BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-171N03.T7 (MSMg01no171_n03.b1) | MSMg01-171N03.TJ (MSMg01no171_n03.g1) |
ACC | AG367936 | AG367937 |
length | 740 | 715 |
length of high quality (start - end) | 323 (45 - 367) | 291 (382 - 672) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no171_n03.b1 PHD_FILE: MSMg01no171_n03.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:42:07 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no171_n03.g1 PHD_FILE: MSMg01no171_n03.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:42:07 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | plural |
---|
sequence | CTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGA
ATTCAGAAAACTGCAGAGGTTGCTTACTGCAAGAAGGTATTCTGCAAAAG
CAATAGATGATAAAAGTACTGAAATATCTATCAGTGCTCTACAATATTAT
ATTCTAGGTGATGAAATTTCTCTTTCTCTCTGTCTCTGTGTCTCTGTGTC
TCTGTCTCTATCTCTATGTCTGTCTATCTGTTTGTCTCTCTCTCTCTCTC
TCTCTCTCTCTCTCTCAATTTCTACTTCTCTAATACTTATTATGAATTAT
GATTCTTTTATCTTATTCCCTCCAATGGGAATGATATTGGAATGGCATCT
GTAACATTCATTCACATTTCTACACAATTCGCCGCTCTCTATTAACAATC
AACTAATATCAAAGTCACACATTCACTCAGATTACAAAATAAGATATCTG
AGCTCATGTAAAGTGATATTCTGAATCAGAGTAGGGGAAGGGCACTTCCA
ATGTGTAGTTTCACTCAAGAGCATGGCTTTTAAGAACTGGTCAATTGGAA
GAAGATGAGACAATGTATAGAAGAGGGTGTTTCTTTTGGTTTAGTTTGGT
TTAGCTTCGCTTCTTTAGGTTACCCACAGTCATTTTAAGATACGTCGATA
ATTACTGCCTATTACTTATATCTTGAACTGAACGCGAATAGGCCCCTTAT
ATTCACGTTATTTTTTTTCCGCTACAATATGTTAGATATT
| NAAATCGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCAAAAAAAACTTGTAATAT
TTACTTTAAACAATTCATACATTTACACCTCACAGCACTTCTTCATAACT
GTACTACCATTGCTGAGATCCTTCTTCTTCCCAAATGGTCCTTCTATTAT
TTTTATAATGGTTCTCCTTTTCTTTGTGTGTATATCTGGGAACATCCATG
CAGGTGGTTGTATTGTACTAGTTGCTATGTTTTTGTGATCACAAGGTCTA
AAGGACCACAATCTGGTCTTGAACTACACATATAAGAGCATCTGACCCTG
AATTACTCTTTTTTTTGACCCCCCTTCTCCAGTCAAGGGATCACAAACAC
CACTTTTGAAGTACTCTATTGAAATGAAAAAAAATTGAAAATATTACACC
GTATCTTCATCTGTTTCTACCTGAGGTGATATATTCTCATCTTTGTCAAA
TGCTGGGCTCTGTACTATATGGGCAACAGAAAATGGAAACATAATATGCT
ATATTAGTAAAAGGGAATAAAGTATTAATGATTTGAATTTCTCAGGAAAT
ACTGCCCAGGTGAATTTTTGAAACAGCTTTTAGAAATGACATAATTACGT
ACATGAAATCCAGTATAGGCATAGATAAGAAGTAAGGTTTCCAAATTATA
GGGCTAGTGAATATT
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 7 9 9 15 18 37 34 29 28 28 22 22 32 23 19 9 9 9 21 21 41 29 29 31 31 31 31 39 34 25 19 12 15 11 11 11 15 19 10 14 14 28 30 50 53 36 36
36 36 36 36 43 43 43 47 53 53 53 48 43 43 35 35 35 42 42 54 54 54 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 50 50 50 51 68 68 68 68
68 68 68 68 68 51 50 51 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 50 42 42 50 50 50 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
51 51 51 51 68 68 68 68 48 48 48 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 47 44 36 28 20 20 20 32 32 48 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57
57 53 57 57 57 57 57 53 53 50 39 34 25 22 17 14 11 8 8 8 8 13 11 15 18 12 12 12 12 12 9 9 9 9 10 8 11 11 22 27 59 59 59 50 50 50 50 50 57 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 59 59 48 43 47 43 43 43 48 48 46 46 43 34 34 43 43 43 59 59 48 40 40 44 44 57 68 68 68 68 68 59
59 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 48 48 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 48 48 48 42
42 37 39 39 40 37 43 43 42 42 42 47 48 48 34 34 23 23 23 34 34 47 43 39 31 25 31 43 39 41 41 41 41 48 59 59 48 57 48 43 25 22 12 12 21 34 28 32 32 30
30 30 31 42 42 43 42 35 35 42 42 43 48 48 57 43 34 28 14 14 23 28 47 48 57 57 57 32 32 20 20 24 32 37 41 37 23 15 9 9 12 19 29 30 30 30 29 39 35 41
41 34 22 18 11 8 8 8 8 8 9 10 14 23 24 16 11 11 16 19 13 14 14 14 19 11 11 11 8 8 8 12 13 17 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 10 8 6
6 6 8 8 11 20 12 11 14 9 11 10 12 10 12 9 9 13 18 23 23 17 16 14 15 17 18 18 25 17 15 8 8 6 6 7 12 12 15 13 13 10 10 14 21 18 17 16 13 9
9 9 12 12 10 10 10 11 11 13 13 18 14 16 9 6 6 6 6 6 8 8 8 10 9 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 3 6 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 11 17 30 30 37 41 47 47 47 42 50 50 50 50 50 39 34 31 34 23 26 18 13 10 10 9 11 11 16 13 18 21 21 33 26 44
39 53 53 53 50 50 50 50 50 50 59 59 29 25 11 12 9 9 9 10 11 24 27 57 57 41 42 42 42 41 50 47 50 50 51 68 68 54 57 54 54 54 54 59 68 68 68 57 57 57
59 59 59 57 57 57 57 57 42 50 50 50 36 36 53 53 37 34 32 25 25 25 34 25 25 11 11 11 25 25 37 37 37 37 37 41 48 47 47 57 57 42 42 50 50 50 53 53 50 50
50 50 57 59 59 59 68 68 68 57 57 57 59 54 54 48 53 50 50 48 50 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 48 50 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 52 59 59 57 57 57 57 52 52 52 57 57 68 57 57 59 59 68 59
59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 57 57 57 57 59 59 57 57 57 54 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 35 30 34 36 36 28 28 28 27 32 32 57 57 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 53 57 57
57 53 48 48 30 34 23 28 28 43 30 25 14 12 12 13 18 12 13 12 11 11 11 11 11 11 11 11 11 16 15 12 19 25 36 47 50 50 43 43 43 43 48 48 48 48 57 57 57 59
57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 39 43 43 48 48 48 48 48 47 34 41 19 19 15 15 15 17 34 59 47 47 42 42 40 43 46 43 43 57 50 48 50 57 57 48 57 57 57
57 57 57 47 47 48 48 48 54 57 57 59 59 59 59 59 59 68 59 59 68 57 57 57 57 54 46 46 48 48 48 57 59 59 59 59 59 59 57 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57
59 59 59 59 59 54 48 48 57 57 59 59 59 48 59 59 59 59 59 59 47 43 43 43 47 39 47 39 47 47 39 39 34 34 24 24 28 34 34 41 40 40 41 48 48 48 48 57 57 48
57 57 48 41 39 30 30 30 37 37 59 59 43 36 25 25 30 30 30 33 40 40 43 40 43 47 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 43 42 35 35 39 43 40 40 43
43 43 43 47 43 33 32 23 23 25 25 12 19 23 34 37 41 43 41 41 37 37 41 41 41 43 59 59 47 30 30 14 14 14 27 27 39 37 32 28 28 28 32 32 43 34 37 30 30 30
32 29 34 28 33 24 32 34 37 37 36 36 35 35 33 37 28 28 23 20 15 15 12 11 11 18 22 11 21 16 15 19 23 31 24 22 22 25 26 21 23 14 20 20 21 28 19 12 12 12
12 11 12 12 24 25 31 31 23 16 12 13 10 10 10 |