BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-158O05
ChromosomeX (Build37)
Map Location 156,450,651 - 156,641,685
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC667524, Pdha1
Upstream geneLOC100040371, Rps6ka3, Eif1ay, Mtap7d2, A830080D01Rik, LOC100041359, Sh3kbp1
Downstream geneLOC100041403, LOC100041416, LOC100041427, Gpr64, Phka2, Ppef1, Rs1, Gja6, Scml2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-158O05.bB6Ng01-158O05.g
ACCDH952713DH952714
length1,1431,109
definitionDH952713|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-158O05, 5' end.DH952714|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-158O05, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(156,450,651 - 156,451,804)(156,640,571 - 156,641,685)
sequence
gaattcattcataaaccctgtgttgctgacaacttgttttgctacctgct
gctagctgtaaataaaagtaggtgctggtgtaatgggagccattgatttg
tgtcttagtttgggttttcctgctgtgatgagataccatgaccaagataa
ctcttacaaaggacagcatttaattagggctgtcttacagtttcagaggt
ttaatctgttatcattatgctgggaagcattacagcatgcagacagacat
ggtgctggaggagcagaaagtctacacctttatctgcaggcagtagaagg
aaactgcaccatcctgggtatatcttgagcataggagcccacccctacag
ttatacttcttccaataaggtcacaccttctaatactgccactttatggg
ccaagcatttaaacacacgagccttatgggggctgtacctattcaaacca
ccagtgtgtgtttccattttaggcttggaccattggccactttgcctgaa
acatttgtagcagaaacagctgaagagcaatcctagcagtccttgattag
tcatgactgaatacagtgggtgtgatggttagctttaattatgaacttgg
gccagtaaagatggctcatcaggcaaaggcacttggtaccaagttcaatt
cctagaatcctcatagtagaacctactatagagagaacctactatagcat
gttgtgtcctgaccaccacacatgctatggcacagtgaagcccctctata
tacacactacaacatattctgaatttgacacaatgtaaaatcaaccaggg
aagactctcagtgaacaattctctgtcttgtgttagcctgtggacatttc
ctatgagacatttttcttagtttggctgattgagatgagacagtctactc
ctgagtgcagatagcaccctatttcatgggcaggaccctggattataagg
agccaagcactaagcatgtacacataaattccactctgctcttgactgtg
gatgtgacagctgcttcaagttcctgcctgacttcctgcaatgatgggct
gtaacctgggattgtaattctgaacaaactcttctcctttaagttgcttt
ttccagaatttatcacaaccagaataaattgaataggggtggg
gaattctttatttaatgttattattgttttgttcattcatgtgtaaaaaa
taaattttgtgcatgaatcctgtaccatataatcatgctgttcaaacatc
ttaaagctatcacaacctggaacctgaagtgtaagttctgtttcatccaa
ttaatcgttatatgatcattcaatgttcctctttctataaaggtcttaca
tacatttgtgtgtttgtttgtttgtttgtttgtttctacagtgctaccaa
tggaaaccgtaacctcagtccaggtaagtaagtgctgtaccactgaacta
tatgcctagccacctatactgatgtatttaaagagcaattagactgaata
taaaatacagaaaccatcctctagtttaacaagaatgttgaaaacattac
tttgttctctttgggctaaatctagctgtcgagatgagttaaagcagcca
tttcactgtttccctctttggttgctttctatttttccaccaagattctt
gattgaaacaaaatgtagtagtgtcccttatatccatagtagttctaaat
ctcagtaaatgtactttaaatcttgtgtgcacgttgcagttttgctagtt
gacccaataacattccttaaagtatttcccctgtactgcacagtcttgta
aatgctcatgtttggcattaggttgccatgttctttaatcccttttaatg
taagtcatttcctcagtatttgtcccttataacattgatattttttttta
aaaattcttcctgttgcctttaaattaaaagttccttagcttccatttct
atatttccaaccagaataccatgtgttgtgtccttctccaggttccataa
tcagctcacatccacctgactctcatttaagatgattctggtcccctagt
tgaatttagttattaatattctaaatttttctcactttacttttttttaa
ctttaactgtataacctcgagtttgctgtattatttgatatgtattttta
gttcattctttttccaggtgattttatccaaccttctaacaggtttatgc
tggctccaattggttttctgaatccgattattacccttttatgcacatgt
atatttcag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chrX_156450651_156451804
seq2: B6Ng01-158O05.b_48_1190

seq1  GAATTCATTCATAAACCCTGTGTTGCTGACAACTTGTTTTGCTACCTGCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTCATAAACCCTGTGTTGCTGACAACTTGTTTTGCTACCTGCT  50

seq1  GCTAGCTGTAAATAAAAGTAGGTGCTGGTGTAATGGGAGCCATTGATTTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGCTGTAAATAAAAGTAGGTGCTGGTGTAATGGGAGCCATTGATTTG  100

seq1  TGTCTTAGTTTGGGTTTTCCTGCTGTGATGAGATACCATGACCAAGATAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTTAGTTTGGGTTTTCCTGCTGTGATGAGATACCATGACCAAGATAA  150

seq1  CTCTTACAAAGGACAGCATTTAATTAGGGCTGTCTTACAGTTTCAGAGGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTACAAAGGACAGCATTTAATTAGGGCTGTCTTACAGTTTCAGAGGT  200

seq1  TTAATCTGTTATCATTATGCTGGGAAGCATTACAGCATGCAGACAGACAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATCTGTTATCATTATGCTGGGAAGCATTACAGCATGCAGACAGACAT  250

seq1  GGTGCTGGAGGAGCAGAAAGTCTACACCTTTATCTGCAGGCAGTAGAAGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGCTGGAGGAGCAGAAAGTCTACACCTTTATCTGCAGGCAGTAGAAGG  300

seq1  AAACTGCACCATCCTGGGTATATCTTGAGCATAGGAGCCCACCCCTACAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTGCACCATCCTGGGTATATCTTGAGCATAGGAGCCCACCCCTACAG  350

seq1  TTATACTTCTTCCAATAAGGTCACACCTTCTAATACTGCCACTTTATGGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATACTTCTTCCAATAAGGTCACACCTTCTAATACTGCCACTTTATGGG  400

seq1  CCAAGCATTTAAACACACGAGCCTTATGGGGGCTGTACCTATTCAAACCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGCATTTAAACACACGAGCCTTATGGGGGCTGTACCTATTCAAACCA  450

seq1  CCAGTGTGTGTTTCCATTTTAGGCTTGGACCATTGGCCACTTTGCCTGAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTGTGTGTTTCCATTTTAGGCTTGGACCATTGGCCACTTTGCCTGAA  500

seq1  ACATTTGTAGCAGAAACAGCTGAAGAGCAATCCTAGCAGTCCTTGATTAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTTGTAGCAGAAACAGCTGAAGAGCAATCCTAGCAGTCCTTGATTAG  550

seq1  TCATGACTGAATACAGTGGGTGTGATGGTTAGCTTTAATTATGAACTTGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGACTGAATACAGTGGGTGTGATGGTTAGCTTTAATTATGAACTTGG  600

seq1  GCCAGTAAAGATGGCTCATCAGGCAAAGGCACTTGGTACCAAGTTCAATT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGTAAAGATGGCTCATCAGGCAAAGGCACTTGGTACCAAGTTCAATT  650

seq1  CCTAGAATCCTCATAGTAGAACCTACTATAGAGAGAACCTACTATAGCAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGAATCCTCATAGTAGAACCTACTATAGAGAGAACCTACTATAGCAT  700

seq1  GTTGTGTCCTGACCACCACACATGCTATGGCACAGTGAAGCCCCTCTATA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTGTCCTGACCACCACACATGCTATGGCACAGTGAAGCCCCTCTATA  750

seq1  TACACACTACAACATATTCTGAATTTGACACAATGTAAAATCAACCAGGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACACTACAACATATTCTGAATTTGACACAATGTAAAATCAACCAGGG  800

seq1  AAGACTCTCAGTGAACAATTCTCTGTCTTGTGTTAGCCTGTGGACATTTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACTCTCAGTGAACAATTCTCTGTCTTGTGTTAGCCTGTGGACATTTC  850

seq1  CTATGAGACATTTTTCTTAGTTTGGCTGATTGAGATGAGACAGTCTAC-C  899
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  CTATGAGACATTTTTCTTAGTTTGGCTGATTGAGATGAGACAGTCTACTC  900

seq1  CTGAGTGCAGATAGCACCCTATTTCATGGGCAGGACCCTGGATTATAAGG  949
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  CTGAGTGCAGATAGCACCCTATTTCATGGGCAGGACCCTGGATTATAA-G  949

seq1  GAGCCAAGCACTAAGCATGTACACATAAATTCCACTCTGCTCTTGACTGT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCAAGCACTAAGCATGTACACATAAATTCCACTCTGCTCTTGACTGT  999

seq1  GGATGTGACCAGCTGCTTCAAGTTCCTGCCTTGACTTCCCTGCAATGATG  1049
      |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||
seq2  GGATGTGA-CAGCTGCTTCAAGTTCCTGCC-TGACTT-CCTGCAATGATG  1046

seq1  GGCTGTAACCTGGAATTGTAA-TCTGAACAAACTCCTTCTCCCTTAAAGT  1098
      ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||
seq2  GGCTGTAACCTGGGATTGTAATTCTGAACAAACT-CTTCT-CCTTTAAGT  1094

seq1  TGCTTTTTCTCAGGATATTTTATCACAACACAGATGAAATTTGAATAGGG  1148
      ||||||||| |||   | ||||||||||| ||||  ||| ||||||| ||
seq2  TGCTTTTTC-CAG---AATTTATCACAAC-CAGAATAAA-TTGAATA-GG  1137

seq1  GGTGGG  1154
      ||||||
seq2  GGTGGG  1143

seq1: chrX_156640571_156641685
seq2: B6Ng01-158O05.g_68_1176 (reverse)

seq1  CTGAAATAATACATGTGCATAAAA-GGTGATATATCAGAATCAAGAAAAC  49
      ||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||| || || |||||||
seq2  CTGAAAT-ATACATGTGCATAAAAGGGTAATA-ATCGGATTC-AGAAAAC  47

seq1  AAATTGAGAACCAGCATAAACCTGTTAG-AGGTTGGATAAAATCA-CTTG  97
       ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |
seq2  CAATTG-GAGCCAGCATAAACCTGTTAGAAGGTTGGATAAAATCACCTGG  96

seq1  AAATAGAATGAACTAAAAATACATTATCAAATTAATAACAGCAAACTCGA  147
      ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||
seq2  AAAAAGAATGAACTAAAAATACA-TATCAAA-TAAT-ACAGCAAACTCGA  143

seq1  GGTTATACAGTTAAAAGTTAAAAAAAAGTAAAGTGAGAAAAATTTTAGAA  197
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  GGTTATACAGTT-AAAGTTAAAAAAAAGTAAAGTGAGAAAAA-TTTAGAA  191

seq1  TATTAATAACTAAATTCAACTAGGGGACCAGAATCATCTTAAATGAGAGT  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTAATAACTAAATTCAACTAGGGGACCAGAATCATCTTAAATGAGAGT  241

seq1  CAGGTGGATGTGAGCTGATTATGGAACCTGGAGAAGGACACAACACATGG  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTGGATGTGAGCTGATTATGGAACCTGGAGAAGGACACAACACATGG  291

seq1  TATTCTGGTTGGAAATATAGAAATGGAAGCTAAGGAACTTTTAATTTAAA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTCTGGTTGGAAATATAGAAATGGAAGCTAAGGAACTTTTAATTTAAA  341

seq1  GGCAACAGGAAGAATTTTTAAAAAAAAATATCAATGTTATAAGGGACAAA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAACAGGAAGAATTTTTAAAAAAAAATATCAATGTTATAAGGGACAAA  391

seq1  TACTGAGGAAATGACTTACATTAAAAGGGATTAAAGAACATGGCAACCTA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGAGGAAATGACTTACATTAAAAGGGATTAAAGAACATGGCAACCTA  441

seq1  ATGCCAAACATGAGCATTTACAAGACTGTGCAGTACAGGGGAAATACTTT  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCAAACATGAGCATTTACAAGACTGTGCAGTACAGGGGAAATACTTT  491

seq1  AAGGAATGTTATTGGGTCAACTAGCAAAACTGCAACGTGCACACAAGATT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAATGTTATTGGGTCAACTAGCAAAACTGCAACGTGCACACAAGATT  541

seq1  TAAAGTACATTTACTGAGATTTAGAACTACTATGGATATAAGGGACACTA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGTACATTTACTGAGATTTAGAACTACTATGGATATAAGGGACACTA  591

seq1  CTACATTTTGTTTCAATCAAGAATCTTGGTGGAAAAATAGAAAGCAACCA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACATTTTGTTTCAATCAAGAATCTTGGTGGAAAAATAGAAAGCAACCA  641

seq1  AAGAGGGAAACAGTGAAATGGCTGCTTTAACTCATCTCGACAGCTAGATT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGGGAAACAGTGAAATGGCTGCTTTAACTCATCTCGACAGCTAGATT  691

seq1  TAGCCCAAAGAGAACAAAGTAATGTTTTCAACATTCTTGTTAAACTAGAG  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCCCAAAGAGAACAAAGTAATGTTTTCAACATTCTTGTTAAACTAGAG  741

seq1  GATGGTTTCTGTATTTTATATTCAGTCTAATTGCTCTTTAAATACATCAG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGTTTCTGTATTTTATATTCAGTCTAATTGCTCTTTAAATACATCAG  791

seq1  TATAGGTGGCTAGGCATATAGTTCAGTGGTACAGCACTTACTTACCTGGA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGGTGGCTAGGCATATAGTTCAGTGGTACAGCACTTACTTACCTGGA  841

seq1  CTGAGGTTACGGTTTCCATTGGTAGCACTGTAGAAACAAACAAACAAACA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGGTTACGGTTTCCATTGGTAGCACTGTAGAAACAAACAAACAAACA  891

seq1  AACAAACACACAAATGTATGTAAGACCTTTATAGAAAGAGGAACATTGAA  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAACACACAAATGTATGTAAGACCTTTATAGAAAGAGGAACATTGAA  941

seq1  TGATCATATAACGATTAATTGGATGAAACAGAACTTACACTTCAGGTTCC  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATCATATAACGATTAATTGGATGAAACAGAACTTACACTTCAGGTTCC  991

seq1  AGGTTGTGATAGCTTTAAGATGTTTGAACAGCATGATTATATGGTACAGG  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTGTGATAGCTTTAAGATGTTTGAACAGCATGATTATATGGTACAGG  1041

seq1  ATTCATGCACAAAATTTATTTTTTACACATGAATGAACAAAACAATAATA  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCATGCACAAAATTTATTTTTTACACATGAATGAACAAAACAATAATA  1091

seq1  ACATTAAATAAAGAATTC  1115
      ||||||||||||||||||
seq2  ACATTAAATAAAGAATTC  1109