BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-181H18
ChromosomeY (Build37)
Map Location 1,924,648 - 1,991,614
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100042840
Upstream geneLOC100039278, EG667079, LOC667089, Rhoay-ps1, Zfy2, Ube1y1-ps2, LOC667137, LOC100039373, LOC100039381, LOC667143, LOC100039401, LOC100039430, Vmn2r-ps137, LOC100039450, LOC547210, Ube1y1-ps1, Sry
Downstream geneLOC100042849, LOC620228, LOC667181, Rbmy1a1, LOC667189, LOC100042874, LOC667194, LOC100042881, LOC667201, LOC100039546, Rhoay-ps2, LOC100039568, LOC100041505, LOC100039581, LOC676356, LOC667217, LOC100039613, LOC100041537, LOC667227, LOC667236, EG631479, LOC667244, LOC100039652
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-181H18.bB6Ng01-181H18.g
ACCGA007633GA007634
length1,168123
definitionB6Ng01-181H18.b B6Ng01-181H18.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(1,990,477 - 1,991,614)(1,924,648 - 1,924,770)
sequence
gaattctttcttaataattttttatatagtaaaagtaatctgtaacctgt
gataatatgtagtgtatgtaacatgtaggacagtatattccaatataata
gcagaaaaagtaatatataaaatatagtatataataaaatatatatttta
aaatgatatgtgatgtaatatatatctaatatataataagatcattttat
acaagataagtccaagcaaggcccactacagagcacagtggttcccaaca
cccggggcctcaggatcgatgctctgtacgactcaggcaggtttgcctac
tccaaaaccatactcacgctgagaaacaacacaaacaggaagaaaatcct
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atttatatatgtattatatgtttaataatatacatcgtatatttattatg
aaatacacatattactttcatataccatataaatattgtattttatgata
aataaaaatggaaattttagaaaaatatgttattaaaaaatatattatac
caccatattatggttgtattacggttaatacacataatatattggtaata
ttacacaattatacatgagcttggctacctggcaatgtccgagcgtctat
gaggtgcatattgtatga
atctgcaatttccctcccagctctgttaagcttgggttctgggcctactt
ataatcttacaacttggagctgagtggccaggttgagaaggcttaaaatg
aactggggttggggggggggtag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chrY_1990477_1991614
seq2: B6Ng01-181H18.b_44_1211 (reverse)

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      ||||  || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  ATAATTATATATAATATAAATGAACATAAATATATACGTATACTATTTAT  399

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  TGGAAGTGGCCGAGACGTCAGGATTTTCTTCCTGTTTGTGTTGTTTCTCA  819
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seq1: chrY_1924648_1924770
seq2: B6Ng01-181H18.g_70_192

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGCAATTTCCCTCCCAGCTCTGTTAAGCTTGGGTTCTGGGCCTACTT  50

seq1  ATAATCTTACAACTTGGAGCTGAGTGGCCAGGTTGAGAAGGCTTAAAATG  100
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seq1  AACTGGGGTTGGGGGGGGGGTAG  123
      |||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGGGGTTGGGGGGGGGGTAG  123