BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-075B14
ChromosomeX (Build37)
Map Location 10,578,666 - 10,759,971
singlet/doubletdoublet
Overlap genePpia-psx_105.1
Upstream geneLOC436194, Srpx, Rpgr, Otc, 4933416E14Rik, Tspan7, EG546265, LOC633354, LOC633361, LOC100042912, Mid1ip1, LOC668982
Downstream geneLOC100042922, LOC100042927, LOC100042929, LOC100042931, OTTMUSG00000016790, LOC100042939, LOC100042943, LOC100042944, LOC100042946, EG236663, 8430439B09Rik, LOC669520, Rpl23a-ps, LOC100043945, Bcor, 2900008C10Rik, LOC385323
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-075B14.bB6Ng01-075B14.g
ACCDH891753DH891754
length795893
definitionDH891753|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-075B14, 5' end.DH891754|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-075B14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(10,759,180 - 10,759,971)(10,578,666 - 10,579,549)
sequence
gaattctgggtgtcctgatttgtccagagccccatcttggagagtgctga
ctgagctgcactgatattcaggcttcacaataccctgtctcctctgcatc
tccttgagcttagaagtgcctgtgagtttaaagccacggacttaagtccc
taagggcaaacagtggtacagtgcctgcagcagagacagttgccaccctt
catttgttgcccttcaccctcacccctgggctctgcagatgtatatggtg
aacacctgctaagctctgcctgaggactttacgctggacatgatcaggcc
tcaaaccaggtgaagcagggatgggggtggggtgggcgtgcttgtcactt
cctagcctggaaagcatccttcaaccaatgaggttggtaaatgtatccca
cagcttcttcactcgagcccaggacatactctactgctcccgaggtcttg
agcagcaggactgcgctcctgttgccctggttggtcggtcactcacttga
gaacacttgggatagatgctcttttctttcttcgccctactttaccacct
catcatcagcactcctggacttgactttcaactcaattattttgccctcg
agtgtttactggtggatggtacttctgggaaaatccaaattaataaagtg
cctcgaagcactctccacgaaaatgccaccgtttctggctgccaagggtt
ccctggctttcagggagagatggaactttctgactgaattattttctgga
cgacatgagagaattggtcatcatatcctctggggcggggctgga
gaattcactcggtaaacaaaattgattcctcatttcttgaattttgaaaa
aaaaaaagtcaatgattgaaagaaagattataacattgaatgaggggata
tttattggattcaaataggagagagttaagatcctacaaaggtatcttaa
ccttaataaattctgaaattatattaaaattgatcaaatatttattttaa
gcatactggaaaaggtatgtatattctggtacctaaatcacctaaccaaa
aatcttcacaaatgtacaatcaacagactggttaattgaaatgtaatcaa
acgttacccaaacaggcaaaagaagtcaagcttgaatagatgggtatgac
aaataaagcaaacataaaataatgcaatgtatgaattaaaacacaacact
aattacattaataaaataatctaatctaagcatatcaatcagaatatagg
ttgtcagaacataatttatagaataattaaagtatatgatgtttacacaa
aattctgtttttgtaatgtagtgatgtagctacttggatgtacctacttt
aaaaataaaatgatatgcaagttttggtgactcacaactgtaatctcagt
gcttgggaggctgagacaggaagatttccaagaatatgagggcagcctgg
gatacagattgagtttcaggtcatcataggctatactgtaagaccctgtt
ttaggaagaaaatatacagtgatgatgatgataataataataatatataa
aatgagctgggcaatggtggcacatgcctttaatcccaacacttgggagg
cagagggaggtggatttctgagttcaaggccagcctggtctaagagtgag
ttccaggacagccagggctataacatagaaaccctattctcga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chrX_10759180_10759971
seq2: B6Ng01-075B14.b_46_840 (reverse)

seq1  TCCAGCCCCG-CCCAGAGGATTATGCTGAGCAATTCTCTCATGTCGTTCA  49
      |||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||
seq2  TCCAGCCCCGCCCCAGAGGA-TATGATGACCAATTCTCTCATGTCGTCCA  49

seq1  GAAAAT-ATTCAGTCAGAAAGTTCCATCTCTCCCTG-AAGCCCGGGAACC  97
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
seq2  GAAAATAATTCAGTCAGAAAGTTCCATCTCTCCCTGAAAGCCAGGGAACC  99

seq1  CTTGGCAGCCAGAAACGGTGGCATTTTCGTGGAGAGTGCTTCGAGGCACT  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGCAGCCAGAAACGGTGGCATTTTCGTGGAGAGTGCTTCGAGGCACT  149

seq1  TTCTTAATTTGGATTTTCCCAGAAGTACCATCCACCAGTAAACACTCGAG  197
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTAATTTGGATTTTCCCAGAAGTACCATCCACCAGTAAACACTCGAG  199

seq1  GGC-AAATAATTGAGTTGAAAGTCAAGTCCAGGAGTGCTGATGATGAGGT  246
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAAAATAATTGAGTTGAAAGTCAAGTCCAGGAGTGCTGATGATGAGGT  249

seq1  GGTAAAGTAGGGCGAAGAAAGAAAAGAGCATCTATCCCAAGTGTTCTCAA  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAAAGTAGGGCGAAGAAAGAAAAGAGCATCTATCCCAAGTGTTCTCAA  299

seq1  GTGAGTGACCGACCAACCAGGGCAACAGGAGCGCAGTCCTGCTGCTCAAG  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGTGACCGACCAACCAGGGCAACAGGAGCGCAGTCCTGCTGCTCAAG  349

seq1  ACCTCGGGAGCAGTAGAGTATGTCCTGGGCTCGAGTGAAGAAGCTGTGGG  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCGGGAGCAGTAGAGTATGTCCTGGGCTCGAGTGAAGAAGCTGTGGG  399

seq1  ATACATTTACCAACCTCATTGGTTGAAGGATGCTTTCCAGGCTAGGAAGT  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATTTACCAACCTCATTGGTTGAAGGATGCTTTCCAGGCTAGGAAGT  449

seq1  GACAAGCACGCCCACCCCACCCCCATCCCTGCTTCACCTGGTTTGAGGCC  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAAGCACGCCCACCCCACCCCCATCCCTGCTTCACCTGGTTTGAGGCC  499

seq1  TGATCATGTCCAGCGTAAAGTCCTCAGGCAGAGCTTAGCAGGTGTTCACC  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATCATGTCCAGCGTAAAGTCCTCAGGCAGAGCTTAGCAGGTGTTCACC  549

seq1  ATATACATCTGCAGAGCCCAGGGGTGAGGGTGAAGGGCAACAAATGAAGG  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATACATCTGCAGAGCCCAGGGGTGAGGGTGAAGGGCAACAAATGAAGG  599

seq1  GTGGCAACTGTCTCTGCTGCAGGCACTGTACCACTGTTTGCCCTTAGGGA  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCAACTGTCTCTGCTGCAGGCACTGTACCACTGTTTGCCCTTAGGGA  649

seq1  CTTAAGTCCGTGGCTTTAAACTCACAGGCACTTCTAAGCTCAAGGAGATG  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAAGTCCGTGGCTTTAAACTCACAGGCACTTCTAAGCTCAAGGAGATG  699

seq1  CAGAGGAGACAGGGTATTGTGAAGCCTGAATATCAGTGCAGCTCAGTCAG  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGGAGACAGGGTATTGTGAAGCCTGAATATCAGTGCAGCTCAGTCAG  749

seq1  CACTCTCCAAGATGGGGCTCTGGACAAATCAGGACACCCAGAATTC  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCTCCAAGATGGGGCTCTGGACAAATCAGGACACCCAGAATTC  795

seq1: chrX_10578666_10579549
seq2: B6Ng01-075B14.g_78_962

seq1  TCGGTAAACAAAATTGATTCCTCATTTCTTGAATTTTGAAAAAAAAAAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGGTAAACAAAATTGATTCCTCATTTCTTGAATTTTGAAAAAAAAAAAG  50

seq1  TCAATGATTGAAAGAAAGATTATAACATTGAATGAGGGGATATTTATTGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATGATTGAAAGAAAGATTATAACATTGAATGAGGGGATATTTATTGG  100

seq1  ATTCAAATAGGAGAGAGTTAAGATCCTACAAAGGTATCTTAACCTTAATA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAAATAGGAGAGAGTTAAGATCCTACAAAGGTATCTTAACCTTAATA  150

seq1  AATTCTGAAATTATATTAAAATTGATCAAATATTTATTTTAAGCATACTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCTGAAATTATATTAAAATTGATCAAATATTTATTTTAAGCATACTG  200

seq1  GAAAAGGTATGTATATTCTGGTACCTAAATCACCTAACCAAAAATCTTCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAGGTATGTATATTCTGGTACCTAAATCACCTAACCAAAAATCTTCA  250

seq1  CAAATGTACAATCAACAGACTGGTTAATTGAAATGTAATCAAACGTTACC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATGTACAATCAACAGACTGGTTAATTGAAATGTAATCAAACGTTACC  300

seq1  CAAACAGGCAAAAGAAGTCAAGCTTGAATAGATGGGTATGACAAATAAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACAGGCAAAAGAAGTCAAGCTTGAATAGATGGGTATGACAAATAAAG  350

seq1  CAAACATAAAATAATGCAATGTATGAATTAAAACACAACACTAATTACAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACATAAAATAATGCAATGTATGAATTAAAACACAACACTAATTACAT  400

seq1  TAATAAAATAATCTAATCTAAGCATATCAATCAGAATATAGGTTGTCAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATAAAATAATCTAATCTAAGCATATCAATCAGAATATAGGTTGTCAGA  450

seq1  ACATAATTTATAGAATAATTAAAGTATATGATGTTTACACAAAATTCTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAATTTATAGAATAATTAAAGTATATGATGTTTACACAAAATTCTGT  500

seq1  TTTTGTAATGTAGTGATGTAGCTACTTGGATGTACCTACTTTAAAAATAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGTAATGTAGTGATGTAGCTACTTGGATGTACCTACTTTAAAAATAA  550

seq1  AATGATATGCAAGTTTTGGTGACTCACAACTGTAATCTCAGTGCTTGGGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGATATGCAAGTTTTGGTGACTCACAACTGTAATCTCAGTGCTTGGGA  600

seq1  GGCTGAGACAGGAAGATTTCCAAGAATATGAGGGCAGCCTGGGATACAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGAGACAGGAAGATTTCCAAGAATATGAGGGCAGCCTGGGATACAGA  650

seq1  TTGAGTTTCAGGTCATCATAGGCTATACTGTAAGACCCTGTTTTAGGAAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGTTTCAGGTCATCATAGGCTATACTGTAAGACCCTGTTTTAGGAAG  700

seq1  AAAATATACAGTGATGATGATGATAATAATAATAATATATAAAATGAGCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATATACAGTGATGATGATGATAATAATAATAATATATAAAATGAGCT  750

seq1  GGGCAATGGTGGCACATGCCTTTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGGCA  800
      |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
seq2  GGGCAATGGTGGCACATGCCTTTAATCCCAACACTTGGGAGGCAGAGGGA  800

seq1  GGTGGATTTCTGAGTTCAAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCAGG  850
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  GGTGGATTTCTGAGTTCAAGGCCAGCCTGGTCTA-AGAGTGAGTTCCAGG  849

seq1  ACAGCCAGGGCTAT-ACAGAGAAACCCTA-TCTCGA  884
      |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||
seq2  ACAGCCAGGGCTATAACATAGAAACCCTATTCTCGA  885