BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-544M05.T7 (MSMg01no544_m05.b1) | MSMg01-544M05.TJ (MSMg01no544_m05.g1) |
ACC | AG609986 | AG609987 |
length | 803 | 753 |
length of high quality (start - end) | 355 (72 - 426) | 446 (83 - 528) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no544_m05.b1 PHD_FILE: MSMg01no544_m05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 21:25:32 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no544_m05.g1 PHD_FILE: MSMg01no544_m05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 21:25:32 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | plural |
---|
sequence | AAGACTGATAAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTATCGAAAGGAGGCG
CGGAATTCGTGATATATCAATCTAATGGCTGAGAAGCACTTAAAGATATG
TTCATTATCCTTAGTCATAAGGTAAATGCAAAATGATATGACTCTGAGAT
TTTATCTTACAAATATCAGAATGGCTAATATCTAAGACTTAAATAACAGC
ACATTCTGCCTCAGGGAGAAAGACAGACAACACATCAGAGTAAAAGGCTA
GAAAACAAATTTCCAAGCAAATGGTCTGAAAAAAAAGCTGGAGTAGCCAT
TCTAATATCAAACAAAATCGACTTCTAAAAGAAAGTTATCAAAAGAGTCA
AGGAAGGACATCACATTAAGTTGAGGTTGTGGAAGTAATGGAAGACTCCT
TCATTGCTGGTACAAATGTAAACTTGTACAACAACTTTGGGAATAAATTT
TTTGGCGTCTCATATAATTGGGAGTAATTGTATCAAAAAAATAAAACAAA
ATCCTATAACAAACTTAAATCCCTTTACTTATCTATATCATTTCCTATTA
TTCTTGCCATATTTCATCTTATCCCTTTATATAAAACCCTTTTATTTTTT
TCTTTTATCCATAACTATACCCTACTTTTTATATCTTCCTAAGTTATATT
ACCCAAACGGTGAAAATTTCCATCCCTCACTCCCCCTTAAATAATTAACC
TAACCTAAAATTATGGTTTCATAAGAAGACATTTTTTTCTGTAAACCGAC
CCTGGATAATCCTGGGAAAACCAACCGCCTATATACTCCCCCCCAAATCC
ATA
| AAGGACAGATGCTAGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCAAAAAAAAAAAAAAAAC
TTGTAATATTTAATTTAAACAATTCATACATTTACACCTCACAGCACTTC
TTCATAACTGTACTACCATTGCTGAGATCCTTCTTCTTCCCAAATGGTCC
TTCTCTTATTTTTATAATGGTTCTCCTTTTCTTTGTGTGTATATCTGATA
ACATCTCATGCAGGTGGTTGTATTGTACTAGTTGCTATATTTTTGTGATC
ACAAGGTCTAAAGGACCACAATCTGGTTTTGATCTACATATGTAAGAGCA
TCTGACCCTGAATTGCTCATTTTCCTGAATCTACTTCTCCAGTTAAGGGA
TCACAAACACCACTTTTGAAGTACTCTATTGAAATGGGAAAAAATTGAAA
ATATTACACCGTATCTTCATCTGTTTCTTCTTGAGATGATATATTCTCAT
CTTTGTCAAATGCTGGGCTCTGTACTATTTAGACAAAGAAAATGGAAACA
TTATATGCTATATTAGCAAAAGGGAATAAAGTATTAATGATTTGAATTTC
TCAGGAAATACTGCCCAGGTGAATTTTTGAAACAGCTTTTATAAATGACA
TATTTACGTACATGAAATTCCGGTATAGGTATAAGATGAGAAGTAAGGTT
TTCCCAATTTTAGGACTAGTTGAATATTTTTTACCCATTTTATTTCAAAA
AAA
|
quality values | Open.Hide. 6 8 8 8 8 8 8 12 8 8 8 8 8 8 15 16 13 9 9 12 16 16 20 20 21 21 14 23 23 11 11 11 15 6 6 6 6 6 6 6 8 10 10 8 8 9 8 8 8 16
27 32 22 22 16 23 11 13 15 16 19 21 9 9 9 12 12 14 12 21 21 22 22 25 28 28 34 25 25 18 33 33 39 39 39 39 47 43 43 43 43 43 43 39 42 39 42 42 43 48
43 47 50 50 48 48 54 54 54 54 48 57 47 41 46 39 39 39 42 39 48 44 32 30 37 37 42 42 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 54 57 57 57 57 37 37 37 57
57 50 50 50 50 50 50 57 44 43 43 57 57 50 50 50 50 50 35 35 43 43 54 54 57 57 52 52 54 57 57 57 38 41 20 32 38 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 43
52 52 57 57 57 57 59 57 52 52 32 38 16 16 16 34 34 39 39 43 43 43 52 45 45 43 43 44 43 35 39 39 43 43 44 43 38 20 20 35 41 43 43 43 39 39 43 43 43 62
62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 52 45 45 62 62 62 62 52 62 52 52 52 52 52 62 43 43 43 43 31 29 18 12 12 12 33 33 62
62 62 62 62 62 62 62 44 39 35 35 39 43 39 62 62 62 62 39 39 43 57 57 57 57 43 35 35 43 43 57 57 57 57 57 57 43 43 43 35 35 47 47 57 57 57 57 52 52 52
52 52 57 57 52 52 52 32 32 13 13 13 38 38 57 52 43 43 28 17 13 36 21 22 32 43 43 43 43 43 43 24 21 16 15 24 30 36 42 32 43 29 28 28 32 38 24 32 27 27
27 43 43 43 50 44 48 43 27 18 11 11 12 24 30 37 43 37 37 37 43 43 32 27 19 11 11 12 18 19 23 19 19 12 15 15 29 22 24 20 23 23 28 28 31 36 36 31 33 33
37 32 32 28 28 23 12 10 8 8 8 8 10 10 10 12 24 27 26 16 13 11 11 12 13 12 12 17 21 17 28 31 23 21 12 12 12 12 12 8 8 7 6 8 8 10 10 11 8 8
8 8 8 8 10 10 8 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 11 10 11 11 10 10 8 10 8 8 10 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 10 8 9 10 15 13 10 10 9 9 9 8
8 6 7 10 12 12 10 8 8 8 10 10 8 8 7 7 6 8 11 12 16 11 11 11 11 10 10 8 8 8 8 8 8 6 6 7 7 8 8 12 8 8 8 8 8 10 16 11 9 9
13 15 14 11 9 8 10 8 8 8 8 10 10 10 13 10 10 10 10 9 9 8 8 8 8 9 9 13 11 8 8 8 8 8 8 10 11 11 11 11 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8
6 6 6 8 16 13 10 10 8 8 8 8 8 10 10 12 10 13 9 9 9 9 10 9 10 12 13 10 8 6 6 8 8 15 12 10 10 9 9 9 9 8 9 10 13 10 8 6 6 8
8 10 10 8 8 8 8 9 8 8 8 9 9 9 9 9 13 16 12 8 8 8 8 8 8 10 9 8 8 8 8 8 10 11 15 13 18 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6
6 9 11 8 8 8 8 10 12 8 8 8 7 9 7 10 10 11 11 13 15 10 8 8 8 7 7 6 8 8 12 9 10 8 8 8 8 8 8 9 8 8 9 9 10 11 10 10 10 10
10 10 10 | Open.Hide.12 12 16 16 9 8 8 8 8 8 8 8 11 13 13 14 11 10 21 9 9 9 9 9 13 22 23 27 30 28 20 25 32 37 23 15 6 6 6 6 6 9 10 10 10 10 10 10 23 17
26 17 19 30 32 35 36 36 33 33 33 59 47 43 27 15 11 8 8 8 8 13 12 12 12 21 16 22 29 29 29 29 29 33 33 36 59 59 57 57 57 57 57 57 48 57 57 57 48 48
48 48 42 48 48 48 54 54 54 54 54 54 54 57 59 59 59 54 54 54 54 50 43 48 37 37 37 46 44 48 48 57 57 57 57 57 47 47 57 47 47 50 50 47 47 57 57 57 57 57
57 57 68 68 68 57 57 57 57 54 54 54 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 68 59 59 57 57 57 59 59 59 57 68 68 57 57 57 59 57 54 59 59 59
59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 52 52 52 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 52 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 52 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 44 44 39 39 39 43 39 38 44 44 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62
62 62 62 62 62 62 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 59 59 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57 45 45 45 57 57 57 52 52 57 57 57
43 43 52 52 52 59 57 57 52 52 52 52 54 54 59 59 59 50 50 38 50 43 52 52 52 52 57 52 54 57 59 59 44 43 33 33 29 43 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 47 47 43 43 42 44 44 54 46 57 57 57 57 46 41 41 44 44 47 47 54 57 57 54 54 54 57 48 57 48 48 48 32 36 33 33 32 42 43 57 57 54 54 43 42 32
32 35 41 34 36 36 28 28 15 17 17 30 30 39 47 32 25 24 22 22 30 34 32 30 28 12 12 8 8 8 8 9 9 15 13 16 15 15 19 29 29 37 37 36 36 43 43 43 39 39
39 32 32 32 37 37 28 30 30 32 28 30 30 20 18 9 9 9 25 23 37 31 25 21 11 10 10 10 19 20 23 23 23 22 23 19 19 12 15 9 9 9 12 18 19 20 24 23 25 28
31 32 28 24 14 23 16 15 15 15 24 21 28 21 12 12 10 18 19 28 37 37 35 32 25 40 30 30 19 19 15 13 15 14 19 11 14 12 13 15 11 10 10 13 13 23 25 21 14 13
12 10 10 10 9 10 9 10 10 9 10 11 11 17 18 15 8 8 8 8 8 8 8 16 17 21 11 12 12 12 11 12 10 9 9 9 10 10 11 11 11 17 15 11 10 10 10 20 19 19
16 11 12 11 11 11 13 10 9 10 9 15 13 18 24 21 19 12 9 10 8 8 10 8 10 15 15 15 11 14 15 12 10 10 9 9 12 12 15 10 6 6 6 10 8 6 6 6 8 15
15 14 14 |