seq1: chr3_7619540_7620658
seq2: B6Ng01-015N22.b_49_1142 (reverse)
seq1 CAAGAGATCCTGTCTCAGAAAAAGTATAAAACAGGCACTGACAACTAACA 50
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seq2 CAAG-GATCCTGTTTCAGAAAAGATA-AAAACAGGCA-TG-CAACT-ACA 45
seq1 ACCTCTGACCTCCACATTCATTGTC-ATATACCCCTCCTGCCTCCTGCAT 99
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seq2 --CTTTGA-CTC--CAATCA-TGTCAATATA-CCCTTCTGC--TCTGCAT 86
seq1 ATACATGCACACACTCATCTAAATAAAATTTAAATAAAATAAAGTGAG-A 148
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seq2 ATACATGCACACATCAATCTAA--TAAATTTAA--TAAATAAAGTGAGAA 132
seq1 TCTCTTTGATGGTAATTCTAAACTATACAAGATTATTAAATTTCTGAAGC 198
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seq2 TCTCTTTGATGGT-ATTCTAAACTATAC-AGAT--ATAAATTTCTGAAGC 178
seq1 AAATTTTATGGAATTGAGGGCTTTACCAAAATCAAATATTTTGTTGGCTT 248
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seq2 AAA-TTTATGGAATTGAGGGCTTTACC-AAATCAAATATTT--GTGGCTT 224
seq1 CCTATTTGATCTCTGTAAGCTTTTCGATACCCATCCTTTATTGTATTTAC 298
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seq2 CCTATTTGATCTCTGTAAGCTTTTCGATACCCATCCTTTATTGTATTTAC 274
seq1 ATGACCATGTGGCCTAAAATGAGACCAAAACAATGAAAAACAATATTATT 348
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seq2 ATGACCATGTGG-CTAAAATGAGACCAAAACAATGAAAAACAATATTATT 323
seq1 GTGCACATGGTTTTACTGGCTATTCAAGCATAGTCCTACAGCCAAGAACT 398
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seq2 GTGCACATGGTTTTACTGGCTATTCAAGCATAGTCCTACAGCCAAGAACT 373
seq1 ACAGATATTTGCAGGCAGTGACTGTTATTTTCTAAAACCTAATGCAACCA 448
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seq2 ACAGATATTTGCAGGCAGTGACTGTTATTTTCTAAAACCTAATGCAACCA 423
seq1 AACCAAGCAAAGAGAAACAGCACAATAGAGGATTGTCAAGAACTTTAAAA 498
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seq2 AACCAAGCAAAGAGAAACAGCACAATAGAGGATTGTCAAGAACTTTAAAA 473
seq1 AAAACTAAGTTTAAAAAGTTCTTAGAATATAGAAAGCAGCTATTAGTCTG 548
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seq2 AAAACTAAGTTTAAAAAGTTCTTAGAATATAGAAAGCAGCTATTAGTCTG 523
seq1 GTCACATTCTTAGTTTTTGTTTTTGTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTT 598
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seq2 GTCACATTCTTAGTTTTTGTTTTTGTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTT 573
seq1 TTTTTTTGCTGTGATTTCAAGCTGGGCAGGAGCTATATTGTTCTTTCATA 648
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seq2 TTTTTTTGCTGTGATTTCAAGCTGGGCAGGAGCTATATTGTTCTTTCATA 623
seq1 ACCTTAATATTGCTGGGGTCTTAACCCAAAAGCTCTCATCTTGTTGGCCT 698
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seq2 ACCTTAATATTGCTGGGGTCTTAACCCAAAAGCTCTCATCTTGTTGGCCT 673
seq1 GAATTAGACTTGATGCAACTCTTTTCTTTTTTTAAAAAATAGGATTTTTG 748
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seq2 GAATTAGACTTGATGCAACTCTTTTCTTTTTTTAAAAAATAGGATTTTTG 723
seq1 GTGAATTTTAAACCACCAGAGACAAAATTTATGACCAACCTGTTCTTCAA 798
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seq2 GTGAATTTTAAACCACCAGAGACAAAATTTATGACCAACCTGTTCTTCAA 773
seq1 AGCAAACTTCTTTGGTGGCTTTTTTCTGGCCATTTCACTTCTTTAAGCAT 848
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seq2 AGCAAACTTCTTTGGTGGCTTTTTTCTGGCCATTTCACTTCTTTAAGCAT 823
seq1 AGCTAATTCAATACAGCATATCAGCAAATGGAATTAACTGGAACCCTGCT 898
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGCTAATTCAATACAGCATATCAGCAAATGGAATTAACTGGAACCCTGCT 873
seq1 TCCCTATGAATTAAAAGGAAGCTCAAGCAGTACATATTTCTGAAGGACAC 948
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seq2 TCCCTATGAATTAAAAGGAAGCTCAAGCAGTACATATTTCTGAAGGACAC 923
seq1 TGTTCCCAAGAGTGTCTCCCACACACTTGTGTCGCTGTGTGTCTCACACT 998
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seq2 TGTTCCCAAGAGTGTCTCCCACACACTTGTGTCGCTGTGTGTCTCACACT 973
seq1 TCCACTGAGGTGCACCAGCAAGTCTCTCTGCACTTGACAGTGGTGGTAGT 1048
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seq2 TCCACTGAGGTGCACCAGCAAGTCTCTCTGCACTTGACAGTGGTGGTAGT 1023
seq1 ACATAGCAATAAAGTCCAACTGGCAAAGACACACAACAGTGATGTTTGCC 1098
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seq2 ACATAGCAATAAAGTCCAACTGGCAAAGACACACAACAGTGATGTTTGCC 1073
seq1 TTCCATTTGCCTGCGGAATTC 1119
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seq2 TTCCATTTGCCTGCGGAATTC 1094
| seq1: chr3_7493004_7493250
seq2: B6Ng01-015N22.g_73_319
seq1 CTATAAAGTAGGAGCACAGAGAGCAGAAGAATGCTCCAGCCCAGCAATGA 50
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seq2 CTATAAAGTAGGAGCACAGAGAGCAGAAGAATGCTCCAGCCCAGCAATGA 50
seq1 GGCGCAGGAGAAGAGTGGTGGGTTCTTCCTCTTTTATTTGTTGTTATTGA 100
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seq2 GGCGCAGGAGAAGAGTGGTGGGTTCTTCCTCTTTTATTTGTTGTTATTGA 100
seq1 TTTAGTGACCCCTTTGAACTTAGTGATGAAGAAGATGATGGTGATGATAA 150
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seq2 TTTAGTGACCCCTTTGAACTTAGTGATGAAGAAGATGATGGTGATGATAA 150
seq1 CTGTGATGTTGATCACTCAGGTTGTGAGGAATCTGATTTTCAGAGATAGT 200
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seq2 CTGTGATGTTGATCACTCAGGTTGTGAGGAATCTGATTTTCAGAGATAGT 200
seq1 GTTTGTCCTGGCATTTTTTCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTC 247
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seq2 GTTTGTCCTGGCATTTTTTCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTC 247
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