BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-098D03
ChromosomeX (Build37)
Map Location 160,973,204 - 161,037,726
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAsb9
Upstream geneGrpr, 1700045I19Rik, Ap1s2, Zrsr2, Car5b, Siah1b, Tmem27, Ace2, Bmx, Pir, Figf, Piga, Asb11
Downstream geneMospd2, Fancb, LOC627045, Glra2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-098D03.bB6Ng01-098D03.g
ACCDH908353DH908354
length1,097723
definitionDH908353|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-098D03, 5' end.DH908354|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-098D03, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(160,973,204 - 160,974,309)(161,037,004 - 161,037,726)
sequence
gaattctgttcatcacgaattccccacattgaaagtctcttgggaaaggg
gatggctagcactgctctgtgacctcttttgttcttgtgaccatttagga
gtatctgtgaatcaaggcaaaggcttggattctcctcttcacgtagtggc
caggatgtccagtgtggagctggtgcatctgctcatggatttcggagcaa
acgctcaagccaagaatgctgatggcaaacgtcctgtggacctggtgcct
ctggagagtcctttgatccagatcttcttgcagaatgaaggtgcctctct
attgccctaatcgaagccctaacccatagagactcctttgatccctagtg
tgaggcaggtacttactaagttctgacttccagttctataaagatcactc
tctgccctcatcatgcatggggaacctgagataattcaacaaggcacatc
attgctaatgaagtaaaatttagccttttgttgtttgatatgttggagtc
aggctgtttggccagtttttaaagaggtcagctatgatttaaaaatattt
gatattaaagttaaatgcaacatgctttagagcagtggttctcaaccttc
ctaatgctgtgaccctttaatacaagttcctcctgtagtggtgaccccca
accataaagtgatttttgttgctacttcataattgtaattttgctacgtg
tgtgaataataatgtaaatgcctatgttttctgatagtcttagccaatcc
ctgtgaaagccattcaaccttctaggggtctcaacccacaggctgagaac
cacttctttagagtgattctgcagatgccttcaaggtattgtctggtttc
tcagatgtctgaactgccccatataccagtcaaatcactgagtaaatgat
tgctggggttagatgtagcaactaagagtttagggcatttgtttatgatt
tacaccaatcaagatacattactcttgcagtttaccacaaataagaactc
acactacccacacaaatactaaacagtggtcttgcaccagagagggcatt
tcatgcagcaaagaacccttcaggtgcaaggaaacctgattgcttat
gaattcatggcaattgtgtggttgtgcagtatttgctgaaaggagatgat
tcttaccaatgacttatcaccctggttgttcacagcaatagacggtcatg
aactttatatcagtggtgacctgggcagggaggtaatttgttaggttatg
ttacaaagactcccaaagtaagagtgattcagagcttgagctatgtcatt
tgacttgcagttctttccactttccttcagtgagatattgaatttacaag
aagaattaatgccttttgtccaacctgtaggatgggcttaatcctaaaac
atgcttaacttttaggtaggacagcaacatccccatttctgcctttcaaa
taagacagagagctttcatgggtctctaagagtgactatctttccacatg
ttcttgacaagtctcttccaatatcttttctttggtctaaactagcttaa
gacttcacagccaggaagaggtttgcagcctcctagaaggaacaacaata
tgaactagccagtacccccagagctccctgggactaaagcaccaaccaaa
gagtacacatggagggactcattgctccagccacatatgtagcagaggat
ggcctagtagatcatcaatgggaggagaggcccttggtcctgtggaggtt
ctatgccccagtatagggaaatgccagggccaggaagcaggagtgggtgg
gttgatgagcagggggtgggggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chrX_160973204_160974309
seq2: B6Ng01-098D03.b_44_1140

seq1  GAATTCTGTTCATCACGAATTCCCCACATTGAAAGTCTCTTGGGAAAGGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGTTCATCACGAATTCCCCACATTGAAAGTCTCTTGGGAAAGGG  50

seq1  GATGGCTAGCACTGCTCTGTGACCTCTTTTGTTCTTGTGACCATTTAGGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGCTAGCACTGCTCTGTGACCTCTTTTGTTCTTGTGACCATTTAGGA  100

seq1  GTATCTGTGAATCAAGGCAAAGGCTTGGATTCTCCTCTTCACGTAGTGGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATCTGTGAATCAAGGCAAAGGCTTGGATTCTCCTCTTCACGTAGTGGC  150

seq1  CAGGATGTCCAGTGTGGAGCTGGTGCATCTGCTCATGGATTTCGGAGCAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGATGTCCAGTGTGGAGCTGGTGCATCTGCTCATGGATTTCGGAGCAA  200

seq1  ACGCTCAAGCCAAGAATGCTGATGGCAAACGTCCTGTGGACCTGGTGCCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGCTCAAGCCAAGAATGCTGATGGCAAACGTCCTGTGGACCTGGTGCCT  250

seq1  CTGGAGAGTCCTTTGATCCAGATCTTCTTGCAGAATGAAGGTGCCTCTCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAGAGTCCTTTGATCCAGATCTTCTTGCAGAATGAAGGTGCCTCTCT  300

seq1  ATTGCCCTAATCGAAGCCCTAACCCATAGAGACTCCTTTGATCCCTAGTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCCCTAATCGAAGCCCTAACCCATAGAGACTCCTTTGATCCCTAGTG  350

seq1  TGAGGCAGGTACTTACTAAGTTCTGACTTCCAGTTCTATAAAGATCACTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGCAGGTACTTACTAAGTTCTGACTTCCAGTTCTATAAAGATCACTC  400

seq1  TCTGCCCTCATCATGCATGGGGAACCTGAGATAATTCAACAAGGCACATC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCCCTCATCATGCATGGGGAACCTGAGATAATTCAACAAGGCACATC  450

seq1  ATTGCTAATGAAGTAAAATTTAGCCTTTTGTTGTTTGATATGTTGGAGTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCTAATGAAGTAAAATTTAGCCTTTTGTTGTTTGATATGTTGGAGTC  500

seq1  AGGCTGTTTGGCCAGTTTTTAAAGAGGTCAGCTATGATTTAAAAATATTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTGTTTGGCCAGTTTTTAAAGAGGTCAGCTATGATTTAAAAATATTT  550

seq1  GATATTAAAGTTAAATGCAACATGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACCTTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATTAAAGTTAAATGCAACATGCTTTAGAGCAGTGGTTCTCAACCTTC  600

seq1  CTAATGCTGTGACCCTTTAATACAAGTTCCTCCTGTAGTGGTGACCCCCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATGCTGTGACCCTTTAATACAAGTTCCTCCTGTAGTGGTGACCCCCA  650

seq1  ACCATAAAGTGATTTTTGTTGCTACTTCATAATTGTAATTTTGCTACGTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATAAAGTGATTTTTGTTGCTACTTCATAATTGTAATTTTGCTACGTG  700

seq1  TGTGAATAATAATGTAAATGCCTATGTTTTCTGATAGTCTTAGCCAATCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAATAATAATGTAAATGCCTATGTTTTCTGATAGTCTTAGCCAATCC  750

seq1  CTGTGAAAGCCATTCAACCTTCTAAGGGGTCTCAACCCACAGGCTGAGAA  800
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGAAAGCCATTCAACCTTCT-AGGGGTCTCAACCCACAGGCTGAGAA  799

seq1  CCACTTCTTTAGAGTGATTCTGCAGATGCCTTCAAGGTATTGTCTGGTTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTTCTTTAGAGTGATTCTGCAGATGCCTTCAAGGTATTGTCTGGTTT  849

seq1  CTCAAGATGTCTGAACTGCCCCATATACCAGTCAAATCACTGAGTAAATG  900
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTC-AGATGTCTGAACTGCCCCATATACCAGTCAAATCACTGAGTAAATG  898

seq1  ATTGCTGGGGTTAAGATGTAGCAACTAAGAGTTTAGGGCATTTGTTTAAT  950
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  ATTGCTGGGGTT-AGATGTAGCAACTAAGAGTTTAGGGCATTTGTTT-AT  946

seq1  GATTTACACCAATCAAGATACATTTACTCTTGCAAGTTTACCACAAATAA  1000
      |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||
seq2  GATTTACACCAATCAAGATACA-TTACTCTTGC-AGTTTACCACAAATAA  994

seq1  GAACTCACACTACCCACACAAATAACTAAACAGTGGTC-TGCACAGGAGA  1049
      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||| 
seq2  GAACTCACACTACCCACACAAAT-ACTAAACAGTGGTCTTGCACCAGAG-  1042

seq1  AGGGCATTTCATGCAGCAAAGAACCCTTCAGGTTGCAAGGAAACCTGATT  1099
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  AGGGCATTTCATGCAGCAAAGAACCCTTCAGG-TGCAAGGAAACCTGATT  1091

seq1  GCCTTAT  1106
      | |||||
seq2  G-CTTAT  1097

seq1: chrX_161037004_161037726
seq2: B6Ng01-098D03.g_67_789 (reverse)

seq1  CCCCCCACCCCCTGCTCATCAACCCACCCACTCCTGCTTCCTGGCCCTGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCCACCCCCTGCTCATCAACCCACCCACTCCTGCTTCCTGGCCCTGG  50

seq1  CATTTCCCTATACTGGGGCATAGAACCTCCACAGGACCAAGGGCCTCTCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTCCCTATACTGGGGCATAGAACCTCCACAGGACCAAGGGCCTCTCC  100

seq1  TCCCATTGATGATCTACTAGGCCATCCTCTGCTACATATGTGGCTGGAGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCATTGATGATCTACTAGGCCATCCTCTGCTACATATGTGGCTGGAGC  150

seq1  AATGAGTCCCTCCATGTGTACTCTTTGGTTGGTGCTTTAGTCCCAGGGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAGTCCCTCCATGTGTACTCTTTGGTTGGTGCTTTAGTCCCAGGGAG  200

seq1  CTCTGGGGGTACTGGCTAGTTCATATTGTTGTTCCTTCTAGGAGGCTGCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGGGGGTACTGGCTAGTTCATATTGTTGTTCCTTCTAGGAGGCTGCA  250

seq1  AACCTCTTCCTGGCTGTGAAGTCTTAAGCTAGTTTAGACCAAAGAAAAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTCTTCCTGGCTGTGAAGTCTTAAGCTAGTTTAGACCAAAGAAAAGA  300

seq1  TATTGGAAGAGACTTGTCAAGAACATGTGGAAAGATAGTCACTCTTAGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGGAAGAGACTTGTCAAGAACATGTGGAAAGATAGTCACTCTTAGAG  350

seq1  ACCCATGAAAGCTCTCTGTCTTATTTGAAAGGCAGAAATGGGGATGTTGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCATGAAAGCTCTCTGTCTTATTTGAAAGGCAGAAATGGGGATGTTGC  400

seq1  TGTCCTACCTAAAAGTTAAGCATGTTTTAGGATTAAGCCCATCCTACAGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCTACCTAAAAGTTAAGCATGTTTTAGGATTAAGCCCATCCTACAGG  450

seq1  TTGGACAAAAGGCATTAATTCTTCTTGTAAATTCAATATCTCACTGAAGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGACAAAAGGCATTAATTCTTCTTGTAAATTCAATATCTCACTGAAGG  500

seq1  AAAGTGGAAAGAACTGCAAGTCAAATGACATAGCTCAAGCTCTGAATCAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTGGAAAGAACTGCAAGTCAAATGACATAGCTCAAGCTCTGAATCAC  550

seq1  TCTTACTTTGGGAGTCTTTGTAACATAACCTAACAAATTACCTCCCTGCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTACTTTGGGAGTCTTTGTAACATAACCTAACAAATTACCTCCCTGCC  600

seq1  CAGGTCACCACTGATATAAAGTTCATGACCGTCTATTGCTGTGAACAACC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTCACCACTGATATAAAGTTCATGACCGTCTATTGCTGTGAACAACC  650

seq1  AGGGTGATAAGTCATTGGTAAGAATCATCTCCTTTCAGCAAATACTGCAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTGATAAGTCATTGGTAAGAATCATCTCCTTTCAGCAAATACTGCAC  700

seq1  AACCACACAATTGCCATGAATTC  723
      |||||||||||||||||||||||
seq2  AACCACACAATTGCCATGAATTC  723