BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-309O06.T7 (MSMg01no309_o06.b1) | MSMg01-309O06.TJ (MSMg01no309_o06.g1) |
ACC | AG433551 | AG433552 |
length | 732 | 749 |
length of high quality (start - end) | 318 (45 - 362) | 588 (77 - 664) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no309_o06.b1 PHD_FILE: MSMg01no309_o06.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:51:35 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no309_o06.g1 PHD_FILE: MSMg01no309_o06.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:51:35 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | plural |
---|
sequence | CTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGA
ATTCATTAAAAACGAACTGAAAACCAGTCTTCATTTACCTCTACCTGTTG
TTAAAATGGCAGATTCCCGAAATTTCTATGTATAGGCTCCAATTGCCTCA
AAATACAGAGGCTCCTCTCAGCCTCAGAAGTGCTGGGACTTCAGACATAA
TTCAGGCCAGGTTGTTGTTATTTATTTGTTGTTTTGTTTTAGGACAGTAA
GCTCTAACTCTATATCTCAGGATTGTCTGAAACCTCACCTGCAGCTTTGA
CTGGCCTTGAAACTGAAGTCCCCAGCCTTACAAATGTACCTGGGCCTGAG
GAAATATGTGTTCTTTATCCTCCCACCCCCCAAAATTTGTTTGTTTGTTT
GTTTGTTTGTTTTTCACCCCCCACAAACAAAGATGAAGATTGAAGCCAGA
GCTTCTTGCTGTAGCAGTAACATATTTGTCCAGCCAGAAAAACTTTATAT
TTTATATCTGCTTTACATTTGCATTATGATGAAAAAAAATGAGGAGCTTG
GATTATGATAAAGTAATTACGATTTCATTTGGAAATTGTGACGCCCCACA
TTTACTCTAATTTACTCAAACCCTATTTTTTATGCTTTTTCACATCTATA
TCAACGCGTGTTTTGTTTATATTCTCTCTCTCTATCCCCGATATATGCTC
CCTCACTCCTTTATATATACCGTTTTTCTCCG
| CGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCATCAAAAAAAATGTATGAAGTTC
TCAAGGAATTAATTAATGTAGTTCTTACTATACAATGTCTGTACTGAACA
TATACAGACCACTTATATTTCAATCTCCTAAATAGCAACTCATTTTATAG
CACTTACATTACATTAAGTGCAAAAGTAATCCAGAGATTATTTAAAATAA
AGAAGGATCAGGGGATATGGCCCAGAGACAATGCCAGGAGTGTGTTCAAA
CATTCACCTACAACACCAGTGCTTAAGATTTTGGGAGGGGCAGAGACAGG
AAGATGATTGTGGCTTCCTGAAAGCCAGGCTCACTACCAGCTCAGCAAGA
AACCCAGTCACAAGGGGACACCCCATGGAGGAAAAGAGTAGATCACACTA
TACCCTTCCCTAGCCTCTGAACTTACCTGTACAGTTCTCTATGCAGACTC
ACATAAATATGATTAAAATATGCAAGAGGTTATTTTGCATAGCTTATGTT
CAAAAGCAGTGTTGTTTTAGACTAGAAACCTGAGGACTTTATATCATTAT
AGTTCCTGGAGCAAACTCCCAAGATATAGATGATGGGTATATCTTCTTAC
TGTGCAAAGGAAACCTCAGTTAAGTGTGTGTGTCAGTGACTCCAAACAGC
TTTCCTCCTCTATGTTCCTTTATATAGCATAGAATGATCTGTAAATAAT
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 12 15 30 33 37 33 32 30 28 28 28 21 17 8 8 8 21 21 47 31 31 31 31 31 36 47 50 50 57 50 48 48 48 48 37 37 28 24 26 42 41 57 57 47 47
42 42 50 50 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 51 50 50 50 50 57 51 51 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 59 59 68
68 68 68 57 57 54 57 50 57 57 57 57 57 57 59 68 59 59 59 57 57 57 57 57 68 57 57 57 59 54 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68
68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 57 59 59 57 57 57 59 59 59 52 52 52 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 52 52 52 52 52 57 57 57 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 57
57 57 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 59 57 54 54 50 57 50 50 48 59 59 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57
54 46 46 47 59 59 68 68 68 68 68 50 57 48 44 39 23 23 14 15 15 20 21 21 18 28 34 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 59 59 59 59 57 48 59 57 57 53 50 50
50 50 41 41 27 27 16 16 11 11 11 9 9 9 23 22 23 16 9 9 9 9 9 8 8 8 12 8 17 13 11 11 11 12 20 31 41 47 40 40 43 43 48 48 41 41 32 32 20 31
20 20 23 32 25 37 41 59 59 47 36 34 22 13 8 8 6 7 9 15 15 6 6 6 8 10 8 8 8 11 8 12 10 11 11 12 18 18 28 34 34 15 13 8 8 8 10 19 28 28
20 20 24 28 32 40 40 48 43 43 32 32 18 15 15 12 15 15 21 24 29 32 39 39 41 41 31 20 19 19 20 20 19 17 25 24 30 33 30 28 28 28 24 20 20 20 28 28 32 37
35 21 18 14 14 14 21 24 19 18 14 12 12 12 8 8 8 10 12 23 20 11 11 11 11 13 13 18 14 12 10 10 10 10 15 19 19 12 13 14 28 16 15 12 12 12 12 12 21 13
10 10 8 6 6 10 15 12 10 10 9 9 10 8 8 8 8 8 8 11 11 10 10 8 11 8 8 9 10 17 15 8 8 8 8 10 14 12 10 10 10 10 12 10 9 9 10 12 12 12
24 28 25 12 12 12 12 12 11 11 12 12 15 12 17 11 10 8 8 8 8 9 9 10 11 9 9 10 8 8 8 10 10 15 16 12 12 9 9 8 10 9 8 8 7 6 8 8 10 13
10 8 8 6 6 8 8 8 8 13 10 16 10 9 10 10 15 10 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 13 8 11 8 8 11 11 11 17 18 12 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8
8 10 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 11 11 12 11 9 9 | Open.Hide.10 10 9 13 15 8 8 8 8 19 23 48 48 48 48 48 48 48 42 50 42 37 37 37 37 32 32 44 44 39 25 18 9 9 7 7 8 8 10 9 15 15 30 22 34 32 41 41 25 19
10 8 6 6 10 19 25 41 42 25 25 10 10 10 13 17 14 14 15 16 13 18 25 25 33 33 37 47 47 53 53 53 57 59 59 50 42 47 47 47 47 53 53 57 57 57 68 68 59 50
50 50 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 50 50 41 37 28 28 28 33 27 24 19 12 12 12 22 28 41 47 50 50 41 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 50 53 53 53
53 53 53 53 53 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 44 38 32 18 17 17 36 38 44 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 68 57
57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 59 57 57 57 54 57 48 48 48 57 57 57 54 54 54 59 57 54 54 54 54 54 54 57 59 68 59 59 59 46 46 59 59 59 57 57
57 57 57 57 57 57 57 48 59 48 48 47 47 59 30 19 10 10 8 8 8 8 9 10 19 24 19 28 34 43 59 59 59 59 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59
48 48 48 59 59 59 59 59 59 53 50 50 50 50 42 41 43 44 39 37 37 39 39 39 41 42 42 47 48 50 50 48 59 48 59 59 59 53 53 50 50 48 57 48 59 59 57 59 59 48
48 48 59 48 42 42 47 42 47 57 43 36 36 34 35 23 27 14 18 18 29 25 40 47 59 59 47 43 36 36 31 39 39 43 43 46 47 47 59 47 39 39 59 59 34 41 30 25 18 32
31 34 34 37 59 59 59 59 23 22 8 8 8 22 27 43 41 34 23 23 23 34 34 25 25 28 28 28 24 24 25 39 31 30 30 37 37 37 41 48 48 48 48 48 48 47 47 59 41 30
17 16 11 11 17 30 34 29 34 38 37 41 41 37 39 39 43 43 59 37 48 34 34 23 28 23 28 23 37 31 34 34 36 35 27 36 34 37 30 37 37 41 43 41 41 34 34 28 25 21
24 24 22 28 29 29 27 24 25 29 30 24 19 14 10 11 12 9 14 17 19 16 16 28 22 18 22 23 23 15 15 10 10 10 15 17 23 19 26 26 32 27 26 37 29 29 32 37 36 37
26 13 13 13 12 12 20 31 37 36 37 37 29 24 12 9 9 9 9 13 19 14 14 10 10 8 10 23 16 12 9 9 9 10 14 30 25 27 19 19 11 11 15 13 16 16 12 10 10 |