BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-183P08
ChromosomeX (Build37)
Map Location 93,560,899 - 93,744,695
singlet/doubletdoublet
Overlap geneB230358A15Rik, Heph
Upstream gene2810002O09Rik, Asb12, LOC668202, AK129302, A130028J20Rik, 1700010D01Rik, Las1l, Msn, Psmb7-ps1, LOC668221, Vsig4
Downstream geneGpr165, LOC675824, LOC668234, EG668236, LOC668238, Pgr15l, Eda2r
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-183P08.bB6Ng01-183P08.g
ACCGA009455GA009456
length1,1091,045
definitionB6Ng01-183P08.b B6Ng01-183P08.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(93,743,599 - 93,744,695)(93,560,899 - 93,561,934)
sequence
gaattcacattttgacctcttgatatgttaataaaatatggggaaatata
tcttctgtcaaacttcatgctttcaataacttctaattaatcactcaggg
tttttctatccttcgctgtgatgacaccctttcttccaacctttttcgtt
gcatcagaaatgatgtttccaatgtctttgttcccattttcagaaattgt
agcaatatgatcaatttcttcaggggttgttacggatttagactgtattt
taagttcagcaattacaacatcaacagacaacatcatacatctctggatt
tccactggattagccactttactgacatcctagaagcccaccttggcaat
agacactgccagaacactaataatgatagtgccatcaccagcctctttgt
ttgtgttattggcaaaatcctggacaaattgagccaagatatttttgtat
ttatcatttaaatcaatttactttgcaacagtcttgcaataatatcccca
ttttttgttaatttgggacttccccaactctgttcaatgatcacagttct
tccccttggctccactttaacagctatagcatctgctagaaggtctacac
cttgaagcattaaggcttaagcatccacaccaaattttacattgttggca
taagccccagtgagatgaggatccaatgcccagaacactgatctcatctg
gctaagggactgtgggtagttgaagcatttctgtgaagaagtggtgggag
tgctcctggcaaggcaggccattggcgacaagtgagagcatattgcagct
tttaaagacgtgttcagagtctcacctatgtccccagtgctatttaattt
tgtagttccatatcctgttctcctttggtgaacaactccaaactttttac
cacatacttcaagtctgacctgttctgtacctcactcccaaagtctcatt
ttaagtcagatatttgaatttgccgaatactttgtatagaacactgagtt
actgaactcttctaaaagaaaaccttttgtagatatgaagtgaaaggttg
gtcccagacagatgttaaaaatatgctttccaaatgttcaccacatcgaa
ctgaaattt
gaattcctatcgggtacaataaacttaaccaactaccatggttggaaata
gactgtatggaccatatcctctatggaccatagaggagaacttactattg
ccactttactagaccactatcattcctaactgcattctaaataattatcc
ttatagctatacataaatgtagtttgtctcaacaaaaattttttatagta
aacacagggcattacagaaagtcacaaatttttaaaatgtgtagaaaaac
tgtttagtggtcagacccaattgatgcatcagcaatacaacctcttacac
acaaagcttagagaagactgcagaacagaagttaggaagagtgtaagagc
cagaaggttaaaatgtctgctttgagatagtgtctctataaatgttatga
aaacagcatccttatacttcacataaattcataactatgaaaatcctagg
gtaaggctcagagggatagaaaaattaatctctaagctctctgagacaac
ttaattaataaataatgtatcagtacttttctagttttggtgataagccc
agagttttttcacatgatagataagtgctttaccactgacctacaaccca
gcgcttatttatttcaatgttaaatatttacttcaatattttaaaagcta
ttttcatgagaagctataaattgaaaaccacatccaccattttcttcaag
tgaagtacaattaaaagctgtttatgaaacaagaatggctattgagttga
ctattatttgaagtttagctgtggtacttgggagttcattgtaccccttt
atatttttgtttggcattttattaacaaaaaaaattaaccttggcagagt
tgtggtagtacattcttgtaataccagcaccgggcaggctgaggcaaggt
gatcatgaatttcagataaacctgggccacagagtgagactcttatctat
ctcaaaaacaaatgaacaacagtgccaaatttaactattatttttgagaa
cttggccatggtctgcttctgaaacacattctacaagattttccc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chrX_93743599_93744695
seq2: B6Ng01-183P08.b_47_1155 (reverse)

seq1  AAATTTCAGTCCGATGT-GTG-ACATTTGGAAAGC-TA-TTTTAACATCT  46
      |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||
seq2  AAATTTCAGTTCGATGTGGTGAACATTTGGAAAGCATATTTTTAACATCT  50

seq1  GTCTGTGACCAACC-TTCACTTCATATCTACAAA--GGTTTCTTTTAGAA  93
      ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||
seq2  GTCTGGGACCAACCTTTCACTTCATATCTACAAAAGGTTTTCTTTTAGAA  100

seq1  GAG-TCAGTAACTCAGTGTTCTATAC-AAGTATTCGGC-AATTCAATTAT  140
      ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||
seq2  GAGTTCAGTAACTCAGTGTTCTATACAAAGTATTCGGCAAATTCAAATAT  150

seq1  CTGACTTAAAATGAGACTTTGGGAGTGAGGTACAGAACAGGTCAGACTTG  190
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACTTAAAATGAGACTTTGGGAGTGAGGTACAGAACAGGTCAGACTTG  200

seq1  AAGTATGTGGT-AAAAGTTTGGAGTTGTTCACC-AAGGAGAACAGGATAT  238
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  AAGTATGTGGTAAAAAGTTTGGAGTTGTTCACCAAAGGAGAACAGGATAT  250

seq1  GGAACTACAAAATTAAATAGCACTGGGGACATAGGTGAGACTCTGAACAC  288
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACTACAAAATTAAATAGCACTGGGGACATAGGTGAGACTCTGAACAC  300

seq1  GTCTTTAAAAGCTGCAATATGCTCTCACTTGTCGCCAATGGCCTGCCTTG  338
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTTAAAAGCTGCAATATGCTCTCACTTGTCGCCAATGGCCTGCCTTG  350

seq1  CCAGGAGCACTCCCACCACTTCTTCACAGAAATGCTTCAACTACCCACAG  388
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGAGCACTCCCACCACTTCTTCACAGAAATGCTTCAACTACCCACAG  400

seq1  TCCCTTAGCCAGATGAGATCAGTGTTCTGGGCATTGGATCCTCATCTCAC  438
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTTAGCCAGATGAGATCAGTGTTCTGGGCATTGGATCCTCATCTCAC  450

seq1  TGGGGCTTATGCCAACAATGTAAAATTTGGTGTGGATGCTTAAGCCTTAA  488
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGCTTATGCCAACAATGTAAAATTTGGTGTGGATGCTTAAGCCTTAA  500

seq1  TGCTTCAAGGTGTAGACCTTCTAGCAGATGCTATAGCTGTTAAAGTGGAG  538
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTCAAGGTGTAGACCTTCTAGCAGATGCTATAGCTGTTAAAGTGGAG  550

seq1  CCAAGGGGAAGAACTGTGATCATTGAACAGAGTTGGGGAAGTCCCAAATT  588
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGGGGAAGAACTGTGATCATTGAACAGAGTTGGGGAAGTCCCAAATT  600

seq1  AACAAAAAATGGGGATATTATTGCAAGACTGTTGCAAAGTAAATTGATTT  638
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAAAAATGGGGATATTATTGCAAGACTGTTGCAAAGTAAATTGATTT  650

seq1  AAATGATAAATACAAAAATATCTTGGCTCAATTTGTCCAGGATTTTGCCA  688
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGATAAATACAAAAATATCTTGGCTCAATTTGTCCAGGATTTTGCCA  700

seq1  ATAACACAAACAAAGAGGCTGGTGATGGCACTATCATTATTAGTGTTCTG  738
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACACAAACAAAGAGGCTGGTGATGGCACTATCATTATTAGTGTTCTG  750

seq1  GCAGTGTCTATTGCCAAGGTGGGCTTCTAGGATGTCAGTAAAGTGGCTAA  788
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTGTCTATTGCCAAGGTGGGCTTCTAGGATGTCAGTAAAGTGGCTAA  800

seq1  TCCAGTGGAAATCCAGAGATGTATGATGTTGTCTGTTGATGTTGTAATTG  838
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGTGGAAATCCAGAGATGTATGATGTTGTCTGTTGATGTTGTAATTG  850

seq1  CTGAACTTAAAATACAGTCTAAATCCGTAACAACCCCTGAAGAAATTGAT  888
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAACTTAAAATACAGTCTAAATCCGTAACAACCCCTGAAGAAATTGAT  900

seq1  CATATTGCTACAATTTCTGAAAATGGGAACAAAGACATTGGAAACATCAT  938
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATTGCTACAATTTCTGAAAATGGGAACAAAGACATTGGAAACATCAT  950

seq1  TTCTGATGCAACGAAAAAGGTTGGAAGAAAGGGTGTCATCACAGCGAAGG  988
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGATGCAACGAAAAAGGTTGGAAGAAAGGGTGTCATCACAGCGAAGG  1000

seq1  ATAGAAAAACCCTGAGTGATTAATTAGAAGTTATTGAAAGCATGAAGTTT  1038
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAAAAACCCTGAGTGATTAATTAGAAGTTATTGAAAGCATGAAGTTT  1050

seq1  GACAGAAGATATATTTCCCCATATTTTATTAACATATCAAGAGGTCAAAA  1088
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGAAGATATATTTCCCCATATTTTATTAACATATCAAGAGGTCAAAA  1100

seq1  TGTGAATTC  1097
      |||||||||
seq2  TGTGAATTC  1109

seq1: chrX_93560899_93561934
seq2: B6Ng01-183P08.g_69_1113

seq1  GAATTCCTATCGGGTACAATAAACTTAACCAACTACCATGGTTGGAAATA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTATCGGGTACAATAAACTTAACCAACTACCATGGTTGGAAATA  50

seq1  GACTGTATGGACCATATCCTCTATGGACCATAGAGGAGAACTTACTATTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGTATGGACCATATCCTCTATGGACCATAGAGGAGAACTTACTATTG  100

seq1  CCACTTTACTAGACCACTATCATTCCTAACTGCATTCTAAATAATTATCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTTTACTAGACCACTATCATTCCTAACTGCATTCTAAATAATTATCC  150

seq1  TTATAGCTATACATAAATGTAGTTTGTCTCAACAAAAATTTTTTATAGTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAGCTATACATAAATGTAGTTTGTCTCAACAAAAATTTTTTATAGTA  200

seq1  AACACAGGGCATTACAGAAAGTCACAAATTTTTAAAATGTGTAGAAAAAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACAGGGCATTACAGAAAGTCACAAATTTTTAAAATGTGTAGAAAAAC  250

seq1  TGTTTAGTGGTCAGACCCAATTGATGCATCAGCAATACAACCTCTTACAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTAGTGGTCAGACCCAATTGATGCATCAGCAATACAACCTCTTACAC  300

seq1  ACAAAGCTTAGAGAAGACTGCAGAACAGAAGTTAGGAAGAGTGTAAGAGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAGCTTAGAGAAGACTGCAGAACAGAAGTTAGGAAGAGTGTAAGAGC  350

seq1  CAGAAGGTTAAAATGTCTGCTTTGAGATAGTGTCTCTATAAATGTTATGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAGGTTAAAATGTCTGCTTTGAGATAGTGTCTCTATAAATGTTATGA  400

seq1  AAACAGCATCCTTATACTTCACATAAATTCATAACTATGAAAATCCTAGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAGCATCCTTATACTTCACATAAATTCATAACTATGAAAATCCTAGG  450

seq1  GTAAGGCTCAGAGGGATAGAAAAATTAATCTCTAAGCTCTCTGAGACAAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAGGCTCAGAGGGATAGAAAAATTAATCTCTAAGCTCTCTGAGACAAC  500

seq1  TTAATTAATAAATAATGTATCAGTACTTTTCTAGTTTTGGTGATAAGCCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATTAATAAATAATGTATCAGTACTTTTCTAGTTTTGGTGATAAGCCC  550

seq1  AGAGTTTTTTCACATGATAGATAAGTGCTTTACCACTGACCTACAACCCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTTTTTTCACATGATAGATAAGTGCTTTACCACTGACCTACAACCCA  600

seq1  GCGCTTATTTATTTCAATGTTAAATATTTACTTCAATATTTTAAAAGCTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGCTTATTTATTTCAATGTTAAATATTTACTTCAATATTTTAAAAGCTA  650

seq1  TTTTCATGAGAAGCTATAAATTGAAAACCACATCCACCATTTTCTTCAAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCATGAGAAGCTATAAATTGAAAACCACATCCACCATTTTCTTCAAG  700

seq1  TGAAGTACAATTAAAAGCTGTTTATGAAACAAGAATGGCTATTGAGTTGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGTACAATTAAAAGCTGTTTATGAAACAAGAATGGCTATTGAGTTGA  750

seq1  CTATTATTTGAAG-TTAGCTGTGGTACTTGGGAGTTCATTGTACCCCTTT  799
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTATTTGAAGTTTAGCTGTGGTACTTGGGAGTTCATTGTACCCCTTT  800

seq1  ATATTTTTGTTTGGCATTTTATTAAC-AAAAAAATTAACCTTGGCAGAG-  847
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| 
seq2  ATATTTTTGTTTGGCATTTTATTAACAAAAAAAATTAACCTTGGCAGAGT  850

seq1  TGTGGTAGTACATTCTTGTAATACCAGCACCGGGCAGGCTGAGGCAAGGT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGTAGTACATTCTTGTAATACCAGCACCGGGCAGGCTGAGGCAAGGT  900

seq1  GATCATGAATTCAAGATAAACCTGGGCCACAGAGTGAGAC-CCTATCTAT  946
      |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||
seq2  GATCATGAATTTCAGATAAACCTGGGCCACAGAGTGAGACTCTTATCTAT  950

seq1  CTCAAAAACAAATGAAC-ACAGTGCCAAA-TTAACTATTATTTTAGAGAA  994
      ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||
seq2  CTCAAAAACAAATGAACAACAGTGCCAAATTTAACTATTATTTTTGAGAA  1000

seq1  C-TGGCCATGGTCTGC-TCTG-AACACATTCTACAAGATTTTCCC  1036
      | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGCCATGGTCTGCTTCTGAAACACATTCTACAAGATTTTCCC  1045