BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-296L08
ChromosomeX (Build37)
Map Location 112,586,999 - 112,695,472
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneKlhl4, Gm1866, EG546361, EG237009, 4930524E20Rik, LOC237008, EG664969, EG546362, LOC100039255, LOC623913, LOC546363
Downstream geneLOC100039277, Cpxcr1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-296L08.bB6Ng01-296L08.g
ACCGA092247GA092248
length1,188584
definitionB6Ng01-296L08.b B6Ng01-296L08.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(112,586,999 - 112,588,174)(112,694,889 - 112,695,472)
sequence
gaattcatatatatgtagcaaaaagaataacttagttgggtgcataatta
gaatttccaaattttagctcattctaggctaaatcatcccacatagatat
tcagaaagctaattaagatctggagagtggattcaatttgtaaaagagct
caacattcaagaatggaactctgagtttgtgtcccccagcatctaagtaa
aaagctggatatagctgcacatgtaaatctagcagtgtggagaaaaagag
atggatcaaaagagctcactggatatccagtctatatgcaacatgaaata
ctatctcaacccaataaggtgatacataaaaacagtcaatgtgtcctgct
ctttcctttgcatatatgcttcaaattatgcaaacttatgtgaatgcaac
acaaacatatatcaaactcattgcacataaatgtaaataatacatataca
cacaaatgaaaggaatttataacagtattaattaataagccaatttcact
actaatttcaggaattctatatgtatttttgtagttcaatatttttgttt
taagtatgattactttattgagaaggctgctttgtctaacttgattttgc
ttccattgtctgctaaagctctcattttgtgcatgtattatttcgtaatt
gcactattttccaaatgttttattatagtcaaaggatagtctttatatct
gttttctttattagataattcatgaattttatgaacagttactagctgaa
tatgatcttttgttgatgccatgtctatgaacttatgattgactcttcta
gtcttggaaatggtccagcaatttagagaagcgactagtatacctatatt
ttgatggagtggatttgggagagaaagccaccttagcattgggagagaaa
aaaccctgggttctttttttggggaagctgatggcaagcatagagtcaca
aaacctgacactagtttagaatcattaaaaatgaatgatgtgaacatgtt
ctgataccaggtcaatgactacacaattcaagctatgagaatatttatgt
tcaataattagaccatataactaaaaaataaataggattttttcttttct
tacaatataattaggtaactatatccatgctgaaattatttgttaaggac
gactgaactgatcattctgttcaacttggaactagccc
gaattcaaggtcataccaaaggtacaggcttcctcataactactcatgta
gacaggtttctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
tgtgtatgaaaccaagaaaaatttgagaaatggaaaccactatgaagcag
aaatcatggactttttattatgaaatcccaaaatgctctgtttttatttt
tgttttgtttttattttatttgtctctctgtcctctgggttttcatttcc
acctaaactggtcaaaatcccaaatctttttcgatgttttcagcttctca
tgatcctcagaatttctaggtttggaagagacattcaaaccaaatctatg
tgttctttcctttaatttttccagcttaactataagcttggtgtcagatg
atgaacctcttattggaactgaagaaattccaaacctacctacttgagca
gccttcttgttctccaaactttcaggtacattgactcattcaaatttctg
tattctctcagtctgagatattccagatgtaatttttaccacttttgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chrX_112586999_112588174
seq2: B6Ng01-296L08.b_47_1234

seq1  GAATTCATATATATGTAGCAAAAAGAATAACTTAGTTGGGTGCATAATTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATATATATGTAGCAAAAAGAATAACTTAGTTGGGTGCATAATTA  50

seq1  GAATTTCCAAATTTTAGCTCATTCTAGGCTAAATCATCCCACATAGATAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTTCCAAATTTTAGCTCATTCTAGGCTAAATCATCCCACATAGATAT  100

seq1  TCAGAAAGCTAATTAAGATCTGGAGAGTGGATTCAATTTGTAAAAGAGCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAAAGCTAATTAAGATCTGGAGAGTGGATTCAATTTGTAAAAGAGCT  150

seq1  CAACATTCAAGAATGGAACTCTGAGTTTGTGTCCCCCAGCATCTAAGTAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACATTCAAGAATGGAACTCTGAGTTTGTGTCCCCCAGCATCTAAGTAA  200

seq1  AAAGCTGGATATAGCTGCACATGTAAATCTAGCAGTGTGGAGAAAAAGAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCTGGATATAGCTGCACATGTAAATCTAGCAGTGTGGAGAAAAAGAG  250

seq1  ATGGATCAAAAGAGCTCACTGGATATCCAGTCTATATGCAACATGAAATA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGATCAAAAGAGCTCACTGGATATCCAGTCTATATGCAACATGAAATA  300

seq1  CTATCTCAACCCAATAAGGTGATACATAAAAACAGTCAATGTGTCCTGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCTCAACCCAATAAGGTGATACATAAAAACAGTCAATGTGTCCTGCT  350

seq1  CTTTCCTTTGCATATATGCTTCAAATTATGCAAACTTATGTGAATGCAAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCCTTTGCATATATGCTTCAAATTATGCAAACTTATGTGAATGCAAC  400

seq1  ACAAACATATATCAAACTCATTGCACATAAATGTAAATAATACATATACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAACATATATCAAACTCATTGCACATAAATGTAAATAATACATATACA  450

seq1  CACAAATGAAAGGAATTTATAACAGTATTAATTAATAAGCCAATTTCACT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAATGAAAGGAATTTATAACAGTATTAATTAATAAGCCAATTTCACT  500

seq1  ACTAATTTCAGGAATTCTATATGTATTTTTGTAGTTCAATATTTTTGTTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAATTTCAGGAATTCTATATGTATTTTTGTAGTTCAATATTTTTGTTT  550

seq1  TAAGTATGATTACTTTATTGAGAAGGCTGCTTTGTCTAACTTGATTTTGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTATGATTACTTTATTGAGAAGGCTGCTTTGTCTAACTTGATTTTGC  600

seq1  TTCCATTGTCTGCTAAAGCTCTCATTTTGTGCATGTATTATTTCGTAATT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCATTGTCTGCTAAAGCTCTCATTTTGTGCATGTATTATTTCGTAATT  650

seq1  GCACTATTTTCCAAATGTTTTATTATAGTCAAAGGATAGTCTTTATATCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTATTTTCCAAATGTTTTATTATAGTCAAAGGATAGTCTTTATATCT  700

seq1  GTTTTCTTTATTAGATAATTCATGAATTTTATGAACAGTTACTAGCTGAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTCTTTATTAGATAATTCATGAATTTTATGAACAGTTACTAGCTGAA  750

seq1  TATGATCTTTTGTTGATGCCATGTCTATGAACTTATGATTGACTCTTCTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGATCTTTTGTTGATGCCATGTCTATGAACTTATGATTGACTCTTCTA  800

seq1  GTCTTGGAAATGGTCCAGCAATTTAGAGAAGCGACTAGTATACCTATATT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTGGAAATGGTCCAGCAATTTAGAGAAGCGACTAGTATACCTATATT  850

seq1  TTGATGGAGTGGATTTGGGAGAGAAAGCCACCTTAGCATTGGGAGAGAAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATGGAGTGGATTTGGGAGAGAAAGCCACCTTAGCATTGGGAGAGAAA  900

seq1  AAACCCT-GGTTCTTTTTTTGGGGAAGCTGATGGCAAGCATAGAGTCACA  949
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCCTGGGTTCTTTTTTTGGGGAAGCTGATGGCAAGCATAGAGTCACA  950

seq1  AAACCTGACACTAGTTTAGAATCATTAAAAATGAATGATGTGAACATGTT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCTGACACTAGTTTAGAATCATTAAAAATGAATGATGTGAACATGTT  1000

seq1  CTGATACCAGGTCAAATGACTACACAATTCAAGCTATGAG-ATA-TTATG  1047
      ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||
seq2  CTGATACCAGGTC-AATGACTACACAATTCAAGCTATGAGAATATTTATG  1049

seq1  -TCAATAATTAGACCATAATAACT-AAAAATAAATAG--ATTTTTCTTTT  1093
       |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||   ||||||||||
seq2  TTCAATAATTAGACCAT-ATAACTAAAAAATAAATAGGATTTTTTCTTTT  1098

seq1  CTTAC-ATATAATTA-GTAACTATAT-CATGCCTGAATTA-TTGTTA---  1136
      ||||| ||||||||| |||||||||| |||||   ||||| ||||||   
seq2  CTTACAATATAATTAGGTAACTATATCCATGCTGAAATTATTTGTTAAGG  1148

seq1  GCAGCTG-ACTGGTTTCCATCTGTACAAC-TGGAACTAGCCC  1176
       |  ||| ||||   ||  ||||| |||| ||||||||||||
seq2  ACGACTGAACTG--ATCATTCTGTTCAACTTGGAACTAGCCC  1188

seq1: chrX_112694889_112695472
seq2: B6Ng01-296L08.g_68_651 (reverse)

seq1  TCACACACACACACACACACACACACACACACACACACAAAAGTGGTAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACACACACACACACACACACACACACACACACACACAAAAGTGGTAAA  50

seq1  AATTACATCTGGAATATCTCAGACTGAGAGAATACAGAAATTTGAATGAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTACATCTGGAATATCTCAGACTGAGAGAATACAGAAATTTGAATGAG  100

seq1  TCAATGTACCTGAAAGTTTGGAGAACAAGAAGGCTGCTCAAGTAGGTAGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATGTACCTGAAAGTTTGGAGAACAAGAAGGCTGCTCAAGTAGGTAGG  150

seq1  TTTGGAATTTCTTCAGTTCCAATAAGAGGTTCATCATCTGACACCAAGCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGAATTTCTTCAGTTCCAATAAGAGGTTCATCATCTGACACCAAGCT  200

seq1  TATAGTTAAGCTGGAAAAATTAAAGGAAAGAACACATAGATTTGGTTTGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGTTAAGCTGGAAAAATTAAAGGAAAGAACACATAGATTTGGTTTGA  250

seq1  ATGTCTCTTCCAAACCTAGAAATTCTGAGGATCATGAGAAGCTGAAAACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCTCTTCCAAACCTAGAAATTCTGAGGATCATGAGAAGCTGAAAACA  300

seq1  TCGAAAAAGATTTGGGATTTTGACCAGTTTAGGTGGAAATGAAAACCCAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGAAAAAGATTTGGGATTTTGACCAGTTTAGGTGGAAATGAAAACCCAG  350

seq1  AGGACAGAGAGACAAATAAAATAAAAACAAAACAAAAATAAAAACAGAGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACAGAGAGACAAATAAAATAAAAACAAAACAAAAATAAAAACAGAGC  400

seq1  ATTTTGGGATTTCATAATAAAAAGTCCATGATTTCTGCTTCATAGTGGTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTGGGATTTCATAATAAAAAGTCCATGATTTCTGCTTCATAGTGGTT  450

seq1  TCCATTTCTCAAATTTTTCTTGGTTTCATACACACACACACACACACACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATTTCTCAAATTTTTCTTGGTTTCATACACACACACACACACACACA  500

seq1  CACACACACACACACACACACACAGAAACCTGTCTACATGAGTAGTTATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACACACACACACACACACAGAAACCTGTCTACATGAGTAGTTATG  550

seq1  AGGAAGCCTGTACCTTTGGTATGACCTTGAATTC  584
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGCCTGTACCTTTGGTATGACCTTGAATTC  584