BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-026D19
Chromosome3 (Build37)
Map Location 32,862,347 - 32,863,430
singlet/doubletsinglet
Overlap genePex2
Upstream geneKcnmb2, LOC665514, Zmat3, 4930429B21Rik, Pik3ca, Kcnmb3, Zfp639, Mfn1, Gnb4, LOC100040977, Actl6a, Mrpl47, Ndufb5, Usp13
Downstream geneEG545512, LOC100041058, Ttc14, Ccdc39
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-026D19.bB6Ng01-026D19.g
ACCDH857340DH857341
length1,2331,073
definitionDH857340|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-026D19, 5' end.DH857341|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-026D19, 3' end.
singlet/doublet---singlet
BLAST hitno hit dataunique
sequence
gaattcttttacttgtgttcccttcatgagtctaaagctaaaagccatga
acataacggtgctaagttttgcttatgaaggagcacttatgaaggagcct
ggttccagtgaatcacatttgcagcaggttttatttattattgcttttgg
gaagtaaataaactccttgggtctttttgttgttgtcttcacaagttgaa
tgcttagctgggcaaggttttgccattcaatacagatcaaaactcatctt
gatctctttatctctttctgcataagttttgcctccagcattaaacttct
tggtgatcttttttaccttcaaaatgaacattttgtatttctttttgcac
ctgttgctctttttatggtagacctgtataaaagtgattattaataatta
tgtgacagagtcaacatcaggctatcttgaaatctccaccaaagaaataa
ttccattacttttaaatttagcctcagaaaaatttgtaatacaaaggcat
aaagcaaccatattctttgccaaaatatcataagaatggtctctagccca
gttgctaaaattgttcctctctaaaactttttgagctaggcattggcaat
ctacattgctctcagcagtattgtatttcaagctcctagtagaatggctc
attaagtactacttatagaattaaacaaattctctagtccaaagtcacaa
agtcttccacttccaaaaaataaatagaaaaaaaaaatccacacggccta
ccctgtcacagaaatagcccatccctggtaccaatttctgtcttagtact
tttctattgctgtgatgaaatattatgactaagtcaacttatcaaagaaa
gcatttgtttgggttcagagggttagaatccatgatggtagtgcaaagtc
atggtggtatgagtagcggagagttacatcttgatcagaagcagggagca
gagaagatcatgttgaaaatggtgatcagaagtggatgctcacattcatc
tattggatggaacacagagcctctaatgaggagctagagaagtactcaag
aacctaaggcggtctgccaccctctaggatgaacacatggaactaaccag
taccccccaaagtgtgttcctagttgctatgatgacaaggtgtgctagtt
ggcactaatgggagggaagccatggcctgcaaatattattccatctacgg
gaagccacgctaggtagagatcgatgtctgagg
gaattccaaaaactgtgaacacacacacatacttgccacatatatggata
catacagataagcatgagcacacatatgttcatatacaggtacacacata
ttcatatacatatagtgcatacatatatgcacagcacatatctcaagcca
tcagcatagaatgtctaagcagaaagaattcagaggtatagaattgatcc
agagcctagataaatgactcagtcagtaacttgcctgtcagtcaagcagg
agaatctgagaggtcctcagaacaatgggaacctgggtaccacaacacac
gcctgtgatcctagtgccagggagtcaggggtgtgggatccttggggctc
tctggccagccagcctagctgagcaagtaagaaacactatcctccaaaat
aaggctgacagcaactgaggaaggaagacaatggacattaatcagcctct
gagcacacgtataccatacatacatacatacagacagacagacagacaga
cagacagatagatagatagatagatagatagatagattacatatatatag
ataaacacagtctacagcatacatatgtatacataacacgcaccatacat
atgtatatacaatacagtctacagcatacatatgtatgcacaacaagcgc
acacatatatgtatatacaacacataacaacatatagttgtatacacaac
acacatacaccatacttatgtatacaaacacacatacaccatacatatgt
atacacaagccttgcacacgtgtaccacatcagggggggcgggaaattga
cacactctgaagtcattgaagacactggaatagaattgaaacaattaagc
tttctttttaaaaaaaaataccaccaaaataaaatgcttgctaacaattt
aaaaaaggggggggatattctgaaaagtacagaaaagacttatggagcaa
atttctccatcgcatcctttaagcgttgctgctggccaactcatcgggca
gcatgttccctacagcctgtttgccgcactgggaacgttacacaacatcc
aagatttataatgctatccataa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_32862347_32863430
seq2: B6Ng01-026D19.g_67_1139 (reverse)

seq1  TTATGAATAGCATTATAAACTCTGGATGTTGTGTAACGTTCCCTGGTGCT  50
      ||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||  |||| 
seq2  TTATGGATAGCATTATAAATCTTGGATGTTGTGTAACGTTCCC-AGTGC-  48

seq1  GGGCAAACAGGCTGTAGGGAACATGGCTG-CCGATGAGTGTGCCAGCAGC  99
       ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||
seq2  -GGCAAACAGGCTGTAGGGAACAT-GCTGCCCGATGAGTTGGCCAGCAGC  96

seq1  AACGCTTTAAAGGGATGCGATTGGGAGAAATTTGCTCCAT-AGTCTTTTC  148
      |||||||  || |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||
seq2  AACGCTT--AAAGGATGCGAT--GGAGAAATTTGCTCCATAAGTCTTTTC  142

seq1  TTGTACTTTTCAGAATATCCCCCCCCCTTTTTTTAAATTGTTAGCAAGCA  198
       |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||
seq2  -TGTACTTTTCAGAATATCCCCCCCC--TTTTTTAAATTGTTAGCAAGCA  189

seq1  TTTTATTTTGGTGGTATTTTTTTTTTAAAAAGAAAGCTTAATTGTTTCAA  248
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATTTTGGTGGTA-TTTTTTTTTAAAAAGAAAGCTTAATTGTTTCAA  238

seq1  TTCTATTCCAGTGTCTTCAATGACTTCAGAGTGTGTCAATTTCCCGCCCC  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTATTCCAGTGTCTTCAATGACTTCAGAGTGTGTCAATTTCCCGCCCC  288

seq1  CCCTTGATGTGGTACACGTGTGCAAGGCTTGTGTATACATATGTATGGTG  348
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCC-TGATGTGGTACACGTGTGCAAGGCTTGTGTATACATATGTATGGTG  337

seq1  TATGTGTGTTTGTATACATAAGTATGGTGTATGTGTGTTGTGTATACATC  398
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  TATGTGTGTTTGTATACATAAGTATGGTGTATGTGTGTTGTGTATACAAC  387

seq1  TATATGTTGTTATGTGTTGTATATACATATATGTGTGCGCTTGTTGTGCA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATGTTGTTATGTGTTGTATATACATATATGTGTGCGCTTGTTGTGCA  437

seq1  TACATATGTATGCTGTAGACTGTATTGTATATACATATGTATGGTGCGTG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATATGTATGCTGTAGACTGTATTGTATATACATATGTATGGTGCGTG  487

seq1  TTATGTATACATATGTATGCTGTAGACTGTGTTTATCTATATATATGTAA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGTATACATATGTATGCTGTAGACTGTGTTTATCTATATATATGTAA  537

seq1  TCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTC  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTC  587

seq1  TGTCTGTATGTATGTATGTATGGTATACGTGTGCTCAGAGGCTGATTAAT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTGTATGTATGTATGTATGGTATACGTGTGCTCAGAGGCTGATTAAT  637

seq1  GTCCATTGTCTTCCTTCCTCAGTTGCTGTCAGCCTTATTTTGGAGGATAG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCATTGTCTTCCTTCCTCAGTTGCTGTCAGCCTTATTTTGGAGGATAG  687

seq1  TGTTTCTTACTTGCTCAGCTAGGCTGGCTGGCCAGAGAGCCCCAAGGATC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTCTTACTTGCTCAGCTAGGCTGGCTGGCCAGAGAGCCCCAAGGATC  737

seq1  CCACACCCCTGACTCCCTGGCACTAGGATCACAGGCGTGTGTTGTGGTAC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACACCCCTGACTCCCTGGCACTAGGATCACAGGCGTGTGTTGTGGTAC  787

seq1  CCAGGTTCCCATTGTTCTGAGGACCTCTCAGATTCTCCTGCTTGACTGAC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGTTCCCATTGTTCTGAGGACCTCTCAGATTCTCCTGCTTGACTGAC  837

seq1  AGGCAAGTTACTGACTGAGTCATTTATCTAGGCTCTGGATCAATTCTATA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAAGTTACTGACTGAGTCATTTATCTAGGCTCTGGATCAATTCTATA  887

seq1  CCTCTGAATTCTTTCTGCTTAGACATTCTATGCTGATGGCTTGAGATATG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTGAATTCTTTCTGCTTAGACATTCTATGCTGATGGCTTGAGATATG  937

seq1  TGCTGTGCATATATGTATGCACTATATGTATATGAATATGTGTGTACCTG  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGTGCATATATGTATGCACTATATGTATATGAATATGTGTGTACCTG  987

seq1  TATATGAACATATGTGTGCTCATGCTTATCTGTATGTATCCATATATGTG  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATGAACATATGTGTGCTCATGCTTATCTGTATGTATCCATATATGTG  1037

seq1  GCAAGTATGTGTGTGTGTTCACAGTTTTTGGAATTC  1084
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGTATGTGTGTGTGTTCACAGTTTTTGGAATTC  1073