGTAGGCACAAGGAAAAGAGTTGTTGGACCTCTGTGGAAAACAA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGATGTAGGCACAAGGAAAAGAGTTGTTGGACCTCTGTGGAAAACAA  246

seq1  TTTGGAGGTTTTCAAAAAAAATTAACAATAGATCTACCATATGAGCCAAC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGAGGTTTTCAAAAAAAATTAACAATAGATCTACCATATGAGCCAAC  296

seq1  TATACCACTCCTGGGTATTTACCCAAGTTAATAGTATTGCCTCCAAGTCA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACCACTCCTGGGTATTTACCCAAGTTAATAGTATTGCCTCCAAGTCA  346

seq1  ACAGATAACAGAATACTTGCACTTCAATGTTTATTGCAGTTCTATTCACA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGATAACAGAATACTTGCACTTCAATGTTTATTGCAGTTCTATTCACA  396

seq1  GCAGATAATTCAAAGAACTGTAATAGGCCTGGAAGAAATGAAGATATTCT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGATAATTCAAAGAACTGTAATAGGCCTGGAAGAAATGAAGATATTCT  446

seq1  AAGGAGACAATTCTGTCTTTTAATCTATCAGACTATTGAAACAATGGACC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAGACAATTCTGTCTTTTAATCTATCAGACTATTGAAACAATGGACC  496

seq1  TTAAAAAACTGGGAATTTCCTCAGAAATCCCATTTTTGCCTGGTGCTCAT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAAAACTGGGAATTTCCTCAGAAATCCCATTTTTGCCTGGTGCTCAT  546

seq1  GCATGTCAGATGTGAGCATTGGAGATTCACTAGAACAAGATATATATATA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGTCAGATGTGAGCATTGGAGATTCACTAGAACAAGATATATATATA  596

seq1  TATATATATATATATATATATATATATATATAGGCATGAGCCTCCATGTG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATATATATATATATATATATATATATATAGGCATGAGCCTCCATGTG  646

seq1  GGTTCTGGGAATCAATTCTGAGACCTCTGCAAGATCAACAAGTGCTCTTA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCTGGGAATCAATTCTGAGACCTCTGCAAGATCAACAAGTGCTCTTA  696

seq1  ATGCTAAGCCATCTCTCCATCCTGGAATGCCAGTTTTAATGCTACTATTG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTAAGCCATCTCTCCATCCTGGAATGCCAGTTTTAATGCTACTATTG  746

seq1  TTTCAAGCTGGTGCTATTTGGTATAGAACAATAGTAATACCATTGGCATC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAAGCTGGTGCTATTTGGTATAGAACAATAGTAATACCATTGGCATC  796

seq1  GAAATGATGCTGCTTTCACCTATTTTTTTTTTTGTAATATTTGTGTCCTG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATGATGCTGCTTTCACCTATTTTTTTTTTTGTAATATTTGTGTCCTG  846

seq1  TTAAATAATACAAATTTTGGTTTAGAGAAATAATGAATAAATATATATTT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAATAATACAAATTTTGGTTTAGAGAAATAATGAATAAATATATATTT  896

seq1  AGCTATATTAACAAAAAGAATATTTCTTCTTGGTGGTGGTATGAATATTA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTATATTAACAAAAAGAATATTTCTTCTTGGTGGTGGTATGAATATTA  946

seq1  TAAGAGCACAGGTACCCTGATACATAATTAATAATGGCATTTTTTCAGAC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAGCACAGGTACCCTGATACATAATTAATAATGGCATTTTTTCAGAC  996

seq1  AGGATCTTTCTGTAGCTCAGGATAGCTTAGAATTC  1034
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATCTTTCTGTAGCTCAGGATAGCTTAGAATTC  1031