BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-124K18.T7 (MSMg01no124_k18.b1) | MSMg01-124K18.TJ (MSMg01no124_k18.g1) |
ACC | AG333966 | AG333967 |
length | 1,230 | 1,236 |
length of high quality (start - end) | 339 (119 - 457) | 655 (118 - 772) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no124_k18.b1 PHD_FILE: MSMg01no124_k18.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:36:05 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no124_k18.g1 PHD_FILE: MSMg01no124_k18.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:36:05 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | plural | no hit data |
---|
sequence | GGGGNGGCGCACTGCGCGCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGA
ATTCAGAAACCTGAAGAGAGCCTATTGAGAAATTGTTCAGGAGATTGCAG
GTTCTCTCAGACCTTATACAAAGTGCTATGAATATGTGAGTGCAGCTTTG
CACAGAGGCCATTGTGCCTGTGAGTTCATGTTCCTGCTGAGGACAGATTG
CAATGGAGACAAAAGTGTAGGTGCCTGCTGATGTCTCGAGTTGAGGATTA
ACCTGTTAGTGCAGGTGACTGCAGGGGCCAGGGAAGGGACCTGGGCAAAT
AAGTGCAGGAGCCTTCAGAAGACTAGATTATGTGGGGACAGTGGGCTATA
CACAGACAAGCTGGTCTCCAGTTGAGTTGAGGTCTGAACTCTAGTAGAAC
CTGATGTTTGGCAATTCCCACCTACATGGGACAGAAGGCGTTCCCTCATG
TCTTCTGTTTTCCTCCCCCCCGTTGAATTTACCACCCCCACATCCAACAC
AAGAGAGGATAGTGGCTAGCAGTCATGTACACAATGTCCCAAGCTTCTGA
CCTTCAGGCTAGACTTCTCCCAGTTACCTAGCAACACCAAGTCAACAAGT
CCATTATAAGAGGGGCTACTTGGCCCACTCCTCACTCTCTTAAGCTTTTA
CTTTCTTTACTCTCCCTCTTACTCTCTCTCTCTTACTCTTTTAAGCTTTT
ACCTTCTTTAGTCTCTCTCTAAGCCTTCTCTCTCTAAGCCTTCACTTTTC
TTACTCTCTAACCCTCTTTCTCTCCTTCCTTTCCCCCTTCTCTCCCGTTG
GCCATGGCCAGTCTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCTCTCTCTC
TCTCCCTCTTTCTCTTTCTTTTTATCCCCCTTCTCTCTCTTCTTTCTAAT
TCTTCTTTTTCTCTTCCCTCCCTTCTCTTTCTTATACCAATCTTTCTATC
CTCCCCTCCTTTCTCTGTTTTTTCCGCTCCCTTATCTCATACTTATCTCT
TGTGCTATATTTTTTCTTTCCTCTGCTTCTTTCTATATTTATTTCTTCAC
TTGCTTTTCTCTACTTTCTCTTATTTTCGTCTTACCTTTTTTTCTCTTCT
CTTTATCCTTTATCTTCTTCCTACTATTCTTTATCTGCCACTTATGTCTT
CTTCTTTTTCCACTCCTCCCTCCCTTTCTTCTTTATTCCCTTCTTCCTCA
ATCTAACACCTCACTTTTCACTTCTCAATA
| CCCCATACCATGGAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTACAAGAGGAATCTCTACTAGTGGAGAAGC
ACTTTAACCTTTAACAACATTCTTATTAGTCATCAGGAGAATGCAAATCA
AAACAACTCTGAGATTCCATCTTAACACCTATCAGAATGGCTAAGATCTA
AACTCACTCGAGGATGTGGAGAAAGGGGAACATTCCTCCAGTGCTAGAGT
GGAAACTTGCACAACCACTTTGTAAATCAATTTGGTGGTTTCTTAGAAAA
TTGGGAATAGCTCTACCTCAAGACACAGCTGTACCACTCCTGGACATATA
CCCAAAGATCAAGTGTCCATAGTATGTGGATTTATTTCTGTGACTTTGAT
TCTATTCTGTTGATCAATCTGTCTATATTTATGTCAATATCTTGTGATTT
TTATTACTATTGCTCTGAAGTTTAGCTTACAATCAGGGATAGGGATACCA
CCAGAAATTATTTAATTATACAGGATTGTTTTAGCTACCCTGGGTTTTTT
GTTTTTCTATATGAAATTGAGAAATGCTCTTTCAAGGTCTGTAATGAATT
GTGTTGGAATTTTGATGTGCATTGCATTGAATCTGTAAATTGATTTTGAT
AAAATGACCATTCTTAGTATGTTACTCCTACCACTCCATGGACAAGGGAG
ATATTTCCATCCTAATATCTTCCTCAATTTCTTTCTTTAGAGACACAAAG
TTCTTGTCATACAGGACTTACACATCATATGTTAGAGTTACACCAAAATA
TTTTATATTTTTTTGTGACTATTGTGAAGAGTGTTGTTCACCTAAATTTC
TTTCTCAATTTACTTATAATTTTTATACAGGAGAAATATTGATATTTTTC
AGCTAAGCTTGTTTCTGGCCACTTTGCTGAAGGTGTTTTTTCCGCTGAAG
AAATTCTCTGGTAGAATTTTGGGAATCATTTATGTGTTCTATTATTTGCA
TGAATAATGATACCTTTGACTTTTTCCTTTCCAAAATGGAACCACCCCAA
TCTCCTTTAATTGTCTTAATTTCCTTGGGCTAAAAATTCTAGGATCATTA
TTGGAAAAGTTCGGAAAATATTGGTAAGATCTTTTTCCCCCCCCTGTATT
TTTAAGGTCACTGCGCTTAAAGTTCTCTCTCTTCTTTACTTCGTGAAGGG
GGCCTCTTCGGTGCCCTCGCAANTACTTGCTTTAAC
|
quality values | Open.Hide. 7 7 14 3 0 3 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 10 10 13 9 9 9 10 17 19 10 8 8 10 11 12 22 23 36 29 23 28 28 30 31 33 39 37 37 37 37 37 32 32
32 19 22 17 11 11 22 30 37 37 36 33 33 33 33 33 30 30 17 17 10 10 9 9 12 22 23 23 34 34 47 48 33 36 36 50 50 50 50 50 53 53 53 44 44 39 43 43 39 43
53 53 44 44 39 37 34 23 16 11 11 14 13 6 6 6 6 8 10 23 29 33 33 33 31 31 36 36 36 53 53 44 44 39 39 39 43 44 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 57 47
46 43 46 46 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 42 42 33 19 19 19 32 44 57 57 57 57 57 57 57 59
50 43 43 44 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 52 52 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 59 59 59 57 43 43 35 42 39 57 43
57 35 35 35 57 57 52 57 57 59 57 57 57 44 38 21 12 12 12 13 32 38 57 57 45 45 45 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 59 59 59
57 57 57 54 57 52 43 43 39 43 43 50 50 43 43 43 57 59 54 54 57 57 47 50 47 57 57 57 57 57 54 54 57 57 59 59 54 54 54 59 59 57 54 46 44 44 18 18 32 25
40 32 19 19 12 12 10 15 18 24 27 37 59 59 59 46 46 48 59 57 57 57 59 59 54 54 59 57 43 37 25 34 30 37 37 29 28 25 25 37 43 47 59 57 57 59 59 48 39 39
35 22 27 20 22 10 9 9 10 10 10 10 11 11 11 12 16 24 25 13 13 11 12 19 30 41 59 59 48 48 48 48 48 43 43 43 47 43 39 32 37 24 19 18 12 13 12 12 11 15
15 23 28 24 30 40 40 57 57 59 48 43 39 36 30 30 41 44 37 43 43 47 15 19 8 8 8 19 26 44 44 43 42 42 42 42 44 43 43 43 37 37 43 43 57 57 68 57 57 54
54 54 57 50 43 39 59 59 59 57 48 48 48 57 57 59 59 57 57 52 52 57 57 57 57 59 59 59 57 52 52 52 52 27 38 12 12 11 19 19 19 11 11 11 19 32 52 52 59 52
52 52 52 57 57 57 44 43 33 33 35 43 43 52 52 43 50 50 52 43 43 33 33 43 43 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 54 54 47 57 57 57 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 68 68 68 57 37 29 29 29 37 40 68 68 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 57 68 50 43 43 43 43 43 48 43 48 21
22 8 8 8 22 22 50 43 36 33 25 25 28 41 41 43 40 40 40 30 28 25 25 24 32 37 41 41 41 46 46 37 37 16 12 8 8 8 13 12 12 12 20 20 33 37 43 48 48 48
37 41 28 28 28 37 37 39 34 25 16 11 11 12 27 27 30 28 28 24 20 13 12 8 8 10 16 21 23 39 39 37 31 32 21 18 18 21 18 18 18 18 17 11 8 8 9 10 10 14
17 24 17 18 16 22 15 15 15 13 13 18 22 20 22 18 14 11 10 10 11 22 22 28 37 37 37 40 43 28 30 12 8 8 8 8 15 16 31 31 21 19 9 12 12 8 8 8 8 9
10 10 10 10 10 10 12 10 10 10 10 12 12 10 8 8 6 6 8 10 10 10 8 6 6 8 8 8 10 10 11 12 10 10 10 17 17 9 9 8 12 12 10 8 8 8 8 8 8 10
10 12 12 10 10 9 9 9 9 9 9 10 10 11 11 11 12 12 11 8 8 7 7 12 10 8 8 8 8 6 7 10 8 8 8 8 10 10 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8
8 10 11 11 10 10 15 12 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 12 11 10 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 11 11 12 9 8 8
6 6 6 6 8 8 10 9 9 11 8 12 10 9 14 10 8 8 12 10 12 10 12 8 8 8 8 9 9 9 10 10 10 9 9 10 10 10 8 7 7 8 8 10 9 8 8 6 6 8
8 8 8 11 11 9 9 8 8 7 7 8 8 10 9 8 12 8 8 8 10 10 10 10 10 10 7 6 8 8 10 10 8 6 6 8 10 8 8 8 8 8 8 10 8 10 10 10 10 8
7 6 8 8 11 10 10 11 10 8 8 6 6 7 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 12 11 9 10 10 10 9 8 8 6 6 8 8 10 8 6 6 7 7 6
6 8 10 8 8 8 8 11 11 12 8 8 8 8 8 8 8 8 6 9 13 10 10 9 10 8 8 8 8 8 8 12 10 8 6 6 8 8 9 9 9 18 9 9 9 9 9 10 10 8
8 8 10 10 8 8 9 10 10 9 8 8 8 8 10 8 9 8 10 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 | Open.Hide. 7 7 7 7 6 8 6 7 6 6 6 6 6 8 6 8 8 6 6 6 7 11 15 15 12 9 9 9 16 12 19 21 22 9 10 10 22 21 28 24 24 28 36 35 36 36 36 36 36 34
34 35 38 50 50 50 50 50 50 50 42 41 27 23 10 9 12 12 8 6 6 6 6 6 10 11 22 28 40 40 33 31 31 36 36 36 36 38 38 38 35 35 36 36 50 53 50 50 50 37
37 41 25 23 12 11 11 10 10 10 9 9 9 11 12 12 13 17 21 25 33 32 35 35 36 50 36 36 36 36 42 43 47 53 50 50 57 59 59 59 57 57 54 59 57 54 54 54 54 54
57 57 57 57 50 47 47 57 57 57 57 57 57 57 68 68 50 50 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 40 40 32 24 24 13 13 30 34 47 48 48 48 54 57 54 54 54 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 68 68 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 43 43 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 47 43 39 39 44 44 62 62 62 62 62
62 43 43 21 21 23 43 44 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 52 39 39
29 29 17 29 27 44 39 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 44 44 29 35 39 44 39 62 52 52 52 62 62 62 44
44 43 43 43 43 39 39 27 23 13 13 13 13 23 13 39 39 43 44 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 45 45 43 44 39 43 43 52 52 52 43 43 52 43
43 43 34 34 19 32 32 47 47 62 62 62 62 52 52 38 38 20 13 13 33 33 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 57
52 52 52 57 57 44 43 31 31 35 44 44 57 57 57 57 57 57 57 42 39 39 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 52 57 57 57 57 57 57 59 44 42
31 28 43 43 52 52 52 52 52 57 32 32 13 13 12 27 16 16 11 15 15 38 38 54 54 54 54 57 57 54 54 50 50 48 48 47 50 43 47 47 47 57 47 57 57 57 57 57 48 48
47 47 57 54 54 57 57 48 48 48 48 48 59 59 44 36 25 25 25 36 36 47 48 54 48 48 48 47 43 39 30 31 30 30 28 34 31 41 37 39 43 43 40 43 39 43 43 43 43 43
43 43 43 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 59 47 47 41 41 39 30 21 19 17 19 19 29 34 37 37 41 59 41 39 40 39 39 31 34 23 34 28 28 28 15 15 14 18 18 22 24
24 31 32 40 39 28 28 28 28 32 43 42 42 42 42 41 41 41 21 21 11 11 10 17 17 12 12 14 18 23 16 19 21 14 18 18 24 31 32 32 20 20 20 32 27 36 32 32 35 34
34 34 24 20 20 28 33 29 30 30 32 28 24 29 21 22 22 25 25 25 32 17 12 15 16 15 13 15 17 18 28 30 21 21 21 28 24 29 33 25 25 18 23 18 15 11 11 12 12 11
19 23 24 13 13 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 10 13 18 12 9 9 9 8 8 9 13 18 12 12 12 26 24 22 19 20 15 15 13 8 8 8 10 10 12 13 18 11 11 12 15
9 11 11 17 18 14 11 11 11 16 17 8 8 8 8 8 8 9 10 10 11 11 16 21 30 15 14 14 21 17 15 14 14 14 10 16 10 9 13 10 13 10 10 10 10 17 15 10 10 10
10 10 13 12 12 12 12 12 12 10 12 17 10 10 9 10 10 10 10 13 9 11 14 11 10 9 9 9 12 18 10 10 8 6 6 6 6 8 8 10 10 10 10 10 10 11 8 8 8 8
10 10 10 8 12 8 8 8 13 10 10 11 10 10 10 9 7 7 8 8 11 19 25 11 11 11 12 12 28 15 15 15 15 15 10 11 11 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 9 9
11 16 19 16 12 10 10 13 12 8 8 9 9 9 9 10 9 12 12 24 15 8 8 6 6 8 7 9 8 8 8 8 8 8 11 11 10 7 9 9 10 7 8 8 8 8 8 8 8 6
8 8 7 9 10 10 9 9 9 8 8 9 9 9 11 16 10 11 7 9 10 10 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 9 11 10 10 10 12 12 18 13 15 12 8 8 8 8 8 8
13 15 13 16 13 12 9 8 8 8 8 6 6 6 6 8 12 9 9 10 9 9 10 10 9 9 7 7 6 6 6 7 7 10 12 11 15 10 8 8 8 10 8 8 6 6 8 6 11 8
8 8 6 8 6 6 8 8 8 8 11 11 11 8 8 8 13 8 8 9 9 3 0 3 9 12 11 11 11 10 13 13 10 12 10 10 |