BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-197G23.T7 (MSMg01no197_g23.b1) | MSMg01-197G23.TJ (MSMg01no197_g23.g1) |
ACC | AG385165 | AG385166 |
length | 715 | 1,507 |
length of high quality (start - end) | 331 (378 - 708) | --- |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no197_g23.b1 PHD_FILE: MSMg01no197_g23.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:17:19 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no197_g23.g1 PHD_FILE: MSMg01no197_g23.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:17:19 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGG
AATTCAAGATCCAGAGCTGCCAAGTTAAAGATTAAAATGCTGAGCCTGAA
ATCTGACAACTATGTTTGCACCACCAAGCTGGATATGCAAAGAGTTCCAA
GAAATGATGATCCTACTTTACATCCTTTTGAAGTCCCACAAAGTATGCAA
AAGCTTTATATGCTTCCAAATTGCAAAGTGTACAAAACCATTCCTTGCTT
CCCTGGATGGTCACCATGATGGAGTCAGTTTCCTGGCAAAGTATCCAAAG
ATCCTGGCTACTATCATTTCTGGGGCATGTGATAGAGAGGTTAAAATTGG
GAACTTGACTATTTCTAAAATACATCTGAATTATAAAAGCACATGAAGGT
TTTCTATGAGGAGGTGCACCTGCTTTTGTAGGAACACAAAACTGTAAAGC
AGTGAAAAATCAGGTTATGTAGACAAGTAGGAGCCATTGCACACTATGTT
AGGAAAAACAATATATGTTGCCACTGATCATCACTGGAAAGACCTTGTCT
TTGCCACTTGTAGACAACAAGTAGACTTTTGTACAAAGAAAAAAACAACC
CATTGAACTCAATGAATTGGGGAGTTGACAGTATAAGTAGTGTTAAATTT
AACCCTATTGAGATTTATTTATTTATTTATTTATTTGCGAAGTTAGGCTT
TTGGTAGTAATATAG
| GGGGGGAGAAGGGGGGCGGATTCAAGCGCCGTCCGCGGGGTCGGTTACCT
CAGACGTGCTCTTGGTTATATACCGTTATTAAGGTTTATTTGATAGATAT
ACGTGCGGGGTGTTTCCCCGCGCAGGTACGCCCCGCGATAGAATGAAGCG
CACGAAGCGGGTGGTTGAGTCTAATTGTGTGAGGTGTTGTTGTCGTGGCG
ATACGTTCGGGATGTTGATCAAGGCGGGCGCGACCGGTGAAAGGAGAATC
TTCGCCGTGCGTTGCGCCGAGTTTATCGGCGCCGCGCTGTGTGTTTTGCA
TTACCGCGCGCTTTATGTCTTTTGTCGCGGTATTCGCTTTTTTTTTATCT
GCTCTCGCTTCCTTATCTATTTCTCCGCTTTTTACCTTATCGCCAACGCC
CTCTGCTCTTGTCCGCTCCCTGAAGACAGCTATATATTGGTTTGTTTATT
CGGCCACTAGATCGCACCGAGTCGATCGTCCGCTAAAATTTTGACACTGT
GGTCCTGATCGTGGCGTGCGATATGTGGTTATGTGCACAGCATGTATTGT
AGGCGAGTGCAGCGAGCGGCAAGCGACGGCCGCTGTTGGGTTTCACGCTG
TCGGTTCTATTTTCCCTCCATACGCAGTGGCGCCGCGCGGTTGCGGTCCA
TTTGTTGATTTGCGCATCCGCCGCCGCGGACNACAGNGAACGCAGATGTG
CGGGCGGATTTGCGGCGTATTGTGAGGTTGTGTCTATTAGATCTTTATAG
TAATTATTATATCGCGCGCACTGTACCGGCACGACTGAGGTAAGGAGTCG
TATATGAATGTCGCGCCGTTTTATTATCGCGCGGGCGCCGCGTGTCAGTG
CGGCTGTGTTGCGCGGCTATTGTGTNGCGCGCTCGTGTCGCGCAGCTGAG
TCGATATGTCTCACTATACATGTAGCGGCANATGTCCGCGCTATGTATAT
GTTNTATGCGCCGGTGCGCTCGACCGCGCCTGCTTTGCTATCTCTNCGTA
TAACCTCTTCCATCGCGCAGACTTTCGACCTTATAGTGATCGAACTGTAT
ATTATGTGATGCCGTACCGTCGCCACTGGACGGCGCCGGTGNTGCGGTGC
CGCATGGTNAGCTCGTCATATCTAGAGTATAGTGATGTGGACGAGAACNA
ATTGATGTGTGGTGTGTTCACAATNGACGCCTACCGGTATCGAGTATTAG
GTGTCGCGCTGTCTGACATGTNAGTACGTATGTGTGTGATAAGAGAGTGC
GCCGACGTAGTGTGCGTCGCATGTATATAATATGCGCTCAGTGATCACTC
ACACACAGTCGTGTTGGTTGGTGTGTATTTATGCTCGNCGCGCCGCGCTG
CTGCGAACGCGACTATATATACGTACGGTATATACGGGGGCGTGGCTGCG
CGATATAGTGGAGTGTGGCGNCGTCATGGATGTAATNTANTTTGTGTGCG
CATTGTGTGGGATATGNTGATCGTGTGCGTGCACTACTCATNCTTGTCGT
AAATGTN
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 6 8 13 18 37 37 29 26 22 18 18 28 30 28 24 24 32 39 40 41 59 29 29 31 31 32 35 39 39 30 30 30 35 43 39 48 34 37 28 30 30 42 35 57 68 47
47 47 47 50 47 47 47 27 35 24 27 24 16 15 15 20 30 44 48 54 54 57 54 54 68 68 68 68 54 54 54 54 54 54 57 54 54 54 68 68 57 57 57 57 59 57 57 57 47 47
47 50 50 53 36 36 36 38 38 36 48 59 59 59 41 41 26 18 12 12 12 11 11 11 25 25 39 39 46 46 31 31 31 36 36 36 50 50 57 59 59 57 57 48 48 47 53 53 53 53
53 47 47 42 42 42 47 47 42 47 47 47 50 68 68 68 68 68 68 68 54 57 57 54 59 68 68 68 57 59 59 57 57 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59
57 57 57 57 54 54 57 57 57 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 59 59 59 59 68 59 57 57
57 68 68 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 47 46 43 43 43 43 59 59 68 68 68 68 68 68 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 59
57 59 59 59 44 39 39 24 24 14 13 12 12 11 11 12 18 12 15 13 18 18 15 14 14 18 21 23 23 23 28 33 43 39 48 48 48 48 48 59 59 59 57 57 57 54 57 57 57 57
57 59 59 68 68 68 59 59 57 59 59 59 44 44 21 19 19 11 11 11 13 21 32 36 42 27 27 14 21 18 36 36 43 44 43 44 44 43 43 43 57 59 59 57 57 57 54 54 57 57
57 48 59 50 59 59 59 59 59 59 59 57 52 52 52 52 57 57 57 59 52 52 52 57 57 57 59 59 52 52 52 57 57 57 54 57 57 59 59 68 59 59 52 54 57 59 59 54 59 59
68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 54 54 54 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 59 48 48 37 37 37 42 44 54 54 57 57
59 59 57 59 59 68 68 59 59 59 59 42 42 35 39 39 48 57 57 57 48 48 48 48 48 59 59 59 41 32 28 23 32 32 41 41 47 59 59 43 37 37 32 32 33 31 33 33 41 48
48 48 48 57 59 57 57 48 48 48 48 41 41 41 39 39 37 37 31 31 37 36 37 36 36 24 30 25 24 24 29 30 47 47 47 48 48 43 39 35 35 30 30 35 39 31 37 44 44 44
37 37 30 30 28 28 30 37 30 41 37 37 35 31 31 41 38 32 17 18 18 12 11 18 27 41 39 39 36 36 34 34 25 20 20 34 34 32 30 22 14 20 11 11 12 23 25 36 36 37
37 30 19 17 12 12 12 12 12 17 20 24 24 15 15 | Open.Hide. 9 9 9 9 18 9 9 9 9 9 9 11 13 9 7 6 6 6 6 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6
8 8 6 6 6 6 6 7 6 6 6 8 8 8 8 9 9 6 8 8 8 6 6 8 8 8 8 15 16 8 8 8 8 8 6 7 7 6 6 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8
8 8 10 9 11 11 11 18 14 10 9 8 8 10 9 12 12 12 12 11 9 9 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 6 6 6 6 6 8 6 6 8 10 13 15 10 9 9 9 9
8 6 6 6 6 8 6 6 6 11 6 8 8 10 10 10 8 9 9 9 10 9 9 9 9 9 6 6 6 6 8 8 10 10 10 11 11 12 11 11 11 12 10 11 10 15 10 10 10 8
8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 9 8 8 8 8 8 8 10 11 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 9
8 8 8 8 7 6 6 6 8 6 8 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 10 10 10 10 11 10 11 11 12 12 12 12 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6
6 6 6 6 6 6 8 9 13 8 9 10 13 9 9 9 9 9 9 12 9 8 8 8 8 9 7 10 8 6 6 8 6 6 6 6 8 8 14 17 22 24 25 19 14 9 9 9 11 10
10 10 10 8 8 10 13 10 10 8 8 10 8 10 10 10 10 10 10 10 8 8 9 8 8 8 8 8 10 8 14 17 13 11 11 11 11 9 9 9 7 8 8 8 6 6 6 6 6 8
9 9 9 10 12 11 11 18 8 10 9 9 8 10 8 10 11 8 8 8 8 8 8 8 7 6 8 6 6 6 6 8 6 6 8 6 9 9 10 8 8 8 10 8 7 10 6 7 8 6
8 8 9 8 8 6 6 6 8 11 12 10 10 8 8 8 6 6 6 6 6 6 9 10 9 10 10 8 8 6 6 6 6 10 10 15 19 15 14 8 8 6 6 8 8 8 8 8 10 8
8 8 8 10 8 9 10 10 9 10 11 15 12 10 6 6 6 6 8 8 8 8 9 8 8 8 10 8 8 8 10 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 11 11 8 9 9 9
9 9 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 6 6 6 6 8 8 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 11 10 8 10 10 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10
8 8 8 8 8 6 6 6 10 8 8 11 11 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 11 8 8 7 8 8 8 8 10 10 10 9 8 10 10 10 10 8 8 8
8 8 8 9 9 8 8 9 9 8 8 8 7 6 8 6 9 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 3 0 3 6 6 3 0 3 9 10 8 8 8 8 8 8 13 8 8 8
8 8 8 8 10 6 7 6 6 8 10 10 10 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 7 7 6 6 9 17 10 10 10 10 8 8 8 6 6 8 10 8 10 8 8 8 8 10
10 10 8 8 12 8 8 6 6 6 6 8 6 6 6 8 11 17 8 6 6 6 7 9 9 9 9 17 12 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 7 7 7 7 8 8
8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 13 12 6 13 7 9 9 8 11 10 10 10 10 10 11 10 10 10 10 10 10 6 8 6 6 8 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6
8 8 8 8 11 10 8 8 8 8 8 8 7 7 7 9 9 9 6 6 6 6 6 6 3 0 3 8 8 8 9 12 10 11 11 8 8 8 10 8 8 8 6 6 8 8 12 11 9 8
6 8 6 6 6 6 10 10 15 10 13 10 10 6 6 6 6 6 6 8 13 10 8 6 6 6 7 8 10 3 0 3 9 8 8 10 7 9 11 10 10 10 11 10 11 8 8 8 13 8
8 8 3 0 3 10 9 8 6 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 11 8 8 8 8 8 8 10 8 8 3 0 3 8 8 8
6 7 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 8 9 11 10 10 9 6 6 6 6 7 7 17 9 8 6 6 6 6 6 6 8 9 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 9 12 12 26 17
16 13 9 8 8 8 8 7 6 6 6 8 8 9 12 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 12 10 8 6 6 6 6 7 8 3 0 3 10 10 10 10 8 8 8
8 8 6 6 8 8 10 3 0 3 8 8 8 8 8 8 10 8 10 8 8 6 7 10 10 13 8 8 6 6 6 6 8 7 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 9 10 9 3 0 3
8 8 10 8 10 10 15 10 8 9 9 8 8 8 8 10 9 11 8 8 8 8 8 3 0 3 6 8 6 6 6 8 6 8 6 6 7 7 6 6 8 8 10 8 6 6 6 8 8 8
8 11 10 6 6 6 8 8 8 9 9 9 9 8 10 8 8 6 8 6 3 0 3 8 10 8 8 6 6 6 6 8 8 25 30 19 17 9 9 13 10 8 8 8 9 8 8 8 10 10
11 11 9 7 6 6 6 8 8 6 6 6 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 10 13 10 8 6 6 6 8 6 7 7 8 8 8 8 8 8 10 11 8
6 6 6 6 6 8 7 9 8 8 8 8 8 8 8 12 12 12 9 9 9 9 13 10 8 8 8 8 15 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 9 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6
6 6 6 8 10 7 7 7 8 8 10 10 10 12 11 10 9 9 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 6 6 6 8 6 6 6 6 6 7 6
6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 9 9 8 8 8 8 8 3 0 3 8 8 8 8 8 6 6 7 7 10 6 6 7 3 0 3 3 0 3 8 6 6 6 6 6 6 6 6
6 6 6 6 6 6 6 7 6 6 6 6 7 6 6 3 0 3 7 9 10 10 9 9 12 10 9 9 9 9 8 8 6 6 6 8 8 10 12 10 3 0 3 6 8 6 8 6 6 6
6 6 6 6 9 3 0 |