BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-064M14.T7 (MSMg01no064_m14.b1) | MSMg01-064M14.TJ (MSMg01no064_m14.g1) |
ACC | AG290159 | AG290160 |
length | 1,258 | 1,219 |
length of high quality (start - end) | 411 (42 - 452) | 382 (70 - 451) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no064_m14.b1 PHD_FILE: MSMg01no064_m14.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:10:00 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no064_m14.g1 PHD_FILE: MSMg01no064_m14.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:10:00 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NNGGGCATTGGGCGCTATAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATT
CTGGGACCATGTTGAGAGACCAAGAATGTCTTGGATCAATCATCACCAGA
TAGCTAGCCAGCTGACATCAAATGTATGACCCCAGCAGAGCCCAGAACTA
ATAGCAAAACCCAGATTAACCAGTCAAACCAAGAGCTTTTTTTCAAAGAA
TTTACAGATGGTAGTTACTAGAGGCATGATATTTTAGGGTTATTATAAAA
CAATAAATAATTGATATGTCATTTATTGTTTTTCTCTCAAACCTGTTACC
TAGTTTTGTTTGGTGCTTTCCTGATTTCTTTTCCTCTTCAGGTTTTAAGT
ATATGCAACAGGACTGGTTTTCACTATTTATGAAAGCTGTGGCAAGACAT
ACTGCTTCTAAGTTTCTATCTCCATTTGCTTTGTTTTCTTGAAATGTCAA
TTTTTTGTTTAGCCCCCCCTATAACAGACACTCTGCGTTATAAAAAAAAT
TGTTGAACTTTTCTTTCTGATACCTCTTTACTAGAATATCTAGAAACATA
AAACCTGAATTTCTCCTATGCCACAAGGGAGGTGATGTGCATGGCTCTGT
CAAAAGATGTTAGGGAAGCCCTTGTGAAAGGCTCCCTCCCCTTTCTCATT
AAGAGAAAGCCCTGGACGCCTCCTTACTTATCCCTGCTCAGAACACAGGA
GGGATGATGCCCTTGTTCAGGAGCTGATAATGCAAAAAGGGGGGGAGGAG
GAGAAGAAAAAGGAAGAAGACGATTATTAATATTATCTATTATATTTATA
TGTATTTCCTCCTCATTCTTTATATTTTATATCTTACTCCTCTTATTCGT
TTCTCTCCACTTCTTTCACTCTTTTTTTATTATTTTTTCCTTTTCTTACT
AATTCACACTCTCTCATCTCTATCCATACAGATAACTCTTTCTCTTTTTT
CTTCTTCCTTTTTCTTTCATTTCATTTCTGTCTCTTTCCTTCTCCACCTT
TACATCCCATCTTTTTTCACCTCTTCTCCCTCTCTCTCTTTTGTCCATCT
CTGTTTTTTTTAAACTATTCTTTCTATCTTCTCTTACCTTTTTCTTCTTT
GTTCTATCATCTTATCTGTTTCTCTTATCATTCTATGCAGTATTTCCTCA
TTTTCTCTCTTCTTATTACTTGTCAAATTTATTATCTTCTCTTCCTCTCC
TCTATATTATGTTTTCTTCTTCTCTCTCTTCTCNTACTCNTTCCTCTCTC
ATACTCAC
| NNGGGAAGACGTGAGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTGAGTACTTTCTTATGCCACCTCTAGGACA
AGAGAGGGTGGTGGTCATAGCTGGTACCCCCAGTTTCCATCAGTCACCTG
AGCATCAGGCAGAGCTAACTGCTCTTTAGAAAGCACCCTGAGCATGTGCG
GACAGGGAAGGAGAAAGATGCCACTGTTCAGAGGAAACAAGGAATGGTCA
AGATGACATGAAAAGAATGTGGTACCCTAGGACCTGAAACTAAACTCTTC
TGATTCTGCTGTGAAAGCTGACTGGACAGCCTCTGAGAAGTTCTGTCTAA
AAGGCCAGCAGTGGCAGAAGCCTAGGAGCTGATGAAAAGTGAACACCCCA
AATGTGGACACTTAGAGGCAGGGGCCCCAGTGCTAAGTTGGAGCAGCTCC
TGTTTTTTACCCCCCCCCATATATGTTCTGTGAAACATTAAAAAAAGAGT
TTATTCATAATACATGAAAACTCTCTAAAACCCAGGCTCAACCTCTGATG
ACAGGTCCTGCACTGTTTTATGACGTATCCTATCACTGAAAACCCAGAGC
TCCCTTCTGAGAACAGCACTGAAGATGTTCATAAATAAGTTCATTAATGT
TCTGTAACTATTTCAACCTGCTTGAATTACAAGGCAGTTAGACAGTAGCA
TTTCCCCACTACTGTTATTTAGATGACCAGTGTGCCTAAGACAGAGGGGG
CATTCTAGCACTCAAAGACAGAGGTGGTCAGAACTCTGTGAGTTCAAGGC
CAGCCTGTTCTATGGAGTGAGTCAGGACAGTCAGGACTGTGTAAAGAGAC
CCTGTCTCAAACCCAAAAAGAGGAATTGTTGGAGAATGAAAAATTAGGAT
AATACTTGGTAAAAACATAAATTGTCCCGTTATATATATATTCCTTTCTC
TTCTCAGTCCCTTTTTCCCTCAAATTCTTTATATTAACCTTTTTTTAAGG
GGCTCAAATTCTTTTATTTTTTAACTGTTTATCTATCCTTATCTTTTTTT
TTCCTATATTTTTTTACTTCAATTTCTTTTTTTTTTTATCCTTTATTTTC
TTTTCTTCCCCCTTTTTATTTCTTTTTCTGTCTCTTCTTCCTTCCTTTTT
CCTTTTCCTTCTTTGATTTTTTCTACATCCTCCTTCATTTTCTATTCTCT
TTTTCTCTCTTTTTTTACT
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 9 9 10 13 11 16 16 13 9 8 8 8 8 8 15 17 31 28 20 20 22 22 22 28 29 36 47 36 36 37 37 37 47 47 40 47 47 48 57 43 47 47 47 57
54 59 57 53 53 42 42 47 37 37 40 42 43 48 51 51 43 50 47 50 48 47 57 57 57 57 57 57 57 54 68 68 68 68 68 68 68 68 57 48 48 48 54 54 54 54 57 57 68 68
53 53 43 43 43 47 47 53 48 43 37 37 37 36 36 42 50 50 50 48 48 48 42 42 41 34 34 22 28 15 12 12 12 19 19 34 34 59 59 59 50 50 50 50 50 50 42 42 43 43
43 53 53 53 53 57 59 59 59 59 57 57 57 57 68 53 54 54 54 50 50 50 50 50 50 50 57 57 57 54 54 57 57 59 57 57 57 59 59 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 68
68 68 68 57 57 48 48 48 46 46 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 54 54 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 52 59 59 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 68 68
57 57 57 57 57 57 59 57 59 57 59 59 52 52 52 59 59 68 59 59 59 59 59 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 54 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 68 68 57 57 57 44 36
32 32 32 30 30 32 44 44 54 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 59 59 46 59 59 39 23
21 13 13 12 9 9 9 8 9 10 8 8 8 12 15 15 10 10 9 9 9 12 23 33 43 47 47 47 46 37 37 34 32 39 35 37 35 32 26 28 13 14 14 14 12 12 10 11 10 10
12 11 12 12 25 41 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 59 68 59 59 59 59 59 59 57 68 57 57 57 57 59 57 59 59 57 57 57 59 59 59 59
68 59 59 48 48 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 54 54 54 57 57 68 57 57 57 57 54 57 57 48 48 48 48 57 59 59 59 59 59 59 39 43 43 43 47
48 54 59 59 57 57 54 57 54 57 59 57 57 54 54 54 54 57 57 57 59 47 46 43 43 43 46 46 57 57 46 46 46 48 34 47 43 43 43 59 43 47 44 40 39 36 36 39 39 36
39 35 35 35 47 47 41 41 41 41 41 41 43 41 37 39 39 39 41 41 46 46 48 48 48 48 48 48 57 48 47 48 48 43 41 41 41 37 37 30 30 25 30 32 37 37 37 39 39 37
35 25 30 30 28 28 34 34 35 31 21 24 28 25 22 21 33 34 48 48 48 40 34 34 23 28 20 24 19 24 30 37 30 25 27 32 37 37 41 37 37 37 30 30 30 28 30 29 37 37
37 30 30 24 26 30 25 28 32 37 37 20 19 22 14 12 8 8 8 8 10 12 12 12 11 10 8 10 9 9 10 10 10 8 10 6 9 8 8 8 8 8 8 6 6 10 10 10 8 8
8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 8 10 8 8 6 6 6 8 8 7 7 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 9 9 8
8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 13 14 14 14 10 10 10 8 8 7 6 8 8 13 9 11 11 12 10 12 13 10 10 8 8 10 8 8 6
6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 7 8 9 10 11 11 11 11 11 8 8 8 8 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 12 8 6
7 11 8 8 8 6 6 6 6 8 8 9 10 10 11 16 11 12 10 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 7 6 8 8 9 13 9 8 8 8 8 6 10 7 7 8 8 10 12
10 11 11 11 9 11 11 9 9 10 12 11 10 11 9 8 8 8 8 8 11 11 11 12 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 10 10 11 11 11 9 9 8 8 10 6
6 8 8 11 11 12 12 12 9 9 9 9 9 9 11 10 10 10 10 10 10 11 10 9 6 8 8 8 8 8 7 10 11 12 7 7 8 8 11 11 11 15 10 10 10 12 12 12 10 9
9 9 8 8 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 10 12 9 9 8 10 6 6 8 6 6 8 8 8 8 6 10 11 11 11 8 10 8 10 13 8 8 8 8 8
10 8 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 10 11 12 11 9 11 11 9 9 10 9 8 8 6 6 10 8 9 6 8 8 8 8 10 7 6 6 6 8 8 8 8 10 8 8 8 8
10 8 8 8 8 8 10 15 15 9 8 8 7 7 8 7 6 6 6 8 8 16 8 10 8 8 8 6 6 10 6 7 3 0 3 6 6 8 3 0 3 6 7 10 8 10 8 8 8 8
8 8 6 8 8 8 6 6 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 9 6 6 6 6 6 6 8 10 8 6 6 6 6 9 10 17 9 9 9 9 13 17 28 21 21 10 10 11 22 19 33 20 23 17 29 29 34 34 37 37 42 53 53
43 43 39 48 48 57 57 57 57 57 57 57 54 48 48 50 48 57 57 54 48 46 39 39 39 39 48 48 68 57 53 48 48 48 48 48 54 57 48 48 46 43 42 43 43 42 42 48 48 48
43 43 43 43 43 57 43 42 34 34 34 34 39 39 39 33 36 37 31 31 31 33 23 19 11 11 11 12 34 34 30 30 33 30 30 31 33 36 36 39 39 39 50 50 47 44 39 43 43 43
43 43 57 59 59 57 57 57 43 43 35 35 35 36 36 41 42 36 32 39 39 46 41 47 47 32 32 37 37 37 57 57 57 57 57 57 46 48 46 46 46 57 57 43 46 43 57 57 57 54
54 54 57 59 57 54 54 48 57 57 57 54 54 50 59 50 54 54 57 57 59 50 43 37 43 43 57 43 43 35 35 35 47 47 57 59 59 59 59 59 54 50 57 43 43 35 43 43 52 57
52 52 52 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 43 43 35 43 43 52 52 52 59 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57
54 54 57 59 59 57 57 52 43 43 35 43 43 57 59 59 57 57 52 57 52 52 52 52 57 57 59 59 57 52 52 52 52 43 50 35 43 43 57 57 57 52 52 57 52 52 52 57 57 59
57 57 59 57 57 59 59 57 50 50 39 39 39 50 50 36 43 28 32 33 37 42 42 37 37 39 42 39 40 43 57 47 57 57 54 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 47 47 36 41 24
20 20 28 21 21 30 30 59 48 47 48 44 44 32 35 35 59 59 59 59 59 59 54 54 48 48 59 48 48 43 43 43 43 43 47 59 59 48 57 48 48 48 48 48 48 39 28 28 20 20
11 12 13 17 19 21 18 12 12 12 21 19 24 24 25 23 27 11 11 11 19 28 32 41 41 47 47 34 34 23 19 18 18 15 20 20 23 19 22 22 11 11 13 22 22 12 12 12 11 12
13 21 28 25 32 30 39 43 59 59 59 57 48 48 48 57 57 57 57 48 48 48 48 48 48 48 57 57 57 57 59 59 59 48 48 48 48 48 59 48 47 43 46 48 54 48 48 48 48 46
48 48 48 57 59 59 48 48 48 48 59 47 43 44 43 59 59 59 59 59 57 48 46 46 46 54 46 46 46 54 54 59 59 48 48 48 48 57 54 57 54 54 54 47 43 43 33 33 33 33
35 43 39 43 43 39 36 26 30 22 25 25 34 34 41 41 41 41 41 59 43 36 22 28 22 23 20 21 21 19 19 23 34 41 47 47 59 48 34 30 26 24 28 28 27 19 20 23 23 34
30 30 34 25 25 24 30 34 43 41 41 41 43 41 37 32 28 28 28 25 34 34 31 28 25 31 37 39 39 37 37 33 33 33 33 36 33 33 36 34 34 28 33 33 29 29 30 28 28 31
21 30 31 37 29 41 25 23 23 28 34 34 32 21 21 10 13 8 8 8 8 12 17 25 24 28 24 16 21 12 12 11 12 12 20 11 12 8 8 8 8 22 13 13 10 10 10 10 23 21
14 13 16 22 22 26 22 24 23 23 23 16 12 10 10 10 11 18 21 24 33 28 28 15 12 8 9 10 13 16 26 12 9 9 9 9 12 19 20 28 22 22 22 17 13 8 8 8 8 18
23 23 23 20 16 23 9 11 9 11 17 18 17 14 17 15 14 15 19 21 21 12 12 12 10 15 10 9 9 9 9 9 12 10 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 12 8 8 8 8
8 11 14 17 13 12 12 12 15 15 10 8 8 8 8 6 10 9 10 10 11 12 8 8 8 8 8 6 8 8 8 11 8 9 8 8 10 8 8 8 8 8 6 10 6 6 8 8 10 10
13 18 18 15 13 9 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6 8 6 9 10 11 10 10 10 8 8
8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 9 7 11 13 18 12 12 12 12 9 9 9 10 10 11 12 12 11 10 10 10 12 10 12 9 9 10 10 9 9 9 13 16 13 8 6 6 8 8 9
9 8 8 10 8 6 10 8 8 10 10 12 10 11 8 8 8 10 13 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 9 9 9 9 8 8 8 10 8 9 9 14 10 12 9 10 10 8 8
8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 17 11 13 11 11 11 11 9 9 11 9 13 11 10 10 10 10 10 8 8 6
6 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 9 9 9 11 15 12 15 11 15 9 8 8 11 8 8 8 6 6 8 8 10 12 10 9 10 8 8 6 6 6 6 8 8 10 6
6 8 8 15 10 8 8 8 8 6 6 8 6 6 6 6 8 8 10 8 12 17 12 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 10 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 10 10 12
13 10 10 10 8 10 8 8 8 8 9 9 12 20 18 13 9 9 9 |