BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-010D14
Chromosome3 (Build37)
Map Location 119,661,891 - 119,753,912
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneDpyd, LOC100043275, LOC100043278, Ptbp2
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-010D14.bB6Ng01-010D14.g
ACCDH845953DH845954
length1,0501,140
definitionDH845953|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-010D14, 5' end.DH845954|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-010D14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(119,752,846 - 119,753,912)(119,661,891 - 119,663,040)
sequence
gaattcagagatcccgtaatccttctctctaacctacccggagaggaaag
ccgggggttcgaatctgtggagaaactaagcagaggagcatcaaacagca
gactcttagtcaaggtagagattttatttgggggtggcggatgggcggtg
acttcatagctccagtcttttccttgtttcctgctacaaacttctatttg
cttcctacaattcaagttgaaatctgactgtaagcttgtgtagattcaag
cagcgccgtgtagggaaaatgacaagagatgcaaagccaacagccctggt
gctggcatgatgcatctgtgtcaccacacatcacaacactgcaacaaacc
acagtcagttagctcctttggggcttgcccttctttggtatacaagccct
tctctgtgcttaagataccaagaattcctattgttctgagttacccattt
tacatgactggagggggagagcaaatttcatctgttggcacttacatttg
caccatgtccacttcctgaacccttgcctgtgtatggatgacaagaataa
cagttgtagcagactcatttggggatttgattggaatatcattatgaaat
ctctaggtcttatcaaagccaaccatgacaactgctcctacactttcctg
ttgggctcagttaccaatgaacatatttttttaatagaaaacaagaacat
tttaattgcctctgcgagatacttctattttgttttatgtgtgtgctcac
agccagacccttgtgtataatgttaaaagatggatatttttttccctggg
catttttccctttttgtgtaaattatataacaattgctttgggaactgtg
catttggactagccataaataatcaaattgtaatgctgttcggtggcagt
attggagtcttcaaattagtggatatattaccacctcaccgtacaggcat
tttgctctagctgggtttaatagactggtcatgggtaataatcttttgtt
ggttgaggctttcaaatatatctagatgtgacggctccatctctcacaac

gaattcctgaaagggagatgtgtagctcctgctggggcaagaggagaaac
aatagaaccattctcactggtcagatgtcagcgggttgtggaagcccagt
tagaaagggagagagagctcttggtgttgacagagagaaatgagaaagag
gcttaaggaacagggaggagttgagcccaggttaagggcctgagaaaaca
gcaatttgaaaaggattaggaggaagcataggaaagacaaaatagaaaag
aaacaagattagctggtgacagttgagggcaggaggctgggctgtgggaa
gctgagagacaatagacagaacagattaccttggagttcagttcagggag
actgaataaaataccaagctgcagggttcaggaaaatacttcacggctta
gccagaaggcccccagtttaaaccaagatgcagaccatggaacatatgtg
ctcccaaagtccaaagggtgtggcacacaggaatcgtggttatcatccat
tgacttagttatagagaggtctgggctatgcctggcgagatgtcagggaa
gtcagaggaaaaccatgagtagatcttaggggtacaggtagatgagacag
gaagtgtgaataacacccttaggtacagacagattaaaacccatgcaaga
agaaatacaccgtggaagctatgtttttgacggcctgttaacaatctata
gatttatgtagcttccatgcagtctaggacacttacagatggctttggct
tgagccccaagaccacctactgatgatctatataaccttggatacattat
ttaacaccctcaccaaaacaaaacaacaaaacagcccctgtagaatgata
gtagcagaactgactttcctgaatgtctgaggatccagtgagatcacttt
gctaataactttaaagatgtctagtgaccaagcagcctgctcacagagtg
tcccctcacttattctatggatgcatcggtttgatattttagcacatcgt
caaaaactaaaattagagggagaggtaatggatgggagaacagtctcttg
cctgctctcttcccttctggtgggagtagaagtgttgttgcagccgtttg
gtgacagaatgcaagattaacttcctttcaggttggattt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_119752846_119753912
seq2: B6Ng01-010D14.b_44_1093 (reverse)

seq1  GTTGTGAGAGATGGAGCCAGTCACATCTAAGATATTATTTTGAAAAGCCC  50
      |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||||   ||
seq2  GTTGTGAGAGATGGAGCC-GTCACATCT-AGATAT--ATTTGAAA--GCC  44

seq1  TCAAACCAACCAAAAGAATTTATTACCCCAATGACCAAGTCTATTAAACC  100
      || |||||| |||||||  |||||||||  |||||| |||||||||||||
seq2  TC-AACCAA-CAAAAGA--TTATTACCC--ATGACC-AGTCTATTAAACC  87

seq1  CAGCTAGGAGCAAAATGCCTGTAACGGTGAGTGGTTAATATATCCACTAA  150
      |||||| ||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||
seq2  CAGCTA-GAGCAAAATGCCTGT-ACGGTGAGGTGGTAATATATCCACTAA  135

seq1  TTTGAAGACTCCAATACTGCCACCGAACAGCATTACAATTTTGATTATTT  200
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||
seq2  TTTGAAGACTCCAATACTGCCACCGAACAGCATTACAA-TTTGATTA-TT  183

seq1  TATGGCTAGTCCAAATGCACAGTTCCCAAAGCAATTGTTATATAATTTAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGCTAGTCCAAATGCACAGTTCCCAAAGCAATTGTTATATAATTTAC  233

seq1  ACAAAAAGGGAAAAATGCCCAGGGAAAAAAATATCCATCTTTTAACATTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAAAGGGAAAAATGCCCAGGGAAAAAAATATCCATCTTTTAACATTA  283

seq1  TACACAAGGGTCTGGCTGTGAGCACACACATAAAACAAAATAGAAGTATC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACAAGGGTCTGGCTGTGAGCACACACATAAAACAAAATAGAAGTATC  333

seq1  TCGCAGAGGCAATTAAAATGTTCTTGTTTTCTATTAAAAAAATATGTTCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGCAGAGGCAATTAAAATGTTCTTGTTTTCTATTAAAAAAATATGTTCA  383

seq1  TTGGTAACTGAGCCCAACAGGAAAGTGTAGGAGCAGTTGTCATGGTTGGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTAACTGAGCCCAACAGGAAAGTGTAGGAGCAGTTGTCATGGTTGGC  433

seq1  TTTGATAAGACCTAGAGATTTCATAATGATATTCCAATCAAATCCCCAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGATAAGACCTAGAGATTTCATAATGATATTCCAATCAAATCCCCAAA  483

seq1  TGAGTCTGCTACAACTGTTATTCTTGTCATCCATACACAGGCAAGGGTTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTCTGCTACAACTGTTATTCTTGTCATCCATACACAGGCAAGGGTTC  533

seq1  AGGAAGTGGACATGGTGCAAATGTAAGTGCCAACAGATGAAATTTGCTCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGTGGACATGGTGCAAATGTAAGTGCCAACAGATGAAATTTGCTCT  583

seq1  CCCCCTCCAGTCATGTAAAATGGGTAACTCAGAACAATAGGAATTCTTGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCTCCAGTCATGTAAAATGGGTAACTCAGAACAATAGGAATTCTTGG  633

seq1  TATCTTAAGCACAGAGAAGGGCTTGTATACCAAAGAAGGGCAAGCCCCAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTTAAGCACAGAGAAGGGCTTGTATACCAAAGAAGGGCAAGCCCCAA  683

seq1  AGGAGCTAACTGACTGTGGTTTGTTGCAGTGTTGTGATGTGTGGTGACAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGCTAACTGACTGTGGTTTGTTGCAGTGTTGTGATGTGTGGTGACAC  733

seq1  AGATGCATCATGCCAGCACCAGGGCTGTTGGCTTTGCATCTCTTGTCATT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGCATCATGCCAGCACCAGGGCTGTTGGCTTTGCATCTCTTGTCATT  783

seq1  TTCCCTACACGGCGCTGCTTGAATCTACACAAGCTTACAGTCAGATTTCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCTACACGGCGCTGCTTGAATCTACACAAGCTTACAGTCAGATTTCA  833

seq1  ACTTGAATTGTAGGAAGCAAATAGAAGTTTGTAGCAGGAAACAAGGAAAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGAATTGTAGGAAGCAAATAGAAGTTTGTAGCAGGAAACAAGGAAAA  883

seq1  GACTGGAGCTATGAAGTCACCGCCCATCCGCCACCCCCAAATAAAATCTC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGGAGCTATGAAGTCACCGCCCATCCGCCACCCCCAAATAAAATCTC  933

seq1  TACCTTGACTAAGAGTCTGCTGTTTGATGCTCCTCTGCTTAGTTTCTCCA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTTGACTAAGAGTCTGCTGTTTGATGCTCCTCTGCTTAGTTTCTCCA  983

seq1  CAGATTCGAACCCCCGGCTTTCCTCTCCGGGTAGGTTAGAGAGAAGGATT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATTCGAACCCCCGGCTTTCCTCTCCGGGTAGGTTAGAGAGAAGGATT  1033

seq1  ACGGGATCTCTGAATTC  1067
      |||||||||||||||||
seq2  ACGGGATCTCTGAATTC  1050

seq1: chr3_119661891_119663040
seq2: B6Ng01-010D14.g_64_1203

seq1  GAATTCCTGAAAGGGAGATGTGTAGCTCCTGCTGGGGCAAGAGGAGAAAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTGAAAGGGAGATGTGTAGCTCCTGCTGGGGCAAGAGGAGAAAC  50

seq1  AATAGAACCATTCTCACTGGTCAGATGTCAGCGGGTTGTGGAAGCCCAGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGAACCATTCTCACTGGTCAGATGTCAGCGGGTTGTGGAAGCCCAGT  100

seq1  TAGAAAGGGAGAGAGAGCTCTTGGTGTTGACAGAGAGAAATGAGAAAGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAAGGGAGAGAGAGCTCTTGGTGTTGACAGAGAGAAATGAGAAAGAG  150

seq1  GCTTAAGGAACAGGGAGGAGTTGAGCCCAGGTTAAGGGCCTGAGAAAACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTAAGGAACAGGGAGGAGTTGAGCCCAGGTTAAGGGCCTGAGAAAACA  200

seq1  GCAATTTGAAAAGGATTAGGAGGAAGCATAGGAAAGACAAAATAGAAAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAATTTGAAAAGGATTAGGAGGAAGCATAGGAAAGACAAAATAGAAAAG  250

seq1  AAACAAGATTAGCTGGTGACAGTTGAGGGCAGGAGGCTGGGCTGTGGGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAAGATTAGCTGGTGACAGTTGAGGGCAGGAGGCTGGGCTGTGGGAA  300

seq1  GCTGAGAGACAATAGACAGAACAGATTACCTTGGAGTTCAGTTCAGGGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAGAGACAATAGACAGAACAGATTACCTTGGAGTTCAGTTCAGGGAG  350

seq1  ACTGAATAAAATACCAAGCTGCAGGGTTCAGGAAAATACTTCACGGCTTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAATAAAATACCAAGCTGCAGGGTTCAGGAAAATACTTCACGGCTTA  400

seq1  GCCAGAAGGCCCCCAGTTTAAACCAAGATGCAGACCATGGAACATATGTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGAAGGCCCCCAGTTTAAACCAAGATGCAGACCATGGAACATATGTG  450

seq1  CTCCCAAAGTCCAAAGGGTGTGGCACACAGGAATCGTGGTTATCATCCAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCAAAGTCCAAAGGGTGTGGCACACAGGAATCGTGGTTATCATCCAT  500

seq1  TGACTTAGTTATAGAGAGGTCTGGGCTATGCCTGGCGAGATGTCAGGGAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTTAGTTATAGAGAGGTCTGGGCTATGCCTGGCGAGATGTCAGGGAA  550

seq1  GTCAGAGGAAAACCATGAGTAGATCTTAGGGGTACAGGTAGATGAGACAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGAGGAAAACCATGAGTAGATCTTAGGGGTACAGGTAGATGAGACAG  600

seq1  GAAGTGTGAATAACACCCTTAGGTACAGACAGATTAAAACCCATGCAAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTGTGAATAACACCCTTAGGTACAGACAGATTAAAACCCATGCAAGA  650

seq1  AGAAATACACCGTGGAAGCTATGTTTTTGACGGCCTGTTAACAATCTATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAATACACCGTGGAAGCTATGTTTTTGACGGCCTGTTAACAATCTATA  700

seq1  GATTTATGTAGCTTCCATGCAGTCTAGGACACTTACAGATGGCTTTGGCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTATGTAGCTTCCATGCAGTCTAGGACACTTACAGATGGCTTTGGCT  750

seq1  TGAGCCCCAAGACCACCTACTGATGATCTATATAACCTTGGATACATTAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCCCCAAGACCACCTACTGATGATCTATATAACCTTGGATACATTAT  800

seq1  TTAACACCCTCACCAAAACAAAACAACAAAACAGCCCCTGTAGAATGATA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACACCCTCACCAAAACAAAACAACAAAACAGCCCCTGTAGAATGATA  850

seq1  GTAGCAGAACTGACTTTCCTGAATGTCTGAGGATCCAGTGAGATCACTTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCAGAACTGACTTTCCTGAATGTCTGAGGATCCAGTGAGATCACTTT  900

seq1  GCTAATAACTTTAAAGATGTCTAGTGACCAAGCAGCCTGCTCACCAAGAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||
seq2  GCTAATAACTTTAAAGATGTCTAGTGACCAAGCAGCCTGCTCAC--AGAG  948

seq1  TGTCCCCTCACTTATTCTATGGATGCATCGGTTTGATAATTTTTAGCACA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||
seq2  TGTCCCCTCACTTATTCTATGGATGCATCGGTTTGATA--TTTTAGCACA  996

seq1  TCGTCAAAAACTAAAAATTAGAGGGAGAGGTAATGGATGAGAGGACAAGT  1050
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||
seq2  TCGTCAAAAACT-AAAATTAGAGGGAGAGGTAATGGATGGGAGAAC-AGT  1044

seq1  CTCTTGCCTGCTCTCTTTCCTCTCT-GTGGGAGTAG-AGTGTTTGTTGCA  1098
      ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||| ||||||||
seq2  CTCTTGCCTGCTCTCTTCCCT-TCTGGTGGGAGTAGAAGTG-TTGTTGCA  1092

seq1  GCCAGTTTGGTGGTAGAATGCAAGGGAATTACTTCCTTTTCAGTTTGGAT  1148
      ||| ||||||||  |||||||||  || | |||||| |||||| ||||||
seq2  GCC-GTTTGGTGACAGAATGCAA--GATTAACTTCC-TTTCAGGTTGGAT  1138

seq1  TT  1150
      ||
seq2  TT  1140