BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-304M08.T7 (MSMg01no304_m08.b1) | MSMg01-304M08.TJ (MSMg01no304_m08.g1) |
ACC | AG429950 | AG429951 |
length | 1,380 | 1,388 |
length of high quality (start - end) | 672 (90 - 761) | 646 (132 - 777) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no304_m08.b1 PHD_FILE: MSMg01no304_m08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:43:51 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no304_m08.g1 PHD_FILE: MSMg01no304_m08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:43:51 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNCCCGGTTTTNNNNNNCCATTGGGCGCTAAGACTCCTATGGGAGAGGAT
CCGCGGAATTCTTTGTTCAGCTCTGAGCCCTTTATTTTATGGGGTTATTT
GATTTTCTGGAGTCCACCCTCTTGAGTTCTTTATATATATTGGATATTAG
TCCCCTATCCAATTTGGGATAGGTAAAGATCCTTTCCCAATCTGTTGGTG
GCCTTTTTGCCTTATTGACGGTGTCTTTTGCTTTGCAGAAGCTTTGCAAT
TTTATGAGGTCCTATTTGTCAATTCTTGATCTTACAGCACAAGCCATTGC
TGTTCTACTCGGGAATTTTTCCCCTGTACCCATATCTTCGAGGCTTTTCC
CTACTTTCTCCTCTATAAGTTTCAGTGTCTCTGGTTTTATGTGGAGTTCC
TTAATCCACTTAGATTTGACCTTAGTACAAGGAGATAAAAATGGATCAGT
TCACATTCTTCTACATGATAACCGCCAGTTGTGCCAGCACCATTTGTTGA
AAATGCTGTCTTTTTTCCACTGGATGGTTTTAGCTCCCTTGTCAAAGATC
AAGTTACCATAGGTGTGTGGATTCATCTCTGGGTCTTCAATTCTGTTCCA
TTGGTCTACTTGTCTGTCACTATACTAGTACCATGCAGGTTTGATCACAA
TTGCTCTGTAGTAGAGTTTTAGGTCCTGCATGGTGATTCCACCAGAGGTT
CTTTTATCCTTGAGAAGAGTTTTTGCTATTCTCGGTTTTTTGTTACTCCA
GATGAATCTGCCGATTGCCCTTTCTAATTCGTTGAAGAATTGAGTTGGAA
TTTTTGATGGGATTGCATTGAATCTGAATATTGCTTTTTGGCAAATAAAC
TTTTTTTAAATGGTGATTCTTGTCTATCTCTGAAGATTGTGAAATCTTCC
CTCCTTCTCAAAACTTCTTTTTATTTTTTTCTTTATAAACTCGTAAGTCC
TCTTATTCTCAATATTTTCTTCCTTTATATTTTATNACAAATAGAGATTT
TTTCTTTTTTTCTCCTTTTTAAATAGTATTGCTATTATTTTTATTTTAAT
TCTTTTAACTTATACTTTTATACACTGTCTAATTTTTATTTTTTCTTCCT
TTATCTCTTTTGATATGTTCATTTATTGCTATCTATAATTAATTCGTTTG
ATTTTGAATCTTTTAATTTATATTTTAAATCACTATATCTCTTGTAATAT
TTACCTTACTTATCTTCATTTATTTCTCTTTCATTTTCAATTTTCATCNT
ACCTTCTTTTTATTTCTGCCCAGCACCCTTAATTATATTAGTTTTCTAAT
TTGTATTCGACCTTCNNNTTTNCNTNNANTNNTTANTAAAANNNNNNNNN
TTATTAAGTTCCTTGATATTACCTCTTCTG
| NNNNCAATTCTTTNNNNNATCATGGAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTTTTAAATATCATTCCAGTA
AATGTAGTGATTTTTTTCTCCATAGACTCATGAGAGCATGAATTCTGATG
TTTTCAGAACACCATTCATTTCTGTTTGACATTGACAATTAACAAGTAGA
CCTTAGCTGCTTATCAAATCAGAGCTTCACTTAAATTTCTCCTGACTAGA
AATTAAAAAGTTGTTTCCAAGGTAACTGACAACCAGCTATTGCCCTCCAG
GGTATCTTAAGTTTGGAATTTAAAATGGGATCCCCATCCCTCATCTCTCT
ATATATTTCTTTTTCTCTCCCCTCTCCCTTGTTGTTGGTTATAATTTTTT
TTGAAGACATTCTCCTAGGCTGCAGTAAAAGAATGTTGAGTACCCTAACA
TTCTGAGATTTCAAAATAAAGTATTAATCGAGCATTATAGATTATGATAG
CTGGGATGCATGGGAAAGGAGATCACATGACCAGATGGAAAAGCTATAGA
GAGATTCAGGGGGCTTAAGTTTTCTCTTAAAACAGCTTGTTCTCAAAAGA
ACTTAACAGGGTCTCATGAGAAGTACTTTAATCCCTCCCAAGAGGAGCCA
ATTTAATGACCCTAAACCTAAATACTTCCTACTCAACTCCATTTTTTAAA
GGTTTCTCATCACTTCCCAAATCATGACTCTAAAGACCAGGTCTCAAACT
CATGAATATTTAGGGGACAAATCACATTGAAACCCAGCAAGCACTGATTC
ATTTCATTGCCCAATTATATTGCCCAAACACCTCCTGCTGGATCCTGCTG
GACTCTACTAAAAATCTCATACACACTTGAAAAAAACATTCCCCCACATG
GACTGTTGAAGGGGATATTTTACCCCAAAAAAATTATGCTTTTTCTCTCC
CCTTTTCAGGGGATAAAAAAAAAATTCATTCCCGAAATTTGTTAAACCAA
TATTTCGATAAAATGAATACAAGGGTTATGTGGAAACATTTTGTTATGCA
AAAAAACAGAACCCCAAAGTTTTTTTTCTTGTTGCGGGTNAAGGGAAGAA
AAAAAATTTTTTTTCTTTCCTTTTTCTGCCTCACATCCACTGATTGTTCT
TTATTGTTAGTTCATTATTACATTACTTCACTGTTGTTTATACACTCCTA
TCTCCATACTTATCTTTCACTTGTTATTTTTGTCTTCCTCTATGTNNNCT
TCAATATTTNACGCTTTCCTTTACATANNACTCGTTTAAACCCATGTGTA
TTCTTCATATACTCCCGTCAATNNGNTTTTTAATNNNNTNTNTNNNATCA
AACNCCCACCNNNNNACGCACAGTTAGTATATCAGATA
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 7 7 6 6 9 10 9 3 0 0 0 0 0 0 3 6 6 6 6 6 8 9 10 8 8 8 8 8 8 13 15 9 8 8 10 8 8 8 22 19 33 37 33 33 36 48 48
47 47 47 50 50 50 50 42 42 53 53 53 38 36 36 36 36 31 33 33 33 31 30 21 21 10 10 11 15 12 14 11 10 10 11 17 15 10 10 15 18 37 44 36 36 36 36 50 38 57
57 57 57 53 36 36 36 36 31 33 31 30 28 27 25 21 23 11 11 11 17 17 26 26 33 30 30 31 36 36 38 38 47 39 39 39 39 43 43 40 44 57 53 53 53 53 53 51 51 51
51 68 68 51 51 51 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 37 30 23 18 18 18 23 11 11 12 23 28 41 47 50 50 50 50 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 57 57 57 57 54 59 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 68 59 59 54 54 54 59 59
59 59 57 59 50 50 50 57 57 57 59 59 68 59 59 57 57 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 48 44 44 43 47 47 59 44 57 43 43 43 44 44 44 44 25 32 25
44 44 54 54 54 57 57 54 47 47 43 43 43 46 43 48 48 48 39 43 39 42 42 35 35 35 59 59 57 59 47 47 40 39 30 37 37 32 32 35 39 47 47 47 39 39 39 47 39 39
39 37 31 30 37 28 34 34 46 43 59 39 39 35 47 35 35 35 59 47 48 48 48 48 47 47 43 43 43 43 47 43 43 41 39 35 35 39 39 43 43 47 47 37 37 23 31 32 37 43
37 41 40 41 41 39 39 29 30 18 25 25 15 15 14 23 17 31 34 40 35 28 28 31 31 34 34 30 28 28 34 36 34 27 29 25 20 22 30 28 37 37 37 18 17 11 11 11 20 19
37 37 41 41 41 41 37 37 37 31 22 30 15 17 17 15 15 15 15 15 24 30 41 59 41 37 37 32 32 32 37 37 30 27 22 36 36 39 39 39 39 39 39 39 39 39 40 39 37 24
24 14 24 24 31 31 41 27 23 11 11 9 15 9 12 12 14 17 18 23 26 30 30 23 18 23 21 19 12 10 11 13 23 23 17 11 11 11 14 16 15 19 15 19 26 27 22 25 26 22
22 11 18 9 9 10 10 10 10 6 6 6 8 10 11 14 18 14 13 15 19 19 19 10 10 8 6 9 9 10 19 15 11 11 14 19 17 11 8 10 8 9 10 8 8 8 6 6 6 6
6 6 10 15 19 19 10 10 10 13 14 12 13 13 13 9 11 11 9 9 9 12 12 8 10 10 8 8 8 8 13 11 10 9 9 12 12 14 9 8 8 8 8 12 10 9 9 8 8 8
10 13 13 9 8 8 8 9 9 9 9 9 10 9 10 9 9 10 19 21 20 11 11 11 13 10 10 16 17 14 22 11 19 13 10 10 6 9 10 12 10 12 9 8 8 8 12 12 9 11
9 8 8 6 6 6 7 6 10 9 9 9 9 11 15 23 15 15 9 9 9 9 8 8 8 8 12 15 15 18 19 13 11 10 3 0 3 7 8 8 12 15 12 12 9 9 9 8 7 6
7 7 10 8 8 8 8 9 9 8 8 8 12 8 8 6 10 8 13 9 9 9 8 10 8 6 6 8 10 8 8 8 7 7 8 9 8 10 8 8 8 6 6 8 8 18 17 11 12 10
8 8 10 19 22 19 16 10 11 11 11 11 8 8 8 8 8 15 12 9 9 9 7 10 8 8 8 8 10 10 9 8 10 9 8 6 6 6 6 8 8 12 9 8 8 8 8 8 10 10
8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 6 6 8 15 8 9 10 13 9 10 10 13 9 8 8 9 9 9 9 9 9 12 9 9 9 10 11 15 10 8 6 6 8 8 8 8 10 8 10
10 11 11 8 8 6 6 8 6 6 8 8 10 10 15 9 9 10 10 8 6 7 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 10 8 8 8 8 8 11 11 8 8 8 9 9 10 8 8 6 7
8 8 8 8 8 13 12 18 10 8 6 6 8 8 10 11 11 10 10 8 8 8 6 8 8 8 6 7 8 13 15 8 9 9 15 15 19 8 8 8 8 12 8 8 7 7 8 3 0 3
7 8 8 8 6 6 7 7 7 7 7 6 6 6 7 15 10 8 8 8 15 17 17 6 6 6 6 9 9 9 9 9 11 15 10 9 9 12 10 10 10 10 15 14 8 8 6 6 8 8
13 9 7 10 7 6 8 8 8 8 8 8 17 17 3 0 0 0 3 7 3 0 3 0 3 0 0 3 0 3 0 0 3 6 3 0 3 6 6 7 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0
3 6 6 8 8 8 8 8 8 6 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 7 10 8 9 9 9 | Open.Hide. 0 0 0 0 3 6 6 8 8 6 7 7 3 0 0 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 10 13 8 8 9 8 10 10 15 15 13 8 9 9 21 19
19 10 10 24 26 35 32 32 36 42 37 35 35 36 38 38 53 53 50 50 50 50 47 47 29 29 9 9 9 9 13 9 11 9 9 8 9 10 10 6 6 8 15 19 39 31 30 31 31 31
35 36 53 53 38 38 38 35 35 35 36 50 59 59 37 30 30 16 15 8 7 7 7 7 9 10 10 10 10 16 17 24 15 19 29 41 34 39 39 36 36 36 39 39 44 47 53 57 57 57
57 53 53 53 68 68 68 68 68 68 68 51 51 51 50 50 50 51 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 46 57 57 57 57
57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 51 51 50 50 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 48 48 48 41 34 37 28 25 21 10 8 8 8 10 15 34 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 48 48 48 57 57 57 57 59 68 68 68 59
59 59 59 43 44 37 37 37 44 44 47 43 43 43 47 59 57 54 48 59 59 59 57 59 59 59 48 48 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 48 57 48 59 59 57 57 57 47 50 43 59
59 59 57 43 43 32 43 43 50 50 50 57 52 59 59 59 57 44 44 32 32 32 43 37 52 52 57 52 57 57 57 52 52 52 43 50 46 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 37 37 36
36 28 37 37 42 42 35 35 35 59 59 59 59 57 57 57 57 48 48 48 44 44 42 47 47 43 43 39 47 47 59 43 43 43 46 47 44 44 30 30 30 40 40 35 35 30 43 30 30 30
33 33 37 42 43 43 57 59 59 48 37 37 28 37 37 43 32 32 20 20 20 31 28 35 32 43 43 43 41 37 37 41 43 59 43 46 43 47 32 32 24 32 20 17 17 19 19 20 24 28
30 37 37 47 46 39 43 43 37 36 36 39 47 47 59 41 41 37 41 43 59 47 47 41 41 48 48 46 41 47 41 34 34 30 24 25 37 37 41 41 41 41 47 47 59 44 44 37 36 37
37 30 24 24 34 34 41 41 43 43 41 46 37 37 37 37 37 37 37 48 48 48 48 48 39 39 39 39 37 39 39 29 29 28 28 24 26 31 28 28 37 34 30 34 33 28 31 40 37 37
30 30 30 37 30 31 37 37 37 32 32 18 18 18 25 25 22 20 18 22 27 30 30 20 18 11 11 10 15 11 11 11 9 15 22 25 28 34 30 29 32 37 37 26 26 26 23 15 13 12
12 22 26 34 30 30 29 31 28 21 21 21 27 27 22 20 22 25 25 19 19 25 18 22 22 28 20 19 22 24 24 28 28 25 22 32 20 19 19 17 21 11 11 11 12 13 21 21 24 18
18 14 14 14 23 23 23 18 11 9 12 12 9 8 9 9 9 8 11 12 10 8 8 10 9 9 8 8 10 10 9 12 14 15 19 11 11 11 15 13 11 8 8 8 8 8 8 8 8 9
10 10 10 10 16 12 10 10 9 9 8 11 16 11 11 11 16 10 10 9 9 9 11 10 11 10 10 8 15 10 9 9 6 6 6 8 9 9 10 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8
10 10 10 19 10 9 10 9 8 9 8 8 6 6 6 8 10 9 9 9 10 10 13 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 17 6 6 6 6 6 8 8 8 10 6 6 6 6
8 8 8 8 8 17 13 6 7 7 13 11 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 11 9 9 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 15 11 9 9 6 6 6 6 6 6
15 19 22 14 9 9 9 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 6 10 8 8 8 8 21 18 21 11 11 9 9 8 8 8 8 8 8 8 13 3 0 3 16 12 25 21 8 8 8 8 17
19 18 9 9 8 8 8 8 9 9 10 10 9 22 9 8 10 8 8 6 6 8 8 11 8 8 8 7 10 7 6 8 8 8 8 8 10 6 6 8 8 8 6 6 9 9 7 10 8 8
8 6 9 9 10 10 6 8 6 6 6 6 8 8 13 12 17 12 12 8 10 8 8 8 6 6 6 7 8 8 8 8 6 6 7 7 10 8 8 7 7 12 12 10 10 8 10 8 6 8
8 9 11 8 8 8 11 8 8 10 8 12 8 8 6 7 11 7 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 6 6 7 8 8 9 8 8 8 8 10 6 7 3 0 0 0 3 11
13 8 8 8 8 12 9 10 3 0 3 8 6 8 11 7 7 8 10 13 16 22 14 14 15 13 3 0 0 3 6 6 8 6 6 7 6 6 6 6 6 8 9 8 9 8 10 8 8 6
6 8 6 6 8 15 11 20 15 15 9 10 11 12 9 9 8 8 8 6 8 3 0 0 3 0 3 7 14 6 6 6 6 3 0 0 0 0 3 0 3 0 3 0 0 0 3 7 8 8
7 7 3 0 3 11 7 7 7 3 0 0 0 0 0 3 9 9 9 12 10 8 8 6 10 6 6 8 10 13 9 9 9 8 8 8 8 7 |