BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-136J07
ChromosomeX (Build37)
Map Location 83,451,822 - 83,597,430
singlet/doubletdoublet
Overlap geneCN716893, LOC667841, LOC236427, EG667852, EG436212, Gm41
Upstream geneLOC669833, 1600014K23Rik, Map3k7ip3, Gyk, LOC100042350, LOC629340, LOC100041562, 5430427O19Rik, 1700072E05Rik, Nr0b1
Downstream geneEG629374, EG637027, Il1rapl1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-136J07.bB6Ng01-136J07.g
ACCDH936318DH936319
length1,2141,202
definitionDH936318|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-136J07, 5' end.DH936319|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-136J07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(83,596,202 - 83,597,430)(83,451,822 - 83,453,069)
sequence
gaattcagagggagccataagagggtcataggaggagatttagggtagcc
tagcccagcaggtaggggtccaagaaagcataatttcaggtagccatgct
gagtgcttgggagacaggatataagcaggagactccatgaaacttagggt
agccacacctactatttaggagtcagggggaacattaaatgggaagtact
atgagtcttaagaatgccactcccagcaggtgggatgcagaaggagcctt
aagagggaggtaccaagaggctttgattagagggagatagtatgacttta
gggcagctttgcccaccatgtaggggtctaaggaagcatgatttcagttc
gctatgcctcgtacttgggagtcagaagataaactgtcaatgccttgata
tttagggtaggcatgcctagcacttaggagtcagaaggaaacttagggga
aggtactactaggcttaagatagccttgctcagaatgtagcatccagaga
gagccatagagggatgtaccaggagattcagggtaaccttgcctagcagg
taagtatccaaaggaagcataatttcaggtagccagtcccagtgtttggg
agtcaaagagtaagcaagagataccatgaaacttagggtagctttgcctt
gtaaatagtcagaggaaaccttaagagggacttactgtgaggcttaagtt
agtatggctagaacctggaattcagagggagccttaaaggaaggtaccat
gaggtttagtataaccatgcccagtatgtggaagatagagggagccttaa
gctgggatataaggaaaggcttaatgtagtattacccaaacctttggagt
cagagccataaaagaaaggtagcatggcatttacagctacaatgtccagc
agttaggggttagaggtcccagcacttgggagtctgagggtaaactggag
atgccatgagacttaggtagccatacctagcacatggtagtcagaagaat
ctttaaaggggaggtactaggaagcttagattatgcacacctatcattgt
gcattcagagggagaatgaagcagaaggaacatgacattaaggtagcaga
ctcagcgagttggatggagccataagagggaggtggcatgaaggttaaat
agccacccacatgtggggttctaaggagatgtaaagaggtccagaaggtt
aagggtgcttctca
gaattcaagattcaaagccaggctggtctaagcaagtgagtttcagtaca
gccagagctgcacagagataccctgtctcagaaacaacaacacatcaata
aataagtctttaaaaagaaaacaaagagctcaagcaaaaaagccaatact
catttgaactgtgtattattttgagtgctgttcatagagtatacctttca
atgcctacactatgttacaagttaaaaattctcttcctgggtaagaaaat
gaagatgcagtgtcaaggcactgtctaagactccttcaatagcatggagc
ttggctagaatttcaaggtatgcttaaatgacaaaagcctctgcatcctt
tgcaaaatacactgttgtccagttgcattacagaagctaaatgggaataa
tgtgacattcattttaaaatagaaataacaaagacttctaggcacacatg
atgtcgctttgcataattacagtgaacacagtttctaaaacagaaatggt
gatatatgacttatctgaacttcagtatttgtgctcacatttataccagt
aagcccgaggaagcataaaatataatatgcatctaattctatttgatttt
taccaaatcatcttaattttaaaaaaatgaagtcacatgaaataaatgat
acccagtttgaaaagaacaaatatgttctggaaaccctacttctgtcgtt
tcaagccagttagtcttgtctccttcaggttttcatcttttacctgtact
aattttgtcagaagtctagtttacctaaaggactctgaaactatttcatg
cttcagtttataaaggtaactaatgctaggatttagacatttaaaaatac
atgtggatgatttaataacattgatgcaattacagtgttttaagtggttt
tcccctacctccataaataattgtattaccgtctaatgctactatgtcat
gctgtctaaatataaacaaagaattgccaaaatagaacgtctgccagctc
aaattagcatgtatacagatataaacatacaagactactgctcatatttc
catacagcaaatgatgcttcatagccaagtcactcaacaatattcttgta
atataccgagtcatttattggagtcttcgaagcactttaacgacgattat
cccttctattctgtggaatattcatcttgtgtcccacctacatgaaagtg
ga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chrX_83596202_83597430
seq2: B6Ng01-136J07.b_48_1261 (reverse)

seq1  TGAGAAGCAACCCTAAACCTCCTGGCACCTCCTTCTTACATCTCCCTTAG  50
      |||||||| ||||| ||||| |||| |||||    |||||||| ||||||
seq2  TGAGAAGC-ACCCTTAACCTTCTGG-ACCTC---TTTACATCT-CCTTAG  44

seq1  ACACCCACATGCTGGGTGTGGCTATTTTAAACCTCATGGCACCTCCCTCT  100
      |  |||||||| |||  ||||||| ||||| | ||||| |||||||||||
seq2  AACCCCACATG-TGG--GTGGCTA-TTTAACCTTCATGCCACCTCCCTCT  90

seq1  TATGGCTCCATCCAACTCGCTGGGTCTGGCTACTCTAAATGTCATGGTCC  150
      |||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||| |||
seq2  TATGGCTCCATCCAACTCGCTGAGTCT-GCTAC-CTTAATGTCATGTTCC  138

seq1  TGTCTGCTTCTATCTCCCTCTGAATGCCACATGATAGGTGTGCATATCTT  200
      | ||||||||  |||||||||||||||   ||||||||||||||||   |
seq2  T-TCTGCTTCATTCTCCCTCTGAATGCACAATGATAGGTGTGCATAATCT  187

seq1  AAGCTTCCTAGTACCTCCCCTTTTAAGGTTCCTTCTGACTACCATGTGCT  250
      ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||
seq2  AAGCTTCCTAGTACCTCCCCTTTAAAGATT-CTTCTGACTACCATGTGCT  236

seq1  AGGTATGGCTACCCTAAGTCTCATGGCATCTCCAGTTTACCCTCAGACTC  300
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTATGGCTA-CCTAAGTCTCATGGCATCTCCAGTTTACCCTCAGACTC  285

seq1  CCAAGTGCTGGGACCTCTAACCCCTAACTGCTGGACATTGTAGCTGTAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGTGCTGGGACCTCTAACCCCTAACTGCTGGACATTGTAGCTGTAAA  335

seq1  TGCCATGCTACCTTTCTTTTATGGCTCTGACTCCAAAGGTTTGGGTAATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCATGCTACCTTTCTTTTATGGCTCTGACTCCAAAGGTTTGGGTAATA  385

seq1  CTACATTAAGCCTTTCCTTATATCCCAGCTTAAGGCTCCCTCTATCTTCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACATTAAGCCTTTCCTTATATCCCAGCTTAAGGCTCCCTCTATCTTCC  435

seq1  ACATACTGGGCATGGTTATACTAAACCTCATGGTACCTTCCTTTAAGGCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATACTGGGCATGGTTATACTAAACCTCATGGTACCTTCCTTTAAGGCT  485

seq1  CCCTCTGAATTCCAGGTTCTAGCCATACTAACTTAAGCCTCACAGTAAGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCTGAATTCCAGGTTCTAGCCATACTAACTTAAGCCTCACAGTAAGT  535

seq1  CCCTCTTAAGGTTTCCTCTGACTATTTACAAGGCAAAGCTACCCTAAGTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCTTAAGGTTTCCTCTGACTATTTACAAGGCAAAGCTACCCTAAGTT  585

seq1  TCATGGTATCTCTTGCTTACTCTTTGACTCCCAAACACTGGGACTGGCTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGGTATCTCTTGCTTACTCTTTGACTCCCAAACACTGGGACTGGCTA  635

seq1  CCTGAAATTATGCTTCCTTTGGATACTTACCTGCTAGGCAAGGTTACCCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAAATTATGCTTCCTTTGGATACTTACCTGCTAGGCAAGGTTACCCT  685

seq1  GAATCTCCTGGTACATCCCTCTATGGCTCTCTCTGGATGCTACATTCTGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCTCCTGGTACATCCCTCTATGGCTCTCTCTGGATGCTACATTCTGA  735

seq1  GCAAGGCTATCTTAAGCCTAGTAGTACCTTCCCCTAAGTTTCCTTCTGAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGGCTATCTTAAGCCTAGTAGTACCTTCCCCTAAGTTTCCTTCTGAC  785

seq1  TCCTAAGTGCTAGGCATGCCTACCCTAAATATCAAGGCATTGACAGTTTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTAAGTGCTAGGCATGCCTACCCTAAATATCAAGGCATTGACAGTTTA  835

seq1  TCTTCTGACTCCCAAGTACGAGGCATAGCGAACTGAAATCATGCTTCCTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCTGACTCCCAAGTACGAGGCATAGCGAACTGAAATCATGCTTCCTT  885

seq1  AGACCCCTACATGGTGGGCAAAGCTGCCCTAAAGTCATACTATCTCCCTC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCCCTACATGGTGGGCAAAGCTGCCCTAAAGTCATACTATCTCCCTC  935

seq1  TAATCAAAGCCTCTTGGTACCTCCCTCTTAAGGCTCCTTCTGCATCCCAC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATCAAAGCCTCTTGGTACCTCCCTCTTAAGGCTCCTTCTGCATCCCAC  985

seq1  CTGCTGGGAGTGGCATTCTTAAGACTCATAGTACTTCCCATTTAATGTTC  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTGGGAGTGGCATTCTTAAGACTCATAGTACTTCCCATTTAATGTTC  1035

seq1  CCCCTGACTCCTAAATAGTAGGTGTGGCTACCCTAAGTTTCATGGAGTCT  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTGACTCCTAAATAGTAGGTGTGGCTACCCTAAGTTTCATGGAGTCT  1085

seq1  CCTGCTTATATCCTGTCTCCCAAGCACTCAGCATGGCTACCTGAAATTAT  1150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCTTATATCCTGTCTCCCAAGCACTCAGCATGGCTACCTGAAATTAT  1135

seq1  GCTTTCTTGGACCCCTACCTGCTGGGCTAGGCTACCCTAAATCTCCTCCT  1200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTCTTGGACCCCTACCTGCTGGGCTAGGCTACCCTAAATCTCCTCCT  1185

seq1  ATGACCCTCTTATGGCTCCCTCTGAATTC  1229
      |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACCCTCTTATGGCTCCCTCTGAATTC  1214

seq1: chrX_83451822_83453069
seq2: B6Ng01-136J07.g_64_1265

seq1  GAATTCAAGATTCAAAGCCAGGCTGGTCTAAGCAAGTGAGTTTCAGTACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGATTCAAAGCCAGGCTGGTCTAAGCAAGTGAGTTTCAGTACA  50

seq1  GCCAGAGCTGCACAGAGATACCCTGTCTCAGAAACAACAACACATCAATA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGAGCTGCACAGAGATACCCTGTCTCAGAAACAACAACACATCAATA  100

seq1  AATAAGTCTTTAAAAAGAAAACAAAGAGCTCAAGCAAAAAAGCCAATACT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAGTCTTTAAAAAGAAAACAAAGAGCTCAAGCAAAAAAGCCAATACT  150

seq1  CATTTGAACTGTGTATTATTTTGAGTGCTGTTCATAGAGTATACCTTTCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTGAACTGTGTATTATTTTGAGTGCTGTTCATAGAGTATACCTTTCA  200

seq1  ATGCCTACACTATGTTACAAGTTAAAAATTCTCTTCCTGGGTAAGAAAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCTACACTATGTTACAAGTTAAAAATTCTCTTCCTGGGTAAGAAAAT  250

seq1  GAAGATGCAGTGTCAAGGCACTGTCTAAGACTCCTTCAATAGCATGGAGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGATGCAGTGTCAAGGCACTGTCTAAGACTCCTTCAATAGCATGGAGC  300

seq1  TTGGCTAGAATTTCAAGGTATGCTTAAATGACAAAAGCCTCTGCATCCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCTAGAATTTCAAGGTATGCTTAAATGACAAAAGCCTCTGCATCCTT  350

seq1  TGCAAAATACACTGTTGTCCAGTTGCATTACAGAAGCTAAATGGGAATAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAAAATACACTGTTGTCCAGTTGCATTACAGAAGCTAAATGGGAATAA  400

seq1  TGTGACATTCATTTTAAAATAGAAATAACAAAGACTTCTAGGCACACATG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGACATTCATTTTAAAATAGAAATAACAAAGACTTCTAGGCACACATG  450

seq1  ATGTCGCTTTGCATAATTACAGTGAACACAGTTTCTAAAACAGAAATGGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCGCTTTGCATAATTACAGTGAACACAGTTTCTAAAACAGAAATGGT  500

seq1  GATATATGACTTATCTGAACTTCAGTATTTGTGCTCACATTTATACCAGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATATGACTTATCTGAACTTCAGTATTTGTGCTCACATTTATACCAGT  550

seq1  AAGCCCGAGGAAGCATAAAATATAATATGCATCTAATTCTATTTGATTTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCCGAGGAAGCATAAAATATAATATGCATCTAATTCTATTTGATTTT  600

seq1  TACCAAATCATCTTAATTTTAAAAAAATGAAGTCACATGAAATAAATGAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCAAATCATCTTAATTTTAAAAAAATGAAGTCACATGAAATAAATGAT  650

seq1  ACCCAGTTTGAAAAGAACAAATATGTTCTGGAAACCCTACTTCTGTCGTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCAGTTTGAAAAGAACAAATATGTTCTGGAAACCCTACTTCTGTCGTT  700

seq1  TCAAGCCAGTTAGTCTTGTCTCCTTCAGGTTTTCATCTTTTACCTGTACT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGCCAGTTAGTCTTGTCTCCTTCAGGTTTTCATCTTTTACCTGTACT  750

seq1  AATTTTGTCAGAAGTCTAGTTTACCT-AAGGACTCTGAAACTATTTCATG  799
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTTGTCAGAAGTCTAGTTTACCTAAAGGACTCTGAAACTATTTCATG  800

seq1  CTTCAGTTTATAAAGGTAACTAATGCTAGGATTTAGACATTTAAAAATAC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCAGTTTATAAAGGTAACTAATGCTAGGATTTAGACATTTAAAAATAC  850

seq1  ATGTGGATGATTTAATAACATTGATGCAATTACAGTGTTTTAAGTGGTTT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGGATGATTTAATAACATTGATGCAATTACAGTGTTTTAAGTGGTTT  900

seq1  TCCCCTACCTCCATAAAATAATTGTATTACCGTCTAATGCTACTATTGTC  949
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  TCCCCTACCTCCAT-AAATAATTGTATTACCGTCTAATGCTACTA-TGTC  948

seq1  ATTGCTGTCTAAATTATAAACAAAAGAATTGCCAAAATAGAAACCGTCTG  999
      | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||
seq2  A-TGCTGTCTAAA-TATAAAC-AAAGAATTGCCAAAATAGAA--CGTCTG  993

seq1  CCAGCTCAAATTAGGCATGGTATACAGAATATTAAAACATACAAAGAACC  1049
      ||||||||||||| |||| |||||||| ||||  |||||||| ||||   
seq2  CCAGCTCAAATTA-GCAT-GTATACAG-ATAT--AAACATAC-AAGA---  1034

seq1  TTACTGCTCATATTTCCAATACAAAGCAAAAATGATTGCTTTCAATTAGC  1099
       |||||||||||||||| ||||  |||  |||||| ||| ||||  ||||
seq2  CTACTGCTCATATTTCC-ATAC--AGC--AAATGA-TGC-TTCA--TAGC  1075

seq1  CCAAAAGTCACTCAAACAAATATCTTGTTAAATATCACGAGTCATTTATT  1149
      |   ||||||||| |||||   ||||||  |||||  |||||||||||||
seq2  C---AAGTCACTC-AACAATATTCTTGT--AATATACCGAGTCATTTATT  1119

seq1  TGGGAGTCTTTCTGGAGGCAACATTTAAACAGCAGATAAACCCCTTCTAT  1199
        ||||||||       | | || || ||| |  |||  | |||||||||
seq2  --GGAGTCTT------CGAAGCACTTTAAC-GACGAT-TATCCCTTCTAT  1159

seq1  TCTGTTGGAATGATTTCATCTGTGT-TCCCACAACTAACATGAGAGTGGA  1248
      |||| ||||||   ||||||| ||| ||||||  || |||||| ||||||
seq2  TCTG-TGGAAT--ATTCATCT-TGTGTCCCAC--CT-ACATGAAAGTGGA  1202