BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-114D04.T7 (MSMg01no114_d04.b1) | MSMg01-114D04.TJ (MSMg01no114_d04.g1) |
ACC | AG326139 | AG326140 |
length | 689 | 756 |
length of high quality (start - end) | 569 (51 - 619) | 386 (73 - 458) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no114_d04.b1 PHD_FILE: MSMg01no114_d04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:19:50 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no114_d04.g1 PHD_FILE: MSMg01no114_d04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:19:50 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NAAGAATCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
CGCGGAATTCTTTGTTTACCCGTGTGCCCCATTTTTTAATGGTGTTATTT
GAATTTCTGGAGTCCAGCTTCTTGAGCTCTTTGTATATATTGGATATTAG
TACCCTATCAGATTTAGGATTGTTAAAAATCCTTTCCCAATCTGTTGGTG
GCCTTTTTGTATTCTTGACAGTGTCTTTTGCCTTACAGAAGCTTTGCAAT
TTTATGAGGTCCCATTTGTCGATTCTTGATCTTACAGCACAAGCCATTGC
TGTTCTGTTTAGGAATTTTTCCCCTATGCCCATATCTTTGAGGCTTTTCC
CCACTTTCTCCTCTATTAATTTCAGTGTCTCTGGTCTTATGTGGAGGTCT
TTGGTCCACTTAGGCTTGAGCTTTGTACAAGGAGATACGAATGGATCAAT
TCACATTCTTCTACATGATAACTGCCAGTTGTGCCAGCTCCATTTGCTGA
AAATGTTGTCTTTTTTCCACTGGATGGTTTTAGCTCCCTTGTCAAAGATC
AAGTGACCATAGCTGTGTGGATTCATTTCTGGGTCTTCAATTCTATTCCA
TTGATCTACCTATCACTGTACCAGTACCATGCAGTTTTTAATCACAATCG
CTCTGTAGCACAGCTTAACGTCAGACATGGTGATTCCAC
| ATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAGTGTTATCTAATAAAAACTTTCTAAAT
AAAATTATATAAATATATAAGTATATATATTTACTGTACTTAAATATGCA
TTGCATCAAATTTTATCTGTTAATTACATTAAATTTATAGTTCAGCAGCA
ACAAGAATATTCATATTATGCAATAGGTTTGCAGGAAATACATACCTGTA
TTCATTTTTAATACCTTTATTCAAAACCAGGGATACATACTGCCTATTTT
AAAGGGAAAGATTAATGTTCCATACTATAACAAAGCTAGGCTTTTATACA
TTCTTGGGCCAAAAGCATACTGAAGGAAAATTATCTCTTCTGGGGACTTT
GTGAATCATTAGTATCTTTTCAATTTTGTGTCATCAGTGGAAAATTTACT
TGTAAGAGCAGTCATTTGCTATGCATATTAGATTTATTTTATTTTATTTT
ATTTTATTTTATTTTATTTTATTTCATCTCATTTTATTCCACTCCATTCC
ATCCCCCCCCCCCCCTCTCTTTCTTTCACCGTCTCTCCCCCTTTCCTCCC
CTTCCTTTACCCCCCCCTCCCTCCCTATCCACCCCTTCCCCTTATTCCCC
CTCCCCCCCCCCCTTTCCTCCTTCTATTCCCATTACCTCCCCCCTCATTT
CTCTCTCGCATTCTCCCCCTCTATATTCCCCCTCCCCACTTCCCCCCCCT
TTTATG
|
quality values | Open.Hide. 0 3 9 9 9 8 8 10 8 15 15 13 13 22 28 23 20 17 18 17 15 17 9 9 9 19 19 39 39 37 26 17 19 19 13 15 13 10 10 12 11 11 12 18 18 25 25 28 22 22
30 32 57 57 36 36 36 36 36 33 50 50 50 42 30 30 23 18 15 14 21 34 37 37 37 37 39 31 33 36 36 36 36 57 53 57 44 37 33 24 23 37 37 47 47 50 50 50 54 54
54 54 54 68 57 54 48 48 43 48 43 50 42 40 40 37 37 40 54 57 57 57 57 57 43 43 44 57 57 57 57 57 48 57 57 57 57 57 57 57 57 47 48 47 47 48 48 57 54 54
54 54 57 59 59 57 57 57 57 47 47 47 57 50 50 52 47 42 42 42 46 37 52 52 52 52 54 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 52 52 43 44 43 43 35 35 35
43 43 57 57 59 59 57 57 52 57 57 68 57 57 59 57 57 57 43 43 35 35 35 44 44 68 59 57 57 52 52 57 57 57 57 52 52 52 52 52 43 44 43 43 43 43 47 62 62 62
62 62 62 62 43 43 43 43 52 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 52 52 52 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 52
52 52 62 62 62 62 52 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 68 68 62
62 62 52 52 52 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 43 43 31 31 31 43 44 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 52 52 52 52 52 62 62 62 62 62
62 62 52 62 62 62 52 52 52 44 44 31 31 28 32 28 43 43 18 18 13 24 24 24 14 14 19 32 35 35 43 44 43 35 35 43 43 43 52 52 57 57 57 57 52 57 52 57 59 68
68 57 57 52 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 52 52 52 57 52 52 52 52 52 59 43 43 43 42 37 35 37 43 43 43 43 36 41 29 41 41 50 50
48 48 43 43 33 28 28 17 16 16 32 32 47 47 48 57 57 47 47 37 42 39 39 35 37 37 31 31 35 39 42 39 39 35 39 39 48 43 41 41 20 20 20 20 20 23 28 28 37 37
35 35 35 33 33 33 33 39 42 37 24 28 18 25 18 18 17 17 17 29 29 43 43 39 37 30 37 37 35 32 32 30 30 31 24 21 13 11 10 10 15 23 30 39 41 46 43 48 48 43
39 34 32 25 20 20 23 24 28 37 39 37 37 28 28 19 28 15 17 17 19 20 23 23 23 18 18 21 29 25 28 26 24 15 16 16 18 19 17 16 16 18 28 28 23 19 18 14 14 14
18 21 23 31 20 16 11 11 11 12 16 19 18 11 13 18 11 11 13 14 22 18 15 22 12 18 18 21 13 11 14 9 13 15 27 27 23 19 15 | Open.Hide. 9 13 8 8 8 8 11 17 26 24 24 28 34 32 31 31 37 32 30 37 33 31 31 28 23 26 18 25 12 22 12 11 12 12 11 10 10 11 15 19 28 34 40 48 48 36 36 33 33 28
33 28 28 28 28 28 34 23 34 34 21 27 14 12 12 12 10 19 23 27 27 16 14 14 24 32 54 54 44 44 43 43 43 59 59 68 68 68 48 48 47 41 36 42 39 39 37 48 47 57
57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 57 57 57 57 59 59 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57
57 50 43 37 33 33 28 28 28 44 44 57 57 57 57 57 36 43 29 43 44 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 43 43 35 26 26 31 44
44 52 43 43 43 43 57 57 62 62 62 39 39 39 62 62 62 62 62 62 62 43 43 35 35 35 43 44 62 62 62 43 39 39 43 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52
57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 54 54
54 57 50 43 35 35 43 50 52 52 52 52 52 57 59 57 57 57 57 52 52 52 52 57 57 57 59 59 57 57 57 47 47 44 50 43 44 44 44 44 57 48 54 54 59 57 37 37 28 28
28 42 44 59 59 57 48 36 36 28 28 35 42 44 57 43 44 44 47 59 59 41 30 18 18 18 34 35 47 47 47 48 48 57 48 48 43 43 39 37 24 24 17 26 26 42 43 57 59 57
48 48 48 50 37 39 35 37 28 31 31 31 17 18 25 26 30 30 22 22 14 14 14 19 24 34 37 32 32 37 27 22 13 13 13 18 11 15 17 22 22 31 31 35 35 32 43 43 42 42
32 31 19 19 17 17 16 16 18 18 15 20 12 15 15 26 30 14 14 14 18 24 18 13 13 13 13 16 16 11 12 18 24 19 25 32 25 25 25 36 36 44 28 28 25 30 25 23 23 28
28 42 42 43 31 31 23 23 20 20 20 23 23 23 23 20 20 18 18 18 14 12 15 12 11 10 16 10 10 10 10 13 12 12 12 8 12 12 13 10 10 8 8 8 10 9 9 9 11 8
8 8 8 8 12 13 16 12 11 9 8 8 8 8 10 10 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 12 15 19 19 21 19 19 20 13
9 13 10 12 12 10 8 8 8 8 10 12 24 28 19 27 12 12 12 15 18 18 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 10 12 12 14 14 15 15 13 17 15 10 9 9 11 9 16 11 15
21 17 11 14 17 16 12 12 9 11 9 9 9 8 8 8 10 8 8 8 8 15 15 13 9 9 9 12 10 13 6 6 6 6 8 8 12 11 17 20 20 17 11 7 6 8 8 11 12 14
15 19 19 23 10 12 8 8 8 8 8 8 13 12 14 22 18 15 12 10 10 10 10 10 9 9 9 12 23 23 23 14 16 13 19 13 8 8 8 10 13 14 14 27 30 39 30 30 17 17
12 13 6 6 6 6 |