BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-282P19
ChromosomeX (Build37)
Map Location 142,688,408 - 142,813,528
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC623591, Lhfpl1, Amot, EG434860, LOC100039313, LOC623697, LOC623731, LOC237096, LOC100039558
Downstream geneEG666730, EG245663, Htr2c
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-282P19.bB6Ng01-282P19.g
ACCGA082060GA082061
length9121,120
definitionB6Ng01-282P19.b B6Ng01-282P19.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(142,688,408 - 142,689,319)(142,812,406 - 142,813,528)
sequence
gaattctccaagtactatgtctgaagtacattatgtcttctgcaatatgt
ggtcttaccttcaacctctgggaggcaaggaggggcaacagcaataacct
gtattgtttcagcagaatctttgagtcctctgaccaacaactctaaatga
aagctttcttatgtctgatattagagtttttgttagatattctatggctt
tttggaggaacgttgtcagctcaaggaacataactttatttaaactcttt
ctctcactctttctgtctttatatgtatatgtgtgtttatatacattata
tacatatgtgtatatgttatatacatataatctaatacataatgataata
cggacatgatattatactttatatataatatgacataatatgtgtttata
tagacatatatatgtgtgtatacatatgtataaacacacacatataaata
tgtatatatatatatacacacatatatatatatatgtatacacacacaca
cacatatatatatatacacacacatatatatatatatatatatatatata
cacacacacacacacacacacatatatatatatatatatatcaggtatat
aaaaataatttggtttcttaaagcttctcaataaaaaaagagaggatatg
tcaggaggggaaatgaataagtgtgttatagaagtagttagaagggaagg
aggagaaatggatttaatgaaatcagattattgtccttcatgaaaattaa
acaacaaatatattaataattaaaacattataaggtctttgtgcaatcta
tagacctattttatctgagagcaggcatctatgtattaaatgtgtcttta
ttttgagattcagctatattttatgtctcttagttagagtaatctcacac
tgcctctttgac
gaattcttttgaatttttattccactgttaaaattcttttggggatttaa
aaagaaaacttgaagcaaaaagaagtattcacaaatctctctgtgaggat
ccaataactgacccttaggaaagagaaatgtattctctggggggcttatg
ctaccttttcttgccacctgggtagctgtcagaatgaaaaaaaaaaaaca
aaaaaaccaagaaactaaaatgaaaaagcttcataaaatgaagacttgaa
tagcttccaggagcagtagagaattgttattcagatggaaggatctgctt
caatcatctgggaaactactttttttttttgacaataagtatgaaacctc
acagcaattaaagttatcttactagcttgctacatcaatgtttcttacat
tgtgcctctgaatttactattccagtggcatccactgtcaggagctagtg
attactgaggcagtcagtgctttaagaaaacccatctcagctgtgcagaa
gctcaatattatgtccctttttatttgaatagagttttgatctgggctaa
gataaatctacaatgaaaatgtatttaaccaagaagaaacccatagctat
ctctttacccttcatttttcctgcaagtattgtgacaaggatactgaaag
gacacaaaatgtttgtttcacagtctgataaggaaattttctgttcaatg
ataaggaattgctaaaggctttgtttcatttactatgtagactttgtcta
cataaaactttcaatgttcttaagtatatgataatcactaaaatgtactg
aaagtatagagatataattaaaaatgttaatgttaagcagggcccgtgct
tctctgaatcagagtgggcttgaaaaagtagagagttagctgggaaaggg
gaagagaacagatagatcattataaacagtgataacaaagaatttgcaga
gagcacctttcctaatagaacaatatgtttatgaaatttcatctaggttt
gctattctcacatcacatactctgtgctttcgccagattagctaattaaa
ttattgtatattactgtctgcatgcaagtactatggaatgctttttaatg
tggataaaactagttcagtc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chrX_142688408_142689319
seq2: B6Ng01-282P19.b_47_958

seq1  GAATTCTCCAAGTACTATGTCTGAAGTACATTATGTCTTCTGCAATATGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCAAGTACTATGTCTGAAGTACATTATGTCTTCTGCAATATGT  50

seq1  GGTCTTACCTTCAACCTCTGGGAGGCAAGGAGGGGCAACAGCAATAACCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTTACCTTCAACCTCTGGGAGGCAAGGAGGGGCAACAGCAATAACCT  100

seq1  GTATTGTTTCAGCAGAATCTTTGAGTCCTCTGACCAACAACTCTAAATGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTGTTTCAGCAGAATCTTTGAGTCCTCTGACCAACAACTCTAAATGA  150

seq1  AAGCTTTCTTATGTCTGATATTAGAGTTTTTGTTAGATATTCTATGGCTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTTTCTTATGTCTGATATTAGAGTTTTTGTTAGATATTCTATGGCTT  200

seq1  TTTGGAGGAACGTTGTCAGCTCAAGGAACATAACTTTATTTAAACTCTTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGAGGAACGTTGTCAGCTCAAGGAACATAACTTTATTTAAACTCTTT  250

seq1  CTCTCACTCTTTCTGTCTTTATATGTATATGTGTGTTTATATACATTATA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCACTCTTTCTGTCTTTATATGTATATGTGTGTTTATATACATTATA  300

seq1  TACATATGTGTATATGTTATATACATATAATCTAATACATAATGATAATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATATGTGTATATGTTATATACATATAATCTAATACATAATGATAATA  350

seq1  CGGACATGATATTATACTTTATATATAATATGACATAATATGTGTTTATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGACATGATATTATACTTTATATATAATATGACATAATATGTGTTTATA  400

seq1  TAGACATATATATGTGTGTATACATATGTATAAACACACACATATAAATA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGACATATATATGTGTGTATACATATGTATAAACACACACATATAAATA  450

seq1  TGTATATATATATATACACACATATATATATATATGTATACACACACACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATATATATATATACACACATATATATATATATGTATACACACACACA  500

seq1  CACATATATATATATACACACACATATATATATATATATATATATATATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATATATATATATACACACACATATATATATATATATATATATATATA  550

seq1  CACACACACACACACACACACATATATATATATATATATATCAGGTATAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACACACACACACACACATATATATATATATATATATCAGGTATAT  600

seq1  AAAAATAATTTGGTTTCTTAAAGCTTCTCAATAAAAAAAGAGAGGATATG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATAATTTGGTTTCTTAAAGCTTCTCAATAAAAAAAGAGAGGATATG  650

seq1  TCAGGAGGGGAAATGAATAAGTGTGTTATAGAAGTAGTTAGAAGGGAAGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGAGGGGAAATGAATAAGTGTGTTATAGAAGTAGTTAGAAGGGAAGG  700

seq1  AGGAGAAATGGATTTAATGAAATCAGATTATTGTCCTTCATG-AAATTAA  749
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  AGGAGAAATGGATTTAATGAAATCAGATTATTGTCCTTCATGAAAATTAA  750

seq1  ACAACAAATATTTTAATAATTAAAACATTATAAGGTCTTTG-GCAACCTA  798
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||
seq2  ACAACAAATATATTAATAATTAAAACATTATAAGGTCTTTGTGCAATCTA  800

seq1  TAGACCTATTTTATCTGAGAGCAGGCATCTATGTATTTAATTTG-CTTTA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||
seq2  TAGACCTATTTTATCTGAGAGCAGGCATCTATGTATTAAATGTGTCTTTA  850

seq1  TTTTTGAGATTCAGCTTTATTTTTATGTTTCTTAGTTTAGAGTAATTTCA  897
       ||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||| |||
seq2  -TTTTGAGATTCAGCTATA-TTTTATGTCTCTTAG-TTAGAGTAATCTCA  897

seq1  CACTGCCTCCTTGAC  912
      ||||||||| |||||
seq2  CACTGCCTCTTTGAC  912

seq1: chrX_142812406_142813528
seq2: B6Ng01-282P19.g_69_1188 (reverse)

seq1  GACTGAACCTAATTTTAT-CACATTAAAAACCATTCCATAGTTACTTTGC  49
      ||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||
seq2  GACTGAA-CTAGTTTTATCCACATTAAAAAGCATTCCATAG-TAC-TTGC  47

seq1  ATGGCAGACAGT-ATATACATAATTTTAATTTGGCTTATCTGGCGAAAGC  98
      || ||||||||| |||||||  | ||||| || ||| |||||||||||||
seq2  AT-GCAGACAGTAATATACAATAATTTAA-TTAGCTAATCTGGCGAAAGC  95

seq1  ACAGAGTATGTGATGTTGGAGGAATAGCAAA-CTAGATGAAATTTCATAA  147
      ||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  ACAGAGTATGTGATGT--GA-GAATAGCAAACCTAGATGAAATTTCATAA  142

seq1  ACATATTGTTCTATTAGG-AAGGTGCTCTCTGCAAATTCTTTGTTATCAC  196
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATATTGTTCTATTAGGAAAGGTGCTCTCTGCAAATTCTTTGTTATCAC  192

seq1  TG-TTATAATGATCTATCTGTTCTCTTCCCCTTTCCCAGCTAACTCTCTA  245
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTATAATGATCTATCTGTTCTCTTCCCCTTTCCCAGCTAACTCTCTA  242

seq1  CTTTTTCAAGCCCACTCTGATTCAGAGAAGCACGGGCCCTGCTTAACATT  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTTCAAGCCCACTCTGATTCAGAGAAGCACGGGCCCTGCTTAACATT  292

seq1  AACATTTTTAATTATATCTCTATACTTTCAGTACATTTTAGTGATTATCA  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATTTTTAATTATATCTCTATACTTTCAGTACATTTTAGTGATTATCA  342

seq1  TATACTTAAGAACATTGAAAGTTTTATGTAGACAAAGTCTACATAGTAAA  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACTTAAGAACATTGAAAGTTTTATGTAGACAAAGTCTACATAGTAAA  392

seq1  TGAAACAAAGCCTTTAGCAATTCCTTATCATTGAACAGAAAATTTCCTTA  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAACAAAGCCTTTAGCAATTCCTTATCATTGAACAGAAAATTTCCTTA  442

seq1  TCAGACTGTGAAACAAACATTTTGTGTCCTTTCAGTATCCTTGTCACAAT  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGACTGTGAAACAAACATTTTGTGTCCTTTCAGTATCCTTGTCACAAT  492

seq1  ACTTGCAGGAAAAATGAAGGGTAAAGAGATAGCTATGGGTTTCTTCTTGG  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGCAGGAAAAATGAAGGGTAAAGAGATAGCTATGGGTTTCTTCTTGG  542

seq1  TTAAATACATTTTCATTGTAGATTTATCTTAGCCCAGATCAAAACTCTAT  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAATACATTTTCATTGTAGATTTATCTTAGCCCAGATCAAAACTCTAT  592

seq1  TCAAATAAAAAGGGACATAATATTGAGCTTCTGCACAGCTGAGATGGGTT  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAATAAAAAGGGACATAATATTGAGCTTCTGCACAGCTGAGATGGGTT  642

seq1  TTCTTAAAGCACTGACTGCCTCAGTAATCACTAGCTCCTGACAGTGGATG  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTAAAGCACTGACTGCCTCAGTAATCACTAGCTCCTGACAGTGGATG  692

seq1  CCACTGGAATAGTAAATTCAGAGGCACAATGTAAGAAACATTGATGTAGC  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTGGAATAGTAAATTCAGAGGCACAATGTAAGAAACATTGATGTAGC  742

seq1  AAGCTAGTAAGATAACTTTAATTGCTGTGAGGTTTCATACTTATTGTCAA  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTAGTAAGATAACTTTAATTGCTGTGAGGTTTCATACTTATTGTCAA  792

seq1  AAAAAAAAAGTAGTTTCCCAGATGATTGAAGCAGATCCTTCCATCTGAAT  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAAAGTAGTTTCCCAGATGATTGAAGCAGATCCTTCCATCTGAAT  842

seq1  AACAATTCTCTACTGCTCCTGGAAGCTATTCAAGTCTTCATTTTATGAAG  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAATTCTCTACTGCTCCTGGAAGCTATTCAAGTCTTCATTTTATGAAG  892

seq1  CTTTTTCATTTTAGTTTCTTGGTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTCATTCTGA  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTTCATTTTAGTTTCTTGGTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTCATTCTGA  942

seq1  CAGCTACCCAGGTGGCAAGAAAAGGTAGCATAAGCCCCCCAGAGAATACA  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTACCCAGGTGGCAAGAAAAGGTAGCATAAGCCCCCCAGAGAATACA  992

seq1  TTTCTCTTTCCTAAGGGTCAGTTATTGGATCCTCACAGAGAGATTTGTGA  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTCTTTCCTAAGGGTCAGTTATTGGATCCTCACAGAGAGATTTGTGA  1042

seq1  ATACTTCTTTTTGCTTCAAGTTTTCTTTTTAAATCCCCAAAAGAATTTTA  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTTCTTTTTGCTTCAAGTTTTCTTTTTAAATCCCCAAAAGAATTTTA  1092

seq1  ACAGTGGAATAAAAATTCAAAAGAATTC  1123
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTGGAATAAAAATTCAAAAGAATTC  1120