BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-093L23
ChromosomeX (Build37)
Map Location 122,580,273 - 122,706,801
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG626048
Upstream geneEG434843, EG665463, EG665522, LOC100038969, LOC100038978, EG665579, EG665611
Downstream geneLOC100040410, LOC100039903, LOC665679, 4932411N23Rik, Gm381, LOC100040472, Gm382
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-093L23.bB6Ng01-093L23.g
ACCDH905146DH905147
length1,0221,108
definitionDH905146|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-093L23, 5' end.DH905147|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-093L23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(122,580,273 - 122,581,294)(122,705,691 - 122,706,801)
sequence
gaattcttttaaactgacttggcttttattttattttattgaatttggaa
aaaaaatatctttgagaaagaatgtgtttatcattaatccccttgaatta
aggcaacattaaatggagaaaggcggctagaaaatgtaagacatattgag
agaatttggatgtctgtggacaaaatatttcattgtgcattcattttatg
ttttttgacatcttatgttcatatttttaatcacaaagccacaagtcctt
gaaatggaactttgtaaaatgaagttcataccaaaaatatatatattgaa
tttgtttaaaactaaaattagcatatcttagaattgggaatgattaaaaa
gctttgggaactctgtatgttttacattcgccaatgatactagtgctgat
gaaacatggtcaaacttttcagatacattaactttagatatgattacaaa
agataacatacttagtgaaaaagtatagatctggtaattgggactattat
atattaaattataactaaataaatctagattaaaagaatataagcagcta
tctaattgaacacagggtccacacaacaggaagaaaatccagtattgtat
tagaagtgtacttctcaccctaatctaagaaatttctctttaccataaat
ggaacctgttacagaaatccacactgggcataatgcaaagatcaatatat
catgcgaagcctagcctcaattgatataatagcacaactcctgcatccag
tatgaatcagaatttctggacatctgccatgagaccacctctcctagtaa
tgcctgcttgaccaaatcatgaataataaaagtatcaataaacatgttaa
tgtggaaagagaaaaattgcagtgttcccaaccacagaaaaagtactaca
ggtagataatgactagtgagaaaaggaacattgatctcttctaagcccat
gattgaccaatataaagtcatcagtcctgaaaccacataaatacaaaaca
taaacctggattaagcattgtg
gaattctttacatgattacaaaagaggtcgaatataaatgacatagtctt
tagttgaattgaacttttataaagagaaatttgacaaaaaataatattta
ctctatgggtgttttcaaaaaatagaatggtttgtatggaacaagttagt
attggaaggattagaagttccaagctatccttggttacatactaagttgg
ggccagcctaggctatatgacaacctgtctgaaaataggaaaattactgg
aaccagtagtttaccagtactttggagactgaatcatgagcaatatcaga
agtacaaggactgtcagtgccagaaagtataaacagaatttccccaaaca
aaaataatttaggagttatacttaggggcttgattatgttgccagggaat
aaaagcactgagatgagagtggtcagttatgaggagtgagtattgctctt
gcagagggctcacattgggtagctcacagtcaccttcagcttgagcttca
gaagacctctggcacctgtgggcatgtgcatttacttacatacgtatgta
cgtaccaacacacacacacacacacacacaaacttaaataatagggaaaa
gtactttgttttatctatcagtttaaaggaagtttgagttgaatgtactt
aaaagaggtgcctcataaccaaagtatgaaatctgctagtcttccacaag
ttaggtgactcagagtcactagtcaaataaattacatcctagatatgggc
agccatgaggtccactggataactgtggatagagattgatggtagagcta
ttggattatgtaaggggggggcttaaataaaactgagagattcacagtct
catgtgatataagctggctttgtttgtgtgttggtatatatagtattata
atcccttacttgcttcagacatattcatatagttcagactggtcctttta
tctcactatagctcaatatgacttatgaccactgatatcctgctttccac
ttcagtacatcaagggattaagagagggtacagcatggccctacttgatg
catgttagagattcaattcaaggcctcatgcatgagaataaaagaactct
acacaatt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chrX_122580273_122581294
seq2: B6Ng01-093L23.b_47_1068

seq1  GAATTCTTTTAAACTGACTTGGCTTTTATTTTATTTTATTGAATTTGGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTTAAACTGACTTGGCTTTTATTTTATTTTATTGAATTTGGAA  50

seq1  AAAAAATATCTTTGAGAAAGAATGTGTTTATCATTAATCCCCTTGAATTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAATATCTTTGAGAAAGAATGTGTTTATCATTAATCCCCTTGAATTA  100

seq1  AGGCAACATTAAATGGAGAAAGGCGGCTAGAAAATGTAAGACATATTGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAACATTAAATGGAGAAAGGCGGCTAGAAAATGTAAGACATATTGAG  150

seq1  AGAATTTGGATGTCTGTGGACAAAATATTTCATTGTGCATTCATTTTATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATTTGGATGTCTGTGGACAAAATATTTCATTGTGCATTCATTTTATG  200

seq1  TTTTTTGACATCTTATGTTCATATTTTTAATCACAAAGCCACAAGTCCTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTGACATCTTATGTTCATATTTTTAATCACAAAGCCACAAGTCCTT  250

seq1  GAAATGGAACTTTGTAAAATGAAGTTCATACCAAAAATATATATATTGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATGGAACTTTGTAAAATGAAGTTCATACCAAAAATATATATATTGAA  300

seq1  TTTGTTTAAAACTAAAATTAGCATATCTTAGAATTGGGAATGATTAAAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTTTAAAACTAAAATTAGCATATCTTAGAATTGGGAATGATTAAAAA  350

seq1  GCTTTGGGAACTCTGTATGTTTTACATTCGCCAATGATACTAGTGCTGAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTGGGAACTCTGTATGTTTTACATTCGCCAATGATACTAGTGCTGAT  400

seq1  GAAACATGGTCAAACTTTTCAGATACATTAACTTTAGATATGATTACAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACATGGTCAAACTTTTCAGATACATTAACTTTAGATATGATTACAAA  450

seq1  AGATAACATACTTAGTGAAAAAGTATAGATCTGGTAATTGGGACTATTAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATAACATACTTAGTGAAAAAGTATAGATCTGGTAATTGGGACTATTAT  500

seq1  ATATTAAATTATAACTAAATAAATCTAGATTAAAAGAATATAAGCAGCTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTAAATTATAACTAAATAAATCTAGATTAAAAGAATATAAGCAGCTA  550

seq1  TCTAATTGAACACAGGGTCCACACAACAGGAAGAAAATCCAGTATTGTAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAATTGAACACAGGGTCCACACAACAGGAAGAAAATCCAGTATTGTAT  600

seq1  TAGAAGTGTACTTCTCACCCTAATCTAAGAAATTTCTCTTTACCATAAAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAGTGTACTTCTCACCCTAATCTAAGAAATTTCTCTTTACCATAAAT  650

seq1  GGAACCTGTTACAGAAATCCACACTGGGCATAATGCAAAGATCAATATAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACCTGTTACAGAAATCCACACTGGGCATAATGCAAAGATCAATATAT  700

seq1  CATGCGAAGCCTAGCCTCAATTGATATAATAGCACAACTCCTGCATCCAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCGAAGCCTAGCCTCAATTGATATAATAGCACAACTCCTGCATCCAG  750

seq1  TATGAATCAGAATTTCTGGACATCTGCCATGAGACCACCTCTCCTAGTAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGAATCAGAATTTCTGGACATCTGCCATGAGACCACCTCTCCTAGTAA  800

seq1  TGCCTGCTTGACCAAATCATGAATAATAAAAGTATCAATAAACATGTTAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTGCTTGACCAAATCATGAATAATAAAAGTATCAATAAACATGTTAA  850

seq1  TGTGGAAGGAGAAAAATTGCAGTGTTCCCAACCACAGAAAAAGTACTACA  900
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGAAAGAGAAAAATTGCAGTGTTCCCAACCACAGAAAAAGTACTACA  900

seq1  GGTAGATAATGACTAGTGAGAAAAGGAACATTGATCTC-TCTAAGCCCCA  949
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||
seq2  GGTAGATAATGACTAGTGAGAAAAGGAACATTGATCTCTTCTAAG-CCCA  949

seq1  TGATTGACCAATATAAAGTCATCAGTCCTGAAACCACATAAATACAAAAC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTGACCAATATAAAGTCATCAGTCCTGAAACCACATAAATACAAAAC  999

seq1  ATAAACCTGGATTAAGCATTGTG  1022
      |||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAACCTGGATTAAGCATTGTG  1022

seq1: chrX_122705691_122706801
seq2: B6Ng01-093L23.g_69_1176 (reverse)

seq1  AATTG-GTAGAGTAC-TTTATTCTCATGCATGAAGCCTTGGATTTGATCT  48
      ||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||  ||||
seq2  AATTGTGTAGAGTTCTTTTATTCTCATGCATGAGGCCTTGAATTGAATCT  50

seq1  CTAACACTGCATCAAGTAGGG-CATGCTGGTACCTCTCTTTAATCCTAGA  97
      |||||| |||||||||||||| |||||||   |||||||| |  ||| ||
seq2  CTAACA-TGCATCAAGTAGGGCCATGCTGTACCCTCTCTTAATCCCTTGA  99

seq1  TGTACTGGAAAGT-GAAAGCAGGAATATCAGTGGTTCAT-AGTCATATTG  145
      |||||||  |||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||
seq2  TGTACTG--AAGTGGAAAGCAGG-ATATCAGTGG-TCATAAGTCATATTG  145

seq1  AGCTATTAAGTGAGAT-AAAGGA-CAGTCTGAACTATATGGAATATGTCT  193
      ||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||
seq2  AGCTAT--AGTGAGATAAAAGGACCAGTCTGAACTATAT-GAATATGTCT  192

seq1  TGAAAGCAAGTAA-GGATTATAATACTATATAATACCAACACACAAACAA  242
         |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
seq2  --GAAGCAAGTAAGGGATTATAATACTATAT-ATACCAACACACAAAC-A  238

seq1  AAGCCAGCTTATATCACATGAGACTGTGAATCTCTCAGTTTTATTTAAG-  291
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  AAGCCAGCTTATATCACATGAGACTGTGAATCTCTCAGTTTTATTTAAGC  288

seq1  CCTCCCCTTACATAATCCAATAGCTCTACCATCAATCTCTATCCACAGTT  341
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCCCTTACATAATCCAATAGCTCTACCATCAATCTCTATCCACAGTT  338

seq1  ATCCAGTGGACCTCATGGCTGCCCATATCTAGGATGTAATTTATTTGACT  391
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCAGTGGACCTCATGGCTGCCCATATCTAGGATGTAATTTATTTGACT  388

seq1  AGTGACTCTGAGTCACCTAACTTGTGGAAGACTAGCAGATTTCATACTTT  441
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGACTCTGAGTCACCTAACTTGTGGAAGACTAGCAGATTTCATACTTT  438

seq1  GGTTATGAGGCACCTCTTTTAAGTACATTCAACTCAAACTTCCTTTAAAC  491
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTATGAGGCACCTCTTTTAAGTACATTCAACTCAAACTTCCTTTAAAC  488

seq1  TGATAGATAAAACAAAGTACTTTTCCCTATTATTTAAGTTTGTGTGTGTG  541
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAGATAAAACAAAGTACTTTTCCCTATTATTTAAGTTTGTGTGTGTG  538

seq1  TGTGTGTGTGTGTTGGTACGTACATACGTATGTAAGTAAATGCACATGCC  591
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTGTGTTGGTACGTACATACGTATGTAAGTAAATGCACATGCC  588

seq1  CACAGGTGCCAGAGGTCTTCTGAAGCTCAAGCTGAAGGTGACTGTGAGCT  641
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGGTGCCAGAGGTCTTCTGAAGCTCAAGCTGAAGGTGACTGTGAGCT  638

seq1  ACCCAATGTGAGCCCTCTGCAAGAGCAATACTCACTCCTCATAACTGACC  691
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCAATGTGAGCCCTCTGCAAGAGCAATACTCACTCCTCATAACTGACC  688

seq1  ACTCTCATCTCAGTGCTTTTATTCCCTGGCAACATAATCAAGCCCCTAAG  741
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTCATCTCAGTGCTTTTATTCCCTGGCAACATAATCAAGCCCCTAAG  738

seq1  TATAACTCCTAAATTATTTTTGTTTGGGGAAATTCTGTTTATACTTTCTG  791
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAACTCCTAAATTATTTTTGTTTGGGGAAATTCTGTTTATACTTTCTG  788

seq1  GCACTGACAGTCCTTGTACTTCTGATATTGCTCATGATTCAGTCTCCAAA  841
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTGACAGTCCTTGTACTTCTGATATTGCTCATGATTCAGTCTCCAAA  838

seq1  GTACTGGTAAACTACTGGTTCCAGTAATTTTCCTATTTTCAGACAGGTTG  891
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACTGGTAAACTACTGGTTCCAGTAATTTTCCTATTTTCAGACAGGTTG  888

seq1  TCATATAGCCTAGGCTGGCCCCAACTTAGTATGTAACCAAGGATAGCTTG  941
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATATAGCCTAGGCTGGCCCCAACTTAGTATGTAACCAAGGATAGCTTG  938

seq1  GAACTTCTAATCCTTCCAATACTAACTTGTTCCATACAAACCATTCTATT  991
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTTCTAATCCTTCCAATACTAACTTGTTCCATACAAACCATTCTATT  988

seq1  TTTTGAAAACACCCATAGAGTAAATATTATTTTTTGTCAAATTTCTCTTT  1041
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGAAAACACCCATAGAGTAAATATTATTTTTTGTCAAATTTCTCTTT  1038

seq1  ATAAAAGTTCAATTCAACTAAAGACTATGTCATTTATATTCGACCTCTTT  1091
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAAGTTCAATTCAACTAAAGACTATGTCATTTATATTCGACCTCTTT  1088

seq1  TGTAATCATGTAAAGAATTC  1111
      ||||||||||||||||||||
seq2  TGTAATCATGTAAAGAATTC  1108