BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-085H23
ChromosomeX (Build37)
Map Location 124,859,222 - 125,003,140
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG237030
Upstream gene4921511C20Rik, 4930412D23Rik, LOC385523, LOC100040516, Mdm4-ps
Downstream geneLOC100040538, LOC100040550, LOC100040562
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-085H23.bB6Ng01-085H23.g
ACCDH899154DH899155
length1,106851
definitionDH899154|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-085H23, 5' end.DH899155|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-085H23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(124,859,222 - 124,860,325)(125,002,356 - 125,003,140)
sequence
gaattcaatcctaacccaaaaaattgaaaggaactaaagaatgtagactg
tgggagaaatagtattacacaggttaaaacacatcaatttcttatccaat
actacatggttagcactgaaaacatacaagtaacattatagagacagggt
gggttataaatatatatatatatatatatatatacatatacatatacata
tatatatatatatatatatatatatatacactcacactagtacacacatg
cgcgcgcacacacacacacacacacacacacacatgcacacacacacaaa
ttccccaaatataaagaggcaatgaattttaaaaagtgagtgtttagaat
gggctgtacatggtaatgattggagggaagaaaggtaagagaaaatgata
tgatagtctatattctcaaaaaagaaaaaataattataaaagtatgtttt
taattttaaaacaatccttatatgtgtatttgtatataaatgccatgtgt
ttgaggtattgagaatgaccagagaaagaagtcagatccattgaagctgt
agttattggtggttctaagtgacctaacatggattcagggaaacaaactt
gagtcaggtcaaacttgagaaaggtcagccattctaaacctctcagccat
ctctgcagctctttctcaaagtcttctgatagttaaaatatatgattgaa
gagaataaattttcaagtaaaaaaattcaacagagtaatgagaaaaatga
agattcaaatgttaaaaataagcttaatttcagatgtgaaagaactttgt
tctatagttataattagtaggtgaattgcacatcccttgtggatcctgaa
aatagctaagttaagtcatttgagtattttctatttgagtatgtatgctc
acctctatcagctccattgacctcaaccaaaagttgcaaatgcattgctc
cgaactaaaggaatttctgttttgtacatgctcaccctgctacttcaagg
aagcaagaatgctggtaagaattttaattctccatgaaaatatgattgta
gataggaaaaaaattcttctctttggagagaaatgggaaaatgtaacctg
aattga
gaattcagttttgatgtgcctagtcctgtgagatttagtgtgccagggtg
gggtgacacctacccattctcagaggagaagtgaagggacatggaggaag
ggactgtataaggtggattccagaggtggtgagacagagattgggatgta
aagtgaacaaataaattaaagaaaaaggaaagaaagacatcagcatctga
atacacagtgcacaaacccattcctcaacatatttctaaataaagcaaac
tcactcctactcctccagcacccttcaattgccagtacttcgtagctact
gttggtttgtttttgtcaatttgacacaaatatagacatctctggagagg
gaaatatcagctgaggaattgcctccaccgtattagcctttaaaaactct
gtgtcttcattagtgattgatgtgggaggtcccatctcactgaggtcatg
ctggtgttgggatgtgtgaaaggtctatttgggaaaactataaggaacag
cttagtatgtagtgttcttctattccctatgcgttgagtttctgcctgac
ttttcccagagatagactgtcatgtggcagtgtagaacaaatggactctt
tcctccacaagatgtttttgattactgtgtttatcacagaaagagagagc
aaatggggacacatagaaatgggatgttaggagtccctttccaacccact
ttgggattttggtttgtttggctttctgcatgtattcattccagctatga
gttcatgtgtgcattagctttctcacatcaagaaaacactatttttgttg
gcagtcagacactgtctctggatcttttggacttcctctttccattcttt
c
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chrX_124859222_124860325
seq2: B6Ng01-085H23.b_47_1152

seq1  GAATTCAATCCTAACCCAAAAAATTGAAAGGAACTAAAGAATGTAGACTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATCCTAACCCAAAAAATTGAAAGGAACTAAAGAATGTAGACTG  50

seq1  TGGGAGAAATAGTATTACACAGGTTAAAACACATCAATTTCTTATCCAAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAGAAATAGTATTACACAGGTTAAAACACATCAATTTCTTATCCAAT  100

seq1  ACTACATGGTTAGCACTGAAAACATACAAGTAACATTATAGAGACAGGGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTACATGGTTAGCACTGAAAACATACAAGTAACATTATAGAGACAGGGT  150

seq1  GGGTTATAAATATATATATATATATATATATATACATATACATATACATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTATAAATATATATATATATATATATATATACATATACATATACATA  200

seq1  TATATATATATATATATATATATATATACACTCACACTAGTACACACATG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATATATATATATATATATATATATACACTCACACTAGTACACACATG  250

seq1  CGCGCGCACACACACACACACACACACACACACATGCACACACACACAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCGCGCACACACACACACACACACACACACACATGCACACACACACAAA  300

seq1  TTCCCCAAATATAAAGAGGCAATGAATTTTAAAAAGTGAGTGTTTAGAAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCCAAATATAAAGAGGCAATGAATTTTAAAAAGTGAGTGTTTAGAAT  350

seq1  GGGCTGTACATGGTAATGATTGGAGGGAAGAAAGGTAAGAGAAAATGATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTGTACATGGTAATGATTGGAGGGAAGAAAGGTAAGAGAAAATGATA  400

seq1  TGATAGTCTATATTCTCAAAAAAGAAAAAATAATTATAAAAGTATGTTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||                 |||||||||
seq2  TGATAGTCTATATTCTCAAAAAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNGTATGTTTT  450

seq1  TAATTTTAAAACAATCCTTATATGTGTATTTGTATATAAATGCCATGTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTTTAAAACAATCCTTATATGTGTATTTGTATATAAATGCCATGTGT  500

seq1  TTGAGGTATTGAGAATGACCAGAGAAAGAAGTCAGATCCATTGAAGCTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGGTATTGAGAATGACCAGAGAAAGAAGTCAGATCCATTGAAGCTGT  550

seq1  AGTTATTGGTGGTTCTAAGTGACCTAACATGGATTCAGGGAAACAAACTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTATTGGTGGTTCTAAGTGACCTAACATGGATTCAGGGAAACAAACTT  600

seq1  GAGTCAGGTCAAACTTGAGAAAGGTCAGCCATTCTAAACCTCTCAGCCAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCAGGTCAAACTTGAGAAAGGTCAGCCATTCTAAACCTCTCAGCCAT  650

seq1  CTCTGCAGCCCTTTCTCAAAGTCTTCTGATAGTTAAAATATATGATTGAA  700
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGCAGCTCTTTCTCAAAGTCTTCTGATAGTTAAAATATATGATTGAA  700

seq1  GAGAATAAATTTTCAAGTAAAAAAATTCAACAGAGTAATGAGAAAAATGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAATAAATTTTCAAGTAAAAAAATTCAACAGAGTAATGAGAAAAATGA  750

seq1  AGATTCAAATGTTAAAAATAAGCTTAATTTCAGATGTGAAAGAACTTTGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTCAAATGTTAAAAATAAGCTTAATTTCAGATGTGAAAGAACTTTGT  800

seq1  TCTATAGTTATAATTAGTAGGTGAATTGCACATCCCTTGTGGATCCTGAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATAGTTATAATTAGTAGGTGAATTGCACATCCCTTGTGGATCCTGAA  850

seq1  AATAGCTAAGGTTAAGTCATTTGAGTATTTTCTATTTGAGTATGTATGCT  900
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGCTAA-GTTAAGTCATTTGAGTATTTTCTATTTGAGTATGTATGCT  899

seq1  CACCTCTATCAGCTCCATTGACCTCAACCAAAAAGTTGCAAATGCATTGC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  CACCTCTATCAGCTCCATTGACCTCAACC-AAAAGTTGCAAATGCATTGC  948

seq1  TCCGAACTAAAGGAATTTCTG-TTTGTACATGCTCACCCTGCTACTTCAA  999
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCGAACTAAAGGAATTTCTGTTTTGTACATGCTCACCCTGCTACTTCAA  998

seq1  GGAAGCAAG-ATGCTGGTAAGAATTTTAATGCTCCATGAAAATATGATTG  1048
      ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  GGAAGCAAGAATGCTGGTAAGAATTTTAATTCTCCATGAAAATATGATTG  1048

seq1  TAG-TAGGAAAAAAAATCTTCTCTTGAGAGA-AAATGGAAAAATGTAGCT  1096
      ||| ||||||||||| |||||||||  |||| |||||| |||||||| | 
seq2  TAGATAGGAAAAAAATTCTTCTCTTTGGAGAGAAATGGGAAAATGTAACC  1098

seq1  GAAATTGA  1104
        ||||||
seq2  TGAATTGA  1106

seq1: chrX_125002356_125003140
seq2: B6Ng01-085H23.g_68_852 (reverse)

seq1  TTTCTTGATGTGAGAAAGCTAATGCACACATGAACTCATAGCTGGAATGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTGATGTGAGAAAGCTAATGCACACATGAACTCATAGCTGGAATGA  50

seq1  ATACATGCAGAAAGCCAAACAAACCAAAATCCCAAAGTGGGTTGGAAAGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATGCAGAAAGCCAAACAAACCAAAATCCCAAAGTGGGTTGGAAAGG  100

seq1  GACTCCTAACATCCCATTTCTATGTGTCCCCATTTGCTCTCTCTTTCTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTCCTAACATCCCATTTCTATGTGTCCCCATTTGCTCTCTCTTTCTGT  150

seq1  GATAAACACAGTAATCAAAAACATCTTGTGGAGGAAAGAGTCCATTTGTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAACACAGTAATCAAAAACATCTTGTGGAGGAAAGAGTCCATTTGTT  200

seq1  CTACACTGCCACATGACAGTCTATCTCTGGGAAAAGTCAGGCAGAAACTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACACTGCCACATGACAGTCTATCTCTGGGAAAAGTCAGGCAGAAACTC  250

seq1  AACGCATAGGGAATAGAAGAACACTACATACTAAGCTGTTCCTTATAGTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACGCATAGGGAATAGAAGAACACTACATACTAAGCTGTTCCTTATAGTT  300

seq1  TTCCCAAATAGACCTTTCACACATCCCAACACCAGCATGACCTCAGTGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCAAATAGACCTTTCACACATCCCAACACCAGCATGACCTCAGTGAG  350

seq1  ATGGGACCTCCCACATCAATCACTAATGAAGACACAGAGTTTTTAAAGGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGACCTCCCACATCAATCACTAATGAAGACACAGAGTTTTTAAAGGC  400

seq1  TAATACGGTGGAGGCAATTCCTCAGCTGATATTTCCCTCTCCAGAGATGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATACGGTGGAGGCAATTCCTCAGCTGATATTTCCCTCTCCAGAGATGT  450

seq1  CTATATTTGTGTCAAATTGACAAAAACAAACCAACAGTAGCTACGAAGTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATATTTGTGTCAAATTGACAAAAACAAACCAACAGTAGCTACGAAGTA  500

seq1  CTGGCAATTGAAGGGTGCTGGAGGAGTAGGAGTGAGTTTGCTTTATTTAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCAATTGAAGGGTGCTGGAGGAGTAGGAGTGAGTTTGCTTTATTTAG  550

seq1  AAATATGTTGAGGAATGGGTTTGTGCACTGTGTATTCAGATGCTGATGTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATATGTTGAGGAATGGGTTTGTGCACTGTGTATTCAGATGCTGATGTC  600

seq1  TTTCTTTCCTTTTTCTTTAATTTATTTGTTCACTTTACATCCCAATCTCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTTCCTTTTTCTTTAATTTATTTGTTCACTTTACATCCCAATCTCT  650

seq1  GTCTCACCACCTCTGGAATCCACCTTATACAGTCCCTTCCTCCATGTCCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCACCACCTCTGGAATCCACCTTATACAGTCCCTTCCTCCATGTCCC  700

seq1  TTCACTTCTCCTCTGAGAATGGGTAGGTGTCACCCCACCCTGGCACACTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACTTCTCCTCTGAGAATGGGTAGGTGTCACCCCACCCTGGCACACTA  750

seq1  AATCTCACAGGACTAGGCACATCAAAACTGAATTC  785
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTCACAGGACTAGGCACATCAAAACTGAATTC  785