BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-111B10.T7 (MSMg01no111_b10.b1) | MSMg01-111B10.TJ (MSMg01no111_b10.g1) |
ACC | AG323847 | AG323848 |
length | 1,152 | 1,138 |
length of high quality (start - end) | 666 (77 - 742) | 598 (65 - 662) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no111_b10.b1 PHD_FILE: MSMg01no111_b10.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:14:57 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no111_b10.g1 PHD_FILE: MSMg01no111_b10.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:14:58 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | plural |
---|
sequence | NAAAACTATGGCGCTATAGACTCACTAAGGGAGAGGATCCGCGGAATTCC
TTAAGAAAAACAGCCATTTACATCCCAACAGGTGATTTAAATGAACAAAA
CCATACTAGACCTAAAAATGGAAGTAGACACAATAAAGAAAACCCAAAGT
GAGGCAATGCTGGAGATAGAAACCCTAGGAAAGATATCTGGAACCATAGA
TGCAAGCATCAGCAACAGAATACAAGTGATGGAAGAGAGAATGTCAGGTG
TAGAAGATTCCATAGAGAACAGCAGCACAACAATCAAAGAAAATGCAAAA
TGCAAAAGGATCCTAACTCACAACATCCAGGAAATACAGGACACAATGAG
AAGACCAAACCTACAGATAATAGGAGTTGATGAGAATGAAGATTTTCAAC
TTAAAGGGGCAGCAAATATCTTCAAAATAATTATAGAAGAAAACTTTTCA
AACCTAAAGAAAGAGATGCCCATGAACATAAAAAAAGCCTACAGAACTCC
AAATAGACTTGACCAGAAAAGAAATTCCTCCCAACACATAATAATCAGAA
AAACACATTCACTAAAAAAAGATAGAACATTATAAGCAGTAAGGGAGAAT
GGTCAAGTAACATATAAAGGCAGGACTATCAGAATTACACCAGACTTTTC
ACCAGAGACTAGGAAAGCCAGAAGAGCCTGAACAGATGTTATACAGACAC
TAAGAGAACTCAAATGCCAACCCAGGCTACTATACCTGGCCAAAATCTCA
ATAACCATAGGTGGAGAAAACGATGTATTCTATTTCTCCTTCCCTGTGTA
ATTTGTTGACAACTTTCTGAAGTATTATAACTATCTATCCTAAAATTTAA
CATTTTTTTGTTTCCTATTATTAATCAGTAGTTTGAAATACGAACTTATT
ATGGCACTACCCAATGCCAGTAGAAAATAATCATAATTATTATTTTTTAA
ACAATATTGTGGATTTATGTTTAGGAAGGCATTGAATATATTAAGACAAA
GNTTTTCTGTCCCCCTTTCTAAAATCCAGTTCCTAGGTAAAAGGTAAAAT
AACTTCCCCATGGATCCCTAAAATTAACCCCGCAAAAAATTTCACCCCCG
GGTAATATATTTAACTTTTAACCCCAAGATGGAAATATTTTTGTGACCCC
CC
| NAAACGAGGCGAGGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXCCATTATAGGTCCATAGCATTTGAGACAACTGGTCC
TGTCACCCTCCTTCAGTCTTTCTCAAATTAAACCAATGGTTCTGTTGATT
CTGTCCATTGGTTGTTTGCATACATCTGCATCTCACTGTTTCACCTGCTC
ATTATTTCTTCATAAGTACAGTCATCCTAGCATTCATATTAAAAGTATCT
GAATTCAGAAACATACAGAGGCTGTGTACTGCAAGCAGGTCTTCTGCAAA
AGCAATATATAATATAAGTACTAAAATTGATATCAGTGCTCTTCAATATT
CTATTCTATGTGATGAAATCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCAA
TATATATATTCCTCTAACTCTTAGTATGAATAAAAATTCTCTTATATTCT
CTCCTATAATGGAGATGATATTGGCATGTCATCTGCAACATTCATTCACT
TTCCTACACAGTTTGTGCTTTCTCTTAGCAATCAACTAATATCTAAATCA
CACATGCACTCAGATTACAAAGTAAGGTATCTGAGCTCATACAAACTGTT
ATTCTGAGTCAGAGTAGGGGGAGGACAATTCCAAACTGTAGTTACGTCCA
AGAGCATGGACTCCAACAACTCGTGAATCAGTAGAAGAGACAATGTATAG
ATGCGTTTGTTTCTTTTGGTTTGGTTTGGTTTAGCTTATTGTGGTTACCC
ACAATCATTATAAGAAATACAGAGAAACACAAATTAATGCCTGTATCTTG
AACTGAATGCAAACAGGGGTCTTAGAACCAACATTATATCTCTGTTACAA
TATACAATATATATTTTTAGAGATTTTTTTTTTATTTATTAGCTATTATA
CCCCACTGCAACAAGTTAAGAAAATATTCCTAGTGACCCAAATAGCAAAC
TTTTATGATCAAATGCAAATATTTTTCACCCAATCAATGGTATTTGCAAC
ATCTGAACCCCTGGTTGTTGTAATTTATGTAGGGCCAAAAAATATTTATA
AAAAAAAGGGCTTCCCCCTGGGGATAAGAAACCCCCTGTCCTCAATTAAA
AGAGGGTTCCCCCCCAACAATTTTTCTTTATTTTTTTG
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 6 10 7 7 10 10 10 22 22 20 15 11 8 8 8 15 18 26 28 18 15 8 8 8 19 22 37 42 42 42 42 42 48 48 48 48 39 43 43 34 43 43 42 47 47 42
28 28 35 35 31 31 50 50 47 37 23 22 9 8 8 8 8 8 10 12 20 25 25 28 13 13 12 27 27 36 36 36 38 38 38 42 42 53 53 53 53 57 57 53 57 57 57 57 57 59
44 26 29 16 24 21 22 12 12 22 25 33 42 37 30 30 35 42 44 57 57 48 48 47 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 47 43 39 37 48 59 68
68 57 57 57 48 48 48 57 57 44 47 43 57 57 57 57 57 57 57 57 59 52 52 57 43 43 35 50 50 57 57 57 68 68 59 57 57 57 59 57 59 59 59 57 52 43 43 57 57 57
59 59 52 52 52 57 57 57 43 43 23 23 43 44 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 62 62 62 45 43 43 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 44 62 52 45 43 44 44 62 52 52 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 45 45 45 62 62
62 44 39 35 35 44 44 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 52 62 62 52 62 62 62 62 62 62 45 45 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 43 43 31 31 35 43
44 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 39 39 43 62 62 62 68 62 62 62 52 45
52 52 62 43 43 43 35 35 43 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 57 57 57 59 52
52 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 52 52 57 57 59 59 68 59 59 52 52 52 57 52 57
57 59 52 52 54 54 52 50 50 35 35 50 59 59 59 59 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 54 54 57 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 59 59
59 57 57 54 57 57 59 57 54 54 54 57 57 59 59 59 59 57 57 54 54 48 57 48 48 54 57 54 44 42 35 39 42 46 48 54 48 48 48 48 48 48 43 43 43 43 48 44 43 48
48 43 43 43 48 59 47 39 37 37 28 28 34 34 37 37 37 31 28 32 34 34 39 37 37 25 21 22 28 24 30 30 37 37 37 48 48 48 48 57 59 47 43 39 39 39 39 37 35 35
40 37 28 37 39 43 32 37 37 37 30 37 37 39 39 39 39 37 37 32 26 27 32 30 33 33 33 33 33 37 37 37 37 37 37 37 32 25 22 24 18 16 16 19 15 16 16 19 16 14
18 32 28 37 41 43 47 47 40 40 40 40 37 37 37 32 27 31 34 34 28 28 21 31 28 48 46 41 41 41 41 41 41 28 30 20 20 20 32 26 34 36 36 37 37 28 34 28 28 13
21 18 33 33 33 33 33 29 34 28 22 13 14 10 10 9 10 10 18 13 13 17 17 19 26 25 32 18 23 25 19 22 24 33 39 35 35 26 21 12 12 12 20 23 29 26 16 14 9 9
9 15 15 13 13 10 17 11 12 15 19 12 16 11 13 12 12 11 15 17 18 15 15 18 24 19 12 10 15 15 21 18 22 21 17 15 12 13 12 18 11 10 8 9 11 13 16 24 28 23
19 16 17 16 19 11 11 15 17 18 16 18 18 16 16 11 10 10 10 8 12 8 10 10 19 17 10 8 8 8 8 9 9 10 15 16 11 10 6 6 6 10 16 20 22 29 28 22 18 8
8 6 6 8 10 9 9 9 8 8 8 11 13 15 22 13 10 10 14 9 8 10 8 8 8 9 11 11 10 8 8 8 8 10 15 8 7 6 8 8 11 8 7 6 6 6 8 9 13 17
3 0 3 10 12 17 15 15 9 9 9 9 8 8 11 6 7 8 8 8 6 10 24 13 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 8 8 8 8 7 9 9 9 11 11 16 15
15 11 12 9 13 10 11 9 8 9 9 9 12 12 11 8 8 6 6 8 7 14 13 13 15 13 20 19 17 10 8 8 8 8 8 15 21 11 10 10 9 9 9 11 11 11 10 16 11 12
8 6 6 6 8 8 8 10 10 10 17 15 8 8 8 8 8 10 10 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 8 10 9 9 9 7 7 8 8 8 8 8 10 8 8 8 9 11 12 18
20 14 | Open.Hide. 0 3 6 6 6 6 6 7 7 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 9 9 19 12 8 10 8 8 21 17 29 29 24 24 14 23 23 35 27 29 20 29 29 43 42 37 37 36 36 36 36
36 36 36 39 48 48 50 50 50 42 35 35 18 20 11 11 11 8 8 8 8 11 13 19 27 28 33 34 32 33 36 33 39 47 48 48 48 48 48 48 48 47 50 53 48 50 53 53 57 54
54 32 32 19 17 16 13 17 14 24 24 41 29 29 24 27 32 37 48 48 51 47 47 47 50 57 51 50 50 47 51 51 68 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 59 57 59 59 68 68 68 68 51 50 50 50 50 50 54 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 50 51 68 57 57 57 57 57 57 57 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 52 57 59 59 57 57 57 57 57 68 68 59 59 62 62 62 62 62 62 62
68 68 68 62 62 62 52 52 52 59 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 43 43 43 62 62 62 62 62 62 68 62 62
62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62
68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 52 52 45 43 43 59 44 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 44 44 43 62 44 44 44 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
41 41 39 39 39 35 35 43 33 38 43 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 45 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 68 68 68 57
57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 59 59 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59
59 59 59 68 59 59 57 57 57 59 50 43 43 43 44 44 57 54 52 59 52 52 43 59 59 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 59 48 44 35 35 39 44 59 57 57 57
57 57 59 57 57 57 59 59 57 48 48 48 48 44 47 47 47 43 47 43 48 48 48 47 47 48 50 54 68 57 57 57 57 48 48 48 59 37 37 23 23 23 34 34 28 28 28 40 32 39
35 37 37 28 28 37 37 34 34 22 25 12 11 11 12 23 24 13 14 15 23 11 11 16 22 28 37 25 22 11 11 18 16 20 34 34 34 39 37 37 39 39 48 57 47 47 43 44 42 39
39 39 39 48 48 48 48 48 48 59 46 47 47 59 59 59 39 28 31 31 31 39 25 20 23 24 24 19 21 21 22 28 23 26 32 37 37 39 41 41 39 37 31 26 26 27 29 32 33 30
33 33 37 43 47 46 48 48 59 59 41 32 20 20 24 32 37 47 47 39 31 25 21 15 15 16 21 13 14 14 23 23 37 37 27 19 14 14 14 18 26 41 32 33 33 31 30 27 27 27
23 31 37 32 33 33 31 30 22 22 19 20 25 37 32 28 13 12 9 9 9 15 21 11 11 9 12 17 18 23 19 17 17 15 29 29 30 30 36 34 34 19 21 13 13 13 30 28 30 30
28 31 31 28 22 19 21 29 27 37 37 37 37 37 32 34 12 12 11 12 11 13 15 10 10 10 16 10 10 10 10 10 10 12 26 23 28 28 10 10 9 10 15 10 9 9 9 11 17 12
11 14 8 8 8 8 15 12 12 12 14 11 10 8 8 8 8 8 7 6 9 9 8 8 8 10 10 13 10 10 10 8 8 10 10 14 10 14 13 17 13 9 10 6 6 6 7 6 6 8
10 9 10 8 8 8 8 8 8 11 11 8 8 8 8 10 10 13 6 6 6 6 8 8 8 11 8 9 8 15 12 12 11 10 8 8 8 10 8 7 7 8 8 9 11 12 10 11 8 10
10 10 10 8 8 9 18 19 25 30 19 11 10 8 8 8 8 7 6 7 9 8 9 13 13 10 9 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 14 24 21 9 10 10 12 9 8 12 12 12 11
12 11 23 30 21 9 8 8 8 8 8 8 8 11 15 13 8 8 8 8 13 11 12 11 11 10 12 9 9 9 9 10 11 8 8 6 6 6 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 8
8 8 8 8 10 9 10 9 8 8 9 9 9 9 9 10 10 13 14 8 8 9 7 7 9 9 9 15 8 9 9 9 12 18 17 17 10 10 |