BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-037A13
Chromosome3 (Build37)
Map Location 151,095,271 - 151,222,936
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEltd1
Upstream geneLOC100040455, LOC100040463, LOC623554
Downstream geneIfi44, H28, Ptgfr, LOC100040741, LOC100040597, LOC676548, Gipc2, Dnajb4, Fubp1, Nexn, C030011O14Rik, Usp33, Zzz3, Ak5
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-037A13.bB6Ng01-037A13.g
ACCDH865030DH865031
length1,046978
definitionDH865030|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-037A13, 5' end.DH865031|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-037A13, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(151,221,895 - 151,222,936)(151,095,271 - 151,096,254)
sequence
catctccttcgcccctaaaataaattaactgctaataatatctattagac
atagccaccacagatgcaccatttctgatcttgatggtttcagattatag
aaagcaaccccccaaaaatattgaagcacctctgattgcactgtttaagg
gcaactcactggaagggtgatggtggttctcaatgtggaaatcaggcaga
aagttctcagaaaagtgcagaagtcaaagcatgtctggaaacccaagtca
ggtggacatcatcaacacccactccctaccagattctccttcctgttagt
gtgtgaaatggccttctccttcactgggtagactgcctccattcactagt
gacagggtggtttggactgtggtagtgcttccccatcattccatgagtgc
acacttatcataggagtgagtagcctagttatatttctcaggactcattt
ccttctactctcccaaatgcttcaccagccagccacagtatgcttctggt
ctttcactgtgccttccaggcacactcctatgataggctcctgtcccatt
gccccacctccgatgaaaacagtagcagccaagttttccatcacacaaca
cttttgttgttgcctttacacataaacacactatttcaccttcatctata
aattcccaaagaagacagtgttttaacataatatcatagctaattgaggg
aaaggtatttcactcaatatttatataattaatcaattttatagacagat
ccaagttatagtttgaatatagggcgctgaacttttatatctgtttttta
attttttatcaactctttttgactattctttccttcaatactcaaccagc
ttatctaaatcacagtcttctctaatctctatcttctttctatacaatgg
cattttataagtatatcagcacttgatgcctagagtgtgtattcattggt
tgctggctcctaatcatcactaacacacaggtgccatggggacttaactt
aatctacttgctaataacctgtacacagtgacacttcggctggggt
gaattcttgttttcacttgtgaacaaggagatgttgattagctgagatgt
cacctaagtcctattcttgatatatttacaaagatacaatatattgcagt
ctataaagacacaggttttgaaaattgtatgcagtgcctagttctggaca
ttgaaatatcttctgattcctccattcttaaattaactaggagacacagt
ggaaagcacccctccacatcccatttgggaactaggaatttctgttcaca
taactaagtttaggtgtgatgtttgttccttttgttttgttttgttgatg
atgatgatgatgctttaattagttgtggaaaaaaatagcctatgcagttc
cagtggcactgaagacacctgaggcaagaatttctagctaatcttctaaa
tcaaaacacaaaacatcattttgaacaaatttcactacatattattgtat
aaatgcatccacttattgaggcagtcagtgaaagccactgtttctgctat
ccttgttgctctgacacaacagcatctcaccaggctagcctggaactcac
tatgcaggcagggcacaagcctagaacgcccagcaatatttctgcttcag
ccttcagcctcccaagtgcagcagcatctatcaatcagccattgtttagt
tacataatgaccatggtgatttcatgtatgaaagaattaactacagacct
atacccatgacctttgtgttctaagaaacttcgttaactcagctattaaa
aaaaatgaatttatgaaattcctaggcaaatggatggacctggagggcat
catcctgagtggggtaacccaatcacaaaggaactcgcacaatatgtact
cactgataagtggatattagcccagaaacttaggatacccaagatataga
tacaacttgctaaacgcatgaaatcaagagaaggagacaaagtgtgacac
tttaccccttcctagaaatgggaacaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_151221895_151222936
seq2: B6Ng01-037A13.b_35_1080 (reverse)

seq1  ACCCAAGCCAGAAGTGTCACTGTGTACCAGGTTATTAAGCAAGTAGATTA  50
      |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||
seq2  ACCCCAGCC-GAAGTGTCACTGTGTA-CAGGTTATT-AGCAAGTAGATTA  47

seq1  AGTTAAGTCCCCATGGCACCTGTGTGTTAGTGATGATTA-GAGACAGCAA  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||
seq2  AGTTAAGTCCCCATGGCACCTGTGTGTTAGTGATGATTAGGAGCCAGCAA  97

seq1  CCAATGAATACACACTCTA-GCATCAAGTGCTGATATACTTAT-AAATGC  147
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  CCAATGAATACACACTCTAGGCATCAAGTGCTGATATACTTATAAAATGC  147

seq1  CATTGTATAGAAAGAAGATAGAGATTAGAGAAGACTGTGATTTAGATAAG  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGTATAGAAAGAAGATAGAGATTAGAGAAGACTGTGATTTAGATAAG  197

seq1  CTGGTTGAGTATTGAAGGAAAGAATAGTC-AAAAGAGTTGATAAAAA--T  244
      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |
seq2  CTGGTTGAGTATTGAAGGAAAGAATAGTCAAAAAGAGTTGATAAAAAATT  247

seq1  TAAAAACAGATATAAAAGTTCAGCGCCCTATATTCAAACTATAACTTGGA  294
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAACAGATATAAAAGTTCAGCGCCCTATATTCAAACTATAACTTGGA  297

seq1  TCTGTCTATAAAATTGATTAATTATAT-AATATTGAGTGAAATACCTTTC  343
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTCTATAAAATTGATTAATTATATAAATATTGAGTGAAATACCTTTC  347

seq1  CCTCAATTAGCTATGATATTATGTTAAAACACTGTCTTCTTTGGGAATTT  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCAATTAGCTATGATATTATGTTAAAACACTGTCTTCTTTGGGAATTT  397

seq1  ATAGATGAAGGTGAAATAGTGTGTTTATGTGTAAAGGCAACAACAAAAGT  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGATGAAGGTGAAATAGTGTGTTTATGTGTAAAGGCAACAACAAAAGT  447

seq1  GTTGTGTGATGGAAAACTTGGCTGCTACTGTTTTCATCGGAGGTGGGGCA  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTGTGATGGAAAACTTGGCTGCTACTGTTTTCATCGGAGGTGGGGCA  497

seq1  ATGGGACAGGAGCCTATCATAGGAGTGTGCCTGGAAGGCACAGTGAAAGA  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGACAGGAGCCTATCATAGGAGTGTGCCTGGAAGGCACAGTGAAAGA  547

seq1  CCAGAAGCATACTGTGGCTGGCTGGTGAAGCATTTGGGAGAGTAGAAGGA  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAAGCATACTGTGGCTGGCTGGTGAAGCATTTGGGAGAGTAGAAGGA  597

seq1  AATGAGTCCTGAGAAATATAACTAGGCTACTCACTCCTATGATAAGTGTG  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAGTCCTGAGAAATATAACTAGGCTACTCACTCCTATGATAAGTGTG  647

seq1  CACTCATGGAATGATGGGGAAGCACTACCACAGTCCAAACCACCCTGTCA  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCATGGAATGATGGGGAAGCACTACCACAGTCCAAACCACCCTGTCA  697

seq1  CTAGTGAATGGAGGCAGTCTACCCAGTGAAGGAGAAGGCCATTTCACACA  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGTGAATGGAGGCAGTCTACCCAGTGAAGGAGAAGGCCATTTCACACA  747

seq1  CTAACAGGAAGGAGAATCTGGTAGGGAGTGGGTGTTGATGATGTCCACCT  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACAGGAAGGAGAATCTGGTAGGGAGTGGGTGTTGATGATGTCCACCT  797

seq1  GACTTGGGTTTCCAGACATGCTTTGACTTCTGCACTTTTCTGAGAACTTT  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTGGGTTTCCAGACATGCTTTGACTTCTGCACTTTTCTGAGAACTTT  847

seq1  CTGCCTGATTTCCACATTGAGAACCACCATCACCCTTCCAGTGAGTTGCC  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCTGATTTCCACATTGAGAACCACCATCACCCTTCCAGTGAGTTGCC  897

seq1  CTTAAACAGTGCAATCAGAGGTGCTTCAATATTTTTGGGGGGTTGCTTTC  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAAACAGTGCAATCAGAGGTGCTTCAATATTTTTGGGGGGTTGCTTTC  947

seq1  TATAATCTGAAACCATCAAGATCAGAAATGGTGCATCTGTGGTGGCTATG  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAATCTGAAACCATCAAGATCAGAAATGGTGCATCTGTGGTGGCTATG  997

seq1  TCTAATAGATATTATTAGCAGTTAATTTATTTTAGGGGCGAAGGAGATG  1042
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAATAGATATTATTAGCAGTTAATTTATTTTAGGGGCGAAGGAGATG  1046

seq1: chr3_151095271_151096254
seq2: B6Ng01-037A13.g_70_1047

seq1  GAATTCTTGTTTTCACTTGTGAACAAGGAGATGTTGATTAGCTGAGATGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTGTTTTCACTTGTGAACAAGGAGATGTTGATTAGCTGAGATGT  50

seq1  CACCTAAGTCCTATTCTTGATATATTTACAAAGATACAATATATTGCAGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTAAGTCCTATTCTTGATATATTTACAAAGATACAATATATTGCAGT  100

seq1  CTATAAAGACACAGGTTTTGAAAATTGTATGCAGTGCCTAGTTCTGGACA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATAAAGACACAGGTTTTGAAAATTGTATGCAGTGCCTAGTTCTGGACA  150

seq1  TTGAAATATCTTCTGATTCCTCCATTCTTAAATTAACTAGGAGACACAGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAATATCTTCTGATTCCTCCATTCTTAAATTAACTAGGAGACACAGT  200

seq1  GGAAAGCACCCCTCCACATCCCATTTGGGAACTAGGAATTTCTGTTCACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAGCACCCCTCCACATCCCATTTGGGAACTAGGAATTTCTGTTCACA  250

seq1  TAACTAAGTTTAGGTGTGATGTTTGTTCCTTTTGTTTTGTTTTGTTGATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTAAGTTTAGGTGTGATGTTTGTTCCTTTTGTTTTGTTTTGTTGATG  300

seq1  ATGATGATGATGCTTTAATTAGTTGTGGAAAAAAATAGCCTATGCAGTTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATGATGATGCTTTAATTAGTTGTGGAAAAAAATAGCCTATGCAGTTC  350

seq1  CAGTGGCACTGAAGACACCTGAGGCAAGAATTTCTAGCTAATCTTCTAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGGCACTGAAGACACCTGAGGCAAGAATTTCTAGCTAATCTTCTAAA  400

seq1  TCAAAACACAAAACATCATTTTGAACAAATTTCACTACATATTATTGTAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAACACAAAACATCATTTTGAACAAATTTCACTACATATTATTGTAT  450

seq1  AAATGCATCCACTTATTGAGGCAGTCAGTGAAAGCCACTGTTTCTGCTAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGCATCCACTTATTGAGGCAGTCAGTGAAAGCCACTGTTTCTGCTAT  500

seq1  CCTTGTTGCTCTGACACAACAGCATCTCACCAGGCTAGCCTGGAACTCAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGTTGCTCTGACACAACAGCATCTCACCAGGCTAGCCTGGAACTCAC  550

seq1  TATGCAGGCAGGGCACAAGCCTAGAACGCCCAGCAATATTTCTGCTTCAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCAGGCAGGGCACAAGCCTAGAACGCCCAGCAATATTTCTGCTTCAG  600

seq1  CCTTCAGCCTCCCAAGTGCAGCAGCATCTATCAATCAGCCATTGTTTAGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCAGCCTCCCAAGTGCAGCAGCATCTATCAATCAGCCATTGTTTAGT  650

seq1  TACATAATGACCATGGTGATTTCATGTATGAAAGAATTAACTACAGACCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATAATGACCATGGTGATTTCATGTATGAAAGAATTAACTACAGACCT  700

seq1  ATACCCATGACCTTTGTGTTCTAAGAAACTTCGTTAACTCAGCTATTAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCCATGACCTTTGTGTTCTAAGAAACTTCGTTAACTCAGCTATTAAA  750

seq1  AAAAATGAATTTATGAAATTCCTAGGCAAATGGATGGACCTGGAGGGCAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATGAATTTATGAAATTCCTAGGCAAATGGATGGACCTGGAGGGCAT  800

seq1  CATCCTGAGTGGGGTAACCCAATCACAAAGGAACTCGCACAATATGTACT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCTGAGTGGGGTAACCCAATCACAAAGGAACTCGCACAATATGTACT  850

seq1  CACTGATAAGTGGATATTAGCCCAGAAACTTAGGATACCCAAGATATAAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  CACTGATAAGTGGATATTAGCCCAGAAACTTAGGATACCCAAGATAT-AG  899

seq1  ATACAACTTGCTAAACGCATGAAATTCAAGAAGAAGGAAGACCAAAGTGT  950
      |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||
seq2  ATACAACTTGCTAAACGCATGAAA-TCAAG-AGAAGG-AGA-CAAAGTGT  945

seq1  GGACACTTTACCCCTTCCTAGAAATGGGAACAAA  984
       |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  -GACACTTTACCCCTTCCTAGAAATGGGAACAAA  978