BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-130G20
ChromosomeX (Build37)
Map Location 128,084,273 - 128,189,279
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC665799, LOC670449
Downstream geneLOC245600, EG631264
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-130G20.bB6Ng01-130G20.g
ACCDH931745DH931746
length1,0281,087
definitionDH931745|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-130G20, 5' end.DH931746|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-130G20, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(128,188,256 - 128,189,279)(128,084,273 - 128,085,376)
sequence
gaattcagagtaatttgttaccccatgcattaatgttgatagtatattac
atctactttgtaaaacagtatctattttagacttgccataataaaatgtg
acaaacatagccactataataacaactcagaattttatttctgaacaagt
ttaaaagccagacatttggaatcaagatgtctgttgctgcagctctactc
ccatagtttggtgggggaagttgtttcttgtttctcccagcatctggtgg
ctttagacattctttgactatatagtgacagtatttagtgacagtacaac
tgcaatctctgccactgtcttctcccagccttctcattttctcctaaatc
ttcacgtctctttctcaaaaagacacttgtcggtgtatttaggactatct
gaatgaaataaaaaagatcctaccttgacttaatagaacaggtagggaat
ctttgtccaaatactgttatatttatcaatatagacataacttattggag
tttaataatcaattctttacacatggtttgatagactccttaaatgaact
aaacattaagccaaccattccaatccctaggtacttctcgaaaccacata
gctcaataaagacttgtatattaatacttatataagcctcagttgtaata
tcaaaaacattcttcaatgtatgaatgaacagcttttattcatacagatg
aatattatttagcagcgtaagcaatagcagaagggaaattaatcattctg
gattctttgaaattatcacattagtacacattcattaattagatgagaag
taaaatgagagaacataccatatgaaatcatttattgaaagttgtcctaa
tcattaattacaaaaagcagatcagtgctaacctgtgagtatgggatgta
aaagtatcctttattcgcctggtatgattgtcatttcagagattactgct
gaatgaacactctttttcactctctctgactttgggtggtggttcactca
ctgtttgctcaaactcttctcagatgat
gaattcaaggcaagaactggaaaaaaaaagaaaatgatgcaaaggctata
aatgaacgtaccttattggccagctccccatgtcccactccacctgcatt
cttatagcactgaccaccaacacaggattggtaccatccacagtgaagtg
ggtcatcctacatcaatcatcaacttctaaatgcatcagaagcttgccct
caaagcttgcctcaaagcgggtttgggcatttggacaaggaagtcccctc
ttctcaaatgatactagtctgagtttgtgttgagtcactacctcagtgtg
tgtatgtatgaatggtagaaaagtgaagaaagaatatcttaaaaaccata
tagcttataagtaaatatttaaacatgctttattttaggtgtactttatg
catgtttcctgaatagtttgcagtcttagatacttattgtgaagatatag
agatataaattccaaagtatttggattactggggtactgtcctcggaagg
gataagtataattcttgtggggtccctagttcttaaatgctttttataaa
ataacaaacgttgccattccccctctctgcatcccatgtcacacatactc
ccaccatgatgcaatctgagattaaaccttatctctcaccatgatcccat
acataaagctggcctatcttggactttcaacctagaaacctctaaccaaa
gtaaaaccccttaaaaatccaaccttccgtatttctttataaaaaaaaat
gaagttataaagaaactttattcactaagccaattccccaggctctacaa
taatgcttgacactagatgttaggtcaaaagggaaaagcagttaaatttc
atactaagaaaaatttggaataatttattttaagacacaatatagtggtt
aagttaaatcaattttagtcaaagaaggatagcttaatagactacatgat
gatttctaataaattttattattgcaatataatgtatttctgaaaaagta
aatgatcctgtcaggatttccatgctgctgtatatgttaatattgagatg
gggtagaagttatcatttaagttcatgaaaattactt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chrX_128188256_128189279
seq2: B6Ng01-130G20.b_47_1063 (reverse)

seq1  AGAGTTTGAAGCAAAACAGTTGAGTTGAACCAACCACCCAAAGTTCAGAG  50
      |||||||| ||| |||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||
seq2  AGAGTTTG-AGC-AAACAG-TGAG-TGAACC-ACCACCCAAAG-TCAGAG  44

seq1  AGAGTGAAAAAGAGTGTTCATTCAGCAGTAATTCTCTGAAATGACAATCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  AGAGTGAAAAAGAGTGTTCATTCAGCAGTAA-TCTCTGAAATGACAATCA  93

seq1  TACCAGGCGAATAAAGGATACTTTTACATCCCATACTCACAGGTTAGCAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCAGGCGAATAAAGGATACTTTTACATCCCATACTCACAGGTTAGCAC  143

seq1  TGATCTGCTTTTTGTAATTAATGATTAGGACAACTTTCAATAAATGATTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATCTGCTTTTTGTAATTAATGATTAGGACAACTTTCAATAAATGATTT  193

seq1  CATATGGTATGTTCTCTCATTTTACTTCTCATCTAATTAATGAATGTGTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATGGTATGTTCTCTCATTTTACTTCTCATCTAATTAATGAATGTGTA  243

seq1  CTAATGTGATAATTTCAAAGAATCCAGAATGATTAATTTCCCTTCTGCTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATGTGATAATTTCAAAGAATCCAGAATGATTAATTTCCCTTCTGCTA  293

seq1  TTGCTTACGCTGCTAAATAATATTCATCTGTATGAATAAAAGCTGTTCAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTTACGCTGCTAAATAATATTCATCTGTATGAATAAAAGCTGTTCAT  343

seq1  TCATACATTGAAGAATGTTTTTGATATTACAACTGAGGCTTATATAAGTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATACATTGAAGAATGTTTTTGATATTACAACTGAGGCTTATATAAGTA  393

seq1  TTAATATACAAGTCTTTATTGAGCTATGTGGTTTCGAGAAGTACCTAGGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATATACAAGTCTTTATTGAGCTATGTGGTTTCGAGAAGTACCTAGGG  443

seq1  ATTGGAATGGTTGGCTTAATGTTTAGTTCATTTAAGGAGTCTATCAAACC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGAATGGTTGGCTTAATGTTTAGTTCATTTAAGGAGTCTATCAAACC  493

seq1  ATGTGTAAAGAATTGATTATTAAACTCCAATAAGTTATGTCTATATTGAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGTAAAGAATTGATTATTAAACTCCAATAAGTTATGTCTATATTGAT  543

seq1  AAATATAACAGTATTTGGACAAAGATTCCCTACCTGTTCTATTAAGTCAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATATAACAGTATTTGGACAAAGATTCCCTACCTGTTCTATTAAGTCAA  593

seq1  GGTAGGATCTTTTTTATTTCATTCAGATAGTCCTAAATACACCGACAAGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAGGATCTTTTTTATTTCATTCAGATAGTCCTAAATACACCGACAAGT  643

seq1  GTCTTTTTGAGAAAGAGACGTGAAGATTTAGGAGAAAATGAGAAGGCTGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTTTTGAGAAAGAGACGTGAAGATTTAGGAGAAAATGAGAAGGCTGG  693

seq1  GAGAAGACAGTGGCAGAGATTGCAGTTGTACTGTCACTAAATACTGTCAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAGACAGTGGCAGAGATTGCAGTTGTACTGTCACTAAATACTGTCAC  743

seq1  TATATAGTCAAAGAATGTCTAAAGCCACCAGATGCTGGGAGAAACAAGAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATAGTCAAAGAATGTCTAAAGCCACCAGATGCTGGGAGAAACAAGAA  793

seq1  ACAACTTCCCCCACCAAACTATGGGAGTAGAGCTGCAGCAACAGACATCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACTTCCCCCACCAAACTATGGGAGTAGAGCTGCAGCAACAGACATCT  843

seq1  TGATTCCAAATGTCTGGCTTTTAAACTTGTTCAGAAATAAAATTCTGAGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTCCAAATGTCTGGCTTTTAAACTTGTTCAGAAATAAAATTCTGAGT  893

seq1  TGTTATTATAGTGGCTATGTTTGTCACATTTTATTATGGCAAGTCTAAAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTATTATAGTGGCTATGTTTGTCACATTTTATTATGGCAAGTCTAAAA  943

seq1  TAGATACTGTTTTACAAAGTAGATGTAATATACTATCAACATTAATGCAT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATACTGTTTTACAAAGTAGATGTAATATACTATCAACATTAATGCAT  993

seq1  GGGGTAACAAATTACTCTGAATTC  1024
      ||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGTAACAAATTACTCTGAATTC  1017

seq1: chrX_128084273_128085376
seq2: B6Ng01-130G20.g_66_1152

seq1  GAATTCAAGGCAAGAACTGGAAAAAAAAAGAAAATGATGCAAAGGCTATA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGGCAAGAACTGGAAAAAAAAAGAAAATGATGCAAAGGCTATA  50

seq1  AATGAACGTACCTTATTGGCCAGCTCCCCATGTCCCACTCCACCTGCATT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAACGTACCTTATTGGCCAGCTCCCCATGTCCCACTCCACCTGCATT  100

seq1  CTTATAGCACTGACCACCAACACAGGATTGGTACCATCCACAGTGAAGTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATAGCACTGACCACCAACACAGGATTGGTACCATCCACAGTGAAGTG  150

seq1  GGTCATCCTACATCAATCATCAACTTCTAAATGCATCAGAAGCTTGCCCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCATCCTACATCAATCATCAACTTCTAAATGCATCAGAAGCTTGCCCT  200

seq1  CAAAGCTTGCCTCAAAGCGGGTTTGGGCATTTGGACAAGGAAGTCCCCTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGCTTGCCTCAAAGCGGGTTTGGGCATTTGGACAAGGAAGTCCCCTC  250

seq1  TTCTCAAATGATACTAGTCTGAGTTTGTGTTGAGTCACTACCTCAGTGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCAAATGATACTAGTCTGAGTTTGTGTTGAGTCACTACCTCAGTGTG  300

seq1  TGTATGTATGAATGGTAGAAAAGTGAAGAAAGAATATCTTAAAAACCATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATGTATGAATGGTAGAAAAGTGAAGAAAGAATATCTTAAAAACCATA  350

seq1  TAGCTTATAAGTAAATATTTAAACATGCTTTATTTTAGGTGTACTTTATG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTTATAAGTAAATATTTAAACATGCTTTATTTTAGGTGTACTTTATG  400

seq1  CATGTTTCCTGAATAGTTTGCAGTCTTAGATACTTATTGTGAAGATATAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTTTCCTGAATAGTTTGCAGTCTTAGATACTTATTGTGAAGATATAG  450

seq1  AGATATAAATTCCAAAGTATTTGGATTACTGGGGTACTGTCCTCGGAAGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATATAAATTCCAAAGTATTTGGATTACTGGGGTACTGTCCTCGGAAGG  500

seq1  GATAAGTATAATTCTTGTGGGGTCCCTAGTTCTTAAATGCTTTTTATAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAGTATAATTCTTGTGGGGTCCCTAGTTCTTAAATGCTTTTTATAAA  550

seq1  ATAACAAACGTTGCCATTCCCCCTCTCTGCATCCCATGTCACACATACTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACAAACGTTGCCATTCCCCCTCTCTGCATCCCATGTCACACATACTC  600

seq1  CCACCATGATGCAATCTGAGATTAAACCTTATCTCTCACCATGATCCCAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCATGATGCAATCTGAGATTAAACCTTATCTCTCACCATGATCCCAT  650

seq1  ACATAAAGCTGGCCTATCTTGGACTTTCAACCTAGAAACCTCTAACCAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAAAGCTGGCCTATCTTGGACTTTCAACCTAGAAACCTCTAACCAAA  700

seq1  GTAAAACCCCTTAAAAATCCAACCTTCCGTATTTCTTTATAAAAAAAAAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAAACCCCTTAAAAATCCAACCTTCCGTATTTCTTTATAAAAAAAAAT  750

seq1  GAAGTTATAAAGAAACTTTATTCACTAAGCCAATTCCCCAGGCTCTACAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTTATAAAGAAACTTTATTCACTAAGCCAATTCCCCAGGCTCTACAA  800

seq1  TAATGCTTGACACTAGATGTTAGGTCAAAAGGGAAAAGCAGTTAAATTTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGCTTGACACTAGATGTTAGGTCAAAAGGGAAAAGCAGTTAAATTTC  850

seq1  ATACTAAGAAAAATTTGGAATAATTTAATTTTAAGACACAATATAAGTGG  900
      |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||
seq2  ATACTAAGAAAAATTTGGAATAATTT-ATTTTAAGACACAATAT-AGTGG  898

seq1  TTAAGTTAAATCAATTTTAGTCAAAGAAGAATAGCTTAATTAGAACTACA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||
seq2  TTAAGTTAAATCAATTTTAGTCAAAGAAGGATAGCTTAA-TAG-ACTACA  946

seq1  TGATGATTTCTTAATAAATTTTATTATTGCAATATTAATGTTAATTTCCT  1000
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||
seq2  TGATGATTTC-TAATAAATTTTATTATTGCAATA-TAATGT--ATTT-CT  991

seq1  GAAAAAAGTAAATGATCCTGTCA-GATTTCCAATGCTGCTGTATATGGTT  1049
      | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |
seq2  G-AAAAAGTAAATGATCCTGTCAGGATTTCC-ATGCTGCTGTATATG--T  1037

seq1  AAATATTGAAGATGGGGTAGAAGAGTTATCATTTTAGAGTACATGAAAAT  1099
       ||||||| ||||||||||||  |||||||||||   ||| |||||||||
seq2  TAATATTG-AGATGGGGTAGA--AGTTATCATTT--AAGTTCATGAAAAT  1082

seq1  TACTT  1104
      |||||
seq2  TACTT  1087