BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-092K01
ChromosomeX (Build37)
Map Location 162,147,842 - 162,284,715
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100040753
Upstream geneMospd2, Fancb, LOC627045, Glra2
Downstream geneGemin8, Gpm6b, Ofd1, Trappc2, Rab9, LOC100040795, A630018P17Rik, Egfl6, LOC100041912
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-092K01.bB6Ng01-092K01.g
ACCDH904336DH904337
length1,1711,080
definitionDH904336|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-092K01, 5' end.DH904337|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-092K01, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(162,147,842 - 162,149,019)(162,283,637 - 162,284,715)
sequence
gaattccttgatcttatcctttgtagtaatagagaatgaacctagagcat
tgtgtatgctgggaacggctctaccactgatctacacacacaagccctga
gttccataacctggaaacatcacagtttaggaaaggaaagttcaactaca
ggtttaatgagggtcagttgagagataaggacaaaattacaacaggtaga
agactggatacaccaacaatatctatttctaactgccatacatttgggcc
agaaacctatagacacaaatgagaatggcttatttcccccattccacctg
atatcctactcacagaagcttttgcttataaaaaatgattgcttagtttc
tgtcacttagggagggcgtaattccaagcaaagcatataaccatgttttc
cttgaattgggagttgacactattacctgccaattggggctcctggtgct
tttgaatctgaaggcaacaaaaacaaaacaaaacaaaacaaaaaaacaaa
caaacaaaaaaaaacagtactaccttctttgaatgactgacagcagattg
agatactgctcctcagtaatatcagtatgggctccatctagaaggtatgg
ggttttctgaggatccacatggtggtttctatgtctgagaataaaaatga
gacacacaaaacaaaatagacaacagtaaaatgttggatcatccaacctg
acaaactaacataatccacatggctcaaaaaaaaaatgggactatgtaat
ggtgatttgaagaatagagttaaattatataatccattcagtggcaaccc
tatgaagggttggagttatcagctggagaaataaagtcttcatttacatt
tttcccctgatatcctgccgtgtgatatctgctatacatgtgtgtaacta
ttagctccttttataaaatattttaaatttatttatttcatgtgttttaa
tgagtgttttgcttgcacatatgccttatgcatcttgtgcatatattgta
cctgcaggactcaaaagaggcatcaaattgttcggaactggattatagaa
aggtatggagccataagttgttgttcacatggatctgggattccttgcaa
gaacaggtaccctacaggtctcgaagttttatttatttggattaatgaat
gaatacgttgcctgtttattt
gaattccgagacaacctgctatggactggatttcatggactattacccta
tttcctccccctccttggcctctttcttctccttatcttgactatcaggc
caggtatgctcaataaactcactcaatttatccatcagagggtagaggtg
atctggcttcacaaagttgaggtccattaccaaagacttgtctcttctga
gccaggctctacatatccccctgcttatgagcacccatcctcagctcttc
acctgacctacaacaggtaagatctcagatgtgttgagacaagctaagac
aggttgtggagcaccccttttttgacccagagtgacacatgttatccaga
gatgggtaagatccccatgtgggggacaacctaagataggagccatgtaa
cctgctcattacaaaaacaaaagggggagatgttggacaccattttggca
atggtttgggccttgaggacaaacccaagcctagctcaattttgagacat
tgtttcagtcacttccatattggggtgactcaacaagacctgtttggctc
tgcctctgccctgctgttgctaatgtagagctttgccattggccctgtca
gttactccataccttctgtcaccctttctcacctcctacatcatcatctt
acaccaccaaaaatccccatcactatattccaaacttatataagtgagag
gctgatgccataaagttgagttccttcttcgacaagactcccagctctgt
gggtatcttttgggccattgacattcaccattccactcaggcccagagag
actctggtgggacttggacctctctcctctcacctggacctgctggcaag
gagctggcaatccaggacactctttggatcttgaatagtgactgagaata
tctggagtgatagttcttcctcagcataagtgttataaacagatcatcct
gatgtctctttgctggacaatatacaaatgcatttgattttagaatctct
gaaaacaagatttttttcagcaagaaaactaatcatgatccaatgggtaa
aatggaaaatttctgtttcttggaagactc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chrX_162147842_162149019
seq2: B6Ng01-092K01.b_43_1213

seq1  GAATTCCTTGATCTTATCCTTTGTAGTAATAGAGAATGAACCTAGAGCAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTGATCTTATCCTTTGTAGTAATAGAGAATGAACCTAGAGCAT  50

seq1  TGTGTATGCTGGGAACGGCTCTACCACTGATCTACACACACAAGCCCTGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTATGCTGGGAACGGCTCTACCACTGATCTACACACACAAGCCCTGA  100

seq1  GTTCCATAACCTGGAAACATCACAGTTTAGGAAAGGAAAGTTCAACTACA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCCATAACCTGGAAACATCACAGTTTAGGAAAGGAAAGTTCAACTACA  150

seq1  GGTTTAATGAGGGTCAGTTGAGAGATAAGGACAAAATTACAACAGGTAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTAATGAGGGTCAGTTGAGAGATAAGGACAAAATTACAACAGGTAGA  200

seq1  AGACTGGATACACCAACAATATCTATTTCTAACTGCCATACATTTGGGCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTGGATACACCAACAATATCTATTTCTAACTGCCATACATTTGGGCC  250

seq1  AGAAACCTATAGACACAAATGAGAATGGCTTATTTCCCCCATTCCACCTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAACCTATAGACACAAATGAGAATGGCTTATTTCCCCCATTCCACCTG  300

seq1  ATATCCTACTCACAGAAGCTTTTGCTTATAAAAAATGATTGCTTAGTTTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCCTACTCACAGAAGCTTTTGCTTATAAAAAATGATTGCTTAGTTTC  350

seq1  TGTCACTTAGGGAGGGCGTAATTCCAAGCAAAGCATATAACCATGTTTTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCACTTAGGGAGGGCGTAATTCCAAGCAAAGCATATAACCATGTTTTC  400

seq1  CTTGAATTGGGAGTTGACACTATTACCTGCCAATTGGGGCTCCTGGTGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGAATTGGGAGTTGACACTATTACCTGCCAATTGGGGCTCCTGGTGCT  450

seq1  TTTGAATCTGAAGGCAACAAAAACAAAACAAAACAAAACAAAAAAACAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAATCTGAAGGCAACAAAAACAAAACAAAACAAAACAAAAAAACAAA  500

seq1  CAAACAAAAAAAAACAGTACTACCTTCTTTGAATGACTGACAGCAGATTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACAAAAAAAAACAGTACTACCTTCTTTGAATGACTGACAGCAGATTG  550

seq1  AGATACTGCTCCTCAGTAATATCAGTATGGGCTCCATCTAGAAGGTATGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATACTGCTCCTCAGTAATATCAGTATGGGCTCCATCTAGAAGGTATGG  600

seq1  GGTTTTCTGAGGATCCACATGGTGGTTTCTATGTCTGAGAATAAAAATGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTTCTGAGGATCCACATGGTGGTTTCTATGTCTGAGAATAAAAATGA  650

seq1  GACACACAAAACAAAATAGACAACAGTAAAATGTTGGATCATCCAACCTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACACACAAAACAAAATAGACAACAGTAAAATGTTGGATCATCCAACCTG  700

seq1  ACAAACTAACATAATCCACATGGCTCAAAAAAAAAATGGGACTATGTAAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAACTAACATAATCCACATGGCTCAAAAAAAAAATGGGACTATGTAAT  750

seq1  GGTGATTTGAAGAATAGAGTTAAATTATATAATCCATTCAGTGGCAACCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGATTTGAAGAATAGAGTTAAATTATATAATCCATTCAGTGGCAACCC  800

seq1  TATGAAGGGTTGGAGTTATCAGCTGGAGAAATAAGGTCTTCATTTACATT  850
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  TATGAAGGGTTGGAGTTATCAGCTGGAGAAATAAAGTCTTCATTTACATT  850

seq1  TTTCCCCTGATATCCTGCCGTGTGATATCTGCTATACATGTGTGTAACTA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCCCTGATATCCTGCCGTGTGATATCTGCTATACATGTGTGTAACTA  900

seq1  TTAGCTCCTTTTATAAAATATTTTAAATTTATTTATTTCATGTGTTTTAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGCTCCTTTTATAAAATATTTTAAATTTATTTATTTCATGTGTTTTAA  950

seq1  TGAGTGTTTTGCTTGCACATATGCC-TATGCATCTTGTGCATATATTGTA  999
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTGTTTTGCTTGCACATATGCCTTATGCATCTTGTGCATATATTGTA  1000

seq1  CCTGCAGGACTCAAAAGAGGGCATCAAATTGTCCGGAACTGGAATTATAG  1049
      |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||
seq2  CCTGCAGGACTCAAAAGA-GGCATCAAATTGTTCGGAACTGG-ATTATAG  1048

seq1  ACAGGTAT-GAGCCATTAAGTTGTTGTTCACAATTGAATCTGGGA-TCCC  1097
      | |||||| |||||| ||||||||||||||||  || |||||||| ||| 
seq2  AAAGGTATGGAGCCA-TAAGTTGTTGTTCACA--TGGATCTGGGATTCCT  1095

seq1  TGCAAGAACAAGTACCCTACA-GTCTCCAGAAGTTTTTATTTTATTGTAT  1146
      |||||||||| |||||||||| |||||  |||| ||||||||  ||| ||
seq2  TGCAAGAACAGGTACCCTACAGGTCTC--GAAG-TTTTATTTATTTGGAT  1142

seq1  TAATGATAGGAATTAACGTTGCTGTTTTATTT  1178
      |||||| | ||||  |||||||   |||||||
seq2  TAATGA-ATGAAT--ACGTTGCCTGTTTATTT  1171

seq1: chrX_162283637_162284715
seq2: B6Ng01-092K01.g_68_1147 (reverse)

seq1  GAGTCTCCAAAGAAACCAGAAA-TTTCCATTTTACCCATTGGATCATGAT  49
      |||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCTTCCAAGAAA-CAGAAATTTTCCATTTTACCCATTGGATCATGAT  49

seq1  TAG-TCTCTTGCTGGAAAAAAATTCTGTTTTCAGAGA-TCTAAAATCAAA  97
      ||| | ||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||
seq2  TAGTTTTCTTGCT-GAAAAAAATCTTGTTTTCAGAGATTCTAAAATCAAA  98

seq1  TGCATTTGTATATTGTCCAGCAAAGAGACATCAGGATGATCTGTTTATAA  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATTTGTATATTGTCCAGCAAAGAGACATCAGGATGATCTGTTTATAA  148

seq1  CACTTATGCTGAGGAAGAACTATCACTCCAGATATTCTCAGTCACTATTC  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTATGCTGAGGAAGAACTATCACTCCAGATATTCTCAGTCACTATTC  198

seq1  AAGATCCAAAGAGTGTCCTGGATTGCCAGCTCCTTGCCAGCAGGTCCAGG  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATCCAAAGAGTGTCCTGGATTGCCAGCTCCTTGCCAGCAGGTCCAGG  248

seq1  TGAGAGGAGAGAGGTCCAAGTCCCACCAGAGTCTCTCTGGGCCTGAGTGG  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAGGAGAGAGGTCCAAGTCCCACCAGAGTCTCTCTGGGCCTGAGTGG  298

seq1  AATGGTGAATGTCAATGGCCCAAAAGATACCCACAGAGCTGGGAGTCTTG  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGTGAATGTCAATGGCCCAAAAGATACCCACAGAGCTGGGAGTCTTG  348

seq1  TCGAAGAAGGAACTCAACTTTATGGCATCAGCCTCTCACTTATATAAGTT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGAAGAAGGAACTCAACTTTATGGCATCAGCCTCTCACTTATATAAGTT  398

seq1  TGGAATATAGTGATGGGGATTTTTGGTGGTGTAAGATGATGATGTAGGAG  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAATATAGTGATGGGGATTTTTGGTGGTGTAAGATGATGATGTAGGAG  448

seq1  GTGAGAAAGGGTGACAGAAGGTATGGAGTAACTGACAGGGCCAATGGCAA  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGAAAGGGTGACAGAAGGTATGGAGTAACTGACAGGGCCAATGGCAA  498

seq1  AGCTCTACATTAGCAACAGCAGGGCAGAGGCAGAGCCAAACAGGTCTTGT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCTACATTAGCAACAGCAGGGCAGAGGCAGAGCCAAACAGGTCTTGT  548

seq1  TGAGTCACCCCAATATGGAAGTGACTGAAACAATGTCTCAAAATTGAGCT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTCACCCCAATATGGAAGTGACTGAAACAATGTCTCAAAATTGAGCT  598

seq1  AGGCTTGGGTTTGTCCTCAAGGCCCAAACCATTGCCAAAATGGTGTCCAA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTTGGGTTTGTCCTCAAGGCCCAAACCATTGCCAAAATGGTGTCCAA  648

seq1  CATCTCCCCCTTTTGTTTTTGTAATGAGCAGGTTACATGGCTCCTATCTT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTCCCCCTTTTGTTTTTGTAATGAGCAGGTTACATGGCTCCTATCTT  698

seq1  AGGTTGTCCCCCACATGGGGATCTTACCCATCTCTGGATAACATGTGTCA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTGTCCCCCACATGGGGATCTTACCCATCTCTGGATAACATGTGTCA  748

seq1  CTCTGGGTCAAAAAAGGGGTGCTCCACAACCTGTCTTAGCTTGTCTCAAC  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGGGTCAAAAAAGGGGTGCTCCACAACCTGTCTTAGCTTGTCTCAAC  798

seq1  ACATCTGAGATCTTACCTGTTGTAGGTCAGGTGAAGAGCTGAGGATGGGT  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCTGAGATCTTACCTGTTGTAGGTCAGGTGAAGAGCTGAGGATGGGT  848

seq1  GCTCATAAGCAGGGGGATATGTAGAGCCTGGCTCAGAAGAGACAAGTCTT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCATAAGCAGGGGGATATGTAGAGCCTGGCTCAGAAGAGACAAGTCTT  898

seq1  TGGTAATGGACCTCAACTTTGTGAAGCCAGATCACCTCTACCCTCTGATG  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTAATGGACCTCAACTTTGTGAAGCCAGATCACCTCTACCCTCTGATG  948

seq1  GATAAATTGAGTGAGTTTATTGAGCATACCTGGCCTGATAGTCAAGATAA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAATTGAGTGAGTTTATTGAGCATACCTGGCCTGATAGTCAAGATAA  998

seq1  GGAGAAGAAAGAGGCCAAGGAGGGGGAGGAAATAGGGTAATAGTCCATGA  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAAGAAAGAGGCCAAGGAGGGGGAGGAAATAGGGTAATAGTCCATGA  1048

seq1  AATCCAGTCCATAGCAGGTTGTCTCGGAATTC  1079
      ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCCAGTCCATAGCAGGTTGTCTCGGAATTC  1080