seq1: chrX_3646867_3647979
seq2: B6Ng01-284G03.b_47_1142
seq1 GAATTCATTGCTAACCCTATTGTCCAAAGCACATGACAACAGTAAAGATC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAATTCATTGCTAACCCTATTGTCCAAAGCACATGACAACAGTAAAGATC 50
seq1 CTATCTTGCCCCTCCCACCATATGATTAACGTCATTAATAAATTTTCTGC 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTATCTTGCCCCTCCCACCATATGATTAACGTCATTAATAAATTTTCTGC 100
seq1 TGTCTCAAGCAAATTCATTGGAGGTTAAATACCTTAACATTCAGCTGGAT 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGTCTCAAGCAAATTCATTGGAGGTTAAATACCTTAACATTCAGCTGGAT 150
seq1 GGTGATGGCTCATGCCTTTAATCCCAGAACTCAGGAGGCAAATCTAGGCA 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGTGATGGCTCATGCCTTTAATCCCAGAACTCAGGAGGCAAATCTAGGCA 200
seq1 TATCTCTGAGTTTGAGGTCAGCCTGGTCTATATAGTATGTCTCAGGACAG 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TATCTCTGAGTTTGAGGTCAGCCTGGTCTATATAGTATGTCTCAGGACAG 250
seq1 CCAGGGCTACAGGGAGAGATCCTGTCTTGGAAAACAAATAAAATAATACA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCAGGGCTACAGGGAGAGATCCTGTCTTGGAAAACAAATAAAATAATACA 300
seq1 AATATAAATATAAACAAAACAATGCAACATTCTTAACTGGAAAGTATTTG 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AATATAAATATAAACAAAACAATGCAACATTCTTAACTGGAAAGTATTTG 350
seq1 GCTATAGATGCTGAATGAAAGCCTTTTCTAAAGCTAAACTATATGCTGTC 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GCTATAGATGCTGAATGAAAGCCTTTTCTAAAGCTAAACTATATGCTGTC 400
seq1 AGCAATTGGTAATTTATCTCCACAATACAATAATAAGAAATACTGAAACT 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGCAATTGGTAATTTATCTCCACAATACAATAATAAGAAATACTGAAACT 450
seq1 ATGTGTACTTCCGTCTGATAGCACATAAGTCATTAATATACCATACAGAA 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATGTGTACTTCCGTCTGATAGCACATAAGTCATTAATATACCATACAGAA 500
seq1 TCAAAAATAATTGTCAGGGTATTCCTTCTAAATAAAATAATAATAATAAA 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCAAAAATAATTGTCAGGGTATTCCTTCTAAATAAAATAATAATAATAAA 550
seq1 AATAATTCCTTCTAAAGGCTCGGAATAATTTGTCCTGTGTGTCCTTTGCT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AATAATTCCTTCTAAAGGCTCGGAATAATTTGTCCTGTGTGTCCTTTGCT 600
seq1 TCCACTTTTTTTTTTCTTCAACACAACCAAAGTACTTTTCACAAAGAAAA 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCCACTTTTTTTTTTCTTCAACACAACCAAAGTACTTTTCACAAAGAAAA 650
seq1 TAGTTATAAATTGGAGCCTTGGACCCTTTGTTTAATGCCTTAAATACCCC 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TAGTTATAAATTGGAGCCTTGGACCCTTTGTTTAATGCCTTAAATACCCC 700
seq1 TTGAGTAGGATGGGCTGTTTTGTGAAATACTTGTGATCATTCTATTGAGC 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTGAGTAGGATGGGCTGTTTTGTGAAATACTTGTGATCATTCTATTGAGC 750
seq1 ATAGATGCCTAAAATCTCTAGCTACCAAGCTCAATGGAGGCAAAGGCTAC 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATAGATGCCTAAAATCTCTAGCTACCAAGCTCAATGGAGGCAAAGGCTAC 800
seq1 TGGAGACATGTGGGTCTTGTGTCTCATTTGGAGTGAGGATCAACATGATG 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGGAGACATGTGGGTCTTGTGTCTCATTTGGAGTGAGGATCAACATGATG 850
seq1 TTAGTTATACACACATTAAATTATATTTCCACATCAGAGTGCATCCTACA 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTAGTTATACACACATTAAATTATATTTCCACATCAGAGTGCATCCTACA 900
seq1 TGTACTAAGAATTGTGCCTGCATTTCTTGGCCCATGAGGAAAGTGTTTTT 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2 TGTACTAAGAATTGTGCCTGCATTTCTTGGCCCATGAGGAAAGTG-TTTT 949
seq1 AGAACACTAATTCTTTGATTTCTTCCCCTTCCCATCCCTTTTTGGTTGGT 1000
||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |
seq2 AGAACACTAATTC-TTGATTTCTTCCCCTT-CCATCC--TTTTGGT--GG 993
seq1 TCAACAAAGAGAAAACAGAATCTCAGGAAAAGGAAAAATCAAATACTTTC 1050
|||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||
seq2 TCAACAAAGAGAAAACAG-ATCTCA-GAAAAGG-AAAATCAAATACTTTC 1040
seq1 TCTAATGCTTAATGAAGGTACTGGTAGGAAGAATAAAGGCTTTTATTTTC 1100
||| |||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||
seq2 TCT-ATGCTT-ATGA--GTACTGGTAAGAAGAAT-AAGGC-TTTATTTT- 1083
seq1 CTAAGTGCTAAAA 1113
||| ||||||||
seq2 CTAGTTGCTAAAA 1096
| seq1: chrX_3786292_3786524
seq2: B6Ng01-284G03.g_75_307 (reverse)
seq1 CACACCCCAAACCTACCCACCATGCTACCTTATCTCTCACCACCCAGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CACACCCCAAACCTACCCACCATGCTACCTTATCTCTCACCACCCAGAGA 50
seq1 CAGCCTTTCTTCTTGGAATTGCTTCTCCCAGGGTTAACTCTTTAATGTCT 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAGCCTTTCTTCTTGGAATTGCTTCTCCCAGGGTTAACTCTTTAATGTCT 100
seq1 CCATCACTAGGTATGCATCGGTCCTTCTGGATTCCCAGGTCCTTTAGCCT 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCATCACTAGGTATGCATCGGTCCTTCTGGATTCCCAGGTCCTTTAGCCT 150
seq1 CTCCTCAGGGTCCTCTCTGATTGGCTCACCCTGCCCACCCTTGCTGTATA 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTCCTCAGGGTCCTCTCTGATTGGCTCACCCTGCCCACCCTTGCTGTATA 200
seq1 CCTCTTTACACTGCTGTGTGTATCCTTCTTCCT 233
|||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCTCTTTACACTGCTGTGTGTATCCTTCTTCCT 233
|