BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-506J06.T7 (MSMg01no506_j06.b1) | MSMg01-506J06.TJ (MSMg01no506_j06.g1) |
ACC | AG580939 | AG580940 |
length | 752 | 751 |
length of high quality (start - end) | 640 (52 - 691) | 634 (83 - 716) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no506_j06.b1 PHD_FILE: MSMg01no506_j06.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:34:50 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no506_j06.g1 PHD_FILE: MSMg01no506_j06.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:34:50 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NCCCCCATCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XCGCGGAATTCAGGAGGAATTCTGTATTGAGAAAAGCATATTATATGATG
ACAGCTGTTCAGGAGAACTAGAGATAGACCAGACCAAATTAAATTTGGAC
TATTTGGAATTCAAGTAAAAGCATTTGTCTTTGAGACTAAAGACTTGGTT
CACACCTTCAGCAAGAACTCGGCGGAGTGTCCCAAGGTTCCCAGAGGACT
CTCCATGTTGCAGGCCCCCAGGCACACCAAGGCCCTTGAGATAACTGGTG
AGTGGAAAGCAACATCTGTTCCAAATAATCCCAGATGGTCTTGTGCCATC
AGGAACAGAGAAAAAGGAATCCCACCTAACCAGATGCTGGGACTCCTTCT
GGTGGCTCTAGCCCTGTGCCATCTTGGGCACTAAATGGGCAGGACCTAGC
ACACCCAGGATTTTGGGAACACTGACCAGTCTATGCAGGAGAACACGTGG
GATATAGAAGAAACAGAGCTTTTTGGACAGTGTCCCTTCAGGTCTTTATC
CTCAGCTAGAAGGCAGAGCTGAGACCCAGACCCCTGGGCACCTTCCTTGC
CAGAGGAGAGTTGGCTTCCAGGGATGGCTCTGACCCTGGGACTCATGAGG
TGGATATGACCTCCAGACTTCTGGAAACTTTCCCTGCAAGAGGAGAGATT
ACCTGCAAAGAGTGCTCTGACCACTGGGACTCAGGATATTTGGACTTCCA
GN
| AATGTTCCAATGCTAGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAAGGCCCATACCTAAACA
TGATAAAAGCAATCTACAGCAAACCAGTAGCCAACATCAAAGTAAATGGA
GAGAAGCTGGAAGCAATCCTATTTGTGGCTATTATAATGGGGTGTCATAT
CCCTAATTTCTTTCTCAGCCCATGTCTCATTTATATAAAGGAATTTTATT
GATTTTTTGAGTTAATTTTGTATCTAGCCACTTTGCTGACAACAGTGTTT
GTCAGCTACAGAACTTATCTGACATAGTTTTAAGAATTACATATGTATTC
TGTCATATCATCTGCAAATAGTGATACTTTGACTGCTTCCTTACAATTTG
CACTTCCTTGATTTTAGTTGTCTTACTGTTCTCGCTAGTATTTAATGTAC
TATATTGAAGACATAGGGAGAGAGTGGGTAGCCTTATGTGCACTTGATTT
TAGTGGAATTGCTTTAAGTTTCTCTGGATTTAATTTGACGTTGGCTATTG
GCTTGGTGTATATTGTTTTCATTGTCTTTAGGTGAGCCTTGTACTCCTTT
TCTCTCTAGAAACTTTTCATGAAGTGTTCTTGAAGTATGTCAGAGGCTTT
TCAGCTCCTTCTTTTTTATTTTTATTTTATTATTATTATTTTTTTATTTT
CCCAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGTCCCAGCTATTCTGGAACTCACTCTG
T
|
quality values | Open.Hide. 0 3 21 21 19 9 9 9 8 8 8 8 9 12 18 31 34 37 37 32 29 25 28 21 17 8 8 8 21 21 41 28 28 26 25 22 21 19 10 10 9 10 9 10 17 19 18 18 24 28
28 31 48 48 57 36 36 36 36 36 33 31 31 31 25 23 16 15 10 10 10 10 10 12 19 28 33 39 44 50 50 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 53 53 53 53 68
68 68 68 68 68 68 68 47 47 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 48 48 48 48 48 46 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 59 59 68 68 59 59 59 57 57 62 62 68 68 68 68 68
62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 57 54 54 57 57 59 59 68 68 68 57 57 57 57 44 44 35 35 35
43 43 50 50 57 50 50 48 48 48 57 57 59 59 59 57 57 57 57 59 59 54 57 57 57 57 57 54 54 59 59 59 59 59 59 54 47 47 43 43 43 47 57 57 57 44 59 37 41 37
44 46 54 48 57 54 47 47 43 43 43 43 43 43 43 43 43 47 47 59 59 59 59 48 48 48 57 43 48 48 48 59 59 50 50 41 37 37 37 35 31 31 39 39 37 37 37 37 39 48
48 48 48 48 37 37 37 37 37 32 27 25 25 27 36 37 39 32 32 28 31 20 31 31 39 39 39 36 36 37 43 43 43 43 48 43 43 39 39 42 39 41 41 41 37 32 36 30 28 23
32 28 31 30 28 28 35 37 18 19 14 13 17 25 35 47 43 43 39 43 26 26 21 21 18 26 19 28 23 32 29 37 30 25 25 32 37 41 39 40 40 37 28 23 14 13 13 23 18 21
32 32 32 32 23 23 28 30 28 25 25 30 34 36 28 28 28 32 33 39 39 39 39 39 31 30 25 25 22 24 37 32 36 32 39 32 30 30 16 15 9 9 9 14 22 28 28 22 24 20
17 14 16 25 21 19 19 19 21 21 23 15 15 10 10 10 10 11 11 14 11 11 14 23 24 26 13 17 12 12 11 12 19 17 16 11 11 10 10 19 14 13 15 19 30 30 16 10 8 8
3 0 | Open.Hide. 8 8 8 19 13 8 7 7 11 9 9 8 10 8 8 6 6 6 8 15 17 19 19 25 37 34 37 37 37 50 44 41 37 37 29 26 28 13 13 9 11 11 11 9 9 10 10 10 23 19
32 28 32 39 37 47 50 47 47 53 57 59 53 53 50 44 28 19 10 17 8 10 8 10 11 23 19 29 30 31 33 33 33 33 36 53 53 53 53 57 57 57 59 59 59 59 53 47 48 48
50 53 53 68 54 57 59 54 54 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 54 54 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 45 45 52 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 68 68 68
62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 68 68 68 59 59 57 57 57 59
59 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 59 59 59 57 57 57 59 57 68 57 57 54 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 48 43 39 32 37 30 39 32 43 47 59 57 54 54
54 54 54 54 59 59 59 43 46 46 48 48 40 40 28 28 28 43 43 43 43 37 37 33 37 37 43 47 43 35 21 21 20 18 18 25 31 31 37 37 30 30 30 39 39 59 48 48 48 59
59 48 48 48 48 37 37 30 33 33 41 37 48 48 40 37 37 30 30 30 32 28 26 31 28 28 24 25 37 37 41 37 30 28 32 32 39 37 36 33 34 20 20 11 11 11 23 25 59 37
30 24 19 19 29 32 31 31 31 32 32 31 36 37 32 30 35 30 30 30 29 29 31 31 31 33 34 34 30 23 23 14 14 13 13 13 13 21 21 30 37 32 32 29 32 35 31 31 39 32
31 30 29 16 22 12 18 18 25 26 31 30 29 16 21 15 15 15 10 10 8 8 8 8 10 10 13 22 35 28 22 13 18 11 11 13 21 19 10 12 10 11 18 14 20 20 23 24 24 25
20 |