BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-405N20.T7 (MSMg01no405_n20.b1) | MSMg01-405N20.TJ (MSMg01no405_n20.g1) |
ACC | AG504195 | AG504196 |
length | 815 | 792 |
length of high quality (start - end) | 277 (47 - 323) | 505 (77 - 581) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no405_n20.b1 PHD_FILE: MSMg01no405_n20.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:20:59 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no405_n20.g1 PHD_FILE: MSMg01no405_n20.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:20:59 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CTCTATTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTCAGAGGATCCGC
GGAATTCTGTACTTTTTCCGCTAATATCCTCTTATTACAGTTCATTTTAC
TTTGAGATTTTATTTGTATAAAAATTGATAAAATGTTGAATAGATTCACA
AAAAGAAATCTTAGTAATTTACTGTTTATTTACTATGCCATGGACGTTTT
AATTATTATCATAGAGTATAAAATAAAATGTGAATGTGAGAAAGAAATTT
AGAGAACGAATTGGAAGGTGAGGATGGAAGGTGTCAAAATTTGGGTTTTG
TTGTTATGAAGAGACACTATGACCACTTTTATTCCTATAAAGCAAAAAAC
TTTGCTGGGGCTGACTTACAGTTTCAGAGGTTAATTTCATTATTGTCTTG
CCAAGAAGTATGGTAGTTTTCAGGAAGATCTTTTGTTAGAGCCGGAGATG
AAGCCAAGAGCTCCTAATCTTCATCCACAGGCAGCAAAAAGAGGCTGTCT
ACACACTGGTCAGACATGAGCATATATGATCTCTAAACCTGCCTCTAGTG
ACAGCCTTCCTTGATTGATCACCATATATAGCTTGTCCCTATAATTGGGG
TTTTCTGATCAGCCTGCCCGTTAAGCTTGTGTCTTGGGAAATTTATTCTC
CGCTTCCTTTTTTTCTTGCCCAGTTCTTTTCTCAATAGAAAAAATCCCCT
CCTTTTTTTCTTTTCCTCCCCTCCCCTCTGTAACTTTATATCCCCCTCGC
AACCCCTTTTCTACTCTCTTATATATACATCTTCTCTCTCCCCTCTCCTT
TCTTTGTCTATACCN
| CCGATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTGAATGCTTTTCCACCCCCTCTC
TTTTTTTTTTTAACTCCAACTTATCTCAGGAGTTTATATTTAAAAGCTAT
TTGCTGTCAGAATATCCACTCTTCTCCTACAATCTGGGGTAACTTGTATT
CCTGGCTAATTCTGTATTAACTATGCTTATCTGAATTTCTAGTTGGTCTT
TTGCCATCTCTGAAAACATTGAATTTAAGTAACAGAACAATCATGCTAGG
CATGAAGAACTTGCTGCATGGTAAAATGGGTAGGAAATTATATGTATCGA
TTCAGATAATATACACCTTTTGAGAATTAGCTGTGCAATCTTAATGTCAG
AACAAAATAGCTTTCTGGATTTAAGTTACTGTACCTATGTTTCTTTCAGA
TAATCTATAAAGGCAAAATGAGTAGTGGTTTATAAATGGAGAAATGCTTG
ATTTAAGCATGGTGATATTGAAAAGAAATTTCAATTTTTCACTTTGAAAT
TAAATCTATGAAGGTGATTACTTGACTTATGTTTTGAAAAGTTTTTTGTT
GATTTTTTCTAATATTGGATATGCTTTTTTAACCTTTCCCTTATAAATAA
CAGGATTATAATGTTTTTCTCATAAAAGGACCTTTTATCTTTTGCCATCG
TTATAACGGGAATAAACCGAATAAGTTTGTATTCTCTCACCCCCCAACTA
ATATTCCCTCTTTAAAAGCCTTTATAAAAATTCCTCTTTTTC
|
quality values | Open.Hide. 8 10 8 8 8 8 10 12 15 8 8 6 6 10 12 9 14 25 34 33 30 33 28 25 18 32 32 33 33 33 33 33 21 19 10 14 12 15 11 9 9 9 10 10 10 10 10 19 23 41
47 30 30 28 28 28 31 41 50 42 41 27 25 12 12 14 12 10 9 9 18 22 39 39 37 37 41 41 47 50 57 53 53 57 57 53 53 50 50 50 50 50 50 50 50 53 59 68 68 68
68 68 57 59 53 54 54 54 54 68 68 68 68 68 57 50 50 50 57 57 54 47 47 48 41 41 41 47 47 57 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 47 47 47 50 50 47 57 57 57
57 57 57 68 59 50 42 46 46 46 48 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 57 57 57 57 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 52 52 52 52 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 54 54 59 59 59 59 57 57 57 68 57 57
57 57 44 44 32 44 43 43 43 44 37 44 44 54 48 57 57 54 54 54 57 57 57 57 50 50 54 54 54 54 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 54 54 59 59 59 59
59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 50 50 50 48 59 43 34 30 19 15 8 8 8 8 8 8 10 10 12 27 27 59 59 59 59 59 59 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 48 54 54 54 57 59 59 59 59 59 54 48 48 48 48 47 57 47 48 48 46 48 54 57 57 57 57 68 57 57 54 54 54 57 57 57 57 48 48 39 59 39 30
30 37 37 54 57 57 48 43 43 43 48 48 57 48 48 48 48 43 43 40 37 28 30 37 43 27 27 14 24 24 37 37 41 30 28 18 23 18 34 31 28 21 20 19 19 23 16 15 16 16
16 25 22 26 26 32 34 34 28 28 24 27 16 18 17 16 16 27 36 32 32 31 36 32 41 23 25 24 33 28 28 28 23 21 11 10 10 12 18 12 26 15 18 18 27 26 28 19 19 10
9 9 9 9 15 17 10 10 10 10 10 11 11 12 15 15 12 21 11 18 11 15 15 22 19 30 30 37 37 33 23 21 13 14 14 16 18 17 18 12 12 10 10 10 12 13 8 8 8 9
12 16 19 15 10 9 12 10 11 8 10 8 8 8 9 10 10 10 10 10 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 19 8 6 6 8 11 10 9 8 8 8 8 6 6 8 6 8
8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 11 10 13 10 10 9 9 9 8 8 10 10 8 10 10 10 10 11 8 8 8 8 10 6 8 8 8 6 6 8 10 10 8
8 9 10 10 10 10 8 9 13 12 13 15 13 8 8 10 15 8 8 9 12 11 10 10 10 10 10 13 14 10 11 10 10 10 9 11 10 9 9 9 9 10 8 8 8 8 10 10 8 8
8 8 10 17 13 14 13 24 13 13 13 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 11 8 8 8 8 6 8 10 12 10 9 8 8 8 8 6 6 8 8 9 9 10 12 8 6 6 6
8 8 8 9 9 10 11 16 18 11 8 8 10 8 8 8 8 8 8 6 8 8 6 6 6 6 8 10 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 12 17 20 10 17 9 9 11 12 11 10 10
9 9 9 9 10 9 9 8 10 7 6 8 8 3 0 | Open.Hide. 6 6 6 6 10 10 10 9 8 8 9 9 9 16 16 27 29 32 28 32 37 37 33 32 32 28 28 37 37 39 28 19 10 6 8 8 8 8 21 10 16 16 28 23 41 43 48 48 44 44
47 39 37 44 39 50 42 41 39 39 30 16 15 21 20 25 22 21 21 30 23 29 30 30 36 35 57 57 38 42 37 37 47 47 57 57 57 47 50 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 54 57 50 50 47 47 47 50 57 68 68 68 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57
57 57 59 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 51 68 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
68 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68
62 62 62 62 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 43 43 43 52 57 57 57 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 44 48 48 59 59 68 68 59 68 59 59 59 59 59 59 57 57 57
57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 59 59 59 59 47 47 47 59 57 57 57 57 54 54 54 59 59 59 57 43 43 33 33 30
37 37 48 48 48 57 57 57 57 57 57 43 43 39 37 43 43 47 59 39 39 35 37 37 36 32 28 31 39 39 39 39 41 41 41 59 41 32 32 35 36 36 41 34 34 28 28 28 34 36
41 43 43 39 31 28 37 30 32 28 31 22 28 23 32 28 30 37 37 41 41 34 34 22 19 15 19 15 15 14 25 24 25 29 37 37 43 31 31 28 25 25 21 31 39 39 37 37 41 39
39 39 37 31 37 30 30 30 37 34 32 11 10 9 9 9 13 15 25 27 30 30 32 37 30 19 19 18 15 19 10 15 21 18 20 24 32 24 19 12 11 11 11 18 27 19 15 6 6 6
6 11 13 15 19 26 25 16 11 10 10 9 9 9 11 12 9 9 9 9 12 10 8 8 8 9 13 16 29 10 9 8 10 8 9 11 12 13 11 11 11 10 9 8 8 10 8 10 10 21
15 10 10 9 10 12 12 8 10 6 7 8 9 12 14 15 15 10 10 8 8 8 6 6 8 7 7 9 9 6 6 8 6 6 7 8 8 8 8 8 8 8 13 10 10 10 8 8 8 8
8 8 8 8 8 6 6 6 6 10 11 11 11 11 8 8 8 8 10 10 6 6 6 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 6 8 8 8 10 17 14 13 11 11 8 10 8 8 8 8
8 8 8 8 11 13 10 8 8 8 8 15 12 12 10 8 8 8 8 8 9 12 8 6 6 8 7 8 8 12 11 8 8 8 12 8 8 8 8 16 16 12 |