BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-264A20.T7 (MSMg01no264_a20.b1) | MSMg01-264A20.TJ (MSMg01no264_a20.g1) |
ACC | AG405706 | AG405707 |
length | 742 | 883 |
length of high quality (start - end) | 317 (45 - 361) | --- |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no264_a20.b1 PHD_FILE: MSMg01no264_a20.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:01:08 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no264_a20.g1 PHD_FILE: MSMg01no264_a20.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:01:08 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGA
ATTCCAAACACTGGCCCTCCACCAAGAATGCAGTATCCTTACCCTTCCAC
TTCAAGCCCAGAGATGTTCTCAGTAAAAATAACCTTAGCTAATCATAACT
GCTGGGGAAGCTAGAGATAATCTTCATAAGGTCACAAAGAGCTTTAAAAA
ATGTCTTTAGAGATCAAACAACTCTTACTAAGAAAGGGTTAGAAAATTCA
GGGTACACTCATTTATCCTCCCCTCCCCATGCCCCTCAGACAAATGAGAT
GCTGAGAGGCTGGGATAATTCTCAAGCAGCATACTCAATCAATTCCTACT
TCCACACTGTACTATTACCTCACCCCCACCGCCCCTTGGTAAATTAGTAG
TATGAAGCTAAATAACTCAAAACAGACAATCATCATAGTGACAGACTTAT
AAAAGGCAGTTGCAGGAAATTGCACAAAATAAGCAGAATAAATAATTCTG
GGGAGAATTGGATGCTTTTTCCAACAACCACCTGACAGCCTAACTTTCTT
TCAAATTTTACATCTACCCCCTTCTCTTCTTTGCCAGATGAATGTGCTTC
CAGCTGGACTTAGGAGAGGCAATGGTGTCAACCAATGACTCGTTAAAAAA
TACACACCTGTCATAAATGCAAGGCTCTCTCAAGGGATATATTAAATTGC
ATTCCTTGCTTTCTATGAAAAGGTGCAATGAAAAAAAATGAG
| CCCCCTTCAAACATCCCCTTTTCTCCCAACCCGCNNTTTTCNNTNNNNTT
TTCTATGATAGTGGGTAGGCCTGGGGCGGCCGCCTGGGGCCGTCGTACAA
TTCTAGTGGTGGGACACCTTAATTAAGTTAAAAAGGGGATAATTTCCCCC
CGGTTCCGTGGTCAAAAATTTCCCACGAGGTCCCTTTTCATGCTTAGAGT
GAGTTATCATTTTTCCATATTTTACACCAAAAGTTAACGGTTTTCCCATT
AAGTAACCTTTGTTGTAAGGGGTAAAACCCAGCCAGGAATAGGAAGATGG
GGTTATTGGTATTGGGGGTTAGGGTTTTTTGGTTAAACTTTGGAATGGGA
GACCCCTGGGTCTTTCTTCTCAGAAGGGGCCCAGTGGGGGCCAAAGCCCC
CTAATGGGGGGGGGAAAAAATTTTTCCCCCCCGCCCATATGGGGTGAAAA
CGGGGGGGCCCCCCCCGCGAGGGGGGGGTTATGTTTTTTCTTTTTTATAA
AACCGCCCAAGGGGGGGCCCCCGGGGGGTATCACCTTCTTTTTTTCCCAA
AATGTGGGGGGGGGGGGACCACCCCCCCGGGGGGGCCCCCCCCCGGGGGT
TTTNGAGTGGGATTTTCCCCGCCCCCCCGGACAAACTCCCCGAGTATGTG
GGTGATGTGTAAAAAATAACGGGGGTGGGAAAACCCTGTCTAAAAAAAGA
GAGGCCCCCGCCAATGAAAAAACAAAAAAAAATAAGCCGCCCCCCCGGGG
TGTTCTCTGCCCCTCCCCCCTAATAAAAAGAGAAATAACTCATGTATAGA
AGAAAGGGTGATCTACTAAATCCATGTTATAATAATCTTCGCGGGGGGAT
TGCTGCGCGAGTGATAATAATGAATGGAAGCTG
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 13 19 37 39 37 29 27 24 22 22 31 23 19 9 9 9 21 21 41 29 29 31 31 31 35 39 37 24 22 17 17 17 30 32 33 33 24 33 36 42 43 57 57 42 42
40 40 40 41 48 48 50 50 54 54 50 50 54 54 57 57 59 51 51 50 50 50 51 57 68 51 50 50 50 50 50 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 48 48 46 46 46
48 51 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 52 52 52 57 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 50 50 48 47 48
48 48 57 57 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 43 39 23 22 16 12 12 12 11 11 11 22 15 24 32 41 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
50 50 41 41 39 22 17 10 13 9 7 7 7 7 7 8 9 10 10 12 11 11 9 13 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 10 16 18 21 25 41 48 48 48 48 57 48 48 57 57 57
57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 68 44 44 37 30 30 14 14 14 18 21 25 18 23 18 44 44 57 57 57 57 43 47 42 44 42 42 35
33 33 35 42 59 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59
59 59 59 59 54 54 54 48 48 53 54 54 54 57 57 59 59 57 57 53 53 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 53 44 44 39 37 37 41 44 44 44 41 41 44 59 59 59 59 59 50
50 50 50 50 57 59 59 59 57 57 57 50 53 53 57 57 57 59 59 57 57 57 53 53 50 59 59 59 59 59 59 59 44 39 37 40 40 41 41 41 37 36 44 44 47 47 47 47 50 50
42 41 39 39 44 41 41 44 59 59 59 36 36 36 39 39 40 41 41 41 41 44 41 37 35 41 30 30 22 28 28 39 39 48 48 41 41 41 41 34 34 33 31 29 37 37 37 35 35 37
37 37 37 37 37 37 43 43 43 36 36 36 37 37 34 37 39 39 37 31 26 31 34 32 34 34 34 34 39 39 36 37 36 36 36 31 23 23 23 33 32 39 39 36 36 35 31 31 37 37
37 47 47 59 47 47 41 39 35 31 31 39 36 36 37 18 9 9 9 9 15 16 14 14 14 28 24 37 32 32 31 28 28 28 31 19 22 12 10 10 12 9 | Open.Hide. 8 10 10 8 8 8 8 8 8 10 9 7 8 17 17 21 21 10 8 8 8 8 8 9 8 10 9 10 10 9 11 8 8 3 0 0 3 8 8 8 3 0 0 3 0 0 0 0 3 6
6 6 9 9 9 13 9 9 9 10 10 9 18 24 24 30 27 21 21 28 19 9 9 9 9 9 16 27 24 23 31 37 22 17 9 11 9 9 9 17 25 22 15 15 10 10 9 11 6 6
6 8 6 8 12 6 6 6 7 7 9 9 9 9 12 12 20 18 23 22 19 15 14 11 9 9 9 9 9 10 19 11 9 9 10 15 7 6 6 6 6 10 9 8 8 8 10 15 10 10
9 10 8 8 7 7 8 8 8 8 8 9 10 10 12 21 20 16 16 18 18 21 17 9 9 7 7 6 7 6 6 8 6 8 8 10 9 14 15 15 8 8 8 8 9 9 7 6 8 6
6 6 8 9 6 11 6 6 9 17 27 37 29 28 18 13 17 15 15 11 11 15 11 15 13 6 6 8 12 16 9 15 9 9 9 12 8 9 9 8 8 8 11 11 11 14 11 9 9 9
8 9 8 8 9 10 10 11 11 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 10 9 18 13 11 13 16 12 19 11 13 12 14 15 15 12 10 7 7 7 8 8 9 11 10 10 9 9 9 13
11 10 13 11 11 12 12 12 10 10 11 9 8 10 9 14 8 9 10 10 11 11 8 8 8 11 11 11 19 9 10 10 13 10 10 10 10 12 12 10 11 11 10 12 10 8 8 10 8 8
6 6 8 6 8 8 8 9 9 10 10 9 10 13 17 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 14 15 11 10 10 9 10 9 9 9 9 13 12 11 9 8 8 8 8 8 8 9 8 13 23
12 10 10 9 9 10 9 22 23 28 19 13 8 8 8 8 8 15 11 12 25 25 22 32 29 28 28 34 28 19 11 7 8 7 6 8 6 6 6 6 6 11 19 8 8 8 8 8 8 13
9 11 11 13 16 7 6 6 6 8 7 8 16 15 13 7 6 8 8 6 6 6 8 17 20 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 12 9 9 11 9 10 12 9 9 9 20 12 13
13 10 8 8 6 6 8 14 10 14 16 15 15 19 15 15 9 12 10 10 14 16 14 15 16 8 7 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 7 9 15 34 30 30 23 24 18 18 11 12 9
9 8 8 8 8 8 9 26 28 28 22 19 31 21 17 11 11 8 8 8 8 8 10 13 9 6 6 6 6 7 9 30 18 15 15 17 17 19 14 11 11 15 8 8 8 9 12 11 11 14
7 7 3 0 3 6 7 6 8 8 8 12 12 14 10 14 12 11 13 10 10 10 11 11 12 10 10 8 7 7 7 7 7 7 9 9 10 11 16 9 9 9 9 8 8 10 10 8 8 8
8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 10 10 13 8 9 12 8 7 8 8 7 9 14 9 6 6 6 7 10 12 8 8 6 6 10 8 8 8 8 8 14 19 19 14 13 13 12 8 8 6
6 6 6 6 6 8 8 9 9 9 9 9 8 8 8 8 12 12 19 8 13 6 6 6 9 11 17 14 11 8 12 8 8 8 8 11 9 10 8 10 15 15 14 13 12 12 11 6 10 8
8 12 8 8 10 8 10 8 8 8 8 7 6 6 6 8 8 15 13 15 13 13 13 14 13 15 15 13 9 7 6 8 8 8 8 8 10 8 8 9 8 8 7 6 8 8 9 9 8 8
8 10 8 8 8 8 10 6 6 6 6 8 8 8 8 9 9 8 8 6 6 8 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 14 14 12 11 10 8
8 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 12 11 10 9 8 11 10 13 10 8 8 6 6 8 8 9 9 9 |