| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-111D02.T7 (MSMg01no111_d02.b1) | MSMg01-111D02.TJ (MSMg01no111_d02.g1) |
|---|
| ACC | AG323927 | AG323928 |
|---|
| length | 1,135 | 1,129 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 671 (118 - 788) | 600 (146 - 745) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no111_d02.b1 PHD_FILE: MSMg01no111_d02.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:15:11 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no111_d02.g1 PHD_FILE: MSMg01no111_d02.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:15:11 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | plural |
|---|
| sequence | NAAAATATGCGCGCTATAGACTCCTAAGGGAGAGGATCCGCGGAATTAAT
GAAAATGAAGGCCCCTTTTACGCCCCTTTATGGGACACAATGGAAGCAGT
GCCCCTAGGAAAGCTCAAAATATTATGAGCCTCCATAAAGAAATTAGAAA
GTTCCATACCAGCAATTTAAAAGTACACCTGAAAGCTGTAGGAAAAAAAA
AGAAGCAAGGACACATAACAGAGTAGAGGGTAGGAAATAATAAAAATCAG
GGCTGAAATCAATCTGTTAGAAACAAATAAAACAGTACAAAGAATCAACA
AAACCAAGAGCTGGTTCTTTGAGAAAATTAGCAAGTTAGCCAAACCTTTA
GCCAAACTAACCAAAAGACAGAGAGACAATACCTGAATAAACATATCCAG
AAATGCAAGTGGAGATCTAACAAGAGACACTGAACAAATTCAAAGAATCA
TGAGACCTTGCTTCAATAACCTGTATTCATCCAAAAGGGAAAACCTTAAT
GAAATGGATGATTGTCTAGACAGATATCACATATCAAAGTTAAATCAAGA
TCAGCTAAACTATTTAAACAGCCCTATAACCCTTAAAGAATTAGAAGCAG
TCATCAAAAGTCTCTCAACCAAAAAGCCCAGGGCCATATGGTTTTAGTGC
ACAATTCTATATGACATTCAAAGAAGAGCTAATTCTAACACTCCTCAAAC
TATTTCACAAAATAGAAATCGAGGGTCTACTGCCAAACTTATTCTATGAA
GCCATAGCCACCCTGATTTCTAAACCACACAAAGACTAAAAGGAAAAGGA
ATTTAAGGACAATTTCTTTTATGAGCATTGATGCAAGCATACTTAATAAA
GTACTCACAAACTGAATCCTGGAACACATCAAAAACCTGATCCATCAAGA
AGAAGTAGGCTAGATCACCTGCCCCAATGTAACAGCCCAGTTACCTCCCC
AGAAGGCCCAAGTAACCCAAGAAACAGGGGATTCTCTTCCTCCAATTTCC
ACACAGGGTTGGAACATGTTACCAGCCCCACGCTGAAGGGGGCCCTTACC
CCCCCACTTCTACCTTAAACCCCCAAGGTCCCCTTTTCCCTTCGAACCCT
TTTTTCCCCCCCAGGGTCAAAAACAATGGGCCCCA
| NNGGCGACTGGAGGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAACCT
GAAGAGAGCAGAGTGAGAAATTGTTCAGGAGAATGCAGGTTCTCTCAGAG
GGAAACAAAGTGCTATGAATATGTGAGTGCAGCTTTGCACAGAGGCCATT
GTGCCTGTGAGTTCATGTTCCTGCTGAGGACAGATTGCAATGGAGACAAA
AGTGTAGGTGCCTGCTGATGTCTCGAGTTGAGGATTAACCTGTTAGTGCA
GGTGACTGCAGGGGCCAGGGAAGGGACCTGGGCAAATAAGTGCAGGAGCC
TTCAGAAGACTAGGTTATGTGGGGACAGTGGGCTATACACAGACTAGCTG
GCCTCCAGTTGAGTTGAGGTCTGAACTCTAGTAGAACCTGATGGGTGGCA
ATTCCCACCTACATGGGACAGAAGGTGTTCCCTCATGTCTTCTGGCCCCC
TGGCTCCTGTTGAATTTACCCCACATACCCCACAAGAGAGGATAGTGGCT
AGCAGTCATGTACACAATGTCCCAAGCTTCTGACCTTCAGGCTAGACTTC
TCCAAGTTACCCAGCACCACCTAGATAACAAGTCCACTATAAGAGGGGCT
GCTTGGCCCACTCCTCACTCTTTTAAGCTTTTACTTTCTTTAGTCTCTCT
CTAAGCCCTCTCTCTCTAAACCTTCACTTTTCTTACTCTCTAACTCTCTT
TCTCTCTTTCCTTTCCCCCTTCTCTCCTGTTGGCCATGGGCCTCTCTCTC
TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTCCTTT
TCTTCTGTGTTTTTCTATTTTCCTTCTGTTCATTTTCATTTAATTGTCCC
CCGTCTCTCTATTCTCCTCTTCTATCTTCTTCTCTCTTGCCTTTTTTTTT
TTTTCCTCCTCCTTTCTCCTTTTTCTTTCTTTTCTCTTCTTATTCCTTCT
CTTCTCTCTTGTCCCTTTTTTTCTCTTCCCTCACCTTTTTCTTTCTTTAA
CCGCTTTTTCCTTCTTTTGTCTTCTACTT
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 6 6 6 8 10 10 15 20 20 20 12 10 8 8 8 10 12 9 8 8 8 8 8 22 23 47 36 36 33 33 33 33 33 33 33 39 37 37 30 21 19 10 10 9 17 17
41 41 50 48 47 59 59 47 44 34 34 15 14 17 14 11 11 11 6 6 6 6 12 13 18 19 13 17 24 37 37 33 39 44 44 53 53 53 53 57 57 53 53 50 48 42 40 37 37 23
23 12 10 8 8 10 8 8 10 19 26 21 15 12 12 12 11 11 21 25 37 37 37 37 48 48 48 59 44 36 33 34 34 34 43 48 48 48 57 59 59 59 57 53 53 68 54 54 59 59
54 54 43 43 36 37 37 46 42 47 41 41 48 57 68 50 50 50 50 50 47 57 57 44 44 37 35 37 44 47 57 57 47 46 47 43 40 39 44 44 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59
59 59 59 59 43 43 43 43 50 59 50 39 39 39 43 43 59 59 57 57 57 57 57 57 57 54 54 59 59 57 54 54 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 68 59 59 57 57 57 57
57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 52 52 52 57 59 57 57 57 57 43 43 35 50 50 57 57 57 59 59 59 59 57 52 52 52 57 57
57 57 59 59 35 35 35 59 59 59 59 54 57 54 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 68 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 68 57 57 57
57 48 48 48 54 57 59 68 59 57 48 48 48 48 57 59 59 57 48 48 48 48 50 50 48 57 48 48 48 59 59 59 48 48 41 41 39 37 34 28 18 12 12 11 11 11 11 11 18 28
41 43 48 48 48 48 48 57 59 57 53 50 50 50 50 50 48 57 48 43 43 43 43 48 54 54 48 48 48 48 48 59 57 57 57 57 57 57 57 57 43 43 37 39 42 40 42 37 30 30
24 32 12 12 12 12 12 25 25 42 47 59 59 68 68 68 68 68 59 59 57 57 48 57 57 57 57 48 48 48 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 57 57 57
57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 54 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 59 54 54 54 57 59 59 59 59 57 57 59 59 59 68 68 68 59 59 48 48 48 59 59
59 44 43 43 44 59 59 57 57 57 59 59 59 59 68 59 59 54 48 47 47 36 36 36 36 43 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 43 47 59 59 42 43 43 43
39 39 43 47 47 48 57 59 57 48 48 48 57 57 59 48 59 48 48 48 48 48 48 59 59 48 46 46 59 47 47 43 33 27 24 33 34 59 37 47 41 47 59 59 59 59 59 59 59 47
47 57 57 50 47 57 48 48 48 48 48 48 48 48 57 59 41 34 14 14 14 34 34 50 50 48 48 48 50 50 50 50 48 48 48 48 43 43 43 41 41 34 34 28 28 20 22 22 39 39
44 59 59 59 59 34 34 25 25 25 37 34 48 48 43 43 43 43 48 48 48 48 57 43 34 23 20 28 28 37 37 37 34 23 23 23 28 32 28 29 28 28 28 24 30 39 39 34 30 24
28 22 22 24 28 34 34 37 32 32 36 37 37 37 37 37 32 29 31 32 28 28 24 25 22 12 12 12 18 15 31 31 28 28 18 16 12 9 14 15 21 30 25 15 10 10 10 19 23 39
39 34 37 41 32 30 28 26 29 27 29 22 28 30 37 37 37 46 39 43 36 31 34 34 30 22 21 18 20 21 22 18 19 13 13 12 18 18 12 12 16 23 23 23 26 22 30 25 25 30
30 17 17 19 28 12 12 12 25 19 16 16 17 19 19 18 21 15 15 10 13 16 16 12 10 15 14 23 15 9 8 8 9 9 17 10 14 17 22 22 13 11 11 9 9 8 8 8 13 10
11 15 10 8 8 8 12 8 11 23 21 18 22 22 16 12 12 10 13 17 19 19 15 9 9 10 13 19 28 22 12 11 12 10 8 9 8 8 8 8 8 8 10 10 12 12 16 11 11 16
14 19 11 12 12 16 16 19 18 19 12 12 11 14 12 16 13 8 8 8 8 8 10 17 22 22 19 20 19 13 12 10 8 8 8 8 12 13 13 10 10 9 9 11 14 14 25 17 23 10
10 10 9 8 10 8 8 8 8 9 9 9 12 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 18 14 9 8 7 6 6 8 9 10 9 10 11 15 18 21 16 15 10 10 10 12 12 14 21
25 33 32 21 10 8 8 8 8 10 10 12 12 10 11 11 11 11 11 19 23 19 19 14 13 15 13 10 8 12 10 10 10 8 11 10 13 15 11 9 9 8 8 8 8 9 9 13 12 10
12 12 6 6 6 6 8 8 11 12 12 10 11 11 8 8 9 9 10 10 15 8 10 6 6 6 6 10 15 12 21 17 17 15 15 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 6 6 6 7 7 8 9 8 12 8 8 8 12 22 19 19 10 11 8 8 3 0 3 21 21 21 10 10 10 19 21 33 36 36 36 38 36 36 36 36 36 36 34 38
38 38 47 48 48 48 41 46 47 47 27 23 9 9 9 9 9 13 11 15 15 16 11 12 11 11 11 17 18 25 25 33 33 37 41 41 47 47 48 39 39 47 47 44 44 43 39 39 47 37
25 25 13 12 12 12 13 11 11 11 18 25 27 21 17 14 15 21 32 41 59 57 47 47 39 43 43 50 53 50 48 57 42 39 39 42 42 43 57 37 35 23 23 23 34 37 43 44 37 37
36 44 44 54 54 59 59 48 47 43 43 46 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 44 44 28 25 25 32 36 44 57 59 44 42 33 33 33 42 34 43 43 43 43 32 21 14 14 38 38
59 59 59 59 57 52 52 52 57 52 52 52 52 52 54 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 52 52 52 57 59 57 57 57 57 57 57
57 57 43 43 39 43 35 44 44 68 57 57 57 52 52 52 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 59 57 57 52 57 52 52 57 57 57 57 57 54 54 54 57
59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 50 50 42 43 35 44 44 59 59 59 52 48 48
57 57 48 48 57 57 57 57 47 47 48 57 47 44 43 44 44 57 48 54 54 57 57 54 54 47 57 47 57 48 57 47 48 48 57 47 47 39 26 24 12 12 11 12 12 21 23 44 44 54
57 57 59 59 57 54 54 43 46 43 43 43 48 48 57 59 59 59 57 57 48 48 48 48 48 46 43 43 48 48 48 48 48 48 59 59 47 39 37 33 32 13 13 7 7 8 13 21 30 32
24 24 21 18 18 18 18 23 34 34 48 48 48 48 48 57 48 47 43 43 43 43 43 43 43 39 43 32 28 15 12 12 25 32 46 57 47 57 46 42 37 37 37 39 39 43 42 39 37 37
43 43 47 47 44 43 43 46 57 44 44 35 35 35 42 42 46 44 48 48 54 54 59 59 47 47 47 57 57 57 57 59 50 43 43 46 44 48 57 59 59 59 57 57 52 43 43 57 57 57
57 57 57 57 57 57 52 52 52 59 52 52 52 52 59 59 57 57 57 57 57 43 43 35 37 37 50 43 50 50 35 37 37 35 43 42 44 44 32 25 11 13 11 21 17 28 33 36 42 46
41 37 37 35 35 39 42 43 43 42 44 30 23 19 15 11 11 11 25 32 48 47 43 43 43 43 42 40 39 35 35 35 43 42 43 42 42 30 30 30 37 42 57 48 48 48 48 48 48 48
39 39 35 35 37 39 59 48 48 47 41 37 30 30 30 32 15 15 14 11 11 11 15 24 26 32 23 23 22 24 24 30 32 35 35 32 35 39 37 30 28 25 28 28 37 26 28 22 22 22
25 25 30 37 37 32 25 25 28 28 28 33 34 30 30 32 30 32 32 34 34 34 34 37 32 31 41 41 39 29 34 28 20 21 15 14 24 23 30 25 30 22 30 28 24 19 20 11 13 15
20 19 25 22 32 17 18 21 23 25 25 30 37 32 24 16 14 11 9 8 10 10 15 16 15 15 20 32 32 37 26 26 9 9 9 12 9 9 11 11 11 20 21 28 28 27 25 30 30 28
30 32 33 17 15 9 9 9 22 22 8 8 8 13 15 16 13 11 11 13 16 15 23 11 8 8 8 8 8 8 11 21 28 27 26 10 9 6 9 7 8 10 12 10 14 14 15 19 19 11
12 12 9 9 9 18 15 11 11 24 24 39 28 28 17 17 17 25 26 32 33 42 42 48 48 36 36 33 26 23 12 11 8 8 8 11 12 11 11 10 10 12 9 12 8 10 10 14 14 21
15 19 11 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 6 6 8 8 10 10 10 6 7 12 10 8 8 6 6 8 8 9 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 9 9 10 10 16 11 12 10
10 10 9 9 12 10 9 9 10 9 8 10 10 7 7 10 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 11 12 11 11 11 11 8 8 6 6 8 8 8 8 8 12 13 9 8 8 10 16 16 15
13 10 10 10 9 8 9 8 10 8 8 8 11 10 8 8 8 8 8 8 14 14 18 16 11 11 13 11 11 11 15 18 8 8 8 10 10 14 17 10 10 9 9 13 9 10 9 9 9 9
10 11 9 9 8 8 10 10 13 8 8 8 8 10 8 8 8 9 10 9 8 11 8 8 8 8 9 11 12 6 8 6 6 8 8 9 9 10 10 10 12 10 16 11 11 11 13 9 9 8
8 8 8 8 8 8 10 13 10 9 10 8 10 13 9 9 10 9 8 8 8 8 10 6 8 8 8 8 8 |
|---|
