BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-313C02.T7 (MSMg01no313_c02.b1) | MSMg01-313C02.TJ (MSMg01no313_c02.g1) |
ACC | AG435147 | AG435148 |
length | 1,258 | 1,244 |
length of high quality (start - end) | 722 (129 - 850) | 356 (501 - 856) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_c02.b1 PHD_FILE: MSMg01no313_c02.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:54:28 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_c02.g1 PHD_FILE: MSMg01no313_c02.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:54:29 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CCCGTTTTNNNNNNNNGTCTGTGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGG
ATCCGCGGAATTCTTTGTTCAGTTCTGACCCTTATTTTTTAATGGGGTTA
TTTGATTTTCTGAAGTCCACTTTCATGAGTTCTTTATATATGTTGGATAT
TAGTCCCCTATCTGATTTAGGATAGGTAAAGATCCTTTCCTTTTCTGTTG
GTGGTCTTTTTGTCTTATTGACGGTGTCTTTTGCCTTGCAGAAACTTTGG
AGTTTCATTAGGTCCCATTTGTCAATTCTCGATCTTACAGCACAAGCCAT
TGCTGTTCTGTTCAGGAATTTTTCCCCTGTGCCCATATCTTCAAGGCTTT
TCCCCACTTTCTCCTCTATAAGTTTCAGTGTCTCTGGTTTTATGTGAAGT
TCCTTGATTCACTTAGATTTGACCTTAGTACAAGGAGATAAGTATGGATC
GATTCGCATTCTTCTACACGATAACAACCAGTTGTGCCAGCACCAATTGT
TGAAACTGCTGTCTTTCTTCCACTGGATGGTTTTAGCTCCCTTGTTGAAG
ATCAAGTGACCATAGGTGTGTGGGTTCATTTCTGGGTCTTCAATTCTATT
CCATTGGTCTACTTGTCTGTCTCTATACCAGTACCATGCAGTTTTTATCA
CAATTGCTCTGTAGTAAAGCTTTAGGTCTGGCATGGTGATTCCGCCAGAA
GTTCTTTTATCCTTGAGAAGACTTTTTGCTATCCTAGGTTTTTTGTTATT
CCAGACAAATTTGCAAATTGCTCCTTCCAATTCGTTGAAGAATTGAGTTG
GAATTTTGATGGGGATTGCATTGAATCTGTAGATTGCTTTTGGCAAGATA
GCCATTTTTACCATGTTGATCCTGCCAATCCATGAGCATGGGAGATCTTT
CCATCTTCTGAGATCTTCCTTAATTTCTTTCTTCAGAGATTTGAAGNTTT
TATCATACAGATCTTTCATTTCCTTAGTTAGAGCCCCGCCCAGAAATTTT
ATATTATTTGGGGCTATTTGAAAAGGGGGTTGTTTCCCCAATTTCCTTTC
TCCCCCGGTTTATTTTTGTTAAAAAGAAAGGCCCTGGATTGTTTGGAATT
ATTTTATATCCCCCTCTTTTCCCCAACCGTTTTTTCAGGTTTGAAAAATT
CCCCGCAAATTTTATGGGCCCTATTTATTTACCTACATTCTTTCGAGAAA
GAAATGTTGTTCTCCCTTTCTCTTTTAATCCCCCCCTCTCTTTTTGGTGG
AAAGACGC
| NNNCCTTTGAGGCGAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCAAATACTGTGGTAGACCATTGCCTAGCT
ATTGTGCACTCTAATTATGGTGGCCTATTCTAGATAGAATTCTATCTTAT
AAAGATAAGATGCCATTCATGAGGTCAAGGACTCTGTTCATCTGGGTTTT
CTAAGGATGACCACTAAAATCATGACTTCAGTGTCAGAAAGAGATCAGCC
AAGTGTCTGATATAAAATGAACCCTGGAGGGTCTCTTTGGCTCTCAAGTT
TATGAATTTAACAAAACAATTATCCTAGAAAAAGTATCTAAGTCCTTACA
CAAATCCATCATGAGGCTAAGGGTATAGCTTGGGAAGAGAGCATTTGCCT
AGCATGAGCGAGTTTCTCGGTTCCATTTCCAGTATTGAACAACCTAATAT
TTTTTTTTTGCCCCCCATGGNCTCAATAGACCCAGATAAAAAAAGGAGTT
GGCAAATAAAAAGAAAATTAACCAGCAAAACAAAATGAGGTCGAACCACT
CATTAATTACCTAATATGTGATTCCTGCTTTATTGGAATTGTAGATATTT
TTGTTGTAGTAAGATGTGGGCAAATACAGAATCAATGTTGAGTGACACGT
CTGCTTCTCCTCTTTCTCCTAACAAAATAATTCTGTGTTTACTGGTCAAA
TACACACCTGGGGAGCATTCCAGGAACACTTCGGGGTAACTCCAGACAGT
GACCTGTATACCACTGTCACTTTATCCTCACCCTTGGCCTGAGCACAACT
TCAGGTCTCCCCTCAACGTTGGTTTCAGATGTCTGACATACCATGTTCAG
AACTTCATATCTAATAAAAGTATGCAGTCTAATGTAGAGAGGCTTTTAAA
CTTGCAAACTGCTTGATATCCAAAGACCATAATGGAGACTTGCTCAAAAT
AGGACTTATGTTGAAATCTTTTGAATAGGCCATGCCTAAAAGCTTCTGCA
GTGACTAGAATTTTTTAGGTTTGGATTGGCCAAGTGGGCACCCATTACCC
TTGGCCTTTATCAAGACCTTAAAAGGGGTTACGGCACTTGAAAACCGGTT
TCTTTGAATTTTGACATTTTAAAAATTATTAGGGCTATTTTTCTCCGGGG
GGACCGGGCTGTGTAAAAAACAATTATGGGAGGGGATTCTCTCCCCCCTT
GTTCTCAGGATAAAAACTACCCCTCCCTTTGTAAGAGATTTTCG
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 6 8 12 3 0 0 0 0 0 0 0 0 3 9 9 7 6 6 8 8 9 10 8 8 8 8 8 8 8 12 12 9 8 8 8 12 8 22 22 42 37 32 33 33 36 36
42 48 48 42 42 42 47 47 50 43 43 53 50 36 35 35 35 35 35 31 31 31 31 37 37 28 34 23 14 14 12 12 10 10 10 13 23 17 23 16 10 12 16 32 44 47 38 42 42 42
53 53 57 57 57 57 53 36 36 36 36 31 33 33 33 28 28 13 13 9 11 12 17 10 10 10 14 10 20 23 29 29 33 32 28 28 28 29 42 42 43 47 57 57 57 53 53 53 53 53
51 51 51 51 57 54 47 42 42 42 47 47 57 57 57 47 47 47 47 47 47 53 53 53 53 53 53 53 53 53 59 59 50 50 50 46 34 25 17 8 8 8 8 12 19 28 36 36 39 39
48 48 48 48 48 48 48 48 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 62 62 62 29 29 11 11 11 13 18 29 34 39 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 62 62 62 62 41 41 43 43 43 39 35 26 29 26 43 44 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 43 43 43 41
39 43 43 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 59 59 68 68 68 57 68 68 57
57 57 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 59
59 57 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57
59 59 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 53 48 48 48 48 46 46 46 43 44 44 44 41 41 37 37 37 37 37 37 46 43 43 43 48 47 47 50
47 47 48 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 43 43 43 43 43 43 43 48 57 57 53 53 53 50 50 50 59 59 59 59 41 37 37 37 32 30 30 44 44 44 59 44 37 37 41 41 41
59 41 41 34 34 28 24 24 34 34 44 59 59 41 37 37 43 37 41 43 59 43 41 40 39 37 37 32 31 31 40 40 32 30 28 28 30 32 30 25 15 18 21 31 31 41 39 39 39 36
29 29 29 37 31 32 44 44 44 43 41 37 43 39 35 32 32 37 37 41 34 36 43 37 37 41 43 47 30 31 32 34 28 30 30 39 43 44 44 39 37 31 31 30 28 22 27 25 24 20
21 22 23 27 28 23 21 19 10 15 10 11 11 25 25 27 27 18 18 23 28 25 18 11 11 11 11 16 16 15 12 18 22 31 19 19 15 19 18 22 20 18 13 17 11 18 19 16 12 12
13 11 14 18 32 20 24 20 15 15 12 12 10 10 10 9 14 12 28 25 25 18 18 18 25 27 41 24 24 20 22 13 12 11 11 12 10 9 8 8 8 15 11 12 10 3 0 3 17 19
10 10 13 19 19 16 16 11 18 11 11 12 11 10 12 9 8 8 8 8 8 11 11 10 9 9 9 8 10 8 8 8 8 8 10 12 10 8 6 7 6 6 8 6 8 9 13 23 14 9
9 9 9 9 11 17 17 11 11 11 9 9 9 9 9 9 6 6 6 7 10 12 23 32 15 11 9 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 10 14 14 15 13 9 6 8 6 6 6 8 6
6 8 10 10 11 10 10 11 12 12 8 10 8 8 13 10 9 10 11 10 9 11 11 9 8 8 9 9 9 10 10 10 8 6 6 6 6 9 9 13 13 13 13 9 9 9 9 11 8 7
6 6 13 19 8 6 6 6 8 8 11 17 13 8 8 8 8 10 8 9 12 8 8 8 10 10 10 9 9 9 10 14 19 13 14 11 8 8 8 8 8 6 8 8 10 8 9 9 9 12
11 11 11 8 6 6 6 8 8 16 15 11 6 6 6 10 10 11 11 10 14 12 12 12 19 15 15 12 12 11 13 8 8 6 6 8 8 9 13 13 11 13 11 8 8 6 6 6 8 10
10 8 8 10 9 9 9 11 10 10 13 16 14 9 9 12 11 11 10 9 9 12 12 10 12 10 10 10 10 15 16 17 22 16 16 8 10 8 8 8 10 15 15 12 8 8 7 8 8 8
8 9 8 8 8 9 9 9 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 8 7 7 7 9 6 6 8 8 9 15 6 6 6 7 10 15 14 10 9 9 9 16 9 19 19 22 19 11 12 14 28 27 30 25 28 28 25 22 12 10 10 24
21 36 36 43 50 53 53 53 53 48 48 48 48 47 48 48 42 42 42 42 42 37 37 41 42 48 50 50 50 48 50 50 50 50 50 47 42 43 42 42 42 48 42 48 43 43 36 42 34 42
43 43 43 50 47 47 43 34 34 28 28 30 28 35 33 41 37 37 37 30 24 12 18 11 11 11 23 25 33 33 33 33 33 41 50 50 57 57 59 57 53 50 50 50 53 47 47 47 48 57
57 57 57 68 68 54 54 54 54 54 59 59 57 57 57 48 51 48 48 48 50 50 54 54 68 68 57 48 44 41 41 43 43 42 44 57 57 57 47 54 54 57 57 57 59 59 59 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 59 57 59 59 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 44 44 44 44 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 52 52 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 54 48 59 57 59 57 57 57 57 68 57 57 68 68 68 44 34 34 15 14 12 18
12 12 18 24 32 44 46 54 54 54 54 68 54 57 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 59 59 59 59 48 48 59 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 47 59 59 27 27 11 15 11
10 12 14 12 11 10 14 12 14 14 15 17 19 15 15 12 19 18 27 3 0 3 27 27 34 32 18 10 8 8 8 8 8 11 15 11 12 12 17 21 34 24 13 8 8 8 8 8 10 12
11 25 25 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 48 48 48 48 59 59 59 59 54 54 54 59 59 57 57 57 57 57 57 48 48 48 48 54 54 54 54 57 54
54 54 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 57 59 59 68 59 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 54 54 54 59 59 68 68 68
68 68 68 68 68 59 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 54 59 57 57 57 57 54 54 57 59 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57
48 59 59 59 59 59 57 57 57 48 48 48 59 59 59 47 47 47 59 41 37 41 44 44 47 59 59 50 50 44 44 43 43 43 47 47 47 59 59 59 59 41 39 31 36 39 41 47 47 59
59 59 47 47 32 32 30 39 39 39 43 47 39 39 39 37 39 59 59 47 41 41 41 41 36 36 41 41 41 43 39 35 35 35 43 43 48 59 47 46 43 43 43 43 43 40 39 39 39 37
37 39 31 29 32 30 37 33 37 39 41 48 48 47 47 39 39 33 33 36 37 37 41 41 47 47 36 34 28 28 24 32 34 41 39 31 31 31 29 30 32 28 30 33 37 39 41 39 39 31
31 32 32 28 30 28 23 31 17 21 19 13 13 16 12 18 28 29 28 28 31 41 28 28 17 15 12 21 16 28 22 29 24 30 34 28 28 28 33 30 27 26 30 25 25 22 20 25 22 30
25 34 34 20 20 12 12 12 24 21 25 23 30 17 12 12 15 12 17 19 35 30 37 34 34 30 28 24 19 17 12 12 14 13 13 12 15 11 22 22 24 14 13 13 12 16 17 17 10 9
12 13 18 19 18 18 18 16 17 13 11 11 13 15 13 8 8 8 8 10 9 10 12 9 11 11 10 8 8 8 8 8 16 11 13 10 9 9 8 8 8 8 19 13 15 15 20 30 22 28
25 26 11 12 13 8 9 10 13 16 21 25 28 15 11 9 10 10 9 9 11 11 21 14 11 10 9 11 9 9 11 10 17 17 20 16 16 12 11 8 8 6 6 6 10 10 10 13 15 12
12 12 10 11 11 9 9 9 8 8 8 13 13 16 14 14 11 14 12 9 12 8 8 9 14 12 11 10 10 11 12 12 12 9 9 9 8 8 8 8 6 7 8 8 6 8 7 9 9 10
8 8 9 9 9 10 15 15 11 11 11 10 8 10 10 8 8 6 6 6 6 6 6 13 13 19 18 11 11 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 8 9 9 10 11 15 14
10 9 9 9 9 10 10 11 12 16 11 9 8 8 8 8 10 17 17 10 9 9 9 9 8 6 6 6 6 8 10 9 9 8 8 12 9 9 12 8 8 8 8 8 8 10 12 17 16 9
6 9 6 8 8 8 6 6 6 8 8 6 6 8 6 10 18 18 13 6 6 7 8 8 8 8 8 8 10 9 11 10 15 8 8 8 8 8 6 6 6 6 10 7 14 20 15 10 8 8
8 8 12 10 9 9 9 9 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 9 11 10 10 8 8 10 10 11 10 8 8 8 8 8 8 9 10 11 14 11 9 9 |