BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-133N07
ChromosomeX (Build37)
Map Location 82,286,953 - 82,428,401
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDmd, LOC100042296
Upstream geneLOC100042306
Downstream geneLOC669833, 1600014K23Rik, Map3k7ip3, Gyk, LOC100042350, LOC629340, LOC100041562, 5430427O19Rik, 1700072E05Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-133N07.bB6Ng01-133N07.g
ACCDH934280DH934281
length1,1901,109
definitionDH934280|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-133N07, 5' end.DH934281|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-133N07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(82,427,193 - 82,428,401)(82,286,953 - 82,288,067)
sequence
gaattcattgacttctcaaaggtgtgcagtatgttttcgtgctctatgat
gtcattttcacttccaacagtccattagctgtattcagatcttatgtaca
aaacaattctgatggagattgccctaaatctctgacatgtagtaaagaaa
accaccaaaaacatatcttcttctatttgagaacaaatgaaccctggctt
tcctataaggtttgccttcttgggacctggaggtgccctctactctggtg
gagatttttgaacatcactggatttggttcaactattctctctttcctcc
tgtatccttatcttcttagaaccctcatctaccttcttcggcatctgtga
atctccattatcacttcaatgatctcagtatcctgctgattgaattgctc
aatcctggctctactccagcaggaactgtacatactctaaccttttccga
gatctccacgtgcaccacgcttccaagttgagtgagaacctacactgtca
atgcttaaataaaggaagaatttgaaatccttcctaataccccatttgtt
caactttcttgatcacaatctcactcctctgacttctatctatccattct
cattttctctccaccccttcatttttgagatgttgtctcactatagccct
gtctggcctagaattcactacatgaacccagctggcctagaacttgcaac
gatcaccctgcctctgctttctaactgttgggcttgcaaatgtgagcccc
cacacccatgtttaccttaatctcttgatcttccacagtaacacatttct
accttcaaccctatttctgcccttgtagtctgagttccacatttttgtct
ctctttaatctaggcaatgaatcatctcaagtatgcattcctacaccagg
ctttgagtgagaacaatgtagtctgtgtgtgagttaatactgatttgagg
ggctgttagagctgtggtgtcactcttttgctcagtcatatcccaaaata
gatcctctcccctcggctcagcgtatctgggactgcatcatgttattaca
ttaagatcttctacaaatatgggaatgccagaaaattcggttaggatcta
ggaaaaaaagatacagtctagggttgaccatgctactcctcataagagga
aatgaggaccagatcaatactggggggcattcttaaacat
gaattcactaattggggttttcacctgctgtgcgtctaatcgaatacaaa
accttatttgtagctgaagaggaagagagattatgcagagtgtcagaatt
tctgcctagttttgaaattcctgttatttggcacaatccggttgggaaag
gcagacaaaatagttacagctctgagctgttaaggtggaccaggaatttt
gcagcagatgtagttgcaccaccttaacccgttctccatttttagcacga
ggtggtgtagttcataggagcctggtagtgctatatagctggcaggctaa
taggcttgctgaattctttcccactaagcgactaccggcctgtgaggtta
atgaagtgtgcctttattttagtgaagatgctaaacttcacatcttttta
gatgttcagcttgatataggtggctctgtgaagctttaagaaatcgtatt
aaatgaaaactgcatgcaattgaaggagagttcgactttatctggaacct
gtctggtgaaatctctggtgtagttggcagctgtctcagaaaacttttcc
tggcctggcttatcctgcttccctgcaaaagaagagcatggcaaaaataa
gctttggtgggagtttgatgtgctctgggtctgaaagctctgctttcaga
cttggttgttgatggtttaacaatgatctagaggcattattatatgtatt
ttaattagtatgccatcacatttgccctaagtggcagtgattcacagtta
tggtaagcatttgttagaagtctgattcatggtccatggctagagctctc
actatgcaaagagaagcatacagatattatatgcttactgggtatccagg
tgcatatttactataaaaatatgcaatccttttttgagtgacaactattc
tctgaatgagtttttacaaggtggtacaggttaatatttaacattggcta
cagtaaataaacattcatatagagtctctagaagctaaggaaaagacgga
tcctagctaatgtgatgttccttaaggcacttcctatacacacttcactt
caccaccaccaccattccccaccccccctcaaaggtcaataaactattcc
ttggcattt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chrX_82427193_82428401
seq2: B6Ng01-133N07.b_49_1238 (reverse)

seq1  ATGTTTAATGAATG-CCACCAGTATTTGATCTGTTTCCTTCATTTCTCCT  49
      |||||||| ||||| || |||||| |||||||| |  | |||||||    
seq2  ATGTTTAA-GAATGCCCCCCAGTA-TTGATCTGGT--CCTCATTTC----  42

seq1  CTTTTATGAGTGAGTAAGCATGAGTCAACCCTATGACTGTATCTCTTTTT  99
      || ||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||
seq2  CTCTTATGAG-GAGT-AGCATG-GTCAACCCTA-GACTGTATCT-TTTTT  87

seq1  TCCTTGGGTCCTAACCGAATTTTCCTTGGCATTCCCACTATTTTGTAGAA  149
      ||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||
seq2  TCC-TAGATCCTAACCGAATTTTC--TGGCATTCCCA-TA-TTTGTAGAA  132

seq1  GATCTTAATGTAATAACATGATGGCAGTCCCAGATACGCTGGAGCCGGAG  199
      |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||
seq2  GATCTTAATGTAATAACATGAT-GCAGTCCCAGATACGCT-GAGCC-GAG  179

seq1  GGGAGAGGATCTA-TTTGGGATATGACTGAGCAAAAGAGTGACACCACAG  248
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGAGGATCTATTTTGGGATATGACTGAGCAAAAGAGTGACACCACAG  229

seq1  CTTCTAACAGCCCCTCAAATCAGTATTAACTCACACACAGACTACATTGT  298
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  C-TCTAACAGCCCCTCAAATCAGTATTAACTCACACACAGACTACATTGT  278

seq1  TCTCACTCAAAGCCTGGTGTAGGAATGCATACTTGAGATGATTCATTGCC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCACTCAAAGCCTGGTGTAGGAATGCATACTTGAGATGATTCATTGCC  328

seq1  TAGATTAAAGAGAGAC-AAAATGTGGAACTCAGACTACAAGGGCAGAAAT  397
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATTAAAGAGAGACAAAAATGTGGAACTCAGACTACAAGGGCAGAAAT  378

seq1  AGGGTTGAAGGTAGAAATGTGTTACTGTGGAAGATCAAGAGATTAAGGTA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTTGAAGGTAGAAATGTGTTACTGTGGAAGATCAAGAGATTAAGGTA  428

seq1  AACATGGGTGTGGGGGCTCACATTTGCAAGCCCAACAGTTAGAAAGCAGA  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATGGGTGTGGGGGCTCACATTTGCAAGCCCAACAGTTAGAAAGCAGA  478

seq1  GGCAGGGTGATCGTTGCAAGTTCTAGGCCAGCTGGGTTCATGTAGTGAAT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGGGTGATCGTTGCAAGTTCTAGGCCAGCTGGGTTCATGTAGTGAAT  528

seq1  TCTAGGCCAGACAGGGCTATAGTGAGACAACATCTCAAAAATGAAGGGGT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGGCCAGACAGGGCTATAGTGAGACAACATCTCAAAAATGAAGGGGT  578

seq1  GGAGAGAAAATGAGAATGGATAGATAGAAGTCAGAGGAGTGAGATTGTGA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAGAAAATGAGAATGGATAGATAGAAGTCAGAGGAGTGAGATTGTGA  628

seq1  TCAAGAAAGTTGAACAAATGGGGTATTAGGAAGGATTTCAAATTCTTCCT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGAAAGTTGAACAAATGGGGTATTAGGAAGGATTTCAAATTCTTCCT  678

seq1  TTATTTAAGCATTGACAGTGTAGGTTCTCACTCAACTTGGAAGCGTGGTG  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTAAGCATTGACAGTGTAGGTTCTCACTCAACTTGGAAGCGTGGTG  728

seq1  CACGTGGAGATCTCGGAAAAGGTTAGAGTATGTACAGTTCCTGCTGGAGT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGTGGAGATCTCGGAAAAGGTTAGAGTATGTACAGTTCCTGCTGGAGT  778

seq1  AGAGCCAGGATTGAGCAATTCAATCAGCAGGATACTGAGATCATTGAAGT  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCCAGGATTGAGCAATTCAATCAGCAGGATACTGAGATCATTGAAGT  828

seq1  GATAATGGAGATTCACAGATGCCGAAGAAGGTAGATGAGGGTTCTAAGAA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAATGGAGATTCACAGATGCCGAAGAAGGTAGATGAGGGTTCTAAGAA  878

seq1  GATAAGGATACAGGAGGAAAGAGAGAATAGTTGAACCAAATCCAGTGATG  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAGGATACAGGAGGAAAGAGAGAATAGTTGAACCAAATCCAGTGATG  928

seq1  TTCAAAAATCTCCACCAGAGTAGAGGGCACCTCCAGGTCCCAAGAAGGCA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAAAATCTCCACCAGAGTAGAGGGCACCTCCAGGTCCCAAGAAGGCA  978

seq1  AACCTTATAGGAAAGCCAGGGTTCATTTGTTCTCAAATAGAAGAAGATAT  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTTATAGGAAAGCCAGGGTTCATTTGTTCTCAAATAGAAGAAGATAT  1028

seq1  GTTTTTGGTGGTTTTCTTTACTACATGTCAGAGATTTAGGGCAATCTCCA  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTTGGTGGTTTTCTTTACTACATGTCAGAGATTTAGGGCAATCTCCA  1078

seq1  TCAGAATTGTTTTGTACATAAGATCTGAATACAGCTAATGGACTGTTGGA  1147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAATTGTTTTGTACATAAGATCTGAATACAGCTAATGGACTGTTGGA  1128

seq1  AGTGAAAATGACATCATAGAGCACGAAAACATACTGCACACCTTTGAGAA  1197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAAAATGACATCATAGAGCACGAAAACATACTGCACACCTTTGAGAA  1178

seq1  GTCAATGAATTC  1209
      ||||||||||||
seq2  GTCAATGAATTC  1190

seq1: chrX_82286953_82288067
seq2: B6Ng01-133N07.g_68_1176

seq1  GAATTCACTAATTGGGGTTTTCACCTGCTGTGCGTCTAATCGAATACAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTAATTGGGGTTTTCACCTGCTGTGCGTCTAATCGAATACAAA  50

seq1  ACCTTATTTGTAGCTGAAGAGGAAGAGAGATTATGCAGAGTGTCAGAATT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTATTTGTAGCTGAAGAGGAAGAGAGATTATGCAGAGTGTCAGAATT  100

seq1  TCTGCCTAGTTTTGAAATTCCTGTTATTTGGCACAATCCGGTTGGGAAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCCTAGTTTTGAAATTCCTGTTATTTGGCACAATCCGGTTGGGAAAG  150

seq1  GCAGACAAAATAGTTACAGCTCTGAGCTGTTAAGGTGGACCAGGAATTTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGACAAAATAGTTACAGCTCTGAGCTGTTAAGGTGGACCAGGAATTTT  200

seq1  GCAGCAGATGTAGTTGCACCACCTTAACCCGTTCTCCATTTTTAGCACGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCAGATGTAGTTGCACCACCTTAACCCGTTCTCCATTTTTAGCACGA  250

seq1  GGTGGTGTAGTTCATAGGAGCCTGGTAGTGCTATATAGCTGGCAGGCTAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGTGTAGTTCATAGGAGCCTGGTAGTGCTATATAGCTGGCAGGCTAA  300

seq1  TAGGCTTGCTGAATTCTTTCCCACTAAGCGACTACCGGCCTGTGAGGTTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGCTTGCTGAATTCTTTCCCACTAAGCGACTACCGGCCTGTGAGGTTA  350

seq1  ATGAAGTGTGCCTTTATTTTAGTGAAGATGCTAAACTTCACATCTTTTTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAGTGTGCCTTTATTTTAGTGAAGATGCTAAACTTCACATCTTTTTA  400

seq1  GATGTTCAGCTTGATATAGGTGGCTCTGTGAAGCTTTAAGAAATCGTATT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTTCAGCTTGATATAGGTGGCTCTGTGAAGCTTTAAGAAATCGTATT  450

seq1  AAATGAAAACTGCATGCAATTGAAGGAGAGTTCGACTTTATCTGGAACCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGAAAACTGCATGCAATTGAAGGAGAGTTCGACTTTATCTGGAACCT  500

seq1  GTCTGGTGAAATCTCTGGTGTAGTTGGCAGCTGTCTCAGAAAACTTTTCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGGTGAAATCTCTGGTGTAGTTGGCAGCTGTCTCAGAAAACTTTTCC  550

seq1  TGGCCTGGCTTATCCTGCTTCCCTGCAAAAGAAGAGCATGGCAAAAATAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCTGGCTTATCCTGCTTCCCTGCAAAAGAAGAGCATGGCAAAAATAA  600

seq1  GCTTTGGTGGGAGTTTGATGTGCTCTGGGTCTGAAAGCTCTGCTTTCAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTGGTGGGAGTTTGATGTGCTCTGGGTCTGAAAGCTCTGCTTTCAGA  650

seq1  CTTGGTTGTTGATGGTTTAACAATGATCTAGAGGCATTATTATATGTATT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGTTGTTGATGGTTTAACAATGATCTAGAGGCATTATTATATGTATT  700

seq1  TTAATTAGTATGCCATCACATTTGCCCTAAGTGGCAGTGATTCACAGTTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATTAGTATGCCATCACATTTGCCCTAAGTGGCAGTGATTCACAGTTA  750

seq1  TGGTAAGCATTTGTTAGAAGTCTGATTCATGGTCCATGGCTAGAGCTCTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTAAGCATTTGTTAGAAGTCTGATTCATGGTCCATGGCTAGAGCTCTC  800

seq1  ACTATGCAAAGAGAAGCATACAGATATTATATGCTTACTGGGTATCCAGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATGCAAAGAGAAGCATACAGATATTATATGCTTACTGGGTATCCAGG  850

seq1  TGCATATTTACTAT-AAAATATGCAATCCTTTTTTGAAGTGACAACTATT  899
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TGCATATTTACTATAAAAATATGCAATCCTTTTTTG-AGTGACAACTATT  899

seq1  CTCTGAATGAGTTTTTACAAAGTGGTACAGGTT-ATATTTAACATTGGCT  948
      |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  CTCTGAATGAGTTTTTACAAGGTGGTACAGGTTAATATTTAACATTGGCT  949

seq1  ACAGTAAATAAAACAATTCATATAGAGTCTCTTAGAGCTAGAGAAAAGAC  998
      ||||||||||||   |||||||||||||||||   |||||  ||||||||
seq2  ACAGTAAATAAA--CATTCATATAGAGTCTCTAGAAGCTAAGGAAAAGAC  997

seq1  GGATCCTAGCTAATGGTGATGTTCCTTAAGGCCACTCCTATACACACATA  1048
      |||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||| | 
seq2  GGATCCTAGCTAAT-GTGATGTTCCTTAAGGCACTTCCTATACACAC-TT  1045

seq1  CACTACCACCACCACCACCATTCCCCACCTCCACTCAAATGTCCAATAAA  1098
      ||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||
seq2  CACT-TCACCACCACCACCATTCCCCACCCCCCCTCAAAGGT-CAATAAA  1093

seq1  TCTATTCCTTGTCATTT  1115
       |||||||||| |||||
seq2  -CTATTCCTTGGCATTT  1109