BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-012D04
Chromosome3 (Build37)
Map Location 149,118,661 - 149,218,925
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100040354, Lphn2, LOC100040368, LOC668893, EG381483
Downstream geneLOC100040620, LOC100040633, LOC100040455, LOC100040463, LOC623554
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-012D04.bB6Ng01-012D04.g
ACCDH847354DH847355
length8521,153
definitionDH847354|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-012D04, 5' end.DH847355|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-012D04, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(149,218,074 - 149,218,925)(149,118,661 - 149,119,824)
sequence
gaattcaattattaataattattgcatgtttataaccatagtaaccatag
aagtcttcatttacttaaaatctctagtgctatttcaagtaaaattcaca
agtaaccttaatttccctttaggatgcattaaaatagtctcctgctctac
gagaaaggtgaactgagagaaccatatctttacatgttgctaccagcttt
caggagggactagtaaaatttagccagagatagcatccaaaccctaagct
tggaagattgatctaaattatttgaaatagcttttaaatatatccaggca
atgtacctagcctagtgaaataatgaatctctcaacaaaatggaataacc
aaataaacagactatggcatgctaattgcttagaattttttggaaataga
attcagtctcttgttacagagactacagtggcattgtagtatgagtcacg
ataacatctgtgtttcgagaatttcaaccttgaactttttctatgcttaa
gtagggtgctcacatcaataacatcagcactaatgacacagaggcatatg
tgaggcagcctgtgttatgtagggagctccaatgcttgtaactaggacac
taaagagagattactgcttggattatatattgaatttacaatattatcat
aaatatgtgtaaaggggtatttgttagacattgaattctaacctagagcc
cacctttctctggaaatacattaggttgaaggattccacgttaattgaac
tgaactgaaattctgtttggattcttttaaggattggaagagagaggaag
actcggaagctcaagttttatttgttctttgtgtgtatgtgtgtgtgtgt
gt
gaattcctaggtcatccttagacacagagttcaaggtcagtggaggaaat
acgataaccggtttccaacaaggcaaacctaaaggccctaaactcacagg
gagaagactgctaggatctgtgaagggggcaagggaagaggaaggctgca
gaatgactgctaaagtttggcattagcagtagaccatgactctttcagac
atgaacgatggagaagatccaaagtgaaagcaaaggtggcctcttcatca
ttgcatgtttaccagcagcttcacgcctccacatggaggcgtgacgatct
cagatctcagatctcagatctcagatctcaggtccacagggaggcataac
attatcagatctcaggtccacatggaggcatgacaatctcagatctcagg
ttgataaatgtatgcagtaggtgctacgaccagggcataaattaagcaat
ttaataagcactatttctgttgaacatgctcagtggatttccattgctgt
agaatgccctttgaggtccccaggatgtcaccgaaaggcttgtgcaatct
tccctttcctgtaggggcttattgatatgtgatattcccaggattctgat
gtgaataaaatgtaaagcaacacatgatgtttttgtattattagtaaccg
aatgggctacgttgactcataattttttatggttccttccatttattaga
acaagtacccatcaagagtggaatagtatttaccagtctccagataccaa
gagcttacagtacttgctacatagtacatagttaataagtacaaccaata
tacagattaggctgagagaaccagagatacatttgtgtatatgggtgact
ttatagaacacttgaactaaattttagggtatggaacaggaactggggtt
tttacaaggcagtaaactaaatatttcaatatgacttggatcctctgtga
agtgttaaatcgggtgtctagcagatctgtgtttggcagtaataattctg
agctcttctgccatgtgaactcagaggcgtgtaagcgggaaaatacagtc
agagaagaaatgaagtcatttcctcctacctaatttagccttcactcatg
cattaacagaaacaaatggactatttctttcacctcttaaacatacttag
gct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_149218074_149218925
seq2: B6Ng01-012D04.b_46_897 (reverse)

seq1  ACACACACACACACATACACACAAAGAACAAATAAAACTTGAGCTTCCGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACATACACACAAAGAACAAATAAAACTTGAGCTTCCGA  50

seq1  GTCTTCCTCTCTCTTCCAATCCTTAAAAGAATCCAAACAGAATTTCAGTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTCCTCTCTCTTCCAATCCTTAAAAGAATCCAAACAGAATTTCAGTT  100

seq1  CAGTTCAATTAACGTGGAATCCTTCAACCTAATGTATTTCCAGAGAAAGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTCAATTAACGTGGAATCCTTCAACCTAATGTATTTCCAGAGAAAGG  150

seq1  TGGGCTCTAGGTTAGAATTCAATGTCTAACAAATACCCCTTTACACATAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCTCTAGGTTAGAATTCAATGTCTAACAAATACCCCTTTACACATAT  200

seq1  TTATGATAATATTGTAAATTCAATATATAATCCAAGCAGTAATCTCTCTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGATAATATTGTAAATTCAATATATAATCCAAGCAGTAATCTCTCTT  250

seq1  TAGTGTCCTAGTTACAAGCATTGGAGCTCCCTACATAACACAGGCTGCCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGTCCTAGTTACAAGCATTGGAGCTCCCTACATAACACAGGCTGCCT  300

seq1  CACATATGCCTCTGTGTCATTAGTGCTGATGTTATTGATGTGAGCACCCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATATGCCTCTGTGTCATTAGTGCTGATGTTATTGATGTGAGCACCCT  350

seq1  ACTTAAGCATAGAAAAAGTTCAAGGTTGAAATTCTCGAAACACAGATGTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTAAGCATAGAAAAAGTTCAAGGTTGAAATTCTCGAAACACAGATGTT  400

seq1  ATCGTGACTCATACTACAATGCCACTGTAGTCTCTGTAACAAGAGACTGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCGTGACTCATACTACAATGCCACTGTAGTCTCTGTAACAAGAGACTGA  450

seq1  ATTCTATTTCCAAAAAATTCTAAGCAATTAGCATGCCATAGTCTGTTTAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTATTTCCAAAAAATTCTAAGCAATTAGCATGCCATAGTCTGTTTAT  500

seq1  TTGGTTATTCCATTTTGTTGAGAGATTCATTATTTCACTAGGCTAGGTAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTTATTCCATTTTGTTGAGAGATTCATTATTTCACTAGGCTAGGTAC  550

seq1  ATTGCCTGGATATATTTAAAAGCTATTTCAAATAATTTAGATCAATCTTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCCTGGATATATTTAAAAGCTATTTCAAATAATTTAGATCAATCTTC  600

seq1  CAAGCTTAGGGTTTGGATGCTATCTCTGGCTAAATTTTACTAGTCCCTCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCTTAGGGTTTGGATGCTATCTCTGGCTAAATTTTACTAGTCCCTCC  650

seq1  TGAAAGCTGGTAGCAACATGTAAAGATATGGTTCTCTCAGTTCACCTTTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAGCTGGTAGCAACATGTAAAGATATGGTTCTCTCAGTTCACCTTTC  700

seq1  TCGTAGAGCAGGAGACTATTTTAATGCATCCTAAAGGGAAATTAAGGTTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGTAGAGCAGGAGACTATTTTAATGCATCCTAAAGGGAAATTAAGGTTA  750

seq1  CTTGTGAATTTTACTTGAAATAGCACTAGAGATTTTAAGTAAATGAAGAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTGAATTTTACTTGAAATAGCACTAGAGATTTTAAGTAAATGAAGAC  800

seq1  TTCTATGGTTACTATGGTTATAAACATGCAATAATTATTAATAATTGAAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTATGGTTACTATGGTTATAAACATGCAATAATTATTAATAATTGAAT  850

seq1  TC  852
      ||
seq2  TC  852

seq1: chr3_149118661_149119824
seq2: B6Ng01-012D04.g_65_1217

seq1  GAATTCCTAGGTCATCCTTAGACACAGAGTTCAAGGTCAGTGGAGGAAAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTAGGTCATCCTTAGACACAGAGTTCAAGGTCAGTGGAGGAAAT  50

seq1  ACGATAACCGGTTTCCAACAAGGCAAACCTAAAGGCCCTAAACTCACAGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGATAACCGGTTTCCAACAAGGCAAACCTAAAGGCCCTAAACTCACAGG  100

seq1  GAGAAGACTGCTAGGATCTGTGAAGGGGGCAAGGGAAGAGGAAGGCTGCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAGACTGCTAGGATCTGTGAAGGGGGCAAGGGAAGAGGAAGGCTGCA  150

seq1  GAATGACTGCTAAAGTTTGGCATTAGCAGTAGACCATGACTCTTTCAGAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGACTGCTAAAGTTTGGCATTAGCAGTAGACCATGACTCTTTCAGAC  200

seq1  ATGAACGATGGAGAAGATCCAAAGTGAAAGCAAAGGTGGCCTCTTCATCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAACGATGGAGAAGATCCAAAGTGAAAGCAAAGGTGGCCTCTTCATCA  250

seq1  TTGCATGTTTACCAGCAGCTTCACGCCTCCACATGGAGGCGTGACGATCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCATGTTTACCAGCAGCTTCACGCCTCCACATGGAGGCGTGACGATCT  300

seq1  CAGATCTCAGATCTCAGATCTCAGATCTCAGGTCCACAGGGAGGCATAAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATCTCAGATCTCAGATCTCAGATCTCAGGTCCACAGGGAGGCATAAC  350

seq1  ATTATCAGATCTCAGGTCCACATGGAGGCATGACAATCTCAGATCTCAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATCAGATCTCAGGTCCACATGGAGGCATGACAATCTCAGATCTCAGG  400

seq1  TTGATAAATGTATGCAGTAGGTGCTACGACCAGGGCATAAATTAAGCAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATAAATGTATGCAGTAGGTGCTACGACCAGGGCATAAATTAAGCAAT  450

seq1  TTAATAAGCACTATTTCTGTTGAACATGCTCAGTGGATTTCCATTGCTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATAAGCACTATTTCTGTTGAACATGCTCAGTGGATTTCCATTGCTGT  500

seq1  AGAATGCCCTTTGAGGTCCCCAGGATGTCACCGAAAGGCTTGTGCAATCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATGCCCTTTGAGGTCCCCAGGATGTCACCGAAAGGCTTGTGCAATCT  550

seq1  TCCCTTTCCTGTAGGGGCTTATTGATATGTGATATTCCCAGGATTCTGAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTTTCCTGTAGGGGCTTATTGATATGTGATATTCCCAGGATTCTGAT  600

seq1  GTGAATAAAATGTAAAGCAACACATGATGTTTTTGTATTATTAGTAACCG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAATAAAATGTAAAGCAACACATGATGTTTTTGTATTATTAGTAACCG  650

seq1  AATGGGCTACGTTGACTCATAATTTTTTATGGTTCCTTCCATTTATTAGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGGCTACGTTGACTCATAATTTTTTATGGTTCCTTCCATTTATTAGA  700

seq1  ACAAGTACCCATCAAGAGTGGAATAGTATTTACCAGTCTCCAGATACCAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGTACCCATCAAGAGTGGAATAGTATTTACCAGTCTCCAGATACCAA  750

seq1  GAGCTTACAGTACTTGCTACATAGTACATAGTTAATAAGTACAACCAATA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTTACAGTACTTGCTACATAGTACATAGTTAATAAGTACAACCAATA  800

seq1  TACAGATTAGGCTGAGAGAACCAGAGATACATTTGTGTATATGGGTGACT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGATTAGGCTGAGAGAACCAGAGATACATTTGTGTATATGGGTGACT  850

seq1  TTATAGAACACTTGAACTAAATTTTAGGGTATGGAACAGGAACTGGGGTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAGAACACTTGAACTAAATTTTAGGGTATGGAACAGGAACTGGGGTT  900

seq1  TTTACAAGGCAGTAAACTAAATATTTCAATATGACTTGGATCCTCTGTGA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACAAGGCAGTAAACTAAATATTTCAATATGACTTGGATCCTCTGTGA  950

seq1  AGTGTTAAATCGGGTGTCTAGCAGATCTTGTGTTTGGCAGTAATAATTCT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTTAAATCGGGTGTCTAGCAGATC-TGTGTTTGGCAGTAATAATTCT  999

seq1  GAGCTCTTCTGCCATGTTGAACTCAAGAGGCCGTGGTAAGCGGG-AGATA  1049
      |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||| | |||
seq2  GAGCTCTTCTGCCATG-TGAACTC-AGAGG-CGT-GTAAGCGGGAAAATA  1045

seq1  CAGTCAGAAGAAGAAATGGAAGGTCATTTTCCTCCTACCTAATTTAGCCC  1099
      ||||||| ||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||| 
seq2  CAGTCAG-AGAAGAAATG--AAGTCA-TTTCCTCCTACCTAATTTAGCCT  1091

seq1  TCACTCATGCCATTACCAG-AACAAATGGGCACTATTTTCTTTCCACTTC  1148
      ||||||||| ||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||  ||  
seq2  TCACTCATG-CATTAACAGAAACAAATGG--ACTA-TTTCTTTCACCTCT  1137

seq1  TAAACATACTTAGGCT  1164
      ||||||||||||||||
seq2  TAAACATACTTAGGCT  1153