BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-495F18.T7 (MSMg01no495_f18.b1) | MSMg01-495F18.TJ (MSMg01no495_f18.g1) |
ACC | AG572422 | AG572423 |
length | 779 | 781 |
length of high quality (start - end) | 673 (46 - 718) | 638 (77 - 714) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no495_f18.b1 PHD_FILE: MSMg01no495_f18.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:20:25 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no495_f18.g1 PHD_FILE: MSMg01no495_f18.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:20:25 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | plural | no hit data |
---|
sequence | TCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGG
AATTCAGAAATCTGAAGAGAGCAGAGTGAGAAATTGTTCAGGAGAATGCA
GGTTCTCTCAGAGGGAAACAAAGTGCTATGAATATGTGAGTGCAGCTTTG
CACAGAGGCCATTGTGCCTGTGAGTTCATGTTCCTGCTGAGGACAGATTG
CAATGGAGACAAAAGTGTAGGTGCCTGCTGATGTCTCAAGTTGAGGATTA
ACCTGTTAGTGCAGGTGACTGCAGGGGCCAGGGAAGGGACCTGGGCAAAT
AAGTGCAGGAGCCTTCAGAAGACTAGGTTATGTGGGGACAGTGGGCTATA
CACAGACAAGCTGGTCTCCAGTTGAGTTGAGGTCTGAACTCTAGTAGAAC
CTGATGGGTGGCAATTCCCACCTACATGGGACAGAAGGTGTTCCCTCATG
TCTTCTGGCCCCCTGGCTCCTGTTGAATTTACCACCCCCACATACCCCAC
AAGAGAGGATAGTGGCTAGCAGTCATGTACACAATGTCCCAAGCTTCTGA
CCTTCAGGCTAGACTTCTCCCAGTTACCTAGCAACAACAAGATAACAAGT
CCACTATAAGAGGGGCTGCTTGGCCCACTCCTCACTCTTTTAAGCTTTTA
CTTTCTTTAGTCTCTCTCTAAGCCCTCTCTCTCTAAGCCTTCACTTTTCT
TACTCTCTAACTCTCTTTCTCTCTTTCCTTTCCCCCTTCTCTCCTGNTGG
CCATGGCCAGTCTGTCTCTCTCTCTCTCN
| CCATTGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTGTTTAGCTCTGTACCGCATTT
TTAATGGGGTTATTTGAATTTATGGAGTCTAGCTTCTTAAGCTCTTTGTA
TATATAATACAAATATATATAAATACAAATACTAATATATTGGATATTAG
TCCCCTATCAGATTTAGGGTTGGGAAAAATGCTTTCCCACTCTGTTGGTG
GCCTTTTTGTCTTATTAACAGAGACACTGAAATTTATAGAGGAGTAAGTG
GGGAAAAGCCTCGAAGATATGGGCACAGGGGAAAAATTCCTGAACAGAAC
AGCAATGGCTTGTGCTGTAAAATCAAGAATTGACAAATGGGACCTCATAA
AATTGCAAAGCTTCTGTAAGGCACATTGTTTTTGACAAATCAGTTTCCTT
TAGACTACACCTTCAAGCCACTTAAGGTTGCATTTACAACAAAAATTTAT
CATCTAAATATCAACAGTAATGGCAGCATTTATCTTGATAATCTCAGATC
ACAGTGTCTCCTGCTTTAACTATTTCTAATGTTCATTTATGCATTTGTTC
ACTGCTATGTGATCCAAACCCTGATGATCTCCTAGTGCCAGAGACTGCAC
AGATCTAAAACAGATAGTGATAAATACAACAGAATATCTTGGGAATGGAC
TCAGAAGTATGCCATGTGATGTTACCTTAAAGTCAGAATAACTTGCATTT
TATAGCTGGAATAAACTTCAAATTCCTATTC
|
quality values | Open.Hide. 9 10 10 15 18 15 24 25 33 41 44 40 34 27 24 30 34 37 37 37 42 42 48 47 41 26 22 16 13 11 8 10 9 10 9 12 17 24 28 28 23 29 29 24 24 28 47 47 57 36
36 31 31 30 29 22 15 19 11 8 6 8 8 8 12 11 12 23 30 34 39 37 35 35 39 43 57 57 57 57 50 50 40 40 47 42 43 31 33 22 22 42 43 47 47 42 42 42 33 32
32 44 44 44 43 43 36 27 19 12 12 27 34 68 68 59 57 57 54 54 54 57 59 59 59 57 57 57 57 51 51 51 51 51 51 51 51 68 68 57 57 57 57 47 54 54 57 59 59 59
50 44 44 43 43 57 50 50 52 52 52 52 57 57 59 59 57 54 57 54 57 57 68 57 57 52 52 52 57 57 57 52 52 52 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 59 57 57 68 57 57 52 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 44 44 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 62 52 45 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62
62 52 52 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 44 44 43 43 35 43 62 62 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
68 68 59 59 57 57 52 57 59 59 43 45 43 43 38 24 13 13 13 15 15 23 36 38 38 44 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 52 52 52 52 57 59 68 68 68 68 59 57 52
52 52 52 52 57 52 52 52 52 57 57 59 59 59 50 50 50 50 43 43 43 57 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 54 57 57 59 59 59 57 47 47 43 44 59 59 47 44 44 37
54 48 59 59 59 68 68 68 59 57 57 54 54 46 46 42 47 46 43 43 43 46 42 42 39 43 43 44 59 54 48 48 48 48 57 59 59 59 59 59 59 48 57 57 57 57 48 48 48 59
59 59 59 59 59 59 59 43 37 37 41 43 47 47 47 59 59 43 43 39 47 47 59 59 57 57 57 57 57 57 47 47 43 43 43 43 43 48 39 39 36 43 43 43 47 57 59 48 48 47
57 48 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 59 48 43 37 32 32 33 37 59 43 48 39 39 35 35 35 39 59 47 43 43 40 40 40 44 59 59 47 43 43 43 41
37 36 37 32 31 20 20 30 34 44 44 59 47 34 34 48 48 48 39 32 28 20 20 35 32 37 39 32 32 20 32 37 32 32 32 28 28 33 33 47 47 48 48 33 34 24 24 24 34 31
26 20 23 23 34 34 39 39 32 32 20 19 19 37 37 47 41 41 41 41 41 37 37 28 28 18 18 20 32 24 25 31 23 23 23 34 28 32 32 39 34 37 31 37 31 37 37 41 41 39
36 36 37 43 37 37 31 30 21 18 18 12 24 21 32 28 28 28 19 15 15 19 15 20 16 28 30 31 31 31 30 28 23 21 16 20 24 20 17 22 24 14 14 14 26 26 34 34 25 25
25 31 28 28 18 18 14 14 14 28 30 32 20 20 20 19 19 34 20 20 15 15 14 14 14 27 27 25 25 25 29 12 13 15 15 8 9 12 13 11 12 10 10 10 10 3 0 3 19 14
18 12 13 9 7 9 9 6 6 8 11 11 21 12 12 9 12 11 12 12 12 12 11 11 11 10 10 3 0 | Open.Hide. 9 9 9 9 9 10 8 8 19 22 39 32 31 37 37 31 29 41 39 34 34 35 35 50 32 32 36 29 23 22 16 18 7 8 9 7 6 6 8 10 10 10 10 16 21 20 23 34 34 33
33 33 33 33 33 41 41 30 25 12 9 9 9 10 10 15 15 31 31 39 28 28 28 28 36 36 48 48 57 59 59 59 59 59 59 43 43 47 47 48 57 44 43 39 36 36 42 42 54 57
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 51 57 57 57 43 47 47 57 48 47 57 47 48 47 57 59 57 46 46 46 46 46 57 57 68 68
68 68 68 68 68 68 57 57 57 50 52 52 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 44 44
33 42 43 52 52 57 57 43 57 45 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 52 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
43 39 39 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 62 62 45 43 43 43 35 35 44 44 62 62 62 62 52 43 43 35 35 35 43 43 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 43 39 41 43 44 62 52 52 52 62 62 52 52
52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 52 52 52 62 62 62 68 68 62 62 52 52 52 62 62 62 68 62 62 45 43 43 43 39 39 62 62 62
68 68 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 39 43 43 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 43 43 35 43 44 44 43 43 52 52 41
44 59 59 57 44 44 57 43 43 39 43 43 43 33 33 39 43 42 45 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 43 43 35 35 35 43 44 54 57 57 68 68 68 57 59 52
52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 52 52 52 52 50 52 52 57 59 68 59 59 59 50 50 50 50 54 59 59 59 59 54 54 54 57 57 57 68 57 57 48 48 42 37 30 30 32 37 39
47 42 42 44 57 44 42 37 41 41 41 42 47 47 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 59 59 36 29 29 29 37 39 48 59 59 43 43 43 43 43 43 59 46 32 32 23
23 28 37 37 48 48 46 59 47 47 47 43 34 30 25 30 30 37 29 31 41 41 41 41 41 40 47 37 39 35 35 32 32 31 36 37 37 25 25 30 31 33 35 36 39 39 35 33 33 30
32 28 37 33 33 30 34 29 35 32 37 37 37 37 59 59 47 43 37 39 39 41 47 59 30 28 14 14 14 28 26 32 30 35 24 37 30 30 30 33 31 34 41 37 36 41 36 36 39 28
22 16 11 11 16 14 24 30 37 34 21 22 18 13 13 16 16 20 26 26 24 22 22 30 22 24 14 9 9 8 9 14 13 12 13 13 17 14 15 20 23 24 24 30 30 28 32 28 31 27
33 25 24 17 29 24 30 27 25 25 16 17 16 24 22 23 13 13 6 6 6 7 8 13 25 25 28 26 24 17 17 |