BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-041G22
Chromosome3 (Build37)
Map Location 136,605,958 - 136,717,295
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC668870
Upstream geneLOC100039350, LOC383923, Bank1, LOC100039477, LOC668868, Ppp3ca
Downstream geneLOC100039447, Emcn, EG229862, Ddit4l, LOC668874, H2afz, Dnajb14, Map2k1ip1, Dapp1, EG329763
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-041G22.bB6Ng01-041G22.g
ACCDH868099DH868100
length7151,110
definitionDH868099|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-041G22, 5' end.DH868100|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-041G22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(136,605,958 - 136,606,672)(136,716,180 - 136,717,295)
sequence
gaattcattacaacaactggtgatccactgacaacagaagagacagcttg
gctctctatctggtaactctctccaaaatgaaaaatcaaatggattggac
atttcatttttaaacataaaatataaaaacaaggagattgctagaaaaca
acaacaacaacaacaacaacaaaacctgaaataatgtttgtggccttgac
taggcacagagtttgacataaaatcaaaagccagaactgaaaattacaaa
ttaacaggattttattaaaagtatgtttcctcttgcttcatagagtgctg
tagtctggaagaaaactggtggcagattgtacctctatcagagaacttgg
agcgcaaatcttcctaaactcaataacaaacaaaatttaaatgcataaga
gatttgggggcgtgggggacagcaaataagatatgcacaaaaataaatgt
ccacattaaaagctgttcaatatcatggtgactggaaaaacagaaagcaa
tggagattgttgtggtctgaatataaaatgtcccatacaaggtcttgtgc
ttggacacttggtctccagttggtagcaaggttatagaacattttggaaa
tggagtcttgctggaggatgtgtatcactgggtgagatgggacttgaggt
tttttagcctggatccacttccctccttccctccttccctcctttcctcc
ctccctccttccctc
gaattctgctttaaagatgttggggccatcagccctagtgagtgagtcac
caatttgtaaaagaagtttcagggcttgtaaaagaggagaagcctctaat
ttttactccccgtcgttcaaaatacctgacaatagatttgctacagagaa
gccattggcaccaaaaataaagtcacctcgccagacacaggccatgttca
ggtcctctagagtaagtatagagtaagccagaggctctcagactccaagg
tcactgatttgaacggataaccaattgttgaacacaaagtctcaaaatgt
cagcactgatgtgaaaggatgtgacaagcaagctcactccagaaccagag
gacaaatagattatagctgctcaggttacagctataaataatgaccacaa
tagaattgacatatgacaactctctatttctgttttgtgtataaaaataa
gttagatatgttcttgctcgctcacttgggtagaatgagccatagggatt
gacaactgtataaactggacctggatatatccatgagagaaataatgcaa
ctctcgctcataggacttggacactaactgtaaagagcaaaaccaaagtt
tttcaatgttattgaaacagagtatgtaacaaagtagaatcttaactacc
actacaagaagtaaataatttatgatggctcaaagagaaaaggaatattt
aagcccaggcattcttttacaatgtctttctggtctctgtgaattttatt
ttcagaaaacttttcatgacacttaataatagttctcagaacagtttcta
aggtcaaacaaatatggaaaaagagcctcccccccacacacacacactaa
caatgggctgttgtgatgtttctcatatcttgataatgctgtgtgaatat
agtgaggaaaatgactggctttcttctctataacacatgtactgctcaag
gattcacccagcttcataaggctctagctggttgagaacataaccttcaa
acactgatttattctgaatgcatgcaaaaccacaattgttaatggagaaa
tgttttgtgaagataaataaatattttacagctatagaattagccctgta
ttcaaataca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_136605958_136606672
seq2: B6Ng01-041G22.b_48_762

seq1  GAATTCATTACAACAACTGGTGATCCACTGACAACAGAAGAGACAGCTTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTACAACAACTGGTGATCCACTGACAACAGAAGAGACAGCTTG  50

seq1  GCTCTCTATCTGGTAACTCTCTCCAAAATGAAAAATCAAATGGATTGGAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTCTATCTGGTAACTCTCTCCAAAATGAAAAATCAAATGGATTGGAC  100

seq1  ATTTCATTTTTAAACATAAAATATAAAAACAAGGAGATTGCTAGAAAACA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCATTTTTAAACATAAAATATAAAAACAAGGAGATTGCTAGAAAACA  150

seq1  ACAACAACAACAACAACAACAAAACCTGAAATAATGTTTGTGGCCTTGAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACAACAACAACAACAACAAAACCTGAAATAATGTTTGTGGCCTTGAC  200

seq1  TAGGCACAGAGTTTGACATAAAATCAAAAGCCAGAACTGAAAATTACAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGCACAGAGTTTGACATAAAATCAAAAGCCAGAACTGAAAATTACAAA  250

seq1  TTAACAGGATTTTATTAAAAGTATGTTTCCTCTTGCTTCATAGAGTGCTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACAGGATTTTATTAAAAGTATGTTTCCTCTTGCTTCATAGAGTGCTG  300

seq1  TAGTCTGGAAGAAAACTGGTGGCAGATTGTACCTCTATCAGAGAACTTGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCTGGAAGAAAACTGGTGGCAGATTGTACCTCTATCAGAGAACTTGG  350

seq1  AGCGCAAATCTTCCTAAACTCAATAACAAACAAAATTTAAATGCATAAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCGCAAATCTTCCTAAACTCAATAACAAACAAAATTTAAATGCATAAGA  400

seq1  GATTTGGGGGCGTGGGGGACAGCAAATAAGATATGCACAAAAATAAATGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTGGGGGCGTGGGGGACAGCAAATAAGATATGCACAAAAATAAATGT  450

seq1  CCACATTAAAAGCTGTTCAATATCATGGTGACTGGAAAAACAGAAAGCAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACATTAAAAGCTGTTCAATATCATGGTGACTGGAAAAACAGAAAGCAA  500

seq1  TGGAGATTGTTGTGGTCTGAATATAAAATGTCCCATACAAGGTCTTGTGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGATTGTTGTGGTCTGAATATAAAATGTCCCATACAAGGTCTTGTGC  550

seq1  TTGGACACTTGGTCTCCAGTTGGTAGCAAGGTTATAGAACATTTTGGAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGACACTTGGTCTCCAGTTGGTAGCAAGGTTATAGAACATTTTGGAAA  600

seq1  TGGAGTCTTGCTGGAGGATGTGTATCACTGGGTGAGATGGGACTTGAGGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGTCTTGCTGGAGGATGTGTATCACTGGGTGAGATGGGACTTGAGGT  650

seq1  TTTTTAGCCTGGATCCACTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTTCCTCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTAGCCTGGATCCACTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTTCCTCC  700

seq1  CTCCCTCCTTCCCTC  715
      |||||||||||||||
seq2  CTCCCTCCTTCCCTC  715

seq1: chr3_136716180_136717295
seq2: B6Ng01-041G22.g_69_1178 (reverse)

seq1  TGTAATTGAATACAAGGCTAAATTCTAATAGCTGTAAAAATATATATTTA  50
      |||| ||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||
seq2  TGTATTTGAATACAGGGCT-AATTCT-ATAGCTGT-AAAATATTTATTTA  47

seq1  TCTTCACAAACATTTTTCTACATTAACCATTTGTTGTTTTTGCATTGCAT  100
      |||||||||| |  ||||| ||||||| |||   || ||||||| |||||
seq2  TCTTCACAAA-ACATTTCTCCATTAACAATT--GTGGTTTTGCA-TGCAT  93

seq1  TCAGAATAAATCAGTGTTTTGAGGTTATGTTCTACAACCAGCTAGAGCCT  150
      |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TCAGAATAAATCAGTGTTTGAAGGTTATGTTCT-CAACCAGCTAGAGCCT  142

seq1  TATGAAGCTGGGTGAATCCTTGAGCAGTTACATGTGTTATAGAGAAG-AA  199
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||
seq2  TATGAAGCTGGGTGAATCCTTGAGCAG-TACATGTGTTATAGAGAAGAAA  191

seq1  GCCAGTCCATTTTCCTCACTATATTCACACAGCATTATCAAGATATGAGA  249
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGT-CATTTTCCTCACTATATTCACACAGCATTATCAAGATATGAGA  240

seq1  AACATCACAACAG-CCATTGTTAGTGTGTGTGTGTGGGGGGG-GGCTC-T  296
      ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
seq2  AACATCACAACAGCCCATTGTTAGTGTGTGTGTGTGGGGGGGAGGCTCTT  290

seq1  TTTCCATATTTGTTTGACCTTAGAAACTGTTCTGAGAACTATTATTAAGT  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCATATTTGTTTGACCTTAGAAACTGTTCTGAGAACTATTATTAAGT  340

seq1  GTCATGAAAAGTTTTCTGAAAATAAAATTCACAGAGACCAGAAAGACATT  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATGAAAAGTTTTCTGAAAATAAAATTCACAGAGACCAGAAAGACATT  390

seq1  GTAAAAGAATGCCTGGGCTTAAATATTCCTTTTCTCTTTGAGCCATCATA  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAAAGAATGCCTGGGCTTAAATATTCCTTTTCTCTTTGAGCCATCATA  440

seq1  AATTATTTACTTCTTGTAGTGGTAGTTAAGATTCTACTTTGTTACATACT  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTATTTACTTCTTGTAGTGGTAGTTAAGATTCTACTTTGTTACATACT  490

seq1  CTGTTTCAATAACATTGAAAAACTTTGGTTTTGCTCTTTACAGTTAGTGT  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTTCAATAACATTGAAAAACTTTGGTTTTGCTCTTTACAGTTAGTGT  540

seq1  CCAAGTCCTATGAGCGAGAGTTGCATTATTTCTCTCATGGATATATCCAG  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGTCCTATGAGCGAGAGTTGCATTATTTCTCTCATGGATATATCCAG  590

seq1  GTCCAGTTTATACAGTTGTCAATCCCTATGGCTCATTCTACCCAAGTGAG  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCAGTTTATACAGTTGTCAATCCCTATGGCTCATTCTACCCAAGTGAG  640

seq1  CGAGCAAGAACATATCTAACTTATTTTTATACACAAAACAGAAATAGAGA  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAGCAAGAACATATCTAACTTATTTTTATACACAAAACAGAAATAGAGA  690

seq1  GTTGTCATATGTCAATTCTATTGTGGTCATTATTTATAGCTGTAACCTGA  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTCATATGTCAATTCTATTGTGGTCATTATTTATAGCTGTAACCTGA  740

seq1  GCAGCTATAATCTATTTGTCCTCTGGTTCTGGAGTGAGCTTGCTTGTCAC  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCTATAATCTATTTGTCCTCTGGTTCTGGAGTGAGCTTGCTTGTCAC  790

seq1  ATCCTTTCACATCAGTGCTGACATTTTGAGACTTTGTGTTCAACAATTGG  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTTTCACATCAGTGCTGACATTTTGAGACTTTGTGTTCAACAATTGG  840

seq1  TTATCCGTTCAAATCAGTGACCTTGGAGTCTGAGAGCCTCTGGCTTACTC  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCCGTTCAAATCAGTGACCTTGGAGTCTGAGAGCCTCTGGCTTACTC  890

seq1  TATACTTACTCTAGAGGACCTGAACATGGCCTGTGTCTGGCGAGGTGACT  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACTTACTCTAGAGGACCTGAACATGGCCTGTGTCTGGCGAGGTGACT  940

seq1  TTATTTTTGGTGCCAATGGCTTCTCTGTAGCAAATCTATTGTCAGGTATT  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTTTGGTGCCAATGGCTTCTCTGTAGCAAATCTATTGTCAGGTATT  990

seq1  TTGAACGACGGGGAGTAAAAATTAGAGGCTTCTCCTCTTTTACAAGCCCT  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAACGACGGGGAGTAAAAATTAGAGGCTTCTCCTCTTTTACAAGCCCT  1040

seq1  GAAACTTCTTTTACAAATTGGTGACTCACTCACTAGGGCTGATGGCCCCA  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACTTCTTTTACAAATTGGTGACTCACTCACTAGGGCTGATGGCCCCA  1090

seq1  ACATCTTTAAAGCAGAATTC  1116
      ||||||||||||||||||||
seq2  ACATCTTTAAAGCAGAATTC  1110