BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-440D03.T7 (MSMg01no440_d03.b1) | MSMg01-440D03.TJ (MSMg01no440_d03.g1) |
ACC | AG530369 | AG530370 |
length | 743 | 739 |
length of high quality (start - end) | 559 (53 - 611) | 532 (83 - 614) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no440_d03.b1 PHD_FILE: MSMg01no440_d03.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:06:33 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no440_d03.g1 PHD_FILE: MSMg01no440_d03.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:06:33 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (49,242,411 - 49,242,774) | (49,120,465 - 49,120,682) |
---|
sequence | NNNNNTTTCTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXCGCGGAATTCAACCTATATATAATAGATATGTTGCCAGCATGACTTAG
TGAAAAATTACTATATGCAGACCCTTTCATATTCTAGTTCATCATTCAGC
AAACACGGGACACAGCTGAGCCCACTGTACTGTCCAAACCTCAACTGTGA
TTCTGTCTTCTTTGTATTTTTTCTGATTTTGGCTAGGTCTCATATGGGCC
ATGCTGGTCTTGAACTCAGTATGGAGCAGGACTATGAACTTCTGACTCTC
CTGACTCTACTTCTTTGATTTGATTGTAAGCATTCACCATCATGCCTAGC
CTTTCTCCCTTCCCTTTCCCCTCTCTATTGCCCTCTCTCCCTCCTATCCT
CCCTCTATTGTTTGATTGTTTTTATTTGTTTTTGAACAAGCTCTCACAAT
GGAGCCCAGCCTGGGCTCAAAAATCACAATTCTTTGGCTTCAGCCTCCTG
AGTGTTGAGATTATAGGTCTGCCTTACCATGCTTGACACATATACCTCAG
CTTTATTACCTAGTACGTTTGTACAGAATATTACAAGATTACCAAGAGTG
AAATGAAATTAAAATGTGACAGTTTGTTGACAATTTGCTTCAGTTTTGCT
AGAACCTAAAATATATTGCTTTCAAAAAGACACTCAATTTGATTGGCTCC
ATGAAGCTCTAGTTTCAAATGGCTTCACAGCCCATTGAAAGAA
| NNNNNCCGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTCAGAGATACAGAGAA
TCCAAGGCTGCTAGTCAGTCTTGTGGGCAGTTAGTTTGGTATTAAAAAAC
ATATGATCTGAACAATAGTGAAGGTAATCAAGTTTCAGGGGCATCTGAAA
TAAGATTAGGAGTTGAAATTAATATTGAATTGAAAAAGCTTTAGGCCGGC
CAGTGGTGGCGCTCGCCTTTGATCCCAGCCCTTGGGAGGCAGATGCTGGT
GGATTTCTGATCTGAGTTCCAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCA
GGACAGCCAGGGCTACACAGAGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAG
TAGGATGTTGAAGTCTAAGTAAGGAAAACAAATGAGAAACAGGCAAAGAC
AGCCTGTGGTAATAAGAGTTAAGCCCATCCATTATTCTAATAATCTCCCT
TGGGTCAACGTCATCCTTGGAACATTTATGACCGCTAGAACAATTTTGAA
GAGTTAACATCTCATTCCAAATGAGTAGTGAGCAAGTTCTAGTTTTTATC
TAGCAGAACATAACATTCTTTACAAAGGGGTGTTTTCCCTTTCTTTATTT
AAACTTTCGTTGGTTGTGGTTTTTTTTATTTTTATAACTATAATTTTCCA
TTATATCACCTTTATGCTCATGTCTCTTTTATCTTTCCT
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 0 0 3 6 6 10 11 11 11 9 9 9 10 25 25 44 44 37 32 32 37 21 22 12 12 12 23 30 44 30 28 28 28 25 25 27 16 9 9 9 10 10 13 25 23 24 18
18 18 31 30 57 57 36 36 30 37 37 37 43 50 53 59 59 59 59 47 43 43 37 39 29 31 24 34 43 51 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 51 68 68 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 50 50 51 68
68 68 68 68 68 68 68 50 51 51 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57
57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62
62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 68 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 54 54 48 57 57 57 57 57 57
48 48 48 48 48 48 57 48 57 48 48 48 48 59 59 59 59 59 59 43 41 37 37 39 39 41 39 40 40 40 48 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 48 39 39 30 30
39 59 37 40 39 39 39 38 32 26 34 32 36 36 39 39 40 48 48 33 33 33 37 37 37 41 36 36 41 41 43 34 34 30 25 20 30 21 24 24 30 27 20 20 20 34 34 31 30 30
29 29 37 37 37 24 22 22 22 12 11 11 11 15 19 23 23 23 28 23 22 27 26 24 19 16 15 19 19 16 18 17 17 20 20 31 34 28 15 14 12 11 11 10 9 15 8 8 10 18
23 31 25 25 25 19 22 18 21 16 11 15 15 21 21 22 22 24 24 28 27 30 18 17 17 18 19 11 11 9 10 10 10 10 10 10 10 13 17 21 24 22 18 12 20 17 12 10 13 11
16 13 19 12 12 10 10 10 10 13 10 13 13 18 12 13 15 17 13 11 8 7 7 7 8 8 8 8 9 9 15 12 12 10 6 7 6 6 6 10 12 10 10 | Open.Hide. 0 0 0 0 0 3 7 7 11 12 8 8 8 8 8 7 9 9 9 18 17 31 28 39 29 37 32 33 33 32 32 32 32 37 37 37 25 25 9 9 9 9 9 9 10 10 12 12 27 26
36 33 37 44 44 47 50 47 47 53 48 59 59 40 40 23 27 12 8 8 6 6 6 8 18 23 23 30 30 30 33 33 48 53 53 53 53 53 36 42 37 37 47 40 50 50 50 50 50 53
53 54 54 54 43 51 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 50 50 50 50 50 50 50 50 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62
62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 44 44 43 35 35 39 43 43 43 35 43 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 62 62 62 62 62 62 57 57 57 68 57 57 59 59 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 59 57 57 59 59 59 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 57 57 59 57 43
43 35 35 43 44 57 52 52 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 52 43 57 57 57 57 57 59 47 47 47 50 57 57 57
44 37 44 44 57 48 44 44 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 47 39 44 39 48 39 48 43 48 46 47 47 48 48 57 50 50 48 48 48 54 54 54 54 54 48
43 43 43 43 36 36 43 43 43 43 43 43 37 59 59 57 57 57 57 57 50 50 50 50 47 47 59 59 44 44 44 37 37 39 41 41 43 43 36 31 37 41 59 59 34 41 35 28 28 32
19 17 8 8 8 22 19 32 34 23 28 24 20 17 26 23 29 25 27 23 27 34 34 23 23 22 14 14 18 18 28 37 46 46 40 37 25 25 13 13 13 21 22 32 39 43 43 47 39 28
22 22 22 36 37 32 22 25 28 30 22 11 10 10 10 8 8 8 10 10 13 12 9 9 10 10 15 15 9 9 7 6 8 8 15 16 10 8 8 8 10 6 6 6 10 10 8 8 10 8
10 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 11 11 11 8 8 8 6 6 8 8 10 11 10 10 11 18 17 19 13 13 10 9 11 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 10 10 10 8
8 6 6 8 8 11 11 12 11 9 11 11 10 9 9 10 10 10 9 8 8 10 6 6 8 8 10 8 11 10 11 11 11 10 10 8 8 8 6 |