BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-218F04.T7 (MSMg01no218_f04.b1) | MSMg01-218F04.TJ (MSMg01no218_f04.g1) |
ACC | AG397534 | AG397535 |
length | 852 | 705 |
length of high quality (start - end) | 213 (42 - 254) | 293 (84 - 376) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no218_f04.b1 PHD_FILE: MSMg01no218_f04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:46:18 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no218_f04.g1 PHD_FILE: MSMg01no218_f04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:46:18 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATT
CACTTCATATCTTTATATAGATCCATACATTTATTATCTAGAGCTTTGGA
AAATATAAAGCCCATTAAAGGTTTTATCATGCAACATTCTCAAACAAGGT
ACACATATTTATTGAAATATTCCAATATTTTAATCTCTTTCCTTATTTGA
TTAAGTGCTAAATTGTTCACTATGCAAACTAAGNTACNNACAGGAAGGCA
CCTAAAATGGAACAAGGTTAAAAAAAACNNCCCAANCNNANATAAACACA
AATAATATTAATTAAATATTAATTTCCACTATCCTTACCTAATCCTTCAA
CATACTTCTATTTCCTTTCCCCTATATTCTTCTTCCAACCCTCAAAACTA
ATAATCCCACTATACCTTAACATTCTCTTTATTTACTTCTTGTACTATTA
TTCCCAATCATATCGCATCCGGTGGTACTCATCCCACCTTTCCACCCTGT
ATTTATTATACTACCAAGCCCCATTTATTATATGTGATTTTTTCCCTCCA
CATTTCCTACCTATTTAACTTCCAACTCATACACTTACTTCACATACGTT
ATTCTATCACCCTATCTCCTTCCTCCTCCCTCACTTTTACTCTATACACA
TCTTATAATATGGGAATAAATTCGGCAAGATATCCTGGAGTTTAACACTA
GCACATTACTCTTCAACTTATTTATCACAATTATACCCGTATCTATCTAC
TTATTTAATATAAAACCTTTTCGGAAATCCTCTTATCATTTTCATATAAC
CTCTACTTTTCCACCTTATTATCCACTGTTAACCACCCCAGTCCTCTCTC
AN
| NNTTTTTACGATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTGATCTTTCCAAAACT
TTTATCATGAATGGGTGTTGGATCTTGTCAAATGCTTTTTCTGCATCTAA
CGAGATGATCATGTGGTTTTTGTCTTTGAGTTTGTTTATATAATGGATTA
CATTGATGGATTTTCGTATATTAAACCATCCCTGCATCCCTGGAATAAAA
CCTACTTGGTCAGGATGGATGATTGCTTTAATGTGTTCTTGGATTCGGTT
AGCGAGAATTTTATTGAGGATTTTTGCATCGATATTCATAAGAGAAATTG
GTCTGAAGTTCTCTATCTTTGTTGCACCTTTCTGCGGTTTAGGTATCAGA
GTAATAGTGGCTTCATAAAATGAGTTGGGTAGAGTACCTTCTACTTCTAT
TTTGTGAAATAGTTTGTGCAGAATTGGAATTAGATCTTCTTTGAAGGTCT
GATAGAACTCTGCACTAAACCCATCTGGTCCTGGGCTTTTTTTGGTTGGG
AGACTATTAATAACTGCTTCTATTTCTTTAGGTGATATGGGACTGTTTAG
ATGGCCAACTTGATCCTGATTCAACTTTGGTACCTGGCATCTGTCCAGAA
ATTTGTCCATTTCGTCCAGGTTTTCCAGTTTTGTTGAGTATACTCTTTTG
TACAN
|
quality values | Open.Hide. 6 6 8 14 37 59 41 33 32 32 28 28 37 22 22 20 24 24 28 43 48 35 30 30 30 32 36 59 59 57 57 57 57 57 57 57 42 42 28 23 29 40 40 57 57 42 42 41 41 41
50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 51 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 44 43 35 35 35 43 43 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 51 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 53 53 53 53 53 50 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 29 14 3 0 3 14 3 0 0 3 14 15 44 33 33 33 37 47 44 19
17 7 7 7 17 19 29 28 14 15 12 11 11 11 15 15 12 15 14 13 12 14 22 23 20 15 13 3 0 0 3 8 8 8 3 0 3 0 0 3 0 3 10 18 12 14 14 17 11 6
6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 12 11 8 8 6 6 6 6 11 8 8 8 8 11 11 8 9 9 9 10 10 13 8 11 8 8 8 8 9 9 10 10 10 13 10 10 10 10 8
8 9 9 8 8 6 6 6 6 8 8 11 11 11 13 15 13 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10
10 12 8 8 8 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 9 10 9 9 10 10 9 9 8 8 8 8 8 8
12 11 11 11 10 10 13 10 8 8 6 7 10 10 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 10 10 10 10 13 8 8 8 7 12 10 10 11 10 10 9 9 8 12 11 8 8 8
10 10 12 10 19 15 13 10 10 11 13 11 13 13 15 12 11 11 11 11 12 15 10 9 8 9 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 9 9 16 13 13 13 12 12 9 10 10 8
8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 10 11 12 12 8 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 8 8 8 12 10 10 11 10 8 8 10 8 8 10
8 8 11 11 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 16 13 12 12 11 9 9 8 8 10 8 11 11 11 13 12 11 11 18 17 11 11 10 13 10 8 8 8 8 8 8 8
8 9 9 10 10 10 12 9 8 8 8 8 8 9 8 8 6 7 8 8 12 12 8 8 8 8 8 8 10 10 8 9 9 9 9 9 9 7 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7
7 6 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 7 7 8 8 8 8 11 8 8 8 15 10 9 8 8 8 6 6 8 10 15 11 9 8 8 7 7 7 7 8 8 8 8 8 8 6 6
8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 12 8 8 7 8 8 8 8 6 6 10 12 12 13 8 10 8 8 8 12 8 11 10 12 11 10 9 10 10 10 9 9
8 8 8 6 6 6 7 6 8 8 10 10 10 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 12 11 12 11 10 11 10 6 7 6 6 8 10 7 6 6 8 8 10 10 10 8 10 10 13 9
3 0 | Open.Hide. 0 0 3 3 6 6 8 6 6 8 8 8 10 10 9 8 8 8 10 11 16 19 29 31 35 37 39 37 37 37 37 37 36 34 34 36 31 32 32 26 19 20 24 23 28 23 30 30 36 48
42 48 54 54 54 43 43 42 39 32 32 42 35 35 57 59 59 59 33 36 30 30 41 34 41 41 41 48 48 32 28 37 37 43 43 57 57 47 47 47 59 30 30 23 25 32 42 42 43 43
57 57 57 50 41 41 41 50 50 68 57 57 57 57 57 57 59 57 59 50 38 38 36 36 37 44 43 37 37 37 52 57 57 52 52 52 57 50 57 52 43 43 43 43 43 32 43 43 44 43
52 52 57 57 57 57 57 57 57 46 46 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 39 39 43 59 44 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 62 43 43 62
52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 42 35 44 44 57 57 57 59 57 59 57 52 52 52 52 57 52 52 43 44 43 52 43 43 43 43 43 44 43 57 57 57 68 57 44 43
35 37 43 43 52 43 44 44 59 38 38 43 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 52 52 52 50 50 57 57 57 57 59 44 44 33 43 43 44 44 57 44 44 37 32 33 44 44 57
57 48 48 48 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 59 59 57 68 68 68 57 57 59 44 32 30 28 31 28 30 44 44 44 46 46 43 36 34 34 54 54 54 54 54 57 57 57 57 42
47 35 35 43 59 59 59 59 59 57 57 48 48 30 41 28 28 28 31 30 39 24 17 10 10 10 10 11 15 13 14 12 10 10 10 10 10 13 24 30 37 59 59 59 47 39 39 35 37 37
43 59 59 59 59 57 57 48 48 48 42 40 40 28 28 43 43 57 57 54 59 59 59 41 32 41 21 20 15 18 13 13 17 22 22 28 37 37 44 44 43 43 47 47 47 43 43 43 57 57
57 57 57 43 43 43 59 59 57 57 48 59 59 59 59 57 54 50 50 44 44 48 59 59 57 48 48 57 57 57 57 52 32 32 32 32 52 52 43 43 59 59 57 57 57 44 44 35 35 43
44 44 50 48 43 43 32 32 33 43 43 44 44 43 43 46 46 57 47 43 47 43 59 43 44 37 44 34 20 20 32 32 40 44 35 35 35 59 59 68 68 59 57 47 46 39 37 37 30 40
32 39 39 48 48 57 57 48 59 43 43 43 59 48 48 48 48 59 48 48 48 57 43 43 43 39 36 37 37 48 48 48 46 46 43 43 43 47 47 41 41 41 33 32 30 30 23 30 28 34
25 30 19 19 18 18 24 28 31 33 37 34 41 43 43 40 39 43 39 37 37 35 35 32 37 39 39 32 29 26 25 25 27 23 14 8 8 8 8 13 15 26 14 14 14 18 18 23 24 24
33 33 33 33 43 37 37 36 37 30 29 28 19 20 20 19 16 21 21 21 22 13 11 11 14 10 13 17 11 11 22 21 22 22 20 28 22 22 12 11 8 8 8 8 8 10 15 23 16 12
12 12 9 3 0 |