BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-257D13
ChromosomeX (Build37)
Map Location 154,234,200 - 154,393,326
singlet/doubletdoublet
Overlap geneKlhl34, Cnksr2
Upstream geneLOC434885, Phex, Gm1947, Sms, LOC100041181, EG625253, Mbtps2, LOC100040239, LOC667460, LOC667465, Smpx
Downstream geneEG667483, LOC671033, LOC667487, LOC436243
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-257D13.bB6Ng01-257D13.g
ACCGA062976GA062977
length350702
definitionB6Ng01-257D13.b B6Ng01-257D13.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(154,234,200 - 154,234,548)(154,392,631 - 154,393,326)
sequence
ctaacagaaggagcaggggctgtctctgactctgttacctgcctttggat
ccctttccctaaatggggtgctttgtctagtttcaataggagaagatgtg
cttagttctactgcatcttgatatgccaagatggattgatatctatgtag
catccccccttttctgaggggaaaggaaagactggagagtggggagagag
gaaggtagatagaaggactgggaggggaagagagagggaaagctttgatc
aggatgcacagcttttaaatgaattaattaaaataactactagtcattgt
cagtagttatggaatacagacctgccggctgaatatgataagtgattggt

gaattcatgcctagcctgttctgcatagttaattcccagacaagccagga
gtgagaccctctcttagagaaacgagagagagagagagagagagagagag
agagagagagagagagagagagatttgtgaggtaataaaaacaaatttca
aatggcacatatagtagtataattgtttgaatattttaaaagagttattt
atctatctatctatgtatctatctatctatctatctatctatctatctat
ttatttcatgtatgtaagtacgctgtagctgtcttcagacacaccagaag
agggcatcagattccattacagatggttgtgagccaccatgtggttgctg
ggaattgaactcaggacctctggaagagcagtcactgctcctaacagctg
agccatctctccagccccttgtggtcttatttatttatttatttatttat
ttattattcaatgtatatgagtacactgtagctgtacagatggtggtgag
cctttgtgtggttgttgggaattgaattttggacctctgctcactcaggt
cggccgcactcactttcagtcaacaccgctcgctcagtccctgctttgct
ctggcccaaagatttatttatttatttattgtatgtaaaatacattgttg
cttgtcttcagacacacttgaagaggggcatctgatctcatttatggtgg
tt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chrX_154234200_154234548
seq2: B6Ng01-257D13.b_53_401

seq1  CTAACAGAAGGAGCAGGGGCTGTCTCTGACTCTGTTACCTGCCTTTGGAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACAGAAGGAGCAGGGGCTGTCTCTGACTCTGTTACCTGCCTTTGGAT  50

seq1  CCCTTTCCCTAAATGGGGTGCTTTGTCTAGTTTCAATAGGAGAAGATGTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTTCCCTAAATGGGGTGCTTTGTCTAGTTTCAATAGGAGAAGATGTG  100

seq1  CTTAGTTCTACTGCATCTTGATATGCCAAGATGGATTGATATCTATGTAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGTTCTACTGCATCTTGATATGCCAAGATGGATTGATATCTATGTAG  150

seq1  CATCCCCCCTTTTCTGAGGGGAAAGGAAAGACTGGAGAGTGGGGAGAGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCCCCCTTTTCTGAGGGGAAAGGAAAGACTGGAGAGTGGGGAGAGAG  200

seq1  GAAGGTAGATAGAAGGACTGGGAGGGGAAGAGAGAGGGAAAGCTATGATC  250
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  GAAGGTAGATAGAAGGACTGGGAGGGGAAGAGAGAGGGAAAGCTTTGATC  250

seq1  AGGATGCAAAGTAGATAAATGAATTAATTAAAATAACTACTAGTCATTGT  300
      |||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATGCACAGCTTTTAAATGAATTAATTAAAATAACTACTAGTCATTGT  300

seq1  CAGTAGTCATGGAAGAAAGACCTGCCTGCTGAATATGATAAGTGATTGG  349
      ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTAGTTATGGAATACAGACCTGCCGGCTGAATATGATAAGTGATTGG  349

seq1: chrX_154392631_154393326
seq2: B6Ng01-257D13.g_68_769 (reverse)

seq1  AACCACCAT-AATGAGATCAGATG-CCCTCTTCTAGTGTGTCTGAAGAC-  47
      ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| 
seq2  AACCACCATAAATGAGATCAGATGCCCCTCTTCAAGTGTGTCTGAAGACA  50

seq1  AGCAACAATGTA-TTTACATACAATAAATAAATAAATAAATCTTTGGGCC  96
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAACAATGTATTTTACATACAATAAATAAATAAATAAATCTTTGGGCC  100

seq1  AGAGC-AAGCAGGGACTGAGCGAGCGGTGTTGACTG-AAGTGAGTGCGGC  144
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  AGAGCAAAGCAGGGACTGAGCGAGCGGTGTTGACTGAAAGTGAGTGCGGC  150

seq1  CGACCTGAGTGAGCAGAGGTCCAAAATTCAATTCCCAACAACCACACAAA  194
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGACCTGAGTGAGCAGAGGTCCAAAATTCAATTCCCAACAACCACACAAA  200

seq1  GGCTCACCACCATCTGTACAGCTACAGTGTACTCATATACATTGAATAAT  244
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCACCACCATCTGTACAGCTACAGTGTACTCATATACATTGAATAAT  250

seq1  AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAGACCACAAGGGGCTGGAGAGATGG  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAGACCACAAGGGGCTGGAGAGATGG  300

seq1  CTCAGCTGTTAGGAGCAGTGACTGCTCTTCCAGAGGTCCTGAGTTCAATT  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGCTGTTAGGAGCAGTGACTGCTCTTCCAGAGGTCCTGAGTTCAATT  350

seq1  CCCAGCAACCACATGGTGGCTCACAACCATCTGTAATGGAATCTGATGCC  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGCAACCACATGGTGGCTCACAACCATCTGTAATGGAATCTGATGCC  400

seq1  CTCTTCTGGTGTGTCTGAAGACAGCTACAGCGTACTTACATACATGAAAT  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTCTGGTGTGTCTGAAGACAGCTACAGCGTACTTACATACATGAAAT  450

seq1  AAATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATACATAGATAGATAG  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATACATAGATAGATAG  500

seq1  ATAAATAACTCTTTTAAAATATTCAAACAATTATACTACTATATGTGCCA  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATAACTCTTTTAAAATATTCAAACAATTATACTACTATATGTGCCA  550

seq1  TTTGAAATTTGTTTTTATTACCTCACAAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAAATTTGTTTTTATTACCTCACAAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT  600

seq1  CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGTTTCTCTAAGAGAGGGTCTC  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGTTTCTCTAAGAGAGGGTCTC  650

seq1  ACTCCTGGCTTGTCTGGGAATTAACTATGCAGAACAGGCTAGGCATGAAT  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCTGGCTTGTCTGGGAATTAACTATGCAGAACAGGCTAGGCATGAAT  700

seq1  TC  696
      ||
seq2  TC  702