BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-147J05
ChromosomeX (Build37)
Map Location 17,350,491 - 17,453,998
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneMaob, Ndph, LOC100043063, Efhc2, Fundc1, EG278181, EG668994
Downstream geneEG436196, EG331391, Dusp21, LOC100043951, Utx, LOC100043952, 4930578C19Rik, LOC100043098, EG628855
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-147J05.bB6Ng01-147J05.g
ACCDH944419DH944420
length1,1361,038
definitionDH944419|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-147J05, 5' end.DH944420|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-147J05, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(17,452,859 - 17,453,998)(17,350,491 - 17,351,461)
sequence
gaattctatcctttcctttgtctggtatgtctgataagttctagtgcctc
attttccttatagggttttaattaagtgcacgtctgccacagtttcaatt
cacctaataaatgaatagagtgagtcctcttctattcccaggaataagtt
atttgtcagtctatgctggatgagggttccctaatagatggtgtaggatc
tgaatatacacagggacttctcactcaaaacagccagctgctcatgaatt
ggaacctcctaggtaggacacagccctaaaatcattattgtcatacaatg
tagagaaactcaggactgaacatagcctgattcccaacagagaggactaa
aggaaatcaaaggcaatgcacccatttgaatgtttttgtgtatggaaggg
gtcattacaatttatatcaaatctgagctcccctgaataaattcccctga
aatttcttgagtctcataaaagacagcattaaagccagcatgctgcttct
tgccttgatcaatggtaaattctttgtcctcctctttatcatcttcaacc
tcctcatactctatgtcctctgcttctttcttcttgtctgtggcatttgt
gatgtccagtgtcttgttaaaatcttttgtgacttttggtgacaaagttg
tcagagatggtgcagtaccttacttctcaggtacctgagatcagctcagc
caaattataaacatagatattggcaatgaggcagaatttaggctgtgcat
ttctacctgtatccaacatgtccctttaatcagggttgttctccagctag
gtgatgacattggtggtttcccccacccccacagctagctctatgtagct
gtcttgccctggttcctggagctagcttgctaagctaaccaaaccagttt
aacctgaaatgcctgaagctaccactcacatttcttgggccatccacccc
ctgtggctggcctgcagacaccagctaaggctcactcagccccccttagg
cccttgaaatgaaacactagaggactttgggtataccagccagatttata
ccatgatcttccaacccacatgccttgtccaagaacacacaactggagtt
aatatgaatacagatggaatgctagatggggcaaat
gaattctacatctagattggcaggcagcagaaagagagacactgggggtg
acttaaatgtttgaaaccccaagccccacccccagtaatgcacttcctcc
aacagggccacagctattccaacaagcccacacctcctaatagtgtcact
ccctggtgactaagcattcaaatatatgaacccatgggggccattcctac
caccacattatgtttctagaaaattgccagatgtgacccaacaatgactt
ctcttgagatgatactttgtgggactttgtaatacttttgtatccccagt
gggtgttgtgttgttagttttcaaaacactcttagtatgtgattgttgtg
ttttaagatttccatggatctagggagattaaggtgttatgtggcaagtt
aaagtgctgtatgtctctgttcttattgatatgcagatgcttatcttaaa
tgatattgcttagatttttgcaagcctttggttgcttttcagaattctga
aaattttatttttaataaattcctttggaaggaacagactttttgtggtt
ccttacctcaccatccctcctaagtgatagttcaaatctgctttcatgtt
gaactgtctataagtgtaacctgccaaatgtttgatttttatggttataa
aatatatttgaactcatatatgtatttctgtaccaaagaaataagatgaa
aataattttaacatgtatatttaggagatccagaagtggaggggagataa
gtttatatacatttttatattcatttatgtacatttatgtaattcagaaa
tatgagttatagttttcagcaatagagaaaagcaacccagatttactttc
tatactttacaaaacttaacaatagacccaaactccaaagttcatgaaca
tttttcctagagatagatctaatttactatattaggatttctattattga
cataaccaaattaaccacaaatccactggcttaatactccatgtattctc
ttacagttctcacatcccaaaactaagagtctccagag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chrX_17452859_17453998
seq2: B6Ng01-147J05.b_45_1180 (reverse)

seq1  ATTTGCCCAATCTAGGCATCCATCTTGTATTCATATTAACT-CAGTTGTG  49
      |||||||| ||||||   |||||| |||||||||||||||| ||||||||
seq2  ATTTGCCCCATCTAGCATTCCATC-TGTATTCATATTAACTCCAGTTGTG  49

seq1  TGTTCTTTGCACAGGCATGTTGGGTTTGGAGATTCATGGTTATAAATCTG  99
      ||||||| |   ||||||| |||||| | ||| |||||| ||||||||||
seq2  TGTTCTTGGACAAGGCATG-TGGGTTGGAAGA-TCATGG-TATAAATCTG  96

seq1  GCTGGTATAACATAAGT-CTCTAGTGTTTTCATTTCAAGGGGCTAAGGGG  148
      ||||||||| |  |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||
seq2  GCTGGTATACCCAAAGTCCTCTAGTG-TTTCATTTCAAGGGCCTAAGGGG  145

seq1  GGCTGAGTGAGCCTTAGCTGGTGTTCTGCAGGCCAGCCACAGGGGGTGGA  198
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGAGTGAGCCTTAGCTGGTG-TCTGCAGGCCAGCCACAGGGGGTGGA  194

seq1  TGGCCCAAGAAATGTGAGTGGTAGCTTCAGGCATTTCAGGTTAAACTGGT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCCAAGAAATGTGAGTGGTAGCTTCAGGCATTTCAGGTTAAACTGGT  244

seq1  TTGGTTAGCTTAGCAAGCTAGCTCCAGGAACCAGGGCAAGACAGCTACAT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTTAGCTTAGCAAGCTAGCTCCAGGAACCAGGGCAAGACAGCTACAT  294

seq1  AGAGCTAGCTGTGGGGGTGGGGGAAACCACCAATGTCATCACCTAGCTGG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCTAGCTGTGGGGGTGGGGGAAACCACCAATGTCATCACCTAGCTGG  344

seq1  AGAACAACCCTGATTAAAGGGACATGTTGGATACAGGTAGAAATGCACAG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACAACCCTGATTAAAGGGACATGTTGGATACAGGTAGAAATGCACAG  394

seq1  CCTAAATTCTGCCTCATTGCCAATATCTATGTTTATAATTTGGCTGAGCT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAAATTCTGCCTCATTGCCAATATCTATGTTTATAATTTGGCTGAGCT  444

seq1  GATCTCAGGTACCTGAGAAGTAAGGTACTGCACCATCTCTGACAACTTTG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTCAGGTACCTGAGAAGTAAGGTACTGCACCATCTCTGACAACTTTG  494

seq1  TCACCAAAAGTCACAAAAGATTTTAACAAGACACTGGACATCACAAATGC  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCAAAAGTCACAAAAGATTTTAACAAGACACTGGACATCACAAATGC  544

seq1  CACAGACAAGAAGAAAGAAGCAGAGGACATAGAGTATGAGGAGGTTGAAG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGACAAGAAGAAAGAAGCAGAGGACATAGAGTATGAGGAGGTTGAAG  594

seq1  ATGATAAAGAGGAGGACAAAGAATTTACCATTGATCAAGGCAAGAAGCAG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATAAAGAGGAGGACAAAGAATTTACCATTGATCAAGGCAAGAAGCAG  644

seq1  CATGCTGGCTTTAATGCTGTCTTTTATGAGACTCAAGAAATTTCAGGGGA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCTGGCTTTAATGCTGTCTTTTATGAGACTCAAGAAATTTCAGGGGA  694

seq1  ATTTATTCAGGGGAGCTCAGATTTGATATAAATTGTAATGACCCCTTCCA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTATTCAGGGGAGCTCAGATTTGATATAAATTGTAATGACCCCTTCCA  744

seq1  TACACAAAAACATTCAAATGGGTGCATTGCCTTTGATTTCCTTTAGTCCT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACAAAAACATTCAAATGGGTGCATTGCCTTTGATTTCCTTTAGTCCT  794

seq1  CTCTGTTGGGAATCAGGCTATGTTCAGTCCTGAGTTTCTCTACATTGTAT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGTTGGGAATCAGGCTATGTTCAGTCCTGAGTTTCTCTACATTGTAT  844

seq1  GACAATAATGATTTTAGGGCTGTGTCCTACCTAGGAGGTTCCAATTCATG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAATAATGATTTTAGGGCTGTGTCCTACCTAGGAGGTTCCAATTCATG  894

seq1  AGCAGCTGGCTGTTTTGAGTGAGAAGTCCCTGTGTATATTCAGATCCTAC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGCTGGCTGTTTTGAGTGAGAAGTCCCTGTGTATATTCAGATCCTAC  944

seq1  ACCATCTATTAGGGAACCCTCATCCAGCATAGACTGACAAATAACTTATT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATCTATTAGGGAACCCTCATCCAGCATAGACTGACAAATAACTTATT  994

seq1  CCTGGGAATAGAAGAGGACTCACTCTATTCATTTATTAGGTGAATTGAAA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGGAATAGAAGAGGACTCACTCTATTCATTTATTAGGTGAATTGAAA  1044

seq1  CTGTGGCAGACGTGCACTTAATTAAAACCCTATAAGGAAAATGAGGCACT  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGGCAGACGTGCACTTAATTAAAACCCTATAAGGAAAATGAGGCACT  1094

seq1  AGAACTTATCAGACATACCAGACAAAGGAAAGGATAGAATTC  1140
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACTTATCAGACATACCAGACAAAGGAAAGGATAGAATTC  1136

seq1: chrX_17350491_17351461
seq2: B6Ng01-147J05.g_136_1108

seq1  ACCCCAAGCCCCACCCCCAGTAATGCACTTCCTCCAACAGGGCCACAGCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCCAAGCCCCACCCCCAGTAATGCACTTCCTCCAACAGGGCCACAGCT  50

seq1  ATTCCAACAAGCCCACACCTCCTAATAGTGTCACTCCCTGGTGACTAAGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCAACAAGCCCACACCTCCTAATAGTGTCACTCCCTGGTGACTAAGC  100

seq1  ATTCAAATATATGAACCCATGGGGGCCATTCCTACCACCACATTATGTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAAATATATGAACCCATGGGGGCCATTCCTACCACCACATTATGTTT  150

seq1  CTAGAAAATTGCCAGATGTGACCCAACAATGACTTCTCTTGAGATGATAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGAAAATTGCCAGATGTGACCCAACAATGACTTCTCTTGAGATGATAC  200

seq1  TTTGTGGGACTTTGTAATACTTTTGTATCCCCAGTGGGTGTTGTGTTGTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTGGGACTTTGTAATACTTTTGTATCCCCAGTGGGTGTTGTGTTGTT  250

seq1  AGTTTTCAAAACACTCTTAGTATGTGATTGTTGTGTTTTAAGATTTCCAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTTCAAAACACTCTTAGTATGTGATTGTTGTGTTTTAAGATTTCCAT  300

seq1  GGATCTAGGGAGATTAAGGTGTTATGTGGCAAGTTAAAGTGCTGTATGTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATCTAGGGAGATTAAGGTGTTATGTGGCAAGTTAAAGTGCTGTATGTC  350

seq1  TCTGTTCTTATTGATATGCAGATGCTTATCTTAAATGATATTGCTTAGAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTTCTTATTGATATGCAGATGCTTATCTTAAATGATATTGCTTAGAT  400

seq1  TTTTGCAAGCCTTTGGTTGCTTTTCAGAATTCTGAAAATTTTATTTTTAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGCAAGCCTTTGGTTGCTTTTCAGAATTCTGAAAATTTTATTTTTAA  450

seq1  TAAATTCCTTTGGAAGGAACAGACTTTTTGTGGTTCCTTACCTCACCATC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATTCCTTTGGAAGGAACAGACTTTTTGTGGTTCCTTACCTCACCATC  500

seq1  CCTCCTAAGTGATAGTTCAAATCTGCTTTCATGTTGAACTGTCTATAAGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCTAAGTGATAGTTCAAATCTGCTTTCATGTTGAACTGTCTATAAGT  550

seq1  GTAACCTGCCAAATGTTTGATTTTTATGGTTATAAAATATATTTGAACTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAACCTGCCAAATGTTTGATTTTTATGGTTATAAAATATATTTGAACTC  600

seq1  ATATATGTATTTCTGTACCAAAGAAATAAGATGAAAATAATTTTAACATG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATGTATTTCTGTACCAAAGAAATAAGATGAAAATAATTTTAACATG  650

seq1  TATATTTAGGAGATCCAGAAGTGGAGGGGAGATAAGTTTATATACA-TTT  699
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TATATTTAGGAGATCCAGAAGTGGAGGGGAGATAAGTTTATATACATTTT  700

seq1  TATATTCATTTATGTACATTTATGTAATTCAGAAATATGAGTTATAGTTT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATTCATTTATGTACATTTATGTAATTCAGAAATATGAGTTATAGTTT  750

seq1  TCAGCAATAGAGAAAAGCAACCCAGATTTAC-TTCTATACTTTACAAAAC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TCAGCAATAGAGAAAAGCAACCCAGATTTACTTTCTATACTTTACAAAAC  800

seq1  TTAACAATAGACCCAAACTCCAAAGTTCATGAACA-TTTTCCTAGAGATA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TTAACAATAGACCCAAACTCCAAAGTTCATGAACATTTTTCCTAGAGATA  850

seq1  GATCTAATTTACTATATTA-GATTTCTATTATTGACATAA-CAAATT-AC  894
      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||
seq2  GATCTAATTTACTATATTAGGATTTCTATTATTGACATAACCAAATTAAC  900

seq1  CACAAATCCACTGGCTTAAATAACTCCATGTATTCTCTTACAGTTCTACA  944
      |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  CACAAATCCACTGGCTTAA--TACTCCATGTATTCTCTTACAGTTCT-CA  947

seq1  CATCCAAAATCTAAGTAGTCTCCAGAG  971
      ||||| ||| ||||| |||||||||||
seq2  CATCCCAAAACTAAG-AGTCTCCAGAG  973