BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-002L12
Chromosome3 (Build37)
Map Location 98,061,595 - 98,062,188
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneOlfr1402, Chd1l, Fmo5, Prkab2, Pde4dip, Sec22b, EG433632, LOC100042975, Notch2, Adam30, LOC622561, Reg4
Downstream geneHmgcs2, Phgdh, Zfp697, LOC100043461, Hsd3b4, LOC100043456, EG545555, LOC676433, Hsd3b5, LOC668543, Hsd3b2, Hsd3b3, Hsd3b6, LOC545556, Hsd3b1, Hao3, LOC668557, Wars2, Tbx15
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-002L12.bB6Ng01-002L12.g
ACCDH840660DH840661
length1,244594
definitionDH840660|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-002L12, 5' end.DH840661|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-002L12, 3' end.
singlet/doublet---singlet
BLAST hitno hit dataunique
sequence
gaattcaaggcccatacctaaacatgataaaagcaatctacagcaaacca
gtagccaacatcaaagtaaatggagagaagctggaagcaatcccactaaa
atcagggactagacaaggctgcccactttctccctaccttctcaacatag
tacttgaagtattagccagagcaattcgacaacaaaaggagatcaagggg
atacaaattggaaaagaggaagtcaaaatatcactttttgcagatgatat
gatagtatatataagtgaccctaaaaattctaccagagaactcctaaacc
tgataaacagcttcggtgaagtagctagatataaaataaactcaaacaag
tcaatggcctttctctatacaaagaataaacaggctgagaaagaaattag
ggaaacaacacccttctcaatagtcacaaataatataaaatatcttggcg
tgactctaactaaggaagtgaaagatctgtatgataaaaacttcaaatct
ctgaagaaagaaattaaggaagatctcagaagatggaaagatctcccatg
ctcatggattggcagcatcaacattgtaaaaatggctatcttgccaaaag
caatctacagattcaatgcaatccccatcaaaattctaactcaattcttc
aacgaattggaaggagcaatttgcaaatttgtctggaataacaaaaaacc
taggatagcaaaaagtcttctcaaggataaaagaacttctggcagaatca
ccatgccagacctaaagctttactacagagcaattgtgattaaaaactgc
atggtactggtatagagacagacaagtagaccaatggaatagaattgaag
acccagaaatgaacccacacacctatggtcacttgatcttcgacagggag
ctaaaaccatccagtggaagaaagacagcattttcaacaattggtgctgg
cacaactggttgttattgtgtagaaagactgcgaatcgatccatacttat
ctccttgtactaggtcaaatctaagtggatcaggaacttcacataaacag
agacactgaaacttatagagggagaaaggtggggaagccttgaagaattg
gcacaagggaaatcctgaacagacagcaatggctgtgggctgtagatctg
gaattgacaatggaacctaatgaacctcagtctgcagcaagatccggtat
gagacaaaggacccctcacagatgggaggagtaatcttttccta
gaattcaacttactaccaaaggaacaagctgctaaagcttcttcaagcaa
cgatctcctccacagatcctgcccaagttattttaaaaccatctattcat
tattgtttaaattaatccagagatggaaatggatgaaatatctgctgtag
aaaagcaccgagaaaggaatctgtgaagctaaaattaatcacaggaacct
cattcgttaatgatttatcagctctcgtgtaagccgtaaggagattgaga
atggatagttaactggggttatgatgagttggtctggcacatggtatgga
taactggggttataatgagttgatctggtacatggtatggataactgggg
ttatgatgagttggtctggtacatggtatgggtaactggggttatgatga
gttgatctggtacatggtatgggtaactgggattatgatgagttggtctg
atacatggtatggataactggggttatgatgaggtggtctggcacatggt
gtggataactggggttatgatgagttggtctggcacatggtatggataac
tggggttatgatgagttggtctggtacatggtatggattactgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_98061595_98062188
seq2: B6Ng01-002L12.g_69_662

seq1  GAATTCAACTTACTACCAAAGGAACAAGCTGCTAAAGCTTCTTCAAGCAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAACTTACTACCAAAGGAACAAGCTGCTAAAGCTTCTTCAAGCAA  50

seq1  CGATCTCCTCCACAGATCCTGCCCAAGTTATTTTAAAACCATCTATTCAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGATCTCCTCCACAGATCCTGCCCAAGTTATTTTAAAACCATCTATTCAT  100

seq1  TATTGTTTAAATTAATCCAGAGATGGAAATGGATGAAATATCTGCTGTAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGTTTAAATTAATCCAGAGATGGAAATGGATGAAATATCTGCTGTAG  150

seq1  AAAAGCACCGAGAAAGGAATCTGTGAAGCTAAAATTAATCACAGGAACCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGCACCGAGAAAGGAATCTGTGAAGCTAAAATTAATCACAGGAACCT  200

seq1  CATTCGTTAATGATTTATCAGCTCTCGTGTAAGCCGTAAGGAGATTGAGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCGTTAATGATTTATCAGCTCTCGTGTAAGCCGTAAGGAGATTGAGA  250

seq1  ATGGATAGTTAACTGGGGTTATGATGAGTTGGTCTGGCACATGGTATGGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGATAGTTAACTGGGGTTATGATGAGTTGGTCTGGCACATGGTATGGA  300

seq1  TAACTGGGGTTATAATGAGTTGATCTGGTACATGGTATGGATAACTGGGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTGGGGTTATAATGAGTTGATCTGGTACATGGTATGGATAACTGGGG  350

seq1  TTATGATGAGTTGGTCTGGTACATGGTATGGGTAACTGGGGTTATGATGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGATGAGTTGGTCTGGTACATGGTATGGGTAACTGGGGTTATGATGA  400

seq1  GTTGATCTGGTACATGGTATGGGTAACTGGGATTATGATGAGTTGGTCTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGATCTGGTACATGGTATGGGTAACTGGGATTATGATGAGTTGGTCTG  450

seq1  ATACATGGTATGGATAACTGGGGTTATGATGAGGTGGTCTGGCACATGGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATGGTATGGATAACTGGGGTTATGATGAGGTGGTCTGGCACATGGT  500

seq1  GTGGATAACTGGGGTTATGATGAGTTGGTCTGGCACATGGTATGGATAAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGATAACTGGGGTTATGATGAGTTGGTCTGGCACATGGTATGGATAAC  550

seq1  TGGGGTTATGATGAGTTGGTCTGGTACATGGTATGGATAACTGG  594
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TGGGGTTATGATGAGTTGGTCTGGTACATGGTATGGATTACTGG  594