BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-142F09.T7 (MSMg01no142_f09.b1) | MSMg01-142F09.TJ (MSMg01no142_f09.g1) |
ACC | AG346975 | AG346976 |
length | 1,279 | 1,281 |
length of high quality (start - end) | 278 (131 - 408) | 642 (139 - 780) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no142_f09.b1 PHD_FILE: MSMg01no142_f09.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:01:52 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no142_f09.g1 PHD_FILE: MSMg01no142_f09.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:01:53 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CCGCCCCTNNNNNCATCATTGGGCGCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XCGCGGAATTCACTCTCGCACCTTCGCCCATTAAAGTCTCTACTAGTTAG
NCACAGCGGAGGCCCGCGCCCTCTTATAATGGCGATTGCCCGCGGCACAC
ACGGCTCTCCTCAGAGATTACTGGTGGCATGCACGAGATTGCTCGCAGTA
CATACCTGCTCTCCACATCTTCCCCTTTTTATTTTATTAAAACTTGAGGC
TGGTCTAGGCCTGTGTAACTTTGCCCATCCACTGTGGCTCCTGTCTTAGA
TCATTCCTCCAATGTCACAGCCTTTCCTGTCATAGGGTAACCCTATCGCC
ACCGGGCCCCGTGTCTTAGGTTGATCTGTGCATGAGGAAAGTTGCCCGTC
CCTGGATACTTTTTGTGCTATGTGACATTAACTACTAAATAAACTAGGGC
GAACTCTATAAAAGAGGACAGCCACCAATGTCAATTAATTTTTGAGCATA
GATAGCCAGATTTCAGGGAAGGCCCCTTGCTTGATGGCAGCAAGTGCTTG
GGTTATCAAAATCTTGTCACGTGTTTGTTGGGTTCTGAGCTTGCAAACCA
ACCAGAGCATGACCACAAGTCCACAACAGGTGGCAACACCAAATAAACCT
ACCCCCACCCATTCCTTAAAATAAGAAAAGGCAGATGAAATCCAGGAGGA
GAGGACCTCTGTCAATGACAGGTCCACTCGTGTTGAGTTGATCTTTAGAA
CGGCCACTCTAAGGACCCTCAAGGGTCTCATCGAATCTTTTCAGACCAGT
TTCCTGCAAGATATTAAGAAACCCTGCCTAGAACAATTAGCTGCATAAGT
AAAATTTCCTATTGGACACTGGTAATGCCCAGAAGCTTCCAGTTTTCTTT
CACAACCCTCCTGGTTCTTCTGGTATAAAACACCTATCTGATCTTTCCCC
CAGGCAAGGCACTGATTTCAAGTTCATCATCCCCCCCTTTAACTTTGTTC
CTAGCCAAAACTTTGGTAAGTGTTGGTTCTCCATCCAAACCTGCTCGAAT
CCTGATTTTTTATTTGTTGCCTGAATGAAACCCCCCCTTATCTCTATCAT
TATCCCTGCGCTTTCTTATATATCTCCTTCCCTTGGCTGATAATTTGTTT
CTGTTCCCTCCGTCCTCTTAAATATCCACATCTTCTCTCTTTTTTCCATC
ATTATTCTTTTTATTGGACGTTGTGTGTATTCTTCCTATATATTTCTTTT
CCCATTTGTGTTCCTCCTCTCTCCTCCTA
| NCCATCCTTTTNNNCATCATTGGAGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCTTTAGAACACAGAACTTATGGCA
TAGCATTGAGGCAATCCCTTAAGGAAATAATTAGACATTAGAAAGTGCCC
CTGTGTTTCTGAATGATGCAAGACTTTATTGCTGTGTAGCCAAAGGGAAA
CCGAAATCCTTCAGAAAAATCAAAGAGAGGAGCCAAATAAACACCTTTCA
TCCAGCAAGATCAAAAACTGCTCTTAGAAAACTGGTAAGGTATGCAACAG
GCAAACAAAGTTTCTGTGTCAGTAAAGAAGGATCTTCACTTATAGCCTCA
ATTTTACACTTTCTTAGTGTATCAATTTCTATAAAACATGACCTCTCAAA
GAATCAGTTTATCTAAGGGTTTAATAAATCATTCTGTGCAACTATATACC
GGCTGCATCATTGGACTCAAACTGAATGGTCCATGTGTTGCCACTGATGT
GAGCCATTTGCCTGTTGTCCTTCAGGAGAATTATATGACCTTCAACAAGC
AATCCAAATATGAAAAACTAATAGGAACCCAACTCACTAACTGTGACAGA
CAAAGCAATTGTTTAAGGCCACAAGTGCTATTTTCAGGATTCCAACTTTT
GTCTGTGTTCTGAATCTAGTCAAACACAGATATAAGTATTTGAAATAAAA
CTTTCATTTGTACTATAAAGAGATTACTAAAGTTCTGCCCTTATTCTCTG
AACAATAGCATATTAATTGCACAATAATGATCTTGCAGTAAGTATTATTT
AGTAATTTAGAGATGTCTTTCAGCATCCAGTTATCACAGATTTATCTAGG
AGAGGTAAATTTAATATTTGAAATAATATCTGTGATATCTATTCCATGCA
TTCTATGTTATATTTCAAATATAAACACCTGTTTCTTTCCCCTAACAAAT
ATGCCCGTTGTTTGTTAAGCCCCCATAACCTGTTGAGGAACAAGGTTTAT
GGAAAAACCCTTTCCCATTCCGTTATGAAGACAGAAAACAAACATCCCCT
GCCACACTCCCCCGGAATAACCTTTAGGTTAAAAGGGATTCTTTCCCTGA
ATTAAAAGTGGGACTCTCCCAATAAATATTTCTCTCAAAAAACACACCTG
TGTTCTTATATTTCCCAACCACAGTTTTTGTCCCCTACAACAAATCCTCT
TGTGATAGAAACCCCTTTTAATGAGGTGCCTCCAAACCGGCTTTTAACTT
CTTATAGCCTCTTAATATGATAGATTCCCTC
|
quality values | Open.Hide.11 11 11 10 11 9 9 3 0 0 0 0 0 3 9 8 7 8 8 8 8 8 9 10 10 8 8 8 8 8 11 14 19 8 8 8 10 10 10 24 24 29 24 23 26 24 24 24 30 42
48 48 50 57 43 43 43 39 34 47 28 35 35 36 50 47 47 39 48 37 37 37 37 37 21 21 9 7 6 6 6 6 6 9 11 12 8 8 8 8 8 10 15 21 25 25 24 19 18 3
0 3 27 18 32 32 37 29 31 31 31 31 37 59 59 59 34 28 22 20 18 18 18 13 23 19 29 24 19 19 20 20 20 32 34 43 25 27 12 12 12 27 27 59 48 48 47 59 59 54
54 46 48 43 57 46 46 46 57 57 46 46 48 48 47 47 37 42 42 47 42 37 48 48 50 50 50 68 57 57 57 54 46 46 44 43 43 44 57 57 54 54 57 57 57 44 41 37 41 42
48 57 59 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 48 46 46 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 52 43 43 44 44 57 57
57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 52 52 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 37 43 36 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 38 38 20 20
38 38 52 54 57 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 54 54 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59
59 59 59 59 59 59 59 48 59 59 48 48 48 54 54 54 57 54 57 57 57 48 57 57 57 57 57 43 43 43 46 46 43 47 35 35 35 39 59 47 48 48 59 48 48 48 57 48 48 48
48 59 47 41 28 28 18 15 16 12 9 8 8 8 8 8 19 30 59 46 50 50 50 50 53 53 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 43 43 43 48 48 54 59 59 59 59 68 68
68 68 54 48 46 46 39 36 30 41 41 47 43 43 43 44 44 57 44 43 36 37 23 23 20 32 32 44 48 57 48 48 48 57 57 57 54 54 59 59 59 68 59 59 59 59 59 59 57 57
43 43 57 57 48 48 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 54 48 42 44 39 43 44 47 47 47 47 47 47 48 57 48 54 48 48 47 43 43 43 43 43 59 57 59 48 54 57 59 59 48
48 48 48 59 59 59 48 48 48 48 57 57 57 48 59 43 43 39 59 39 37 33 28 24 23 22 32 37 37 39 36 47 47 59 59 53 48 48 48 48 57 59 59 48 47 47 43 43 43 43
59 42 39 35 35 35 39 37 43 43 43 39 39 28 31 23 20 20 28 32 29 25 25 30 36 41 43 42 35 32 32 39 39 43 32 34 25 23 23 32 31 36 39 39 32 32 28 30 37 43
47 48 48 39 39 36 36 36 39 37 39 59 41 41 44 41 41 22 24 17 17 21 28 28 36 31 31 31 31 37 34 28 25 22 25 25 25 18 18 25 26 30 30 23 23 23 23 28 32 37
33 31 31 22 28 37 37 40 37 37 22 21 10 10 10 10 19 22 36 36 36 39 43 48 48 48 48 47 47 47 35 35 39 39 46 48 43 43 39 43 43 47 27 26 10 10 9 13 11 22
23 24 24 18 17 15 15 24 26 20 28 34 19 17 14 14 11 11 14 9 21 21 28 19 19 13 19 18 21 12 12 11 17 10 12 13 16 19 28 23 27 21 15 17 19 24 14 16 15 11
9 15 25 28 26 21 12 17 15 10 10 9 10 8 9 10 10 16 19 20 23 13 11 8 8 8 8 9 11 19 19 10 10 11 12 12 12 19 9 9 9 12 20 16 11 11 12 11 8 8
11 11 16 16 22 18 16 11 11 11 15 9 9 9 11 14 13 16 12 15 11 15 10 8 9 12 11 8 8 9 9 9 10 8 9 9 10 12 11 10 8 8 8 8 10 10 11 16 21 12
9 9 10 10 10 15 18 10 8 7 6 10 8 8 8 8 8 12 8 8 10 8 9 8 8 6 6 8 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 10 12 9 11 13 11
10 9 8 8 8 8 8 12 15 10 10 8 8 8 8 8 10 10 10 10 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 9 9 9 9 12 21 18 13 8 8 8 8 8 11 11 11 10 12 11 10
10 10 9 7 9 10 10 10 8 8 8 8 18 15 7 6 8 8 6 6 8 13 12 12 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 10 11 11 11 11 8 8 6 6 6 8 8 10
11 8 8 8 8 8 8 15 8 8 7 7 8 18 11 11 9 10 10 10 9 9 9 9 9 9 10 9 15 13 12 14 13 19 20 28 12 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 9 10 10 10 10 8 8 6 6 8 8 9 11 11 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 15 8 10 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 7 9 8 8 8 8 8 7 7 8 10 6 6 8 8 6 6 8 8 6 6 6 6 8 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 22 15 13 10 9 13 13 6 6 8 6 6 8
8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 6 7 6 8 8 8 8 8 8 7
7 7 8 11 11 11 6 6 6 10 8 7 7 8 8 8 8 8 8 6 7 6 6 6 7 11 8 6 6 | Open.Hide. 0 3 8 8 10 10 8 9 8 17 3 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 10 12 22 9 7 7 13 8 9 10 15 9 8 9 8 12 12 19 21 21 8 9 9 19 21 31 26 28
30 35 35 36 36 37 37 36 28 28 33 33 36 53 53 41 41 50 50 47 39 27 18 9 9 14 15 18 12 11 9 10 9 10 9 9 9 9 13 22 34 37 37 37 41 41 53 53 53 47
47 39 39 36 43 37 44 44 39 37 37 37 23 18 9 9 10 10 10 10 10 10 21 24 24 21 18 23 19 19 22 25 25 15 11 12 12 15 17 23 23 37 59 50 50 48 48 48 47 38
42 42 42 42 42 36 47 47 47 47 48 57 59 59 59 59 57 57 54 54 54 54 59 59 54 68 68 54 54 48 54 48 48 47 47 46 48 57 57 68 59 59 59 59 59 54 54 42 44 42
48 48 47 47 59 59 54 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 54 54 54 57 57 57 57 54 54
54 59 52 52 52 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 68 68 68 57 59 35 35 35 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 59 59 57 52 52 52 57 57
52 52 52 59 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 43 43 20 20 20 43 43 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 44 44 35 35 24 33 15 12 12 15 15 33 33 62 52 52 52 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68
68 59 59 57 57 52 45 45 52 59 44 57 57 68 68 57 59 52 52 52 52 52 57 57 52 57 57 57 68 57 57 59 57 68 57 57 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 52
52 52 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 59 59 43 43 33 44 38 57 57 47 47 57 57 57 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 54 57 47 47 43 47 47
47 47 54 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 32 25 10 10 10 28 25 57 54 54 57 57 57 68 59 59 59 59 59 48 48 54 48 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59
57 57 57 59 34 34 23 23 28 37 41 59 59 59 59 47 47 23 23 11 11 11 25 25 44 59 59 59 50 50 50 53 48 57 48 48 48 48 50 50 50 27 27 11 10 11 15 15 18 26
28 59 54 59 54 57 59 59 59 48 48 48 57 57 68 57 54 54 68 68 54 54 57 57 43 43 43 57 32 32 18 18 15 32 25 57 48 48 46 57 54 54 54 54 48 48 32 32 17 16
19 32 32 48 48 48 36 42 42 40 40 57 59 59 57 32 27 15 15 15 25 29 37 37 37 28 28 28 25 22 21 11 11 11 25 25 41 43 41 41 44 44 41 41 34 34 28 28 24 27
25 37 41 43 47 43 39 41 27 25 12 21 18 17 8 8 8 17 22 41 41 41 43 43 48 46 32 32 21 14 11 11 9 14 19 37 37 16 15 8 8 8 8 8 8 9 12 23 23 47
36 36 25 22 18 18 18 22 28 28 30 37 37 34 34 35 35 36 26 21 19 14 14 16 30 34 28 22 12 12 12 12 16 10 10 10 16 11 11 11 19 21 32 22 24 19 25 22 11 12
12 16 12 17 10 10 8 8 10 11 14 21 21 11 10 9 10 9 9 9 9 8 8 13 13 8 8 8 10 8 15 21 18 18 16 16 20 19 19 18 14 11 10 10 10 13 14 25 28 28
26 23 13 14 14 23 29 34 22 17 11 8 8 8 8 8 9 11 9 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 10 10 13 17 10 11 10 11 11 12 18 16 11 9 10 10 11 11 15
15 32 32 19 11 9 8 7 6 6 12 19 13 11 10 9 9 10 10 10 14 25 28 19 19 15 16 14 12 9 9 8 8 8 6 6 6 6 6 9 10 11 11 16 11 9 8 8 10 10
9 9 9 11 9 11 11 10 9 14 12 19 19 11 11 13 14 12 15 8 8 8 10 9 9 9 10 12 11 11 6 8 6 6 6 8 6 6 6 6 8 13 13 11 11 17 10 6 6 8
8 8 8 10 10 10 10 9 9 9 12 9 9 9 9 10 9 9 9 8 8 10 12 12 6 6 6 6 8 8 6 8 8 8 10 6 6 6 6 8 8 8 8 8 9 8 8 10 7 8
8 12 10 10 9 13 9 9 9 9 9 10 10 8 6 6 6 8 8 7 6 6 6 8 12 6 6 8 8 7 7 8 8 8 8 8 8 12 20 15 16 6 6 6 6 6 6 10 10 12
8 8 8 8 9 10 8 8 8 8 8 13 11 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 12 8 8 8 8 8 10 8 6 6 6 8 6 6 6 10 10 8 6 6 6 6 10
6 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 9 8 8 12 11 12 9 9 8 8 8 8 8 8 8 7 7 6 8 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 6
6 8 6 6 6 6 6 9 11 8 6 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 9 9 10 10 10 10 9 9 9 |