BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-153K10
ChromosomeX (Build37)
Map Location 49,179,259 - 49,303,216
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100040479, LOC665888
Upstream gene2610018G03Rik, LOC100040422, Rap2c, LOC385355, Mbnl3, LOC665866, LOC385356, Hs6st2, Usp26
Downstream gene1700080O16Rik, LOC100040495, Gpc4, Gpc3, Kis2, LOC100041925, LOC665929, 6330534C20Rik, LOC624936, LOC546298, LOC100040569, Phf6
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-153K10.bB6Ng01-153K10.g
ACCDH948904DH948905
length1,0511,049
definitionDH948904|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-153K10, 5' end.DH948905|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-153K10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(49,302,160 - 49,303,216)(49,179,259 - 49,180,333)
sequence
gaattcattagtcagttcacttaatcatttagccctttgctcatttcttc
atttaacaggcattaatgactttctttatgtagaactgtgcagatattct
gtgaacaataaaaatcattctaagacaatgggtcccaataccttgaagcc
ttttataaactactttgaatgtatcataactgtttttagcagacttaagt
gaatgaatgagatgcgaagacatccatttattcacatccaagggaatagt
caatagtactttatttttcagatgggactgtagagcctaattctttagga
attctagcatatactgaagatcaggtgagatatctggcattgttgaatga
acaaatactggattcttgcacttcctgttggtagatgatcattgttagac
tagctggaccccagcttgtaagccattctgataaaacccatatatatgta
tatgtatgtgtatgtgattatatatatataaaatcagttacgtttctcta
gagaaccctcctgtagcctaggctttcttcaaacttaatatagtcaaggc
tgatattgaactttagattctcttgtctacaactcttgagtcaattaaag
gcaggcactaccatacccagcaaaagcagatgacagccagaacttcatgt
acatgtactctatgcaggcactctaccctctgagctgcagccctgccgtt
actggtgcagacattagttttaggcaacttcggcagaagcagcacaatgc
agggaatgattctatcacagatgagttgctcaaacatggaagacttaagg
cagaagcaagatgggaagtagagagactgagctggaccttgaaatccaca
gatggattgtgggaagaggaagcagatgagctaatgccagcttttccaga
tgattacatctgagaaaaataactgctcattcagcgctggaccaggttca
cctctggtgattcatcatctgggttaagtctcttacttgggtaacacacc
ttcccttacattctgagtaggcctagggttttcattgctgtataaaacac
c
gaattcaaggagaaattgcaatgctatttattaaaatagcctatcgttcc
aggttatttcataaaccagagctcaaatttcatagtgtctgtaggccagg
caccattctgaatatcttacattcattacttcacttaattatcacaatgg
acagagatctattttattgtcttcattttacagtgagaaaactggggtcc
agaaaggttaatttgctcaatgatagctattaaacagtcagatttggtct
taaattcaggtatatccaattctcaaacctctgctatggctactgtgccc
ttgttactttaaagggtatctccatagaaccagccctaccaggaagccag
aaaaggagcctccagggtagtgcttgttagtgtctatgtgcagtcaagat
ttgtattctaaagtgagacccagagtacggagtatcagcagggatcctac
ggataccaggcttatcagaaaacagtcaaaagagctttgatgagtctata
gtcaaacataaactagctatagaagattgtgtcgattatctaaaaagaaa
tcagactcaaagacccaagtggttatatgggacagtagaggtgtggagtt
aaaggcacttcctaccaagcctgatgatgtgagactaaccttcctaccaa
gcctgatgatgagagattaactcctgagcttatgtgttggaaggagagaa
ccaactctcataagttatcctgtgaccttcacacacattgtggtacatgc
tcaccattcccaaacacacaataaatacagaaagttaaagctaggatatg
tattcattcactggatgatatatgtcttttatgggacttagagctttcct
gaagcatattgtgaaatgaaaattacaaaaccaagattgctgtactgagc
atgtgcagaggcagattcctgcgactttgctcatagacactgtttcagag
ttattaaattcatttcgtcagaggcaagagcaagtcccatgtactgcaat
gaaagctagttggtctcaatagatggtcctgcttttgatccaacatggt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chrX_49302160_49303216
seq2: B6Ng01-153K10.b_42_1092 (reverse)

seq1  GGTGTTTTATTACAGCAATAGAAACCCTAAGACATACTCAGAATGTAGAG  50
      ||||||||| |||||||||  ||||||| || | |||||||||||||  |
seq2  GGTGTTTTA-TACAGCAATGAAAACCCT-AGGCCTACTCAGAATGTAAGG  48

seq1  GAGGGTGTGTTACCAAAGTTAAGAGAACTCTAGACCACAGATGATGGATC  100
      || ||||||||||| ||| |||||||   ||  ||| ||||||||| |||
seq2  GAAGGTGTGTTACCCAAG-TAAGAGA---CTTAACC-CAGATGATGAATC  93

seq1  A-CAGAGGTGGACCTGGGTCCAGCGCTGACTGAGCAGTTATTTTTCTCAG  149
      | |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGAGGTGAACCT-GGTCCAGCGCTGAATGAGCAGTTATTTTTCTCAG  142

seq1  ATGTGATCATCTGGGAAAGGCTGGCATTGGCTCATCTGCTTCCTCTT-CC  198
      |||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||
seq2  ATGTAATCATCT-GGAAAAGCTGGCATTAGCTCATCTGCTTCCTCTTCCC  191

seq1  ACAATCCATCTGTGGATTTCAAGGTCCAGCTCAGTCTCTCTACTTCCCAT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATCCATCTGTGGATTTCAAGGTCCAGCTCAGTCTCTCTACTTCCCAT  241

seq1  CTTGCTTCTGCC-TAAGTCTTCCATGTTTGAGCAACTCATCTGTGATAGA  297
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCTTCTGCCTTAAGTCTTCCATGTTTGAGCAACTCATCTGTGATAGA  291

seq1  ATCATTCCCTGCATTGTGCTGCTTCTGCCGAAGTTGCCTAAAACTAATGT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATTCCCTGCATTGTGCTGCTTCTGCCGAAGTTGCCTAAAACTAATGT  341

seq1  CTGCACCAGTAACGGCTGGGCTGCAGCTCAGAGGGTAGAGTGCCTGCATA  397
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCACCAGTAACGGCAGGGCTGCAGCTCAGAGGGTAGAGTGCCTGCATA  391

seq1  GAGTACATGTACATGAAGTTCTGGCTGTCATCTGCTTTTGCTGGGTATGG  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTACATGTACATGAAGTTCTGGCTGTCATCTGCTTTTGCTGGGTATGG  441

seq1  TAGTGCCTGCCTTTAATTGACTCAAGAGTTGTAGACAAGAGAATCTAAAG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGCCTGCCTTTAATTGACTCAAGAGTTGTAGACAAGAGAATCTAAAG  491

seq1  TTCAATATCAGCCTTGACTATATTAAGTTTGAAGAAAGCCTAGGCTACAG  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAATATCAGCCTTGACTATATTAAGTTTGAAGAAAGCCTAGGCTACAG  541

seq1  GAGGGTTCTCTAGAGAAACGTAACTGATTTTATATATATATAATCACATA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGTTCTCTAGAGAAACGTAACTGATTTTATATATATATAATCACATA  591

seq1  CACATACATATACATATATATGGGTTTTATCAGAATGGCTTACAAGCTGG  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATACATATACATATATATGGGTTTTATCAGAATGGCTTACAAGCTGG  641

seq1  GGTCCAGCTAGTCTAACAATGATCATCTACCAACAGGAAGTGCAAGAATC  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCCAGCTAGTCTAACAATGATCATCTACCAACAGGAAGTGCAAGAATC  691

seq1  CAGTATTTGTTCATTCAACAATGCCAGATATCTCACCTGATCTTCAGTAT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTATTTGTTCATTCAACAATGCCAGATATCTCACCTGATCTTCAGTAT  741

seq1  ATGCTAGAATTCCTAAAGAATTAGGCTCTACAGTCCCATCTGAAAAATAA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTAGAATTCCTAAAGAATTAGGCTCTACAGTCCCATCTGAAAAATAA  791

seq1  AGTACTATTGACTATTCCCTTGGATGTGAATAAATGGATGTCTTCGCATC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACTATTGACTATTCCCTTGGATGTGAATAAATGGATGTCTTCGCATC  841

seq1  TCATTCATTCACTTAAGTCTGCTAAAAACAGTTATGATACATTCAAAGTA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTCATTCACTTAAGTCTGCTAAAAACAGTTATGATACATTCAAAGTA  891

seq1  GTTTATAAAAGGCTTCAAGGTATTGGGACCCATTGTCTTAGAATGATTTT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTATAAAAGGCTTCAAGGTATTGGGACCCATTGTCTTAGAATGATTTT  941

seq1  TATTGTTCACAGAATATCTGCACAGTTCTACATAAAGAAAGTCATTAATG  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGTTCACAGAATATCTGCACAGTTCTACATAAAGAAAGTCATTAATG  991

seq1  CCTGTTAAATGAAGAAATGAGCAAAGGGCTAAATGATTAAGTGAACTGAC  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTTAAATGAAGAAATGAGCAAAGGGCTAAATGATTAAGTGAACTGAC  1041

seq1  TAATGAATTC  1057
      ||||||||||
seq2  TAATGAATTC  1051

seq1: chrX_49179259_49180333
seq2: B6Ng01-153K10.g_69_1117

seq1  GAATTCAAGGAGAAATTGCAATGCTATTTATTAAAATAGCCTATCGTTCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGGAGAAATTGCAATGCTATTTATTAAAATAGCCTATCGTTCC  50

seq1  AGGTTATTTCATAAACCAGAGCTCAAATTTCATAGTGTCTGTAGGCCAGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTATTTCATAAACCAGAGCTCAAATTTCATAGTGTCTGTAGGCCAGG  100

seq1  CACCATTCTGAATATCTTACATTCATTACTTCACTTAATTATCACAATGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCATTCTGAATATCTTACATTCATTACTTCACTTAATTATCACAATGG  150

seq1  ACAGAGATCTATTTTATTGTCTTCATTTTACAGTGAGAAAACTGGGGTCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAGATCTATTTTATTGTCTTCATTTTACAGTGAGAAAACTGGGGTCC  200

seq1  AGAAAGGTTAATTTGCTCAATGATAGCTATTAAACAGTCAGATTTGGTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGGTTAATTTGCTCAATGATAGCTATTAAACAGTCAGATTTGGTCT  250

seq1  TAAATTCAGGTATATCCAATTCTCAAACCTCTGCTATGGCTACTGTGCCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATTCAGGTATATCCAATTCTCAAACCTCTGCTATGGCTACTGTGCCC  300

seq1  TTGTTACTTTAAAGGGTATCTCCATAGAACCAGCCCTACCAGGAAGCCAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTACTTTAAAGGGTATCTCCATAGAACCAGCCCTACCAGGAAGCCAG  350

seq1  AAAAGGAGCCTCCAGGGTAGTGCTTGTTAGTGTCTATGTGCAGTCAAGAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGGAGCCTCCAGGGTAGTGCTTGTTAGTGTCTATGTGCAGTCAAGAT  400

seq1  TTGTATTCTAAAGTGAGACCCAGAGTACGGAGTATCAGCAGGGATCCTAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTATTCTAAAGTGAGACCCAGAGTACGGAGTATCAGCAGGGATCCTAC  450

seq1  GGATACCAGGCTTATCAGAAAACAGTCAAAAGAGCTTTGATGAGTCTATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATACCAGGCTTATCAGAAAACAGTCAAAAGAGCTTTGATGAGTCTATA  500

seq1  GTCAAACATAAACTAGCTATAGAAGATTGTGTCGATTATCTAAAAAGAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAAACATAAACTAGCTATAGAAGATTGTGTCGATTATCTAAAAAGAAA  550

seq1  TCAGACTCAAAGACCCAAGTGGTTATATGGGACAGTAGAGGTGTGGAGTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGACTCAAAGACCCAAGTGGTTATATGGGACAGTAGAGGTGTGGAGTT  600

seq1  AAAGGCACTTCCTACCAAGCCTGATGATGTGAGACTAACCTTCCTACCAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGCACTTCCTACCAAGCCTGATGATGTGAGACTAACCTTCCTACCAA  650

seq1  GCCTGATGATGAGAGATTAACTCCTGAGCTTATGTGTTGGAAGGAGAGAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGATGATGAGAGATTAACTCCTGAGCTTATGTGTTGGAAGGAGAGAA  700

seq1  CCAACTCTCATAAGTTATCCTGTGACCTTCACACACATTGTGGTACATGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACTCTCATAAGTTATCCTGTGACCTTCACACACATTGTGGTACATGC  750

seq1  TCACCATTCCCAAACACACAAATAAATACAGAAAGATTAAAGCTAGGATA  800
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TCACCATTCCCAAACACAC-AATAAATACAGAAAG-TTAAAGCTAGGATA  798

seq1  TGTATTCAATTCACT-GATGATATATGTCTATTATGGGAACTTAGAGCTT  849
      ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||
seq2  TGTATTC-ATTCACTGGATGATATATGTCTTTTATGGG-ACTTAGAGCTT  846

seq1  TCCTGAAGCATATTGTGAAAATGAAAAATACAAAACCAAAGATTGCCTGT  899
      ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||
seq2  TCCTGAAGCATATTGTG-AAATGAAAATTACAAAACC-AAGATTG-CTGT  893

seq1  ACTGAGGCATGTGGCAGAGGCAGATTCCTGCAGACATTGCTCATAGGACA  949
      ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| 
seq2  ACTGA-GCATGT-GCAGAGGCAGATTCCTGC-GACTTTGCTCATA-GAC-  938

seq1  ACTGTTTCAGAAGTTTATTAAAAATCCATTTTGTCCAGAAGGCAAAGAGC  999
      |||||||||||   |||||  |||| ||||| || ||| |||| ||||||
seq2  ACTGTTTCAGA--GTTATT--AAATTCATTTCGT-CAG-AGGC-AAGAGC  981

seq1  AAAGTCCCATGTAACTGCAAATGGAAAGCTAGTTGGTTTCAATAAGATGG  1049
       ||||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||||| ||||  
seq2  -AAGTCCCATGT-ACTGCAA--TGAAAGCTAGTTGGTCTCAAT-AGAT--  1024

seq1  GGCCTTGCTTTTGAATCAGACATGGT  1075
      || | |||||||| |||  |||||||
seq2  GGTCCTGCTTTTG-ATCCAACATGGT  1049