BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-075F24.T7 (MSMg01no075_f24.b1) | MSMg01-075F24.TJ (MSMg01no075_f24.g1) |
ACC | AG298207 | AG298208 |
length | 678 | 685 |
length of high quality (start - end) | 422 (75 - 496) | --- |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no075_f24.b1 PHD_FILE: MSMg01no075_f24.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:24:01 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no075_f24.g1 PHD_FILE: MSMg01no075_f24.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:24:01 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TCTTTNNNCTATCATAATTGCGGCGCTATACGACTCCTATATCCAGAGAT
CCGCGGAATTCAATAACATAGCGCTACAAAGCCTGAAGCATGGTAGATGT
CCATTGAAACTTTCTCTCATTCATACTAACTTTGTGACTTAGTGTGATTT
TACTAGTTATTTCTTTGTGGACTTTGTTTTTTGTACTGTTTTGTTTGAGA
CATGGTCTCTGTGGCCCAGCCTGGTCTTGAACTTGTTATGTAGCTAAGAT
GGCCTTGACTCCCACTCTTGATTCTCTTGCCTGTACCTCCCAACTGCTGG
AATGGCAGCTGAGTGTTTTCACATCTATCCCAATCAATACAATTTTAAAG
ATTTCAATGTAATAACCAGAATATTAATGAAAAAGGATAAAATATATTAC
TTCACTGTTAAAAAAGAAATTTTCTGGATATTACCTTATGGTAGTTTATT
ACAATCTTTTGGATTTTTTTTTAGATAGAACTCTGTAGCCCTGGCTGTCC
TGGAACTCACTCCCTCTACTAAGCTGAACTCATACTTACAGATACACCTG
CCTATGCTTCTTTAGTACCTGGATTAAAGGGGCACCCCCACTGCCTGGCA
CCTTATGATGGTTTATAACTCAATAAATAAGAAGTTTTAGTTTCTTACCC
TAAAGTTGCATATATATGCATACATATT
| TGGGCGCGCCTGGTGTCGACTTTATGCGACCTATAGAAGGTCCTCGCAAC
TCCCGCTAGTCAGGGGTAACAGTGTGAGGAACAGGAAGATCGCAAGATCA
GTAAGCCTTTCTAAACACATCATGATCAGGCGGTCAACAGACCACAAAGA
GCCTCACCACACTTAGCAGATTACCAAGCCAGAGCTTCAGATATAACACT
ACAATGTTTCACAACAACTTATACCGGACTTTGGACATATTCAACGTACA
GATGTACGATGGAGGAGAAGAGCACTCAAGCCATACCGAGTCCAACGTCT
AGGATACCTAGCCCTCCCCATGACCTTTGATCTTACAACATGTTTTTTTA
AGCACCCCCCCCGCGCGCTCTCTCCCCCCTGGCTGGGGCTACCGGATCGG
CTGACGACAACATCCCCCCTGGACCTCGTTGCCTCTGATACCACTCTCTC
CTAGCCACAGAACCGATCCCATCCCTCCCTATGGCCCCACCTGTCCCCAA
AACCCAACACTTCCCCTTCCCCCCCCCCTCCCCACTTTACCGCCCGCACC
ATCTTTTCACCCCGCTCATTCTGCCATTTCCGTTTCCCTTCCTCCGTCCC
ATCCCTTCCCCCCCCACTCGCCTCATACCTCCAGCCCCCGTCCATTCACC
CCTCCCCCCATCCATCCTTCCCCTATATCCGACTT
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 3 0 0 0 3 6 8 6 8 8 8 9 9 8 21 13 16 12 12 18 26 23 35 28 24 25 28 47 25 21 13 14 14 27 25 15 15 11 18 14 11 8 8 8 8 10
19 22 37 37 37 28 28 30 24 29 22 22 19 30 23 23 11 11 11 9 9 9 9 11 21 21 33 30 33 33 41 48 50 48 48 57 39 48 42 42 43 50 47 47 42 43 43 50 50 50
50 53 68 68 53 57 57 57 57 57 54 68 68 68 68 50 42 42 32 18 24 17 30 32 48 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 47 47 47 57 50 50 50 50 68 68
68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52
57 57 57 57 57 52 57 59 59 59 57 57 57 57 52 52 57 52 57 57 57 59 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 68 68 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52
52 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 44 44 43 43 41 43 43 52 52 57 57 57 57 57 57 57 52 52 43 57 57 57 57 52 52 52 57
57 68 57 57 57 57 52 52 52 57 45 45 45 57 43 44 39 28 28 43 44 44 43 43 41 27 23 23 27 23 21 23 27 41 43 39 43 42 43 35 43 43 52 52 54 54 57 59 59 68
57 57 52 52 52 52 52 43 43 43 43 43 42 43 43 43 43 44 43 57 50 50 48 42 42 35 35 42 42 43 46 57 57 57 57 59 59 57 57 39 39 38 37 30 30 42 44 57 57 57
57 39 39 39 46 59 59 59 59 48 43 43 47 57 57 57 59 59 59 59 41 32 19 15 15 21 12 17 25 30 40 47 47 39 28 28 23 23 28 28 30 24 14 14 18 19 15 15 15 25
25 12 12 11 12 13 27 26 33 33 33 47 46 48 48 48 39 43 28 24 15 27 27 32 34 31 28 28 42 28 23 18 18 18 24 34 32 32 23 31 31 42 23 23 11 11 11 24 23 37
17 17 18 24 24 31 43 43 43 43 46 32 30 17 17 17 19 22 21 27 16 11 11 19 21 19 11 11 13 19 16 11 8 8 8 8 8 12 13 14 16 19 13 10 10 10 10 10 11 22
14 20 21 22 22 20 18 16 12 9 9 11 22 10 16 13 13 13 13 22 15 12 12 12 15 14 16 15 19 12 12 12 11 10 10 14 14 14 10 11 11 14 21 22 24 22 19 12 11 9
10 8 6 6 6 6 8 6 8 9 14 12 11 20 20 15 18 11 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 | Open.Hide. 8 8 9 8 8 10 8 8 8 9 12 8 8 9 9 9 14 16 16 16 16 19 19 10 10 6 6 8 15 15 20 22 19 10 10 10 17 17 9 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9
11 13 13 13 13 13 10 10 9 9 9 10 10 19 11 8 7 8 8 8 8 8 10 8 12 10 12 18 28 18 15 13 14 12 16 19 15 10 8 8 6 6 6 10 22 22 8 8 8 8
13 10 12 11 11 15 22 24 28 28 21 20 15 10 10 19 19 9 10 11 19 19 15 19 24 19 19 15 16 10 10 10 13 11 11 12 12 12 12 22 12 11 10 10 10 10 10 11 8 8
7 6 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 9 9 9 10 13 13 13 10 10 9 10 10 8 8 8 8 10 12 8 7 7 10 8 10 10 10 16 13 11 9 9 10 8 8 8
8 8 12 15 15 17 17 19 15 16 16 15 19 12 12 11 11 11 12 15 18 24 24 15 14 13 16 13 11 11 11 18 18 19 19 17 19 23 17 17 10 10 10 10 12 11 10 10 11 10
10 15 16 12 11 11 12 15 16 15 15 14 14 18 28 18 18 18 20 23 26 21 13 13 13 16 20 10 10 8 8 11 8 8 8 13 13 12 13 11 10 9 9 9 10 11 10 10 13 17
13 11 11 11 11 11 13 11 16 11 10 8 8 7 6 7 10 10 10 11 19 13 10 8 9 10 10 8 10 11 11 11 10 10 12 12 9 9 10 10 10 10 10 9 12 11 11 11 9 9
9 9 11 13 12 11 11 10 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 9 9 14 12 10 10 10 11 19 18 11 9 9 9 11 9 10 19 10 10 8 7 6 8 8
8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 13 17 24 27 16 16 9 8 8 8 10 8 8 9 9 9 9 10 10 12 10 10 10 11 11 11 18 21 13 12 9 9 9 9 16 16
11 10 9 9 9 9 9 10 11 10 10 10 15 10 10 11 11 11 8 8 8 7 7 11 9 10 10 8 8 8 8 8 11 17 17 12 16 11 11 11 6 6 6 6 10 8 8 8 8 8
8 8 10 9 6 8 6 6 8 10 11 11 14 9 9 12 12 11 11 9 9 9 15 15 19 19 9 9 10 9 7 7 8 8 8 6 9 10 10 8 8 8 10 10 8 6 6 8 10 8
8 10 8 10 13 8 8 8 8 8 11 10 11 9 9 9 9 9 9 10 8 6 6 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 11 13 15 18 14 19 16 10 8 8 8 8 8 8
8 10 10 11 10 9 9 9 10 14 15 14 10 8 7 7 6 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 10 10 10 10 8 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 8 11 11 14 23 18 24
13 10 10 10 10 10 7 6 6 6 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 8 10 9 9 9 14 9 8 8 8 10 8 |