BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-038P12
Chromosome3 (Build37)
Map Location 75,992,150 - 76,146,185
singlet/doubletdoublet
Overlap geneFstl5
Upstream geneSerpini2, Wdr49, Pdcd10, Serpini1, Golph4
Downstream geneLOC100041625, LOC100041635
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-038P12.bB6Ng01-038P12.g
ACCDH866376DH866377
length1,2181,118
definitionDH866376|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-038P12, 5' end.DH866377|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-038P12, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(76,144,950 - 76,146,185)(75,992,150 - 75,993,273)
sequence
gaattctcagctgaggaatactgaatgcctgagaagcacctaaagaaatg
ttcaatatccttaatcatcagggaaatacaaatcaaaacaaccctgagat
cagattggctaagttcaaaatctcaagtaacagcagatgctggtgagcat
gtgtagaaaggaacactcctccattgctggtgggattgcaatctggtaat
gctcatttatataatttgctatacttctatttcattcaacttcagaaaac
aaagaaacaaattaacaaacgtaagtgggattacattttgtaattcttct
aacttcatataaccactacattaaaaccaccaaagtacttctttgccaaa
aaccctacataataataagaccagttatgtattccaatgcaaatgattgt
atttttgggttcaaattcacactaaatacatccaccgaaatagttgcaac
agcttcttgaaattgaataattaaaaatcaaatcagcttctggtgttaga
aatgatcaagtaagattatatttcttagttaatgccttttgacatgtaaa
acagtgctaattatattacatatagtaaatgaaaaattattatgaaggtc
acaatgtctaaacttgttagcctaaagctcagcatctgaagatctaacaa
ttacaaattgcaaagaattttatttaaaaaataatgatgaagttcaaaca
atataatatataatattactttatatcttacttgacttttaattaaaagc
atttaattattaaagtgcattcgtcttaaaatttttctctctcttctttt
aatctttgcatacatccatttctgtgccttacaataagtgaatacattct
gggttttggatgatacaatctgtgttttctcatgataggtaaatttctac
ttagttgtataaaataatggctatattctctacatatccatttaccattt
ggctaagcacacacacgtaataatacttctacatatgtgatcattgacaa
cccacacaagaaaagacagaggcaggactctacaattctgagtgtacagc
tgaacttggcccttcttaggatgaataaaacatttatgtacaatttgcct
aacagaaccctattaaaaaaagctcaatttaagttctggtatcatactaa
ttaccctaagcttaaactttggattattcttttataggtttggctggcta
tatggtgtcctcatgcac
gaattccacctgtattgaagagcacttttgtttgtgctataataataata
gtgatagaaaagcaattatcctctcaaaggggataagaggtagtatattc
cgggacccattttgagtgattgtagtccagaatctgaggtttaggttact
tcaaataccatgtttcaatgtagaaacagtttattaagcttcaataacaa
caaataagaatatcataaatgaatgactttccaaatataatggaggaaac
atccaataggtaggttgaagcaaaaatgtaggccctgttataggtcccag
aaaatatctgatggcatttatagctcttccttgtctggaaactagtgctc
tgtttgtaaattacaaactatgtatctaatggtcacaaagatgttaacta
agttatagaggatgacaattacgggggataaaggtgcccaaagataagga
acccatggaactgcaatatttgagtctattgccacaagaattctagtgcc
ttaatcagccctgcagagtacttatggaaaggtgcaactttttggtaaat
ttgttcacagtacttagagtacaatcatgccttatttttgtctgctatgt
gatatgtctccagttggatgtttacgctaagatagtaatttgaagttctc
tgttgtagaagtcctgagaaaaccatctttaagtaataatgctgagaggc
ctgggcagaaaaggagttaatttacagtgagcttataatataggttctga
ttatccccaaagggagtactaggatagcctagttttgcacaaggatgaca
gattttgtaacctgttattagccagttaccatggtggctcacccttagaa
ataaataaagtagctctttggctatttcttcactgcatggggtgagttgg
gatataaagacaaatagcaaattcttgaatcttaaactttctgtttgtca
ttaatagtttagtcattttcctataatatagtaagactggtattgccagc
caccagcaaaattagaaagactctcattattatgtaaggaatcattctac
agcttctccagttcttaatattgaaattgtaaactgatagacagcagact
ttcttgtccaatgatgaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_76144950_76146185
seq2: B6Ng01-038P12.b_50_1267 (reverse)

seq1  GTGCATTGATGACACCATTATGACCACAAGCCAAAAACTATACAAGAATA  50
      ||||| ||| ||||||| |||  ||   |||| ||| ||||| |||||||
seq2  GTGCA-TGAGGACACCA-TATAGCC---AGCC-AAACCTATAAAAGAATA  44

seq1  ATACCAAAGTATTAAGCTTAGGGTTAATATTAGTATGGAATA-CAGAACT  99
      || ||||||| |||||||||||||    |||||||||  ||| |||||||
seq2  AT-CCAAAGT-TTAAGCTTAGGGT---AATTAGTATG--ATACCAGAACT  87

seq1  TAAAATTTGAGCTTCTCTTTAATTAGGGTTCTTGTTATGCAAATGGTACA  149
      ||||  |||||||| | ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||
seq2  TAAA--TTGAGCTT-TTTTTAA-TAGGGTTC-TGTTAGGCAAATTGTACA  132

seq1  TAAATGTTTTATTCATTCTTAAGAGTGCCAAGTTCAGCTGTACACTCAGA  199
      |||||||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATGTTTTATTCATCCTAAGAAGGGCCAAGTTCAGCTGTACACTCAGA  182

seq1  ATTGTAGAGTCCTGCCTCTGTCTTTTCTTGTGTGGGTTGTCAATGATCAC  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTAGAGTCCTGCCTCTGTCTTTTCTTGTGTGGGTTGTCAATGATCAC  232

seq1  ATATGTAGAAGTATTATTACGTGTGTGTGCTTAGCCAAATGGTAAATGGA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGTAGAAGTATTATTACGTGTGTGTGCTTAGCCAAATGGTAAATGGA  282

seq1  TATGTAGAGAATATAGCCATTATTTTTATACAACTAAGTAGAAATTTACC  349
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTAGAGAATATAGCCATTA-TTTTATACAACTAAGTAGAAATTTACC  331

seq1  TATCATGAGAAAACACAGATTGTATCATCCAAAACCCAGAATGTATTCAC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCATGAGAAAACACAGATTGTATCATCCAAAACCCAGAATGTATTCAC  381

seq1  TTATTGTAAGGCACAGAAATGGATGTATGCAAAGATTAAAAGAAGAGAGA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTGTAAGGCACAGAAATGGATGTATGCAAAGATTAAAAGAAGAGAGA  431

seq1  GAAAAATTTTAAGACGAATGCACTTTAATAATTAAATGCTTTTAATTAAA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAATTTTAAGACGAATGCACTTTAATAATTAAATGCTTTTAATTAAA  481

seq1  AGTCAAGTAAGATATAAAGTAATATTATATATTATATTGTTTGAACTTCA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCAAGTAAGATATAAAGTAATATTATATATTATATTGTTTGAACTTCA  531

seq1  TCATTATTTTTTAAATAAAATTCTTTGCAATTTGTAATTGTTAGATCTTC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTATTTTTTAAATAAAATTCTTTGCAATTTGTAATTGTTAGATCTTC  581

seq1  AGATGCTGAGCTTTAGGCTAACAAGTTTAGACATTGTGACCTTCATAATA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGCTGAGCTTTAGGCTAACAAGTTTAGACATTGTGACCTTCATAATA  631

seq1  ATTTTTCATTTACTATATGTAATATAATTAGCACTGTTTTACATGTCAAA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTTCATTTACTATATGTAATATAATTAGCACTGTTTTACATGTCAAA  681

seq1  AGGCATTAACTAAGAAATATAATCTTACTTGATCATTTCTAACACCAGAA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCATTAACTAAGAAATATAATCTTACTTGATCATTTCTAACACCAGAA  731

seq1  GCTGATTTGATTTTTAATTATTCAATTTCAAGAAGCTGTTGCAACTATTT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGATTTGATTTTTAATTATTCAATTTCAAGAAGCTGTTGCAACTATTT  781

seq1  CGGTGGATGTATTTAGTGTGAATTTGAACCCAAAAATACAATCATTTGCA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGTGGATGTATTTAGTGTGAATTTGAACCCAAAAATACAATCATTTGCA  831

seq1  TTGGAATACATAACTGGTCTTATTATTATGTAGGGTTTTTGGCAAAGAAG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGAATACATAACTGGTCTTATTATTATGTAGGGTTTTTGGCAAAGAAG  881

seq1  TACTTTGGTGGTTTTAATGTAGTGGTTATATGAAGTTAGAAGAATTACAA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTTGGTGGTTTTAATGTAGTGGTTATATGAAGTTAGAAGAATTACAA  931

seq1  AATGTAATCCCACTTACGTTTGTTAATTTGTTTCTTTGTTTTCTGAAGTT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTAATCCCACTTACGTTTGTTAATTTGTTTCTTTGTTTTCTGAAGTT  981

seq1  GAATGAAATAGAAGTATAGCAAATTATATAAATGAGCATTACCAGATTGC  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGAAATAGAAGTATAGCAAATTATATAAATGAGCATTACCAGATTGC  1031

seq1  AATCCCACCAGCAATGGAGGAGTGTTCCTTTCTACACATGCTCACCAGCA  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCCCACCAGCAATGGAGGAGTGTTCCTTTCTACACATGCTCACCAGCA  1081

seq1  TCTGCTGTTACTTGAGATTTTGAACTTAGCCAATCTGATCTCAGGGTTGT  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCTGTTACTTGAGATTTTGAACTTAGCCAATCTGATCTCAGGGTTGT  1131

seq1  TTTGATTTGTATTTCCCTGATGATTAAGGATATTGAACATTTCTTTAGGT  1199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGATTTGTATTTCCCTGATGATTAAGGATATTGAACATTTCTTTAGGT  1181

seq1  GCTTCTCAGGCATTCAGTATTCCTCAGCTGAGAATTC  1236
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCTCAGGCATTCAGTATTCCTCAGCTGAGAATTC  1218

seq1: chr3_75992150_75993273
seq2: B6Ng01-038P12.g_67_1184

seq1  GAATTCCACCTGTATTGAAGAGCACTTTTGTTTGTGCTATAATAATAATA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCACCTGTATTGAAGAGCACTTTTGTTTGTGCTATAATAATAATA  50

seq1  GTGATAGAAAAGCAATTATCCTCTCAAAGGGGATAAGAGGTAGTATATTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATAGAAAAGCAATTATCCTCTCAAAGGGGATAAGAGGTAGTATATTC  100

seq1  CGGGACCCATTTTGAGTGATTGTAGTCCAGAATCTGAGGTTTAGGTTACT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGGACCCATTTTGAGTGATTGTAGTCCAGAATCTGAGGTTTAGGTTACT  150

seq1  TCAAATACCATGTTTCAATGTAGAAACAGTTTATTAAGCTTCAATAACAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAATACCATGTTTCAATGTAGAAACAGTTTATTAAGCTTCAATAACAA  200

seq1  CAAATAAGAATATCATAAATGAATGACTTTCCAAATATAATGGAGGAAAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATAAGAATATCATAAATGAATGACTTTCCAAATATAATGGAGGAAAC  250

seq1  ATCCAATAGGTAGGTTGAAGCAAAAATGTAGGCCCTGTTATAGGTCCCAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCAATAGGTAGGTTGAAGCAAAAATGTAGGCCCTGTTATAGGTCCCAG  300

seq1  AAAATATCTGATGGCATTTATAGCTCTTCCTTGTCTGGAAACTAGTGCTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATATCTGATGGCATTTATAGCTCTTCCTTGTCTGGAAACTAGTGCTC  350

seq1  TGTTTGTAAATTACAAACTATGTATCTAATGGTCACAAAGATGTTAACTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTGTAAATTACAAACTATGTATCTAATGGTCACAAAGATGTTAACTA  400

seq1  AGTTATAGAGGATGACAATTACGGGGGATAAAGGTGCCCAAAGATAAGGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTATAGAGGATGACAATTACGGGGGATAAAGGTGCCCAAAGATAAGGA  450

seq1  ACCCATGGAACTGCAATATTTGAGTCTATTGCCACAAGAATTCTAGTGCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCATGGAACTGCAATATTTGAGTCTATTGCCACAAGAATTCTAGTGCC  500

seq1  TTAATCAGCCCTGCAGAGTACTTATGGAAAGGTGCAACTTTTTGGTAAAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATCAGCCCTGCAGAGTACTTATGGAAAGGTGCAACTTTTTGGTAAAT  550

seq1  TTGTTCACAGTACTTAGAGTACAATCATGCCTTATTTTTGTCTGCTATGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTCACAGTACTTAGAGTACAATCATGCCTTATTTTTGTCTGCTATGT  600

seq1  GATATGTCTCCAGTTGGATGTTTACGCTAAGATAGTAATTTGAAGTTCTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATGTCTCCAGTTGGATGTTTACGCTAAGATAGTAATTTGAAGTTCTC  650

seq1  TGTTGTAGAAGTCCTGAGAAAACCATCTTTAAGTAATAATGCTGAGAGGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGTAGAAGTCCTGAGAAAACCATCTTTAAGTAATAATGCTGAGAGGC  700

seq1  CTGGGCAGAAAAGGAGTTAATTTACAGTGAGCTTATAATATAGGTTCTGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGCAGAAAAGGAGTTAATTTACAGTGAGCTTATAATATAGGTTCTGA  750

seq1  TTATCCCCAAAGGGAGTACTAGGATAGCCTAGTTTTGCACAAGGATGACA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCCCCAAAGGGAGTACTAGGATAGCCTAGTTTTGCACAAGGATGACA  800

seq1  GATTTTGTAACCTGTTATTAGCCAGTTACCATGGTGGCTCACCCTTAGAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTTGTAACCTGTTATTAGCCAGTTACCATGGTGGCTCACCCTTAGAA  850

seq1  ATAAATAAAGTAGCTCTTTGGCTATTTCTTCACTGCATGGGGTGAGTTGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATAAAGTAGCTCTTTGGCTATTTCTTCACTGCATGGGGTGAGTTGG  900

seq1  GATATAAAGACAAATAGCAAAATTCTTGAATCTTAAACTTTCTGTTTTGT  950
      |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  GATATAAAGACAAATAGC-AAATTCTTGAATCTTAAACTTTCTG-TTTGT  948

seq1  CATTAATAGTTTAGTCATTTTCCTATAATATAGT-AGACTGGTATTGCCA  999
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  CATTAATAGTTTAGTCATTTTCCTATAATATAGTAAGACTGGTATTGCCA  998

seq1  GCCACCAGCAAAATTAG-AAGACTCTCATTATTATGTAAGGAAAATCATT  1048
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||
seq2  GCCACCAGCAAAATTAGAAAGACTCTCATTATTATGTAAGG--AATCATT  1046

seq1  CCTACAGCTTCTCCAGTTCTTAATATTGAAATTGTTAAAACTGATAGACA  1098
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||
seq2  -CTACAGCTTCTCCAGTTCTTAATATTGAAATTGT--AAACTGATAGACA  1093

seq1  GCAGACTTTCTTGTCCAAATGATGAA  1124
      |||||||||||||||| |||||||||
seq2  GCAGACTTTCTTGTCC-AATGATGAA  1118