BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-013P06
Chromosome3 (Build37)
Map Location 31,934,703 - 32,078,856
singlet/doubletdoublet
Overlap geneKcnmb2
Upstream genePrkci, Skil, Cldn11, Slc7a14, LOC625125
Downstream geneLOC665514, Zmat3, 4930429B21Rik, Pik3ca, Kcnmb3, Zfp639, Mfn1, Gnb4, LOC100040977, Actl6a, Mrpl47, Ndufb5, Usp13, Pex2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-013P06.bB6Ng01-013P06.g
ACCDH848637DH848638
length1,009369
definitionDH848637|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-013P06, 5' end.DH848638|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-013P06, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(31,934,703 - 31,935,724)(32,078,482 - 32,078,856)
sequence
gaattcagttcaaaaggatgggttgccagatttccaactgggctcgattt
ctgtatgtgtcaggacttctgacacacctgtttggagtgggctcaggaca
aagccaagcaaggacaggcatggacaaggaaagggggtaagtcatctctg
ggcatagttccattatttaacattcacgaaagtttgctttgacaaataca
tggaatctctgatcagtgttcacgcgttttcctggaaaagcatatctaag
agagaaattctgctgtgttctgctgactgcttctgagaacaaaagaagaa
actctgctctaggaatagacaatcaacaaccaaagtcagagaacaagtca
gagggtccaggacatcactgcaccacaagcttcaagtacagatgagaaag
aggctcagattcctgtcagactgataggagcacctatgctttatgtaatc
tgtccacatagaataacaatagtgcattgactacttacgtagccatggat
tctgcggtggggccgttaggtacttgcatgtcctataagtacctaaggca
cattaccatcattctaacactaagaacactgagaacactgaaacccagaa
agaccacagtgagctcagaactccaagtcaagtctcttgacactgtgttg
atcctcttgtatgaggatgaagcacctaatcgtaagcatgcagcttggaa
aggagaatgggttggggttagcaactgagcatcactaacaggtacaggct
ccaacacagaactgaaggccactcaggacacatgtccagctccaaaatat
ggacacaatccgtgatacaagtctcaagaccttgactggacggtacctcc
cacaaagccttcaagccaacttgagtatttcagccaagtcctggcagagg
aaaggagacagacacatgaattcatttgcacagagaagaaaacatcctgg
cactgagaactatctctttctcatacatcagtctgctcatacctgctagc
tatcaccat
caacttcttttgcttgggcattcgagagcttccaaggaagctgggagatg
gagaagtggggtggttagaaaagcagtggcaggcaagaaccgggacgctc
gagttcctgggatgtggctttgaaatctcaattgccatgtgtttgtgctg
tgtcccacagagaggtgtgacgttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcac
ttgagtgcataggcgcatttgcatagatgtgtgcatgttaggtttgtgta
catgtgtgtgtatgtgtgtgcaggtacactgttatgcattcatatgcctg
ttcatgtgtgtgcaggaaggagcatgtgtatgggtatgtgtacatgctca
tgcaagtatgtttctctat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_31934703_31935724
seq2: B6Ng01-013P06.b_44_1052

seq1  GAATTCAGTTCAAAAGGATGGGTTGCCAGATTTCCAACTGGGCTCGATTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTTCAAAAGGATGGGTTGCCAGATTTCCAACTGGGCTCGATTT  50

seq1  CTGTATGTGTCAGGACTTCTGACACACCTGCTTGGAGTGGGCTCAGGACA  100
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  CTGTATGTGTCAGGACTTCTGACACACCTGTTTGGAGTGGGCTCAGGACA  100

seq1  AAGCCAAGCAAGGACAGGCATGGACAAGGAAAGGGGGTAAGTCATCTCTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCAAGCAAGGACAGGCATGGACAAGGAAAGGGGGTAAGTCATCTCTG  150

seq1  GGCATAGTTCCATTATTTAACATTCACGAAAGTTTGCTTTGACAAATACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCATAGTTCCATTATTTAACATTCACGAAAGTTTGCTTTGACAAATACA  200

seq1  TGGAATCTCTGATCAGTGTTCACGCGTTTTCCTGGAAAAGCATATCTAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAATCTCTGATCAGTGTTCACGCGTTTTCCTGGAAAAGCATATCTAAG  250

seq1  AGAGAAATTCTGCTGTGTTCTGCTGACTGCTTCTGAGAACAAAAGAAGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAAATTCTGCTGTGTTCTGCTGACTGCTTCTGAGAACAAAAGAAGAA  300

seq1  ACTCTGCTCTAGGAATAGACAATCAACAACCAAAGTCAGAGAACAAGTCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTGCTCTAGGAATAGACAATCAACAACCAAAGTCAGAGAACAAGTCA  350

seq1  GAGGGTCCAGGACATCACTGCACCACAAGCTTCAAGTACAGATGAGAAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGTCCAGGACATCACTGCACCACAAGCTTCAAGTACAGATGAGAAAG  400

seq1  AGGCTCAGATTCCTGTCAGACTGATAGGAGCACCTATGCTTTATGTAATC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTCAGATTCCTGTCAGACTGATAGGAGCACCTATGCTTTATGTAATC  450

seq1  TGTCCACATAGAATAACAATAGTGCATTGACTACTTACGTAGCCATGGAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCACATAGAATAACAATAGTGCATTGACTACTTACGTAGCCATGGAT  500

seq1  TCTGCGGTGGGGCCGTTAGGTACTTGCATGTCCTATAAGTACCTAAGGCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCGGTGGGGCCGTTAGGTACTTGCATGTCCTATAAGTACCTAAGGCA  550

seq1  CATTACCATCATTCTAACACTAAGAACACTGAGAACACTGAAACCCAGAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTACCATCATTCTAACACTAAGAACACTGAGAACACTGAAACCCAGAA  600

seq1  AGACCACAGTGAGCTCAGAACTCCAAGTCAAGTCTCTTGACACTGTGTTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCACAGTGAGCTCAGAACTCCAAGTCAAGTCTCTTGACACTGTGTTG  650

seq1  ATCCTCTTGTATGAGGATGAAGCACCTAATCGTAAGCATGCAGCTTGGAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTCTTGTATGAGGATGAAGCACCTAATCGTAAGCATGCAGCTTGGAA  700

seq1  AGGAGAATGGGTTGGGGTTAGCAACTGAGCATCACTAACAGGTACAGGCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGAATGGGTTGGGGTTAGCAACTGAGCATCACTAACAGGTACAGGCT  750

seq1  CCAACACAGAACTGAAGGCCACTCAGGACACATGTCCAGCTCCAAAATAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACACAGAACTGAAGGCCACTCAGGACACATGTCCAGCTCCAAAATAT  800

seq1  GGACACAATCCGTGATACAAGTCTCAAGACCTTGACTGGACGGTACCTCC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACACAATCCGTGATACAAGTCTCAAGACCTTGACTGGACGGTACCTCC  850

seq1  AACAAAGCCTTCAAGCCAACTTGAGTATTTCAGCCAAGTCCTGGCAGAAG  900
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  CACAAAGCCTTCAAGCCAACTTGAGTATTTCAGCCAAGTCCTGGCAG-AG  899

seq1  AAAAGGAGACAGACACATGGAATTCATTTGCACAGAGAAAGAAAACATCC  950
       ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  GAAAGGAGACAGACACAT-GAATTCATTTGCACAGAG-AAGAAAACATCC  947

seq1  TGGCACTGAGAACTATCTCCTTTCTTCATACAATCCAAGTCTGCCTCCAT  1000
      |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||   |||
seq2  TGGCACTGAGAACTATCT-CTTTC-TCATAC-ATC--AGTCTGC--TCAT  990

seq1  ACCCTGCCTAGCTATTCACCAT  1022
      | |||| ||||||| |||||||
seq2  A-CCTG-CTAGCTA-TCACCAT  1009

seq1: chr3_32078482_32078856
seq2: B6Ng01-013P06.g_66_440 (reverse)

seq1  ATAGAGAAACATACTAGCATGAGCATGTACACATACCCATACACATGCTC  50
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAGAAACATACTTGCATGAGCATGTACACATACCCATACACATGCTC  50

seq1  CTTCCTGCACACACATGAACAGGCATATGAATGCATAACAGTGTACCTGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTGCACACACATGAACAGGCATATGAATGCATAACAGTGTACCTGC  100

seq1  ACACACATACACACACATGTACACAAACCTAACATGCACACATCTATGCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACATACACACACATGTACACAAACCTAACATGCACACATCTATGCA  150

seq1  AATGCGCCTATGCACTCAAGTGCACACACACACACACACACACACAACGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCGCCTATGCACTCAAGTGCACACACACACACACACACACACAACGT  200

seq1  CACACCTCTCTGTGGGACACAGCACAAACACATGGCAATTGAGATTTCAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACCTCTCTGTGGGACACAGCACAAACACATGGCAATTGAGATTTCAA  250

seq1  AGCCACATCCCAGGAACTCGAGCGTCCCGGTTCTTGCCTGCCACTGCTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCACATCCCAGGAACTCGAGCGTCCCGGTTCTTGCCTGCCACTGCTTT  300

seq1  TCTAACCACCCCACTTCTCCATCTCCCAGCTTCCTTGGAAGCTCTCGAAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAACCACCCCACTTCTCCATCTCCCAGCTTCCTTGGAAGCTCTCGAAT  350

seq1  GCCCAAGCAAAAGAAGTTGGAATTC  375
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCAAGCAAAAGAAGTTGGAATTC  375