BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-305B16.T7 (MSMg01no305_b16.b1) | MSMg01-305B16.TJ (MSMg01no305_b16.g1) |
ACC | AG430181 | AG430182 |
length | 1,330 | 1,297 |
length of high quality (start - end) | 387 (479 - 865) | 783 (90 - 872) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no305_b16.b1 PHD_FILE: MSMg01no305_b16.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:44:37 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no305_b16.g1 PHD_FILE: MSMg01no305_b16.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:44:37 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NCCCCATTTNNNNNGGGCATTGGGCGCATAGACTCCTATGGGAGAGGATC
CGCGGAATTCAAATATAAAATTTTAACAATTAAGGACAGATAACTGCCAG
AGTTTCCCTAGTTTGCCTTTTTATACAGCTTGTGATTGGGGAATCCAGCC
TTCCCAGTTTCCATTCCTTTTATTTTTAATTTTTTTTATTGCTTATTTTA
TTTACATTTCAAATGTTACCCCTTCCCAGTTACCCCTCTGAAAACCCCCT
AGCCACTTTCAAGTCCATGGCATTTATTCTGTGTTTTGCTTGCTGAGAAT
CCCTCTCATGCCCTCAAACAACTTCCAGTACCTATCTTCAAGTGCTCCTC
ATACCCACTTAATCTTGTAAATTCCTCAGTGCCTTTCCCAGGTATAGGTC
TATGTAGATTAAATGAGAGATGGATGAGAAGCCAAGTGACACATGCTTGT
GATTTCCAGATTTTTTACACCGCCCCAAGAGGACAGTAATTTCAAGGCCG
AACTGGACTATATAGCAAGACTCTGTCACTTTAAAAAAAAGAGAGAGAAA
GAAATGGAAGAGAAACAGATAAAAAGTATTTTCAACTTACTTCTAAATAT
TTAAGTTTTCTTAGACTTATATTTTCATAAATTATTCCTAAAATAAATGC
CAACTTTACAGCTAAAACATATGCACTTAGTTGGAGCCAACAGACCATTG
CCATAGATTTTTTTCTGGAAAAAAAAGGAAATTTAATTTTGAAATTAAAT
CATTTATATGGTATCAATGTTCCAAATGCTGACTGGCTGAGTTATAGTAT
CTATAAAGTACTTTCCAGCTCTAAGAGTCCCTGATATTAATGTAGAATAT
GAAATATGGACTTGGCCAAGATAAATTTAAAGTGCCAAAAAATCCAACAA
GGGCCTATGAAAAGGGTCATGGTGTGTGGTCTGTCACTTTGNTGACACAA
TGTGCCAGCAGGGAGCGAGGGACAACCAGCCTCCTTGTTGCACATGGGCA
GTTTTCATTTCCTGCTCCGTTTTCCGAAAAGAGAAGACTCCTTGAGTTAG
CTTCCCCTGAGTCCCGGGGGGAAAATTGCCGCCTTCATGGATGGCATTTC
CTCCAAGAAAAAAGTTTCCTTCTGTTTTGGGACAAAAAAAACCCTTTAAA
ACAAATTTTGTTGGAAAATTTTTTTCCTTTCTTTTTTTTTTTTCCCGGGG
GGGCTGGCCTTATCCCCTTGGAAAGAGGAGGGGATTTTTGGGCCTGTTTT
CAAAGATTCTAAGCGGGTTAAAAAATTTTTTTTTNTAAAACCAACCCAAA
AATATNGTTCCCCCTTCCGTATCTTTCTTT
| NCCGATTCTNNNNNNTTCGCATGGAGGCTGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTCTAGGGAGCCACGAATAC
ACAGAAAAAAAAAAAAACTCCCCTGACAAATTAAAGAAGTTGAAGAAATC
CAGGAAAAAAAATAAACATATAGTTCAAGGTGAGGGTATAACTATTCAAG
ACCTGAAAATGGAAATAGAATCAACAAGAGAAACCAAACCTGAAAGAATT
TTGGAAATGAAAATTTTAGTTATTTGAATGGGAACTGCAGAGGCAGTATT
CACTAAGAGGACAGAAAGGTTGGAAGAAAGATTCTTTATACACACACACG
CACACACAAATGATTAATATACAAATTCCTGACACAGAACATCCAGGAAA
TCTAAGGTGTTTATCATTTGTAGGAGTTCTCTTGTTGAATTTTGGGGGTC
ACATATTATACTAGCATATCATTTGCAATTAGTGAAACCTTGACTTCTTC
TTTGCCAATTTGTATCCCCTTGATCACCTTTTGTTCTCCCATTGCTTCAG
CTAGAACTTCAAGTGCTATACTGAATAGATAGGGAAGAGTGAGCAACCTT
GATTTTAGTGGGATTGCTTCAAGTATCTCTCCATTTAATTTGATATTGGC
TGTTGGTTTGCTGTATACTGCTTTTATTATGTTTAGGTATTGGCCTTGAA
TTCCTGATCTCTCCAATACTTCTAACATGAAGGAGTGTTGTATTTTGTCA
AATGCTTTTCCAGCATATGAGTAGAAGAGTATGCAATTTTTTTTCTTTGA
GATTTTTATATAGTGGATTATGCTAATGGATTTTTGTATGTTGAATGAAC
CTTGTATCCCTGGGATGCAGCCTACATGATAATGGTCGATGATAGTTTTG
ATATGTTCTTGGATTCTGTTTGTGAGAAATTTAATGGAAATTTTAGCATC
CATATTTCTAAATGAAATTGGGCTGAAAATTTGAATTTTAGTCTGAATTT
CCGGTTTTTTTTTAAAAAAAAGGGATTAAACCTGCCCGGGATTGGGTAAA
AAAAAACCCGGTTGGTTATTGGGTTTAAATTTAAAACCAAAAAAAAACCC
GCCCCCCTTCAAAAATTTATTTTTTCTAGAAACACCAAAATTCCCTCTGT
AGAAAAAAAAACCTTTTTAAATGGGGGAGGCCACAGGGCACCTGTTGTTA
AAAAAAAAAAAAAAACAAATTTTTTTTCTTTTAGACTTCTGTCCGGGGAA
AGGGACCCCTTATAACCACATCTGTATTTTAATAAAAAAATAATAAC
|
quality values | Open.Hide. 0 3 7 7 6 9 9 9 3 0 0 0 0 0 3 6 6 6 15 15 9 9 9 8 10 8 8 8 6 6 8 13 15 9 8 8 10 10 8 8 21 21 28 28 28 28 26 30 37 37
37 37 37 37 37 32 28 25 22 10 10 10 26 26 44 44 44 44 39 59 59 22 19 10 8 6 6 9 9 9 10 12 13 17 18 21 25 30 33 41 47 36 50 50 50 50 50 50 50 50
50 50 36 36 36 35 31 31 31 30 28 25 30 21 21 10 10 16 16 19 15 10 15 6 6 8 8 19 28 33 33 33 33 33 36 53 57 57 57 57 59 57 57 57 53 53 53 57 57 53
53 53 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 43 37 26 28 22 36 36 47 57 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 68 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 34 25 12 10 9 9 9 9 9 12 15 27 23 41 48 50 53 53 53 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 53 53 53 53 53 57 59 59 59 59 59 59 59 53
53 50 50 50 50 41 28 10 9 9 8 8 8 11 10 10 10 11 11 8 6 6 6 6 6 11 11 11 12 23 30 41 50 50 50 50 59 59 59 59 59 59 48 41 32 28 20 12 11 13
11 15 13 13 11 15 24 25 35 39 47 39 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 52 52 52 57 57 59 59 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 59 59 48 48
48 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 54 59 59 68 68 68 68 59 59 59 54 54 59 59 54 54 54 59 43 48 48 43 43 43 43 48 57 42 42 35 39 39 43 43 57 48
48 48 57 57 37 37 30 37 37 41 59 59 59 47 43 39 36 36 44 59 59 59 59 50 50 50 50 50 47 47 47 44 44 44 37 37 39 39 39 44 44 37 37 39 39 39 41 41 41 46
48 48 47 59 59 59 47 39 39 39 37 39 39 59 47 47 59 59 59 59 41 41 35 34 34 37 43 44 44 47 47 44 44 41 37 37 43 34 34 28 28 24 31 34 39 39 39 40 41 41
59 59 47 41 39 35 35 39 39 44 44 36 41 41 41 41 41 41 41 41 41 39 31 18 24 13 19 19 34 34 39 39 37 37 37 37 41 37 32 32 37 37 37 39 39 39 39 39 41 41
41 37 37 41 41 39 39 36 36 39 39 29 20 20 20 20 19 21 24 23 16 17 14 17 18 27 32 37 37 32 43 37 37 32 14 9 9 9 9 19 22 37 35 25 22 18 20 23 31 22
27 25 26 20 22 30 37 25 19 18 21 19 14 22 22 31 30 37 32 23 21 11 11 11 12 12 8 8 9 11 10 19 22 26 15 15 15 23 17 15 3 0 3 13 13 10 10 10 14 18
30 23 13 8 8 8 8 8 8 15 12 19 18 12 12 10 10 10 14 11 9 8 8 8 9 8 9 12 12 10 9 9 9 8 9 9 10 8 8 10 10 11 11 12 8 8 8 8 8 8
10 8 15 13 12 14 12 12 12 11 10 10 10 8 8 8 8 8 8 11 12 11 10 10 9 6 8 9 8 10 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 7 7 9 9 9 9 9 8 10 8
8 8 8 9 8 8 8 12 10 10 8 8 8 8 8 9 13 16 26 26 12 12 9 10 13 11 10 10 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 6 6 6 6 6 6 10 10 10 13 12 10
10 10 12 12 12 12 14 14 14 17 13 9 9 9 9 9 10 11 11 10 10 8 8 8 8 10 8 9 10 9 8 6 6 6 6 10 21 26 19 15 11 10 10 10 9 10 11 8 10 8
9 9 10 9 9 9 13 13 10 9 8 8 8 8 8 8 8 14 15 14 16 19 15 17 6 6 6 6 7 6 9 9 10 17 11 11 8 8 9 19 13 8 8 8 10 8 8 7 9 9
9 7 6 8 6 6 6 6 12 10 10 8 8 8 8 15 9 10 10 10 11 12 11 10 10 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 7 7 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8
8 8 8 8 9 10 8 12 11 11 11 8 8 6 6 6 8 10 8 8 8 10 23 21 11 8 10 8 8 11 19 10 10 3 0 3 6 8 8 10 11 12 8 15 10 17 17 19 21 17
8 8 8 8 3 0 3 11 11 9 10 10 10 8 7 6 6 6 8 10 10 11 13 10 14 9 9 9 9 9 | Open.Hide. 0 3 7 7 9 8 8 7 3 0 0 0 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 7 10 9 12 13 8 7 9 8 9 9 15 16 15 15 8 10 8 19
15 10 10 19 24 35 35 35 37 37 37 35 30 35 36 36 36 36 33 33 39 37 47 41 30 27 9 9 9 9 8 8 8 8 8 13 12 14 15 13 25 34 33 33 36 36 36 36 53 53
57 53 53 53 53 53 53 59 59 59 59 59 59 59 59 42 41 27 27 12 12 10 11 10 13 10 19 22 34 31 29 29 35 36 50 59 57 57 57 57 57 57 59 48 48 48 59 59 59 59
57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 48 47 43 43 50 50 50 50 50 48 48 48 47 47 47 47 47 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 42 43 37 37 28 32 32 42
42 57 47 47 57 57 57 57 43 44 43 59 59 68 59 59 57 57 57 57 57 54 59 59 59 57 57 57 59 57 57 57 57 57 59 59 59 57 59 52 57 57 59 59 52 52 52 59 59 59
59 59 52 52 52 59 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 43 43 43 43 57 57 57 43 59 38 39 39 59 59 59 59 57 52 52 57 57
57 54 54 57 57 52 52 52 59 59 59 59 54 54 54 57 57 57 59 54 54 54 59 59 48 48 48 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 57 68 68 68 68 57 59 59 43 43 47 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 54 54 54 59 59 54 48 43 43 43 54 54 54 54 54 57 48 48 57 59 59 57 48 48 42 47 47
57 57 57 59 59 59 39 39 39 59 43 47 47 32 23 15 12 12 12 19 19 30 30 41 41 43 48 48 48 57 57 57 57 48 57 48 48 48 59 59 59 59 59 48 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 47 39 39 41 59 59 48 47 42 32 31 31 20 20 20 20 32 44 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59
59 59 59 57 59 59 59 54 57 57 59 43 43 52 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 54 59 54 57 57 57 59 59 59 57 57 52 59 59 59 57 59 59
52 57 52 52 52 57 57 57 59 57 57 57 52 52 52 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 59 59 59 59 59 57 45 45 45 52 52 52 57 57 57 59 59 57 57 57 57
57 57 57 68 57 59 57 43 43 37 35 35 43 57 52 52 59 59 59 59 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 57 57 57 59 54
54 54 57 57 59 59 59 57 59 59 59 59 57 57 43 47 47 57 57 54 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 54 59 59 59 57 57 48 43 43 44 44 48 48 48 48 57 59 57 57 57
57 57 57 54 54 54 54 48 48 48 48 43 47 59 59 48 48 48 43 24 24 11 11 19 23 37 48 48 43 48 40 40 39 39 36 36 35 36 36 41 43 19 17 8 8 8 19 21 47 59
59 46 47 48 59 59 57 57 57 57 48 48 48 43 43 40 43 39 39 39 39 39 35 25 25 18 18 23 28 28 47 34 43 41 41 41 41 36 30 21 23 25 28 24 33 35 47 25 25 12
12 12 24 28 41 59 47 40 39 34 34 32 25 25 22 30 28 37 37 47 47 47 47 47 47 36 35 31 31 35 31 31 39 39 39 30 30 31 39 35 31 14 15 9 9 9 15 12 23 22
22 24 34 25 28 28 37 32 37 31 35 31 31 31 28 28 19 22 16 21 18 17 23 24 20 20 26 29 13 14 14 24 20 16 15 19 16 20 11 11 11 11 11 11 16 13 33 34 27 27
12 12 12 12 10 10 10 15 12 24 23 23 22 19 19 13 13 10 10 10 18 10 11 11 12 9 10 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 10 16 10 9 9 11 15 10 11
10 10 8 8 11 9 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 12 12 11 13 10 10 10 10 10 15 14 10 9 9 12 10 11 11 12 13 11 11 10 8 8 8 8 8 8 12 13 9 7 6
6 6 8 12 10 10 9 14 8 8 8 8 8 10 11 15 8 8 9 10 9 7 6 7 7 12 12 13 15 9 10 10 10 8 10 8 6 6 6 8 9 9 9 9 6 6 6 6 8 10
14 14 15 12 12 10 10 10 8 8 8 9 9 9 8 6 6 8 8 8 8 12 11 11 11 11 8 8 8 8 6 8 8 10 8 11 11 9 9 10 9 9 9 9 15 23 15 15 13 13
8 10 9 9 11 9 8 8 8 8 8 8 10 18 19 10 8 8 6 6 6 6 11 11 10 10 8 8 6 6 7 6 8 8 8 8 10 14 8 6 8 6 6 7 6 6 6 6 8 8
8 8 10 12 19 17 17 19 17 17 14 12 12 11 10 12 8 6 6 6 8 6 9 19 17 19 12 12 10 12 10 8 8 8 8 8 11 14 12 12 15 11 12 12 11 13 11 11 11 11
11 17 19 39 39 23 23 15 8 8 8 21 14 22 12 16 8 8 8 9 9 10 32 30 12 13 6 6 6 7 10 10 8 6 6 8 6 6 6 8 6 7 7 15 19 15 6 6 6 10
6 6 6 7 7 12 8 7 8 8 8 8 10 10 11 7 7 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 12 12 11 12 9 9 9 13 23 23 11 8 8 6 6 6 6 6 8 6 |