| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-516N18.T7 (MSMg01no516_n18.b1) | MSMg01-516N18.TJ (MSMg01no516_n18.g1) |
|---|
| ACC | AG588753 | AG588754 |
|---|
| length | 775 | 1,161 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 398 (49 - 446) | --- |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no516_n18.b1 PHD_FILE: MSMg01no516_n18.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:48:45 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no516_n18.g1 PHD_FILE: MSMg01no516_n18.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:48:45 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | TTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCG
CGGAATTCAGTTGGGAATGTTTGACAAGCTAATGAGAAGTAGAGATAGTG
GTATCAAACAGGCAGTTGGTTATGGAGGTTCAAAGCATATGTTTATATTA
AAGGCAAAAATGAAGTCATAAGTATATGTATATAAGTATAGATCATTTTT
TATATCTTAGAACTACAAAATATGAGCTGATACTATATGCAGTTGGAGGA
AAACAGAGTGCTTACATATGGATGTGTAAGTGATTTTTTTTAAATTTAAA
AAGTCCTAGTTTATATACTTAGGATTAAAGAAAAACATGCATACATATAT
ATATGAAGATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTATATATATGTATAT
ATATATATATATTCATTCTTATCATCTCTGTCTCTCTGATACACATATAT
ATAATCTTATGTAATATTATATATAATCTTATATATATTTATAATATTAT
ATAATCTAATATATATTCTTATATATAAGTATATATATAATCTTATGCAT
GTGAAATATATACTATACACTTACGCATACACTCACACACACACACACAC
ACCCGCACTGTCATTCATACCCACCTTACACACATCGTTTGTCTTTTCCG
CCCTAATGAAGATTATCGAAGGAACTAACTACAAAAAGTTAAAATGTAAT
AACCCTCCCAATAAAGAATTTATATGCTAGGCCCCAATGGATGGCGCTTT
GGGCGACCACGGCATAAAATAATCC
| NGGGCCCTGTGGTTTGTTGCGGCTTGGGGGGGGGCGTACGCCCCGCGGCG
CCCACAACAATTTATGTGAGTACACCTCTGAAGAGATGCCTCCGGTAATA
NCCCTTATTTATCGACTCTCGTGAACCCCACTCCCTTGAAAAATGGCGTG
CGCATCGAGTATTCTTGCGAACGTTGCTATTGACACATAATAATCATGAT
ATAATGATTATAATAACATGACAGTACCATTATATTCATCGCGTATAACT
ATTTCCGCCAATATTACGCGCGTGCTCTTCTTAGAGTCATCATAAGTAAC
CGTGGATCGGCTGTCATATCTATAAGTAATATCTTATTGCGTACCTTGAT
ATTTGACACGCATCCAATCTCGTATGGAATTCTTTGCCTCACCATGTATC
ATTTGCTCTGCACACGTGCGTTCCGTGTGTGCTTTGTATATCACTTTTCC
CCTTGATGATACTTTAGCCAATTTAGAATGTCTTCTATAAATCCATCCTA
TCTCCCATAATAATATAGCTCCACATGTAGTGCCGGTGGAGTTATCATAT
GATGGGCAGAATTCCGAGTGCAACCCACTGACAGAAGCTCTGGTGTCCTG
TCGCTTGCTGCGTTTCGATATTGTGGACACGCGTGTATATGTGTTGTTAA
TTCCCATCTTAACACCGGCTTCACCTATTTAGATAGATGAAGCGTTACAG
ATCTCAATATTTGTATTGAAACGGATAGTGTGATATATTAGATGCTGTCC
TCAGTGTGAATAATAATTATCCATTCTTTCCCTAATTCGCGGGGACATGA
CAGTTGCATAGTGGATCCTCACGAGCTGGGAGTATATCACGACACTGCCC
GAGGGTCTGCTGTGTTATTGTGTTCCAACATCTATCTGGTGATCTGATTA
GAGTCGCCGGTACTGTTGATGTAACACACTTATAAGATGAATATAGAGCG
CGCGCTCTGCTTATGATCCTTCTCAACACGCTGACATATAATTATACCCT
ATATTTCTAATACAACAGANCCACAATGTCGGACGTGAAACTTCTGACGT
TGAGGCTGGTGAGACACTATGTGAGCCCTCCTCATAAATTACGTCGACCG
AATAAACATTACCACGAGTGGTAACTAATATCATAACACGACCCCACAAC
TCGTGCTACCN
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 7 7 6 6 6 6 8 9 9 19 24 24 28 19 19 22 22 22 22 19 19 20 20 24 24 37 39 39 22 15 10 10 10 22 30 39 32 28 26 37 37 39 39 28 28 24 24 21 28 35
37 37 21 19 17 30 30 30 37 37 37 47 48 48 36 36 36 36 36 36 47 47 47 47 47 47 47 47 48 48 43 43 43 43 43 48 42 48 46 46 41 42 42 46 46 48 48 47 47 47
50 50 50 50 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 47 48 47 47 47 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 57 57 50 50 50 50 50
57 57 57 52 52 52 59 50 46 46 46 46 46 47 47 47 37 37 35 42 35 42 42 50 50 54 54 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 52 57 52 59 57
57 57 57 57 57 68 44 44 31 29 31 44 44 57 57 57 57 57 43 43 52 52 43 43 43 43 57 62 62 62 52 52 52 62 62 52 52 43 43 35 31 35 43 35 43 43 39 39 43 62
62 62 52 62 52 52 43 43 35 35 43 62 62 62 45 45 45 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 54 54 62 62 62 62 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
43 43 35 44 44 57 57 57 57 59 57 43 52 52 57 57 57 57 59 57 41 39 39 57 44 57 52 52 52 57 52 52 52 52 52 52 52 52 57 57 52 52 57 52 52 52 52 57 57 52
52 52 57 57 57 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 48 57 50 48 48 48 48 48 57 57 47 46 43 43 43 47 47 54 54 54 46 57 44 48 57 59 57 57
57 57 57 54 57 57 46 46 43 43 43 43 43 39 39 35 32 28 21 21 10 10 10 27 29 39 39 39 39 36 36 36 36 29 40 25 28 25 32 26 31 18 18 18 20 24 30 28 21 15
10 10 10 26 15 16 16 24 22 27 19 15 11 13 11 11 13 27 27 37 37 14 12 8 8 8 8 10 19 19 33 33 24 25 15 15 15 21 24 22 31 28 37 31 34 40 47 40 40 25
22 21 31 27 18 21 11 11 11 13 12 14 26 26 35 39 37 29 25 17 21 16 24 26 37 22 22 8 8 8 15 15 20 37 37 28 22 28 25 19 15 6 6 8 15 19 16 11 10 10
10 10 10 9 9 12 8 8 10 20 20 33 33 37 40 37 32 30 26 19 19 12 12 10 12 11 11 11 13 8 10 10 19 17 11 23 14 13 13 9 9 9 10 10 9 12 14 15 18 23
14 12 11 10 10 10 10 10 10 10 11 11 12 12 12 17 15 12 10 10 10 12 12 8 11 9 8 8 8 10 8 6 8 7 7 8 8 8 10 8 8 8 8 10 17 15 11 6 6 6
7 9 10 8 8 8 10 10 9 9 10 6 7 8 6 9 9 8 8 8 8 10 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 10 10 6 6 6 6 8 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 12 10 11 11 12 12 9 8 11 11 17 12 12 11 11 11 16 15 13 12 6 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 10 10 24 18 12 9 6 6 6 6 10 10
22 14 19 16 13 10 8 10 6 6 6 6 7 7 8 8 8 9 11 11 8 8 10 10 8 | Open.Hide. 0 3 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 7 10 7 6 8 8 6 6 8 6 8 8 8 12 19 20 31 12 10 9 9 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10
10 28 8 8 8 7 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 7 6 6 6 8 8 8 8 10 10 10 11 9 9 9 8 8 6 6 8 6 6 6 8 8 6 6 8 6 10 3
0 3 11 10 8 8 8 8 8 11 9 8 8 8 10 11 10 12 10 10 9 9 6 8 6 6 11 12 13 8 8 8 8 8 6 6 8 7 9 10 10 10 8 8 8 6 6 6 6 6
8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 8 6 6 6 6 8 7 8 7 7 7 6 8 10 8 8 8 8 8 10 10 12 11 8 8 8 8 12 10 8
8 8 8 8 9 9 10 10 10 11 11 10 10 7 7 7 10 12 9 9 6 8 6 6 6 6 6 6 8 8 6 9 7 7 6 8 6 6 8 8 6 7 8 8 12 17 13 8 8 8
8 8 8 8 8 10 13 16 10 10 10 16 9 9 6 8 6 6 6 7 10 12 8 10 8 8 8 8 8 8 10 6 6 8 6 6 8 8 6 6 8 8 10 8 8 6 6 6 8 8
10 10 10 8 8 8 10 8 6 8 6 6 8 8 6 6 8 8 8 6 8 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 10 13 8 8 8 10 7 7 12 8 8 8 8 9 8 8
8 6 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 10 9 10 12 10 10 8 10 10 10 8 8 9 10 13 10 9 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 9 9 8 10 10 8 8 10 7 7 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 11 12 12 13 13 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 18 11 11 11
12 11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 6 7 10 10 7 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 7 6 6 6 6 8 9 11 9 8 8 10 10 8 8
8 8 9 9 9 10 15 15 15 15 14 13 11 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 11 13 10 8 8 6 6 6 8 8 8 8 13 8 10 9 7 10 8
10 10 11 11 11 11 8 8 10 8 8 8 8 8 7 7 8 10 10 8 13 17 15 11 17 10 10 6 6 6 8 12 10 10 10 10 10 11 10 10 6 6 8 8 9 10 8 8 8 8
8 8 9 8 8 8 11 10 11 9 9 10 11 11 9 9 8 8 6 7 8 8 6 8 8 8 12 10 10 8 6 9 7 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 14 11 12 12 11
10 12 12 12 10 10 8 8 8 10 8 8 9 10 9 9 9 9 10 18 12 12 8 8 6 6 8 8 6 6 6 6 8 6 6 6 8 8 9 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10
12 18 8 8 8 8 10 8 9 9 8 8 10 10 10 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 6 8 7 7 10 10 8 8 8 8 8 8 9 12 9 10 11 11
8 8 8 8 8 8 9 7 7 13 9 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 15 15 15 15 13 13 16 11 11 11 8 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6
6 6 6 6 8 8 10 12 11 12 10 10 8 8 8 8 8 9 12 9 9 9 10 10 8 8 6 8 6 8 7 12 10 10 10 8 6 6 6 6 6 6 8 13 8 6 6 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 13 10 10 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 10 6 6 8 8 8 8 6 6 6 8 6 9 9 10 10 11 11 11 11 11 6 6 6
6 8 6 9 9 11 10 10 10 10 13 15 10 12 9 9 10 10 9 9 10 9 8 8 11 8 8 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10
8 8 8 8 9 10 10 10 10 10 10 8 8 8 9 8 8 13 13 12 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 11 10 8 8 11 8 10 9 9 9 9 13 12 12 8 8 8 8 8
8 7 8 11 12 12 15 10 10 10 9 9 9 9 9 8 8 8 3 0 3 10 8 8 8 8 6 6 6 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 11 9 9 9 9 11 11 12 16 9
9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 8 8 8 10 8 6 6 6 6 8 8 8 7 6 11 7 7 6 6 8 7 7 6 6 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6 6
8 7 7 7 6 8 8 7 9 9 11 10 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 13 9 8 8 8 8 8 8 8 10 11 9 9 8 8 8 8 8 10
10 8 8 8 8 8 8 10 10 3 0 |
|---|
