BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-156J17.T7 (MSMg01no156_j17.b1) | MSMg01-156J17.TJ (MSMg01no156_j17.g1) |
ACC | AG357303 | AG357304 |
length | 750 | 714 |
length of high quality (start - end) | 315 (46 - 360) | 288 (75 - 362) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no156_j17.b1 PHD_FILE: MSMg01no156_j17.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:21:47 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no156_j17.g1 PHD_FILE: MSMg01no156_j17.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:21:47 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | plural | no hit data |
---|
sequence | CTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGG
AATTCTATTGTATCTTTTTTTATGATATGAAACATAACTCTCCCAAATTT
TCTAGATTTTAAACCTTCTTTACATTCTGTCCCTGCAATATGCTAATTTT
CCTTAGCTTGGCCATTCTGTCTGAGTTTTCTGACTAAGTACATTCTGGTG
TCTGAGAAGCCTTGATCATCTGTTAAACATTTTCTCACACAGGTTACATG
TATAGGGATGGTCAGCAATGTGGGTCAGCTGGTGCTTAATGAGGTGACAT
TTTTGAAGGAATGGTCTCCCACATTCAATACAGTTAAACAGGATTCTCTC
CTGTATAAAATCTTTTTTGTTCCACTCCCCCCCGCATTATGATTAAAGGT
TTTCTGGCAACAGGAACACCCACGCAGATTTATTTCTTAGTGAGTCAGAT
AATGTATTTTAAAATCTGAACGGTGTTTTTCTGTGTGTGAGGGTGCATGT
GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGATATCGCTCCCCAATCCTTCTCCCCCTTA
TTATTTATTCCCTCTCTTTCTCTCGTACTCTTTCTTCTCTCCTTCTCCTA
CCCCCTTTTCCGCCGCTTCCCCTTACTTTTACTCTCTTTCCTTTCCCCCC
CTTCTTTTTTCCTCCCTTTTCCCGCCTCCTCTTTTTTTTTCCTTCCCTTT
TTTTCCCCCCTTCTTTCCATTCTCCCCTCTTTTCCCTTGTCCTTTTTCCC
| CGATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAAAGACTCATTTGGTCCCTGGAATGA
AGTTAACGGTCCCTCTGTAGGTTTAGAGAGGTCTAAAGGCTCTTCTGTGG
AAAGGGAAGATCCAAAAGGCTTAGGGAAGAAAGTGAGGAACTAAGTTGGG
CAGAAATTGCAAGTTCCAGAGGTGAGTCATTGGATATCACATGTCCTGGG
GTAGCTGTTGAAAATTTTTGTGCTCCTCATGCAAATGATGAATATCCTAG
AGCCCCCTGGGGAGGCAGCAATGTTTCTACAGAGCCTGTGTATTTGCTGA
AATCCTCAGAGATCCCTGGCCACATCTCACCAATCCTTGCTGTATTTTGA
GCAGGGTGGTTATATCCCTGCCACACTGGTAAAGATGGTGAGTCTGCTAC
TGTGTAGTGTGTAGATGTGGAGTGAGTTCCTATACCTTGTGTATGTAAAG
AAAGACTTGAAAACCTTTTGGAAGATGTAGAATGTTGGGTAGACCTTTGT
GGACATGTGGACAGATGTATGGTCCCCTTGTGCAGAGACCGGCCCTCACA
CATCCTTGAGCAGAATCAGAAGATCCTGCAGTCCTTTGTTCTGAGGATGA
CAGACCCAGAGGATTATGAGAACATCCATAGCATTGTGATGTATTCTTCA
TTGTCTGCGCTGAN
|
quality values | Open.Hide. 6 6 7 6 9 9 14 19 37 39 33 32 32 28 28 37 37 28 23 22 24 27 30 47 41 30 28 28 28 30 36 44 44 31 31 20 20 20 28 34 29 29 22 29 29 37 34 57 57 42
42 47 42 53 50 57 54 54 54 68 68 68 54 46 54 54 54 54 54 57 57 68 68 68 68 51 51 51 68 68 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 51 51 51 51 51 59 57 68
68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 43 43 32 19 15 32 32 44 44 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68
68 68 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 47 43 43 59 59 59 68 68 68 59 59 54 54 57 57 57 68 57 57 59 57 57 57 57 57 57 47 47 47
59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 54 54 57 48 59 44 44 36 30 30 30 24 32 28 35 39 47 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59
59 59 59 50 50 47 41 32 15 15 12 12 12 16 15 19 14 19 16 20 12 11 6 6 6 8 11 13 11 11 9 8 8 8 8 10 19 34 43 46 50 50 50 59 59 59 57 57 57 57
57 57 59 59 59 48 59 59 59 59 59 50 50 50 32 32 15 10 10 11 10 10 11 11 11 13 11 11 11 20 21 30 33 30 37 33 25 25 25 41 59 59 59 59 59 48 48 43 43 43
43 43 43 47 59 59 59 48 47 47 46 57 57 59 59 43 43 43 43 36 37 36 37 43 44 57 59 68 59 59 47 47 43 47 47 59 47 37 37 28 28 32 32 43 40 40 43 46 43 48
48 43 43 43 43 43 43 43 46 57 46 43 30 29 15 11 11 11 11 10 15 13 11 8 8 6 6 15 8 9 8 12 10 12 12 13 21 21 19 13 9 9 9 9 9 13 10 10 8 10
9 9 9 10 23 12 12 14 12 14 14 15 10 8 8 8 8 8 8 11 13 8 8 6 6 8 8 8 8 13 9 16 23 13 13 15 10 8 8 8 8 12 19 13 12 12 7 6 6 6
8 8 10 9 8 8 8 12 13 13 9 8 10 8 10 10 13 17 15 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 10 12 13 17 13 10 12 18 12
16 19 11 11 11 13 22 21 11 11 9 9 9 11 12 10 10 10 18 13 12 11 9 9 6 13 6 9 10 10 10 11 12 14 11 14 11 12 11 9 9 15 12 12 19 19 24 20 19 15
11 11 10 11 23 25 36 28 28 24 22 18 18 18 23 19 17 9 9 11 11 11 11 11 10 11 10 10 8 8 8 8 10 9 9 11 13 9 9 9 9 8 10 17 14 15 13 19 13 13
| Open.Hide. 9 9 9 10 11 11 9 9 19 15 19 9 9 10 22 34 42 50 50 50 50 50 50 50 50 57 57 50 50 50 47 43 43 43 43 43 42 36 32 32 36 42 57 54 54 54 54 50 50 50
50 50 50 54 54 54 54 54 54 50 50 50 50 50 50 57 57 57 50 50 50 50 50 48 50 50 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 57 59 59 59 57 57 43 50 50 50 50 57 57
57 57 68 57 57 57 57 57 54 54 52 59 59 59 57 57 52 59 59 59 59 59 57 57 54 54 54 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 59 52 52 57 59 57 57 57 52 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 46 46 46 57 57 57 57 59 57 59 59 57 57 57 59 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62
62 62 57 57 57 57 47 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 52 52 52 59 52 52 52 57 57 57 57 57 52 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 43 59 59
57 54 52 52 52 52 52 57 57 59 59 57 57 68 68 57 57 57 57 52 52 52 57 57 59 59 59 57 54 50 50 57 59 59 43 44 50 59 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 48 48
48 59 59 59 59 59 48 48 44 57 57 57 57 57 57 57 59 59 44 39 37 30 39 39 59 59 68 59 59 59 48 48 48 59 59 43 47 43 47 46 54 48 59 57 57 54 48 48 59 48
59 48 48 57 59 59 43 24 18 12 12 12 14 14 17 18 17 23 12 12 11 12 12 11 12 12 8 8 8 8 8 10 20 24 28 59 36 47 48 48 48 48 48 48 57 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 35 35 35 59 59 46 47 47 48 47 41 41 20 20 15 24 14 14 14 23 20 25 19 17 17 17 41 30 40 39 30 34 46 46 46 59 43 59 48 48 48 57 57 57 43
47 43 47 47 57 54 59 57 47 43 31 31 22 23 28 44 44 57 48 48 48 59 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 47 47 39 39 37 37 47 59 54 59 59 57 48 43
47 43 43 43 43 43 48 48 48 59 48 47 47 47 47 53 59 59 59 48 43 43 39 37 28 33 22 24 16 16 17 25 25 33 29 31 32 19 14 14 19 24 29 43 43 39 27 19 12 12
23 23 39 40 37 40 37 33 30 37 33 40 43 43 43 37 39 36 36 28 32 23 28 28 37 41 59 34 28 19 19 22 15 14 14 23 26 33 31 29 25 19 12 12 15 22 24 37 32 32
20 20 20 32 32 43 29 32 19 26 26 28 20 18 24 31 28 15 14 14 14 21 14 22 22 18 13 8 8 8 15 15 20 28 22 32 19 14 12 16 12 19 20 28 11 10 9 8 8 8
9 9 9 14 19 16 12 15 21 26 22 19 24 21 17 17 13 25 22 11 11 11 11 10 9 9 9 9 9 13 19 30 29 13 13 6 6 8 10 10 9 9 10 10 8 8 8 11 12 10
9 10 9 9 10 14 10 10 10 10 11 12 3 0 |