BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-421M07.T7 (MSMg01no421_m07.b1) | MSMg01-421M07.TJ (MSMg01no421_m07.g1) |
ACC | AG516317 | AG516318 |
length | 782 | 776 |
length of high quality (start - end) | 249 (73 - 321) | 522 (76 - 597) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no421_m07.b1 PHD_FILE: MSMg01no421_m07.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:42:04 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no421_m07.g1 PHD_FILE: MSMg01no421_m07.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:42:04 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | plural | no hit data |
---|
sequence | TAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTCAGAGAATCCGCGGAA
TTCAAAAACACTTTCCGCAATCTTCTCTGGTAAGGTTCAGACCTACAGCT
TAAGAACCACAGATCTTCTAAACTACTGTATGTACCAAGGGGACTTCTGA
TCTGCCCATTCTGAACCAGGGATCCTCAGATCATCCCCAATAGCCTAAGT
GAACTTCAACTTAACTGTTTAGAACCAATGTGCTGGGGTTGGAGAGATGG
CTCTTCAGTTATAAACACTGACTGCTCTACCACAGGTCCTGAGTTCAATT
CTCAGTAACCACGTGTTGTCTCATAATCATCTGTCATGGGACCCGATGCC
ACCTTATGGTGTGTCTGAAGACAATATCAGTATACCCACACACATGAAAA
ATAACCGATGTGACTCACAACTTCCACCAATAACTCAAGGGGGTTTCAGA
TGCAACCCCTGAAATCAAATATGTTAGAAACTCCCCAGTATTGAAGGCAG
CATTAACTTATTGAGAACCTGATATCCCATAAATTCCTTATTTCCCCCCA
GAATTACCTCTTATGATCTATGTTGTCTTTTACGGTCCTCCATTATCTGT
ATATGCCCTGTATCCCTTTGACTTGTTTTTACTAGGTATTTTTTATACTC
CACACAACTTTATCTATTTTTTTTTATATGTGTTCCTTTCACTATCTCCT
TTGCTTTATTTTCTGTCTGCACTCCCCCATGGTGTTTTCTCTCCATTTTT
CTCCTGTTTATCACCCCTTTTTTTATCTCACT
| CAATAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAAGAAGCTAAACTCCAGAAAAACAA
ACACCCTAACGAAAAAATGATCTCTAGAGCTAAACAAAATTCTCAATTTA
GGAATCTCAAAAGCCTGAGAAGCACCTAAAGAAATGTTCAACATCCTTAT
TTATAGTGAAACACAAATCAAAACCACGCTGAGATTCCATCCTAAATCAA
TGAGAATGGTTGAGACCAAAATGTAAGGGGAAAATAGCTGCTAGAGCAAA
TGTCGATAAAAAGAAAACTTTATCTTTTCTTGTGGGATTGAAAAGTGTTT
TCCAGATTCCAAAATCTGGAAAATATTATGGCATTTCTTCACAAAATTGG
AAATAAGTCTATCTGAATATTCATATATACAACTTCTGGGCATATATCCC
AAAAATCTCTACCATACCATAAGTAAACCTTCAGTATTTACAGCACCCTT
AATTATAATAGCGGGGGTTCAGGGACTATGCCGAACTTAGGAAATTAATC
TGAACAGGTGAGAGGGTGCAACACAGAACTGGAGAGCTTCTGGGACAGGC
GGAGCCACAGAACCGCTGAGGCAGCACCCTTTTTCGGGTCGCAAACTGCC
CGGCCACCCTCCCAATCAGATGACACGTATCCTGCCTGGGTTCCGGAAGC
CTTCACACTCAGGAACATCGTGGTGCCACCCTTCGTTCCTGGACCGCCCG
CCCATACTTATTATCCTTCTTCTGCG
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 9 12 30 24 24 21 25 20 22 28 22 20 20 24 24 28 39 37 31 31 31 30 29 21 23 9 9 9 12 10 10 11 9 9 9 9 9 14 17 24 30 32 22 21 19
22 37 37 37 37 37 37 23 23 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 21 26 34 37 28 30 37 50 50 57 59 59 57 53 50 50 50 50 59 59 50 50 48 48 48 50 59
59 59 57 57 57 54 50 50 50 50 50 50 51 68 68 68 68 68 57 57 57 57 48 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 51 50
50 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 50 50 57 57 54 50 48 42 46 46 48 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 54 54 59 59 59 59 57 59 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 47 48 48 48 54 57 57 59 43 43 28 25 28 43 43 48 48 48 57 57 57 57 57 59 59 35 35 28 36 25 28 30 59 59 33 33 33 33 33 28
23 15 10 10 10 10 10 11 22 28 39 39 41 41 47 43 50 50 53 57 57 57 57 48 48 59 57 57 48 48 48 48 48 43 48 57 59 59 57 57 57 48 48 48 57 48 48 48 53 53
53 57 59 59 59 57 57 57 57 50 47 59 59 59 59 59 22 23 16 16 9 7 7 7 7 7 7 9 9 11 23 29 40 47 47 50 41 30 17 17 17 41 41 57 57 57 57 57 59 59
57 57 57 43 43 39 32 28 28 14 14 24 28 33 39 37 37 28 20 20 19 19 17 17 28 31 34 37 43 43 44 57 57 44 59 43 42 36 28 28 25 30 30 30 37 44 44 36 29 28
33 31 30 30 44 37 43 37 34 34 13 13 21 26 43 59 59 59 59 59 59 59 34 33 28 21 18 13 13 13 12 17 15 28 23 29 24 25 25 21 24 13 12 9 14 15 19 20 22 19
19 11 11 11 12 15 24 30 39 33 33 25 28 28 33 23 23 11 11 12 20 15 19 16 17 11 11 12 18 15 23 28 23 20 27 24 28 23 16 13 12 12 15 12 11 11 11 11 11 12
12 12 12 22 18 11 11 10 12 21 24 24 19 16 11 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 6 8 8 10 10 10 17 17 13 9 12 10 12 10 12 10 10 11 18 23 15 13 11 11
12 9 11 11 17 21 28 18 18 21 16 15 10 8 8 8 8 10 11 11 11 9 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 12 10 10 12 10 10 10 10 6 6
8 8 9 14 14 23 12 10 8 8 6 8 8 8 8 8 9 10 10 10 10 11 13 14 10 10 10 8 8 8 8 10 10 12 8 8 8 10 10 19 10 9 8 11 6 7 6 10 10 12
9 6 8 8 8 8 8 8 8 12 12 7 6 8 8 8 9 10 11 10 10 12 13 10 8 8 8 8 8 8 6 9 12 15 10 8 8 8 13 12 14 12 14 12 11 6 7 7 8 10
15 11 12 13 10 12 8 10 8 9 10 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 13 10 11 15 12 13 10 10 9 10 10 10 10 10 13 13 10 10 11 12 15 10 10 18 16 17 19 15 8
8 8 8 8 8 9 10 10 12 10 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 | Open.Hide. 6 6 6 6 8 6 6 8 10 17 32 30 34 31 25 22 30 26 37 37 37 37 37 37 28 31 37 39 37 33 27 15 9 9 6 6 6 8 6 8 9 8 8 8 8 13 11 17 22 30
30 37 37 39 50 50 50 50 42 30 22 11 13 8 8 7 7 7 7 7 15 8 8 12 15 26 27 37 40 41 41 48 50 53 59 57 57 53 53 50 50 50 50 57 57 47 50 48 48 48
50 50 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 47 47 50 50 50 50 50 48 59 43 43 43 44 44 59 59 68 68 68 68 68 68 50 50 50 51 68 68 68 68 68 59 59 59
59 50 50 42 46 50 50 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 43 57 52 57 57 57 57 68 57 57 59 59 59 59 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 68 57
57 57 57 57 57 52 52 54 57 57 68 57 57 54 54 54 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 54 54 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57
57 59 57 57 42 44 40 37 37 39 42 47 48 48 57 57 48 48 48 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 57 68 68 68 57 57 59 54 57 57 59 54 54 54 57 59 54 54 48
59 59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 53 48 48 48 59 59 59 59 23 21 9 9 9 9 10 11 11 22 22 39 39 47 50 50 59 59 37 37 36 36 36 39 44 57
57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 68 68 68 59 59 54 54 48 48 48 48 54 57 57 57 57 54 57 57 57 57 68 59 59 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 59 59 57
57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 57 59 59 59 57 57 57 48 48 57 59 59 59 57 57 48 50 50 46 46 57 57 59 59 59 59 57
47 47 47 47 47 57 57 57 57 47 47 43 43 44 57 57 57 54 48 48 57 59 59 48 48 48 57 54 54 54 57 57 43 43 40 40 46 46 48 54 43 43 37 37 43 59 59 59 59 43
43 43 47 47 48 48 59 59 59 48 43 43 40 40 40 40 39 39 32 37 37 27 23 26 29 32 31 41 41 37 37 35 35 35 37 34 24 22 11 11 13 21 24 37 37 37 36 36 43 39
39 39 39 37 39 35 31 24 30 28 28 28 34 34 23 22 22 22 19 23 28 31 26 28 16 19 12 15 15 16 15 15 15 18 20 34 32 39 37 36 33 28 20 20 14 15 15 13 11 21
16 15 8 8 8 8 8 9 14 15 14 12 12 10 9 9 9 15 10 10 11 12 11 11 11 15 15 28 24 30 25 22 24 19 15 12 16 12 11 9 13 10 8 8 8 9 9 11 8 8
8 8 8 8 8 8 8 10 10 15 13 13 12 12 11 11 11 9 9 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 10 11 13 10 10 10 10 10 10 16 13 13 8 8 8 10 8 14 8 9
9 12 13 10 10 10 12 11 11 11 11 11 10 9 9 9 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 11 12 11 15 15 8 8 6 6 6 7 8 9 7 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8
8 6 7 6 7 6 6 9 9 9 13 10 8 8 9 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 |